vv/vvBinaryImageOverlayActor.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ======================================================================-====*/
  18
  19 #include "vvBinaryImageOverlayActor.h"
  20 #include "vvImage.h"
  21 #include <vtkImageActor.h>
  22 #include <vtkCamera.h>
  23 #include <vtkRenderer.h>
  24 #include <vtkMarchingSquares.h>
  25 #include <vtkImageClip.h>
  26 #include <vtkImageData.h>
  27 #include <vtkPolyDataMapper.h>
  28 #include <vtkProperty.h>
  29 #include <vtkImageMapToRGBA.h>
  30 #include <vtkLookupTable.h>
  31
  32 //------------------------------------------------------------------------------
  33 vvBinaryImageOverlayActor::vvBinaryImageOverlayActor() {
  34   mTSlice = -1;
  35   mSlice = 0;
  36   mColor.resize(3);
  37   mAlpha = 0.6;
  38   mImage = 0;
  39   mSlicer = 0;
  40 }
  41 //------------------------------------------------------------------------------
  42
  43
  44 //------------------------------------------------------------------------------
  45 vvBinaryImageOverlayActor::~vvBinaryImageOverlayActor() {
  46   for (unsigned int i = 0; i < mSlicer->GetImage()->GetVTKImages().size(); i++) {
  47     mSlicer->GetRenderer()->RemoveActor(mImageActorList[i]);
  48   }
  49   mImageActorList.clear();
  50   mMapperList.clear();
  51 }
  52 //------------------------------------------------------------------------------
  53
  54
  55 //------------------------------------------------------------------------------
  56 void vvBinaryImageOverlayActor::setColor(double r, double g, double b) {
  57   mColor[0] = r;
  58   mColor[1] = g;
  59   mColor[2] = b;
  60 }
  61 //------------------------------------------------------------------------------
  62
  63
  64
  65 //------------------------------------------------------------------------------
  66 void vvBinaryImageOverlayActor::setSlicer(vvSlicer * slicer) {
  67   mSlicer = slicer;
  68 }
  69 //------------------------------------------------------------------------------
  70
  71
  72 //------------------------------------------------------------------------------
  73 void vvBinaryImageOverlayActor::initialize() {
  74   if (!mSlicer) {
  75     std::cerr << "ERROR. Please use setSlicer before setSlicer in vvBinaryImageOverlayActor." << std::endl;
  76     exit(0);
  77   }
  78
  79   if (!mImage) {
  80     std::cerr << "ERROR. Please use setImage before setSlicer in vvBinaryImageOverlayActor." << std::endl;
  81     exit(0);
  82   }
  83   // Create an actor for each time slice
  84   for (unsigned int numImage = 0; numImage < mSlicer->GetImage()->GetVTKImages().size(); numImage++) {
  85     DD(numImage);
  86     vtkImageMapToRGBA * mOverlayMapper = vtkImageMapToRGBA::New();
  87     mOverlayMapper->SetInput(mImage->GetVTKImages()[0]); // DS TODO : to change if it is 4D !!!
