vv/vvImageReader.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ======================================================================-====*/
  18 #ifndef vvImageReader_H
  19 #define vvImageReader_H
  20 #include <string>
  21 #include <vector>
  22 #include <QThread>
  23
  24 #include "itkCommand.h"
  25 #include "vvImage.h"
  26 #include "vvConstants.h"
  27
  28 class vvImageReader : public QThread {
  29
  30 public:
  31     vvImageReader();
  32     ~vvImageReader();
  33
  34     void SetInputFilename(const std::string & filename);
  35     void SetInputFilenames(const std::vector<std::string> & filenames);
  36
  37     vvImage::Pointer GetOutput() {
  38         return mImage;
  39     }
  40
  41     std::string GetLastError() {
  42         return mLastError;
  43     }
  44
  45     //====================================================================
  46     // Main function
  47     void Update();
  48     void Update(LoadedImageType type);
  49     void Update(int dim, std::string InputPixelType, LoadedImageType type);
  50     //void Extract(int dim, std::string InputPixelType, int slice);
  51
  52 protected:
  53     void run();
  54     //====================================================================
  55     std::vector<std::string> mInputFilenames;
  56     ///Method used to load the image, see vvConstants.h for definition
  57     LoadedImageType mType;
  58     itk::Command::Pointer mObserver;
  59
  60     std::string mLastError;
  61
  62     //====================================================================
  63     template<unsigned int VImageDimension>
  64     void UpdateWithDim(std::string inputPixelType);
  65
  66     //====================================================================
  67     /*template<unsigned int VImageDimension>
  68     void ExtractWithDim(std::string inputPixelType, int slice);*/
  69
  70     //====================================================================
  71     template<class InputPixelType, unsigned int VImageDimension>
  72     void UpdateWithDimAndInputPixelType();
  73     ///Input dimension and pixel type
  74     int mDim;
  75     std::string mInputPixelType;
  76
  77     //====================================================================
  78     void ReadNkiImageTransform();
  79     void ReadMatImageTransform();
  80 private:
  81     vvImage::Pointer mImage;
  82
  83 }; // end class vvImageReader
  84
  85 #endif /* end #define CLITKvvImageReader_H */
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