vv/vvBinaryImageOverlayActor.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ===========================================================================**/
  18
  19 #include "vvBinaryImageOverlayActor.h"
  20 #include "vvImage.h"
  21 #include <vtkImageActor.h>
  22 #include <vtkCamera.h>
  23 #include <vtkRenderer.h>
  24 #include <vtkMarchingSquares.h>
  25 #include <vtkImageClip.h>
  26 #include <vtkImageData.h>
  27 #include <vtkPolyDataMapper.h>
  28 #include <vtkProperty.h>
  29 #include <vtkImageMapToRGBA.h>
  30 #include <vtkLookupTable.h>
  31
  32 //------------------------------------------------------------------------------
  33 vvBinaryImageOverlayActor::vvBinaryImageOverlayActor()
  34 {
  35   mTSlice = -1;
  36   mSlice = 0;
  37   mColor.resize(3);
  38   mAlpha = 0.6;
  39   mImage = 0;
  40   mSlicer = 0;
  41   mColorLUT = vtkSmartPointer<vtkLookupTable>::New();
  42   mForegroundValue = 1;
  43   mBackgroundValue = 0;
  44   m_modeBG = true;
  45   mDepth = 1.0;
  46 }
  47 //------------------------------------------------------------------------------
  48
  49
  50 //------------------------------------------------------------------------------
  51 vvBinaryImageOverlayActor::~vvBinaryImageOverlayActor()
  52 {
  53   mImageActorList.clear();
  54 }
  55 //------------------------------------------------------------------------------
  56
  57
  58 //------------------------------------------------------------------------------
  59 void vvBinaryImageOverlayActor::RemoveActors()
  60 {
  61   for (unsigned int i = 0; i < mImageActorList.size(); i++) {
  62     if (mSlicer != 0) {
  63       if (mSlicer != NULL) {
  64         if (mSlicer->GetRenderer() != 0) {
  65           if (mImageActorList[i] != 0)  {
  66             mSlicer->GetRenderer()->RemoveActor(mImageActorList[i]);
  67           }
  68         }
  69       }
  70     }
  71   }
  72 }
  73 //------------------------------------------------------------------------------
  74
  75
  76 //------------------------------------------------------------------------------
  77 void vvBinaryImageOverlayActor::SetColor(double r, double g, double b)
  78 {
  79   mColor[0] = r;
  80   mColor[1] = g;
  81   mColor[2] = b;
  82 }
  83 //------------------------------------------------------------------------------
  84
  85
  86 //------------------------------------------------------------------------------
  87 void vvBinaryImageOverlayActor::SetSlicer(vvSlicer * slicer)
  88 {
  89   mSlicer = slicer;
  90 }
  91 //------------------------------------------------------------------------------
  92
  93
  94 //------------------------------------------------------------------------------
  95 void vvBinaryImageOverlayActor::Initialize(bool IsVisible)
  96 {
  97   if (!mSlicer) {
  98     std::cerr << "ERROR. Please use setSlicer before setSlicer in vvBinaryImageOverlayActor." << std::endl;
  99     exit(0);
 100   }
 101
 102   if (!mImage) {
 103     std::cerr << "ERROR. Please use setImage before setSlicer in vvBinaryImageOverlayActor." << std::endl;
 104     exit(0);
 105   }
 106   // Create an actor for each time slice
 107   for (unsigned int numImage = 0; numImage < mSlicer->GetImage()->GetVTKImages().size(); numImage++) {
 108     // how many intensity ?
 109     vtkSmartPointer<vtkImageMapToRGBA> mOverlayMapper = vtkSmartPointer<vtkImageMapToRGBA>::New();
 110     mOverlayMapper->SetInput(mImage->GetVTKImages()[0]); // DS TODO : to change if it is 4D !!!
 111
 112     double range[2];
 113     mImage->GetVTKImages()[0]->GetScalarRange(range);
 114     int n = range[1]-range[0]+1;
 115     mColorLUT->SetRange(range[0],range[1]);
 116     mColorLUT->SetNumberOfTableValues(n);
 117
 118     // Mode BG -> all is color except BG
 119     if (m_modeBG) {
 120       for(int i=0; i<n; i++) {
 121         mColorLUT->SetTableValue(i, mColor[0], mColor[1], mColor[2], mAlpha);
 122       }
 123       mColorLUT->SetTableValue(mBackgroundValue, 0, 0, 0, 0.0);
 124     }
 125     else {
 126       // Mode FG -> all is BG, except FG which is color
 127       for(int i=0; i<n; i++) {
 128         mColorLUT->SetTableValue(i, 0, 0, 0, 0.0);
 129       }
 130       mColorLUT->SetTableValue(mForegroundValue, mColor[0], mColor[1], mColor[2], mAlpha);
 131     }
 132
 133     mOverlayMapper->SetLookupTable(mColorLUT);
 134
 135     vtkSmartPointer<vtkImageActor> mOverlayActor = vtkSmartPointer<vtkImageActor>::New();
 136     mOverlayActor->SetInput(mOverlayMapper->GetOutput());
 137     mOverlayActor->SetPickable(0);
 138     mOverlayActor->SetVisibility(IsVisible);
 139     //mOverlayActor->SetOpacity(1.0);
 140
 141     mMapperList.push_back(mOverlayMapper);
 142     mImageActorList.push_back(mOverlayActor);
 143     mSlicer->GetRenderer()->AddActor(mOverlayActor);
 144   }
 145 }
 146 //------------------------------------------------------------------------------
 147
 148
 149 //------------------------------------------------------------------------------
 150 void vvBinaryImageOverlayActor::SetOpacity(double d)
 151 {
 152   mAlpha = d;
 153 }
 154 //------------------------------------------------------------------------------
 155
 156
 157 //------------------------------------------------------------------------------
 158 // void vvBinaryImageOverlayActor::UpdateOpacity(double d) {
 159 //   mAlpha = d;
 160 //   mColorLUT->SetTableValue(1, mColor[0], mColor[1], mColor[2], mAlpha); // FG
 161 //   for (unsigned int numImage = 0; numImage < mSlicer->GetImage()->GetVTKImages().size(); numImage++) {
 162 //     // how many intensity ?