  88     vtkLookupTable * lut = vtkLookupTable::New();
  89     DD(lut->IsOpaque ());
  90     lut->SetRange(0,1);
  91     lut->SetNumberOfTableValues(2);
  92     lut->SetTableValue(0, 0, 0, 0, 0.0);   // BG
  93     lut->SetTableValue(1, mColor[0], mColor[1], mColor[2], mAlpha); // FG
  94     DD(mColor[0]);
  95     mOverlayMapper->SetLookupTable(lut);
  96
  97     vtkImageActor * mOverlayActor = vtkImageActor::New();
  98     mOverlayActor->SetInput(mOverlayMapper->GetOutput());
  99     mOverlayActor->SetPickable(0);
 100     mOverlayActor->SetVisibility(true);
 101     //mOverlayActor->SetOpacity(1.0);
 102
 103     mMapperList.push_back(mOverlayMapper);
 104     mImageActorList.push_back(mOverlayActor);
 105     mSlicer->GetRenderer()->AddActor(mOverlayActor);
 106   }
 107 }
 108 //------------------------------------------------------------------------------
 109
 110
 111 //------------------------------------------------------------------------------
 112 void vvBinaryImageOverlayActor::setImage(vvImage::Pointer image) {
 113   mImage = image;
 114 }
 115 //------------------------------------------------------------------------------
 116
 117
 118 //------------------------------------------------------------------------------
 119 void vvBinaryImageOverlayActor::hideActors() {
 120   if (!mSlicer) return;
 121   mSlice = mSlicer->GetSlice();
 122   for(unsigned int i=0; i<mImageActorList.size(); i++) {
 123     mImageActorList[i]->VisibilityOff();
 124   }
 125 }
 126 //------------------------------------------------------------------------------
 127
 128
 129 //------------------------------------------------------------------------------
 130 void vvBinaryImageOverlayActor::showActors() {
 131   if (!mSlicer) return;
 132   mSlice = mSlicer->GetSlice();
 133   mTSlice = mSlicer->GetTSlice();
 134   //  for(unsigned int i=0; i<mSquaresActorList.size(); i++) {
 135   mImageActorList[mTSlice]->VisibilityOn();
 136   update(0, mSlice);
 137   //}
 138 }
 139 //------------------------------------------------------------------------------
 140
 141
 142 //------------------------------------------------------------------------------
 143 void vvBinaryImageOverlayActor::update(int slicer, int slice) {
 144   // DD("update");
 145   // DD(slicer);
 146   // DD(slice);
 147   if (!mSlicer) return;
 148   // DD(mSlicer->GetSlice());
 149   // DD(mSlicer->GetTSlice());
 150
 151   if (mPreviousSlice == mSlicer->GetSlice()) {
 152     if (mPreviousTSlice == mSlicer->GetTSlice()) {
 153       DD("=========== NOTHING");
 154       return; // Nothing to do
 155     }
 156   }
 157
 158   // Get current slice
 159   mSlice = mSlicer->GetSlice();
 160   mTSlice = mSlicer->GetTSlice();
 161
 162   // Update extent
 163   //  DD("Update extent");
 164
 165   /*
 166 1 - get extent
 167 2 - orientation
 168 3 - compute new extent : ComputeImageDisplayedExtent
 169 4 - ClipDisplayedExtent
 170 5 - actor SetDisplayExtent
 171
 172 ==> à mettre dans slicer.
 173   ==> fct (image input, image à overl)
 174   */
 175   int * imageExtent = mSlicer->GetExtent();
 176   int orientation = mSlicer->GetOrientation();
 177   int maskExtent[6];
 178   ComputeExtent(orientation, mSlice, imageExtent, maskExtent);
 179   //ComputeExtent(imageExtent, maskExtent, mSlicer->GetImage()->GetFirstVTKImageData(), mImage->GetFirstVTKImageData());
 180   ComputeExtent(maskExtent, maskExtent, mSlicer->GetImage()->GetFirstVTKImageData(), mImage->GetFirstVTKImageData());
 181   // std::cout << "maskExtent = " << maskExtent[0] << " " << maskExtent[1] << " " << maskExtent[2] << " "
 182   //        << maskExtent[3] << " " << maskExtent[4] << " " << maskExtent[5] << std::endl;
 183   mSlicer->ClipDisplayedExtent(maskExtent, mMapperList[mTSlice]->GetInput()->GetWholeExtent());
 184   // std::cout << "maskExtent = " << maskExtent[0] << " " << maskExtent[1] << " " << maskExtent[2] << " "
 185   //        << maskExtent[3] << " " << maskExtent[4] << " " << maskExtent[5] << std::endl;
 186   SetDisplayExtentAndCameraPosition(orientation, mSlice, maskExtent, mImageActorList[mTSlice], 0.0);
 187
 188   // TOO SLOW ?
