vv/vvBinaryImageOverlayActor.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ======================================================================-====*/
  18
  19 #include "vvBinaryImageOverlayActor.h"
  20 #include "vvImage.h"
  21 #include <vtkImageActor.h>
  22 #include <vtkCamera.h>
  23 #include <vtkRenderer.h>
  24 #include <vtkMarchingSquares.h>
  25 #include <vtkImageClip.h>
  26 #include <vtkImageData.h>
  27 #include <vtkPolyDataMapper.h>
  28 #include <vtkProperty.h>
  29 #include <vtkImageMapToRGBA.h>
  30 #include <vtkLookupTable.h>
  31
  32 //------------------------------------------------------------------------------
  33 vvBinaryImageOverlayActor::vvBinaryImageOverlayActor() {
  34   mTSlice = -1;
  35   mSlice = 0;
  36   mColor.resize(3);
  37   mAlpha = 0.6;
  38   mImage = 0;
  39   mSlicer = 0;
  40 }
  41 //------------------------------------------------------------------------------
  42
  43
  44 //------------------------------------------------------------------------------
  45 vvBinaryImageOverlayActor::~vvBinaryImageOverlayActor() {
  46   for (unsigned int i = 0; i < mSlicer->GetImage()->GetVTKImages().size(); i++) {
  47     mSlicer->GetRenderer()->RemoveActor(mImageActorList[i]);
  48   }
  49   mImageActorList.clear();
  50   mMapperList.clear();
  51 }
  52 //------------------------------------------------------------------------------
  53
  54
  55 //------------------------------------------------------------------------------
  56 void vvBinaryImageOverlayActor::setColor(double r, double g, double b) {
  57   mColor[0] = r;
  58   mColor[1] = g;
  59   mColor[2] = b;
  60 }
  61 //------------------------------------------------------------------------------
  62
  63
  64 //------------------------------------------------------------------------------
  65 void vvBinaryImageOverlayActor::setSlicer(vvSlicer * slicer) {
  66   mSlicer = slicer;
  67 }
  68 //------------------------------------------------------------------------------
  69
  70
  71 //------------------------------------------------------------------------------
  72 void vvBinaryImageOverlayActor::initialize() {
  73   if (!mSlicer) {
  74     std::cerr << "ERROR. Please use setSlicer before setSlicer in vvBinaryImageOverlayActor." << std::endl;
  75     exit(0);
  76   }
  77
  78   if (!mImage) {
  79     std::cerr << "ERROR. Please use setImage before setSlicer in vvBinaryImageOverlayActor." << std::endl;
  80     exit(0);
  81   }
  82   // Create an actor for each time slice
  83   for (unsigned int numImage = 0; numImage < mSlicer->GetImage()->GetVTKImages().size(); numImage++) {
  84     DD(numImage);
  85
  86     // how many intensity ?
  87
  88
  89     vtkImageMapToRGBA * mOverlayMapper = vtkImageMapToRGBA::New();
  90     mOverlayMapper->SetInput(mImage->GetVTKImages()[0]); // DS TODO : to change if it is 4D !!!