 163 //     vtkImageMapToRGBA * mOverlayMapper = mMapperList[numImage];
 164 //     mOverlayMapper->SetLookupTable(mColorLUT);
 165
 166 //     vtkImageActor * mOverlayActor = mImageActorList[numImage];
 167 //     mOverlayActor->SetInput(mOverlayMapper->GetOutput());
 168 //   }
 169 // }
 170 //------------------------------------------------------------------------------
 171
 172
 173 //------------------------------------------------------------------------------
 174 // void vvBinaryImageOverlayActor::SetColor(double r, double v, double b) {
 175 //   mColor[0] = r;
 176 //   mColor[1] = v;
 177 //   mColor[2] = b;
 178 //   // mColorLUT->SetTableValue(1, mColor[0], mColor[1], mColor[2], mAlpha); // FG
 179 //   // for (unsigned int numImage = 0; numImage < mSlicer->GetImage()->GetVTKImages().size(); numImage++) {
 180 //   //   // how many intensity ?
 181 //   //   vtkImageMapToRGBA * mOverlayMapper = mMapperList[numImage];
 182 //   //   mOverlayMapper->SetLookupTable(mColorLUT);
 183
 184 //   //   vtkImageActor * mOverlayActor = mImageActorList[numImage];
 185 //   //   mOverlayActor->SetInput(mOverlayMapper->GetOutput());
 186 //   // }
 187 // }
 188 //------------------------------------------------------------------------------
 189
 190
 191 //------------------------------------------------------------------------------
 192 void vvBinaryImageOverlayActor::SetImage(vvImage::Pointer image, double bg, bool modeBG)
 193 {
 194   mImage = image;
 195   if (modeBG) {
 196     mBackgroundValue = bg;
 197     m_modeBG = true;
 198   }
 199   else {
 200     mForegroundValue = bg;
 201     m_modeBG = false;
 202   }
 203 }
 204 //------------------------------------------------------------------------------
 205
 206
 207 //------------------------------------------------------------------------------
 208 void vvBinaryImageOverlayActor::HideActors()
 209 {
 210   if (!mSlicer) return;
 211   mSlice = mSlicer->GetSlice();
 212   for(unsigned int i=0; i<mImageActorList.size(); i++) {
 213     mImageActorList[i]->VisibilityOff();
 214   }
 215   // Caller MUST call Render
 216   //  mSlicer->Render();
 217 }
 218 //------------------------------------------------------------------------------
 219
 220
 221 //------------------------------------------------------------------------------
 222 void vvBinaryImageOverlayActor::ShowActors()
 223 {
 224   if (!mSlicer) return;
 225   mSlice = mSlicer->GetSlice();
 226   mTSlice = mSlicer->GetTSlice();
 227   //  for(unsigned int i=0; i<mSquaresActorList.size(); i++) {
 228   mImageActorList[mTSlice]->VisibilityOn();
 229   UpdateSlice(0, mSlice);
 230   //}
 231   // Caller MUST call Render
 232   //mSlicer->Render();
 233 }
 234 //------------------------------------------------------------------------------
 235
 236
 237 //------------------------------------------------------------------------------
 238 void vvBinaryImageOverlayActor::UpdateColor()
 239 {
 240   mColorLUT->SetTableValue(1, mColor[0], mColor[1], mColor[2], mAlpha); // FG
 241   for (unsigned int numImage = 0; numImage < mSlicer->GetImage()->GetVTKImages().size(); numImage++) {
 242     // how many intensity ?