 189   //mSlicer->Render();
 190
 191   //
 192   mPreviousTSlice = mSlicer->GetTSlice();
 193   mPreviousSlice  = mSlicer->GetSlice();
 194 }
 195 //------------------------------------------------------------------------------
 196
 197
 198 //------------------------------------------------------------------------------
 199 void vvBinaryImageOverlayActor::ComputeExtent(int orientation,
 200                                               int slice,
 201                                               int * inExtent,
 202                                               int * outExtent) {
 203   //  std::cout << "InExtent = " << inExtent[0] << " " << inExtent[1] << " " << inExtent[2] << " "
 204   //        << inExtent[3] << " " << inExtent[4] << " " << inExtent[5] << std::endl;
 205   //  DD(orientation);
 206   switch (orientation) {
 207   case vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_XY:
 208     for(int i=0; i<4; i++) outExtent[i] = inExtent[i];
 209     outExtent[4] = outExtent[5] = slice;
 210     break;
 211   case vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_XZ:
 212     for(int i=0; i<2; i++) outExtent[i] = inExtent[i];
 213     for(int i=4; i<6; i++) outExtent[i] = inExtent[i];
 214     outExtent[2] = outExtent[3] = slice;
 215     break;
 216   case vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_YZ:
 217     for(int i=2; i<6; i++) outExtent[i] = inExtent[i];
 218     outExtent[0] = outExtent[1] = slice;
 219     break;
 220   }
 221   // std::cout << "OutExtent = " << outExtent[0] << " " << outExtent[1] << " " << outExtent[2] << " "
 222   //        << outExtent[3] << " " << outExtent[4] << " " << outExtent[5] << std::endl;
 223 }
 224 //------------------------------------------------------------------------------
 225
 226
 227 //----------------------------------------------------------------------------
 228 void vvBinaryImageOverlayActor::ComputeExtent(int * inExtent, int * outExtent, vtkImageData * image, vtkImageData * overlay)
 229 {
 230   outExtent[0] = (( image->GetOrigin()[0] + inExtent[0]*image->GetSpacing()[0] ) - overlay->GetOrigin()[0]) /
 231     overlay->GetSpacing()[0];
 232   outExtent[1] = (( image->GetOrigin()[0] + inExtent[1]*image->GetSpacing()[0] ) - overlay->GetOrigin()[0]) /
 233     overlay->GetSpacing()[0];
 234   outExtent[2] = (( image->GetOrigin()[1] + inExtent[2]*image->GetSpacing()[1] ) - overlay->GetOrigin()[1]) /
 235     overlay->GetSpacing()[1];
 236   outExtent[3] = (( image->GetOrigin()[1] + inExtent[3]*image->GetSpacing()[1] ) - overlay->GetOrigin()[1]) /
 237     overlay->GetSpacing()[1];
 238   outExtent[4] = (( image->GetOrigin()[2] + inExtent[4]*image->GetSpacing()[2] ) - overlay->GetOrigin()[2]) /
 239     overlay->GetSpacing()[2];
 240   outExtent[5] = (( image->GetOrigin()[2] + inExtent[5]*image->GetSpacing()[2] ) - overlay->GetOrigin()[2]) /
 241     overlay->GetSpacing()[2];
 242 }
 243 //----------------------------------------------------------------------------
 244
 245
 246 //------------------------------------------------------------------------------
 247 void vvBinaryImageOverlayActor::SetDisplayExtentAndCameraPosition(int orientation,
 248                                                                   int slice,
 249                                                                   int * extent,
 250                                                                   vtkImageActor * actor,
 251                                                                   double position) {
 252   //  DD("SetDisplayExtentAndCameraPosition");
 253   //DD(orientation);
 254   //DD(slice);
 255   actor->SetDisplayExtent(extent);
 256
 257
 258   if (orientation == vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_XY) {
 259     if (mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[2] > slice)
 260       actor->SetPosition(0,0, position);
 261     else
 262       actor->SetPosition(0,0, -position);
 263   }
 264   if (orientation == vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_XZ) {
 265     if (mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[1] > slice)
 266       actor->SetPosition(0,position,0);
 267     else
 268       actor->SetPosition(0,-position,0);
 269   }
 270   if (orientation == vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_YZ) {
 271     if (mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[0] > slice)
 272       actor->SetPosition(position,0, 0);
 273     else
 274       actor->SetPosition(-position,0, 0);
 275   }
 276
 277 }
 278 //------------------------------------------------------------------------------
 279
 280
 281
 282