  91     vtkLookupTable * lut = vtkLookupTable::New();
  92     DD(lut->IsOpaque ());
  93     lut->SetRange(0,1);
  94     lut->SetNumberOfTableValues(2);
  95     lut->SetTableValue(mBackgroundValue, 0, 0, 0, 0.0);   // BG
  96     lut->SetTableValue(1, mColor[0], mColor[1], mColor[2], mAlpha); // FG
  97     DD(mColor[0]);
  98     mOverlayMapper->SetLookupTable(lut);
  99
 100     vtkImageActor * mOverlayActor = vtkImageActor::New();
 101     mOverlayActor->SetInput(mOverlayMapper->GetOutput());
 102     mOverlayActor->SetPickable(0);
 103     mOverlayActor->SetVisibility(true);
 104     //mOverlayActor->SetOpacity(1.0);
 105
 106     mMapperList.push_back(mOverlayMapper);
 107     mImageActorList.push_back(mOverlayActor);
 108     mSlicer->GetRenderer()->AddActor(mOverlayActor);
 109   }
 110 }
 111 //------------------------------------------------------------------------------
 112
 113
 114 //------------------------------------------------------------------------------
 115 void vvBinaryImageOverlayActor::setImage(vvImage::Pointer image, double bg) {
 116   mImage = image;
 117   mBackgroundValue = bg;
 118 }
 119 //------------------------------------------------------------------------------
 120
 121
 122 //------------------------------------------------------------------------------
 123 void vvBinaryImageOverlayActor::hideActors() {
 124   if (!mSlicer) return;
 125   mSlice = mSlicer->GetSlice();
 126   for(unsigned int i=0; i<mImageActorList.size(); i++) {
 127     mImageActorList[i]->VisibilityOff();
 128   }
 129 }
 130 //------------------------------------------------------------------------------
 131
 132
 133 //------------------------------------------------------------------------------
 134 void vvBinaryImageOverlayActor::showActors() {
 135   if (!mSlicer) return;
 136   mSlice = mSlicer->GetSlice();
 137   mTSlice = mSlicer->GetTSlice();
 138   //  for(unsigned int i=0; i<mSquaresActorList.size(); i++) {
 139   mImageActorList[mTSlice]->VisibilityOn();
 140   update(0, mSlice);
 141   //}
 142 }
 143 //------------------------------------------------------------------------------
 144
 145
 146 //------------------------------------------------------------------------------
 147 void vvBinaryImageOverlayActor::update(int slicer, int slice) {
 148   if (!mSlicer) return;
 149
 150   if (mPreviousSlice == mSlicer->GetSlice()) {
 151     if (mPreviousTSlice == mSlicer->GetTSlice()) {
 152       //DD("=========== NOTHING");
 153       return; // Nothing to do
 154     }
 155   }
 156
 157   // Get current slice
 158   mSlice = mSlicer->GetSlice();
 159   mTSlice = mSlicer->GetTSlice();
 160
 161   // Update extent
 162   int * imageExtent = mSlicer->GetExtent();
 163   int orientation = mSlicer->GetOrientation();
 164   int maskExtent[6];
 165   ComputeExtent(orientation, mSlice, imageExtent, maskExtent);
 166   //ComputeExtent(imageExtent, maskExtent, mSlicer->GetImage()->GetFirstVTKImageData(), mImage->GetFirstVTKImageData());
 167   ComputeExtent(maskExtent, maskExtent, mSlicer->GetImage()->GetFirstVTKImageData(), mImage->GetFirstVTKImageData());
 168   // std::cout << "maskExtent = " << maskExtent[0] << " " << maskExtent[1] << " " << maskExtent[2] << " "
 169   //        << maskExtent[3] << " " << maskExtent[4] << " " << maskExtent[5] << std::endl;
 170   mSlicer->ClipDisplayedExtent(maskExtent, mMapperList[mTSlice]->GetInput()->GetWholeExtent());
 171   // std::cout << "maskExtent = " << maskExtent[0] << " " << maskExtent[1] << " " << maskExtent[2] << " "
 172   //        << maskExtent[3] << " " << maskExtent[4] << " " << maskExtent[5] << std::endl;
 173   SetDisplayExtentAndCameraPosition(orientation, mSlice, maskExtent, mImageActorList[mTSlice], 0.0);
 174
 175   // set previous slice
 176   mPreviousTSlice = mSlicer->GetTSlice();
 177   mPreviousSlice  = mSlicer->GetSlice();
 178 }
 179 //------------------------------------------------------------------------------
 180
 181
 182 //------------------------------------------------------------------------------
 183 void vvBinaryImageOverlayActor::ComputeExtent(int orientation,
