vv/vvImageContour.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ===========================================================================**/
  18
  19 #include "vvImageContour.h"
  20 #include "vvImage.h"
  21 #include <vtkImageActor.h>
  22 #include <vtkCamera.h>
  23 #include <vtkRenderer.h>
  24 #include <vtkMarchingSquares.h>
  25 #include <vtkImageClip.h>
  26 #include <vtkImageData.h>
  27 #include <vtkPolyDataMapper.h>
  28 #include <vtkProperty.h>
  29
  30 //------------------------------------------------------------------------------
  31 vvImageContour::vvImageContour()
  32 {
  33   mTSlice = -1;
  34   mSlice = 0;
  35   mHiddenImageIsUsed = false;
  36   mDisplayModeIsPreserveMemory = true;
  37   SetPreserveMemoryModeEnabled(true);
  38   mPreviousOrientation = -1;
  39 }
  40 //------------------------------------------------------------------------------
  41
  42
  43 //------------------------------------------------------------------------------
  44 vvImageContour::~vvImageContour()
  45 {
  46   for (unsigned int i = 0; i < mSlicer->GetImage()->GetVTKImages().size(); i++) {
  47     mSlicer->GetRenderer()->RemoveActor(mSquaresActorList[i]);
  48   }
  49 }
  50 //------------------------------------------------------------------------------
  51
  52
  53 //------------------------------------------------------------------------------
  54 void vvImageContour::SetSlicer(vvSlicer * slicer) {
  55   mSlicer = slicer;
  56   // Create an actor for each time slice
  57   for (unsigned int numImage = 0; numImage < mSlicer->GetImage()->GetVTKImages().size(); numImage++) {
  58     CreateNewActor(numImage);
  59   }
  60 }
  61 //------------------------------------------------------------------------------
  62
  63
  64 //------------------------------------------------------------------------------
  65 void vvImageContour::SetImage(vvImage * image) {
  66   for (unsigned int numImage = 0; numImage < image->GetVTKImages().size(); numImage++) {
  67     mClipperList[numImage]->SetInput(image->GetVTKImages()[numImage]);
  68   }
  69   mHiddenImageIsUsed = true;
  70   mHiddenImage = image;
  71 }
  72 //------------------------------------------------------------------------------
  73
  74
  75 //------------------------------------------------------------------------------
  76 void vvImageContour::SetPreserveMemoryModeEnabled(bool b) {
  77   // FastCache mode work only if threshold is always the same
  78   if (mDisplayModeIsPreserveMemory == b) return;
  79   mDisplayModeIsPreserveMemory = b;
  80   if (!b) {
  81     clitkExceptionMacro("TODO : not implemented yet");
  82     HideActors();
  83     InitializeCacheMode();
  84   }
  85   else {
  86     for(unsigned int d=0; d<mListOfCachedContourActors.size(); d++)
  87       mListOfCachedContourActors[d].clear();
  88     mListOfCachedContourActors.clear();
  89     ShowActors();
  90   }
  91 }
  92 //------------------------------------------------------------------------------
  93
  94
  95 //------------------------------------------------------------------------------
  96 void vvImageContour::SetColor(double r, double g, double b) {
  97   for(unsigned int i=0; i<mSquaresActorList.size(); i++) {
  98     mSquaresActorList[i]->GetProperty()->SetColor(r,g,b);
  99   }
 100 }
 101 //------------------------------------------------------------------------------
 102
 103
 104 //------------------------------------------------------------------------------
 105 void vvImageContour::SetLineWidth(double w)
 106 {
 107   for(unsigned int i=0; i<mSquaresActorList.size(); i++) {
 108     mSquaresActorList[i]->GetProperty()->SetLineWidth(w);
 109   }
 110 }
 111 //------------------------------------------------------------------------------
 112
 113
 114 //------------------------------------------------------------------------------
 115 void vvImageContour::HideActors() {
 116   if (!mSlicer) return;
 117   mSlice = mSlicer->GetSlice();
 118   for(unsigned int i=0; i<mSquaresActorList.size(); i++) {
 119     mSquaresActorList[i]->VisibilityOff();
 120   }
 121 }
 122 //------------------------------------------------------------------------------
 123
 124
 125 //------------------------------------------------------------------------------
 126 void vvImageContour::ShowActors() {
 127   if (!mSlicer) return;
 128   mSlice = mSlicer->GetSlice();
 129   mTSlice = mSlicer->GetTSlice();
 130   mSquaresActorList[mTSlice]->VisibilityOn();
 131   Update(mValue);
 132 }
 133 //------------------------------------------------------------------------------
 134
 135
 136 //------------------------------------------------------------------------------
 137 void vvImageContour::Update(double value) {
 138   std::cout << "vvImageContour::Update " << value << std::endl;
 139   if (!mSlicer) return;
 140   if (mPreviousValue == value) {
 141     if (mPreviousSlice == mSlicer->GetSlice()) {
 142       if (mPreviousTSlice == mSlicer->GetTSlice()) {
 143         if (mPreviousOrientation == ComputeCurrentOrientation()) {
 144           std::cout << "Nothing to do" << std::endl;
 145           return; // Nothing to do
 146         }
 147       }
 148     }
 149   }
 150
 151   // Get current threshold value
 152   mValue = value;
 153
 154   // Get current slice
 155   mSlice = mSlicer->GetSlice();
 156
 157   if (mDisplayModeIsPreserveMemory) {
 158     UpdateWithPreserveMemoryMode();
 159   }
 160   else {
 161     UpdateWithFastCacheMode();
 162   }
 163
 164   //  mSlicer->Render(); //DS ---> REMOVE ??
