vv/vvDeformableRegistration.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ======================================================================-====*/
  18 #ifndef VV_DEFORMABLE_REGISTRATION
  19 #define VV_DEFORMABLE_REGISTRATION
  20 #include <QMutex>
  21 #include <QString>
  22 class string;
  23 class QThread;
  24 class vvImage;
  25 #include "vvImage.h"
  26
  27 class vvDeformableRegistration : public QThread
  28 {
  29 public:
  30     vvDeformableRegistration(vvImage::Pointer image,unsigned int ref,\
  31                              unsigned int iter,  unsigned int nthread,double a, double s,\
  32                              std::string output_f,unsigned int stop);
  33     unsigned int getProgress();
  34     void abort();
  35     QMutex progress_mutex;
  36     void run();
  37     vvImage::Pointer getOutput() {
  38         return mOutput;
  39     }
  40 protected:
  41     vvImage::Pointer mImage;
  42     vvImage::Pointer  mOutput;
  43     unsigned int refimage,nb_iter,n_thread,progress,stop;
  44     double alpha,sigma;
  45     std::string output_filename;
  46     bool aborted;
  47     void cleanup(int);
  48     void partial_run(int,int,int,std::string);
  49     ///Temporary path, specific to the current instance of vv
  50     QString mTempPath;
  51 };
  52
  53
  54 #endif
  55