 184                                               int slice,
 185                                               int * inExtent,
 186                                               int * outExtent) {
 187   //  std::cout << "InExtent = " << inExtent[0] << " " << inExtent[1] << " " << inExtent[2] << " "
 188   //        << inExtent[3] << " " << inExtent[4] << " " << inExtent[5] << std::endl;
 189   //  DD(orientation);
 190   switch (orientation) {
 191   case vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_XY:
 192     for(int i=0; i<4; i++) outExtent[i] = inExtent[i];
 193     outExtent[4] = outExtent[5] = slice;
 194     break;
 195   case vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_XZ:
 196     for(int i=0; i<2; i++) outExtent[i] = inExtent[i];
 197     for(int i=4; i<6; i++) outExtent[i] = inExtent[i];
 198     outExtent[2] = outExtent[3] = slice;
 199     break;
 200   case vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_YZ:
 201     for(int i=2; i<6; i++) outExtent[i] = inExtent[i];
 202     outExtent[0] = outExtent[1] = slice;
 203     break;
 204   }
 205   // std::cout << "OutExtent = " << outExtent[0] << " " << outExtent[1] << " " << outExtent[2] << " "
 206   //        << outExtent[3] << " " << outExtent[4] << " " << outExtent[5] << std::endl;
 207 }
 208 //------------------------------------------------------------------------------
 209
 210
 211 //----------------------------------------------------------------------------
 212 void vvBinaryImageOverlayActor::ComputeExtent(int * inExtent, int * outExtent, vtkImageData * image, vtkImageData * overlay)
 213 {
 214   outExtent[0] = (( image->GetOrigin()[0] + inExtent[0]*image->GetSpacing()[0] ) - overlay->GetOrigin()[0]) /
 215     overlay->GetSpacing()[0];
 216   outExtent[1] = (( image->GetOrigin()[0] + inExtent[1]*image->GetSpacing()[0] ) - overlay->GetOrigin()[0]) /
 217     overlay->GetSpacing()[0];
 218   outExtent[2] = (( image->GetOrigin()[1] + inExtent[2]*image->GetSpacing()[1] ) - overlay->GetOrigin()[1]) /
 219     overlay->GetSpacing()[1];
 220   outExtent[3] = (( image->GetOrigin()[1] + inExtent[3]*image->GetSpacing()[1] ) - overlay->GetOrigin()[1]) /
 221     overlay->GetSpacing()[1];
 222   outExtent[4] = (( image->GetOrigin()[2] + inExtent[4]*image->GetSpacing()[2] ) - overlay->GetOrigin()[2]) /
 223     overlay->GetSpacing()[2];
 224   outExtent[5] = (( image->GetOrigin()[2] + inExtent[5]*image->GetSpacing()[2] ) - overlay->GetOrigin()[2]) /
 225     overlay->GetSpacing()[2];
 226 }
 227 //----------------------------------------------------------------------------
 228
 229
 230 //------------------------------------------------------------------------------
 231 void vvBinaryImageOverlayActor::SetDisplayExtentAndCameraPosition(int orientation,
 232                                                                   int slice,
 233                                                                   int * extent,
 234                                                                   vtkImageActor * actor,
 235                                                                   double position) {
 236   actor->SetDisplayExtent(extent);
 237
 238   // Set position
 239   if (orientation == vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_XY) {
 240     if (mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[2] > slice)
 241       actor->SetPosition(0,0, position);
 242     else
 243       actor->SetPosition(0,0, -position);
 244   }
 245   if (orientation == vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_XZ) {
 246     if (mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[1] > slice)
 247       actor->SetPosition(0,position,0);
 248     else
 249       actor->SetPosition(0,-position,0);
 250   }
 251   if (orientation == vtkImageViewer2::SLICE_ORIENTATION_YZ) {
 252     if (mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[0] > slice)
 253       actor->SetPosition(position,0, 0);
 254     else
 255       actor->SetPosition(-position,0, 0);
 256   }
 257
 258 }
 259 //------------------------------------------------------------------------------
 260
 261
 262
 263