 165
 166   mPreviousTSlice = mSlicer->GetTSlice();
 167   mPreviousSlice  = mSlicer->GetSlice();
 168   mPreviousValue  = value;
 169   mPreviousOrientation = ComputeCurrentOrientation();
 170 }
 171 //------------------------------------------------------------------------------
 172
 173
 174 //------------------------------------------------------------------------------
 175 void vvImageContour::UpdateWithPreserveMemoryMode() {
 176   // Only change actor visibility if tslice change
 177   int mPreviousTslice = mTSlice;
 178   mTSlice = mSlicer->GetTSlice();
 179
 180   vtkMarchingSquares * mSquares = mSquaresList[mTSlice];
 181   vtkPolyDataMapper* mapper = mSquaresMapperList[mTSlice];
 182   vtkImageClip * mClipper = mClipperList[mTSlice];
 183   vtkActor * mSquaresActor = mSquaresActorList[mTSlice];
 184   int orientation = ComputeCurrentOrientation();
 185
 186   UpdateActor(mSquaresActor, mapper, mSquares, mClipper, mValue, orientation, mSlice);
 187   //mSquaresActorList[mTSlice]->VisibilityOn();
 188
 189   if (mPreviousTslice != mTSlice) {
 190     if (mPreviousTslice != -1) mSquaresActorList[mPreviousTslice]->VisibilityOff();
 191   }
 192 }
 193 //------------------------------------------------------------------------------
 194
 195
 196 //------------------------------------------------------------------------------
 197 void vvImageContour::InitializeCacheMode() {
 198 clitkExceptionMacro("TODO : not implemented yet");
 199   mPreviousSlice = mPreviousOrientation = 0;
 200   int dim = mSlicer->GetImage()->GetNumberOfDimensions();
 201
 202   mListOfCachedContourActors.resize(dim);
 203   for(int d=0; d<dim; d++) {
 204     int size = mSlicer->GetImage()->GetSize()[d];
 205     mListOfCachedContourActors[d].resize(size);
 206     for(int j=0; j<size; j++) {
 207       mListOfCachedContourActors[d][j] = NULL;
 208     }
 209   }
 210 }
 211 //------------------------------------------------------------------------------
 212
 213
 214 //------------------------------------------------------------------------------
 215 int vvImageContour::ComputeCurrentOrientation() {
 216   // Get extent of image in the slicer
 217   int* extent = mSlicer->GetImageActor()->GetDisplayExtent();
 218
 219   // Compute orientation
 220   int orientation;
 221   for (orientation = 0; orientation < 6; orientation = orientation+2) {
 222     if (extent[orientation] == extent[orientation+1]) {
 223       break;
 224     }
 225   }
 226   orientation = orientation/2;
 227   return orientation;
 228 }
 229 //------------------------------------------------------------------------------
 230
 231
 232 //------------------------------------------------------------------------------
 233 void vvImageContour::UpdateWithFastCacheMode() {
 234 clitkExceptionMacro("TODO : not implemented yet");
 235
 236   // Compute orientation
 237   int orientation = ComputeCurrentOrientation();
 238
 239   if ((mPreviousSlice == mSlice) && (mPreviousOrientation == orientation)) return;
 240
 241   vtkActor * actor = mListOfCachedContourActors[orientation][mSlice];
 242   if (actor != NULL) {
 243     mListOfCachedContourActors[orientation][mSlice]->VisibilityOn();
 244   } else {
 245     CreateNewActor(0);
 246     //SR: commented out, this code is never reached anyway
 247     //UpdateActor(mSquaresActor, mSquares, mClipper, mValue, orientation, mSlice);
 248     //mListOfCachedContourActors[orientation][mSlice] = mSquaresActor;
 249     //mSquaresActor->VisibilityOn();
 250   }
 251
 252   if (mListOfCachedContourActors[mPreviousOrientation][mPreviousSlice] != NULL)
 253     mListOfCachedContourActors[mPreviousOrientation][mPreviousSlice]->VisibilityOff();
 254   mPreviousSlice = mSlice;
 255   mPreviousOrientation = orientation;
 256 }
 257 //------------------------------------------------------------------------------
 258
 259
 260 //------------------------------------------------------------------------------
 261 void vvImageContour::CreateNewActor(int numImage) {
 262   vtkSmartPointer<vtkActor> squaresActor = vtkSmartPointer<vtkActor>::New();
 263   vtkSmartPointer<vtkImageClip> clipper = vtkSmartPointer<vtkImageClip>::New();
 264   vtkSmartPointer<vtkMarchingSquares> squares = vtkSmartPointer<vtkMarchingSquares>::New();
 265   vtkSmartPointer<vtkPolyDataMapper> squaresMapper = vtkSmartPointer<vtkPolyDataMapper>::New();
 266
 267   if (mHiddenImageIsUsed)
 268     clipper->SetInput(mHiddenImage->GetVTKImages()[0]);