 243     vtkImageMapToRGBA * mOverlayMapper = mMapperList[numImage];
 244     mOverlayMapper->SetLookupTable(mColorLUT);
 245
 246     vtkImageActor * mOverlayActor = mImageActorList[numImage];
 247     mOverlayActor->SetInput(mOverlayMapper->GetOutput());
 248   }
 249 }
 250 //------------------------------------------------------------------------------
 251
 252 //------------------------------------------------------------------------------
 253 void vvBinaryImageOverlayActor::UpdateSlice(int slicer, int slice, bool force)
 254 {
 255   if (!mSlicer) return;
 256
 257   if (!force) {
 258     if (mPreviousSlice == mSlicer->GetSlice()) {
 259       if (mPreviousTSlice == mSlicer->GetTSlice()) {
 260         return; // Nothing to do
 261       }
 262     }
 263   }
 264
 265   // Get current slice
 266   mSlice = mSlicer->GetSlice();
 267   mTSlice = mSlicer->GetTSlice();
 268
 269   // Update extent
 270   int * imageExtent = mSlicer->GetExtent();
 271   int orientation = mSlicer->GetOrientation();
 272   int maskExtent[6];
 273   ComputeExtent(orientation, mSlice, imageExtent, maskExtent);
 274   ComputeExtent(maskExtent, maskExtent, mSlicer->GetImage()->GetFirstVTKImageData(), mImage->GetFirstVTKImageData());
 275   mSlicer->ClipDisplayedExtent(maskExtent, mMapperList[mTSlice]->GetInput()->GetWholeExtent());
 276   SetDisplayExtentAndCameraPosition(orientation, mSlice, maskExtent, mImageActorList[mTSlice], mDepth);
 277
 278   // set previous slice
 279   mPreviousTSlice = mSlicer->GetTSlice();
 280   mPreviousSlice  = mSlicer->GetSlice();
 281 }
 282 //------------------------------------------------------------------------------
 283
 284
 285 //------------------------------------------------------------------------------
 286 void vvBinaryImageOverlayActor::ComputeExtent(int orientation,
 287                                               int slice,
 288                                               int * inExtent,
 289                                               int * outExtent)
 290 {
 291   switch (orientation) {
 292   case vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_XY:
 293     for(int i=0; i<4; i++) outExtent[i] = inExtent[i];
 294     outExtent[4] = outExtent[5] = slice;
 295     break;
 296   case vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_XZ:
 297     for(int i=0; i<2; i++) outExtent[i] = inExtent[i];
 298     for(int i=4; i<6; i++) outExtent[i] = inExtent[i];
 299     outExtent[2] = outExtent[3] = slice;
 300     break;
 301   case vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_YZ:
 302     for(int i=2; i<6; i++) outExtent[i] = inExtent[i];
 303     outExtent[0] = outExtent[1] = slice;
 304     break;
 305   }
 306 }
 307 //------------------------------------------------------------------------------
 308
 309
 310 //----------------------------------------------------------------------------
 311 void vvBinaryImageOverlayActor::ComputeExtent(int * inExtent, int * outExtent, vtkImageData * image, vtkImageData * overlay)
 312 {
 313   outExtent[0] = (int)lrint(((image->GetOrigin()[0] + inExtent[0]*image->GetSpacing()[0]) - overlay->GetOrigin()[0]) / overlay->GetSpacing()[0]);
 314   outExtent[1] = (int)lrint(((image->GetOrigin()[0] + inExtent[1]*image->GetSpacing()[0]) - overlay->GetOrigin()[0]) / overlay->GetSpacing()[0]);
 315   outExtent[2] = (int)lrint(((image->GetOrigin()[1] + inExtent[2]*image->GetSpacing()[1]) - overlay->GetOrigin()[1]) / overlay->GetSpacing()[1]);
 316   outExtent[3] = (int)lrint(((image->GetOrigin()[1] + inExtent[3]*image->GetSpacing()[1]) - overlay->GetOrigin()[1]) / overlay->GetSpacing()[1]);
 317   outExtent[4] = (int)lrint(((image->GetOrigin()[2] + inExtent[4]*image->GetSpacing()[2]) - overlay->GetOrigin()[2]) / overlay->GetSpacing()[2]);
 318   outExtent[5] = (int)lrint(((image->GetOrigin()[2] + inExtent[5]*image->GetSpacing()[2]) - overlay->GetOrigin()[2]) / overlay->GetSpacing()[2]);
 319 }
 320 //----------------------------------------------------------------------------
 321
 322
 323 //------------------------------------------------------------------------------
 324 void vvBinaryImageOverlayActor::SetDisplayExtentAndCameraPosition(int orientation,
 325                                                                   int slice,
 326                                                                   int * extent,
 327                                                                   vtkImageActor * actor,
 328                                                                   double position)
 329 {
 330   /* FIXME
 331      Error according to camera orientation
 332    */
 333
 334   // Set position
 335   if (orientation == vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_XY) {
 336     //if (mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[2] > slice)
 337       actor->SetPosition(0,0, -position);
 338       //else
 339       //actor->SetPosition(0,0, position);
 340   }
 341   if (orientation == vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_XZ) {
 342     //if (mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[1] > slice)
 343     // actor->SetPosition(0,position,0);
 344     //else
 345       actor->SetPosition(0,-position,0);
 346   }
 347   if (orientation == vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_YZ) {
 348     //if (mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[0] > slice)
 349     //  actor->SetPosition(position,0, 0);
 350     //else
 351       actor->SetPosition(-position,0, 0);
 352   }
 353   actor->SetDisplayExtent(extent);
 354 }
 355 //------------------------------------------------------------------------------
 356