vv/vvImageReader.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ======================================================================-====*/
  18 #ifndef vvImageReader_H
  19 #define vvImageReader_H
  20 #include <string>
  21 #include <vector>
  22 #include <QThread>
  23
  24 #include "itkCommand.h"
  25 #include "vvImage.h"
  26 #include "vvConstants.h"
  27
  28 class vvImageReader : public QThread {
  29
  30 public:
  31     vvImageReader();
  32     ~vvImageReader();
  33
  34     void SetInputFilename(const std::string & filename);
  35     void SetInputFilenames(const std::vector<std::string> & filenames);
  36
  37     vvImage::Pointer GetOutput() {
  38         return mImage;
  39     }
  40
  41     std::string GetLastError() {
  42         return mLastError;
  43     }
  44
  45     void SetSlice(unsigned int i) { mSlice = i; }
  46
  47     //====================================================================
  48     // Main function
  49     void Update();
  50     void Update(LoadedImageType type);
  51     void Update(int dim, std::string InputPixelType, LoadedImageType type);
  52
  53 protected:
  54     void run();
  55     //====================================================================
  56     std::vector<std::string> mInputFilenames;
  57     ///Method used to load the image, see vvConstants.h for definition
  58     LoadedImageType mType;
  59     unsigned int mSlice;
  60     itk::Command::Pointer mObserver;
  61
  62     std::string mLastError;
  63
  64     //====================================================================
  65     template<unsigned int VImageDimension>
  66     void UpdateWithDim(std::string inputPixelType);
  67
  68     //====================================================================
  69     /*template<unsigned int VImageDimension>
  70     void ExtractWithDim(std::string inputPixelType, int slice);*/
  71
  72     //====================================================================
  73     template<class InputPixelType, unsigned int VImageDimension>
  74     void UpdateWithDimAndInputPixelType();
  75     ///Input dimension and pixel type
  76     int mDim;
  77     std::string mInputPixelType;
  78
  79     //====================================================================
  80     void ReadNkiImageTransform();
  81     void ReadMatImageTransform();
  82 private:
  83     vvImage::Pointer mImage;
  84
  85 }; // end class vvImageReader
  86
  87 #endif /* end #define CLITKvvImageReader_H */
  88