 269   else
 270     clipper->SetInput(mSlicer->GetImage()->GetVTKImages()[numImage]);
 271   squares->SetInput(clipper->GetOutput());
 272   squaresMapper->SetInput(squares->GetOutput());
 273   squaresMapper->ScalarVisibilityOff();
 274   squaresActor->SetMapper(squaresMapper);
 275   squaresActor->GetProperty()->SetColor(1.0,0,0);
 276   squaresActor->SetPickable(0);
 277   squaresActor->VisibilityOff();
 278   mSlicer->GetRenderer()->AddActor(squaresActor);
 279
 280   mSquaresActorList.push_back(squaresActor);
 281   mClipperList.push_back(clipper);
 282   mSquaresList.push_back(squares);
 283   mSquaresMapperList.push_back(squaresMapper);
 284 }
 285 //------------------------------------------------------------------------------
 286
 287
 288 //------------------------------------------------------------------------------
 289 void vvImageContour::UpdateActor(vtkActor * actor,
 290                                  vtkPolyDataMapper * mapper,
 291                                  vtkMarchingSquares * squares,
 292                                  vtkImageClip * clipper,
 293                                  double threshold, int orientation, int slice) {
 294   std::cout << "vvImageContour::UpdateActor" << std::endl;
 295
 296    // Set parameter for the MarchigSquare
 297   squares->SetValue(0, threshold);
 298
 299   // Get image extent
 300   int* extent = mSlicer->GetImageActor()->GetDisplayExtent();
 301
 302   // Change extent if needed
 303   int* extent2;
 304   if (mHiddenImageIsUsed) {
 305     extent2 = new int[6];
 306     int * extent3;
 307     extent3 = mHiddenImage->GetFirstVTKImageData()->GetExtent();
 308
 309     for(int i=0; i<6; i++) extent2[i] = extent3[i];
 310
 311     double s = (double)extent[orientation*2]*(double)mSlicer->GetImage()->GetSpacing()[orientation]; // in mm
 312     s = s+mSlicer->GetImage()->GetOrigin()[orientation]; // from origin
 313     s = s-mHiddenImage->GetFirstVTKImageData()->GetOrigin()[orientation]; // from corner second image
 314     s = s/mHiddenImage->GetFirstVTKImageData()->GetSpacing()[orientation]; // in voxel
 315
 316     if (s == floor(s)) {
 317       extent2[orientation*2] = extent2[orientation*2+1] = (int)floor(s);
 318     } else {
 319       extent2[orientation*2] = (int)floor(s);
 320       extent2[orientation*2+1] = extent2[orientation*2];
 321     }
 322
 323     // Do not display a contour if there is no contour on this slice
 324     if (extent2[orientation*2+1] > extent3[orientation*2+1]) {
 325       actor->VisibilityOff();
 326       return;
 327     }
 328     else actor->VisibilityOn();
 329
 330   } else {
 331     extent2 = extent;
 332   }
 333
 334   clipper->SetOutputWholeExtent(extent2[0],extent2[1],extent2[2],
 335                                 extent2[3],extent2[4],extent2[5]);
 336
 337   if (mHiddenImageIsUsed) delete extent2;
 338
 339   // Move the actor to be visible
 340   double position[3] = {0, 0, 0};
 341   position[orientation] = -1;
 342   actor->SetPosition(position);
 343
 344 //   switch (orientation)  {
 345 //   case 0:
 346 //     actor->SetPosition(-1,0,0);
 347 //     /*
 348 //     // DD(mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[0]);
 349 //     if (mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[0] > slice) {
 350 //     actor->SetPosition(1,0,0);
 351 //     } else {
 352 //       actor->SetPosition(-1,0,0);
 353 //       }*/
 354 //     break;
 355 //   case 1:
 356 //     actor->SetPosition(0,-1,0);
 357 //     /*
 358 //     // DD(mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[1]);
 359 //     if (mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[1] > slice) {
 360 //       actor->SetPosition(0,1,0);
 361 //     } else {
 362 //       actor->SetPosition(0,-1,0);
 363 //     }
 364 //     */
 365 //     break;
 366 //   case 2:
 367 //     actor->SetPosition(0,0,-1);
 368 //     /*
 369 //     DD(mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[2]);
 370 //     if (mSlicer->GetRenderer()->GetActiveCamera()->GetPosition()[2] > slice) {
 371 //       DD("1");
 372 //       actor->SetPosition(0,0,1);
 373 //     } else {
 374 //      DD("-1");
 375 //       actor->SetPosition(0,0,-1);
 376 //     }
 377 //     */
 378 //     break;
 379 //   }
 380
 381   mapper->Update();
 382   actor->VisibilityOn();
 383 }
 384 //------------------------------------------------------------------------------
 385
 386