vv/vvImageReader.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ======================================================================-====*/
  18 #ifndef vvImageReader_H
  19 #define vvImageReader_H
  20 #include <string>
  21 #include <vector>
  22 #include <QThread>
  23
  24 #include "itkCommand.h"
  25 #include "vvImage.h"
  26 #include "vvConstants.h"
  27
  28 class vvImageReader : public itk::LightObject, public QThread {
  29
  30 public:
  31   typedef vvImageReader Self;
  32   typedef itk::SmartPointer<Self> Pointer;
  33   itkNewMacro(Self);
  34
  35   void SetInputFilename(const std::string & filename);
  36   void SetInputFilenames(const std::vector<std::string> & filenames);
  37
  38   vvImage::Pointer GetOutput() {
  39       return mImage;
  40   }
  41
  42   std::string GetLastError() {
  43       return mLastError;
  44   }
  45
  46   void SetSlice(unsigned int i) { mSlice = i; }
  47
  48   //====================================================================
  49   // Main function
  50   void Update();
  51   void Update(LoadedImageType type);
  52   void Update(int dim, std::string InputPixelType, LoadedImageType type);
  53
  54 protected:
  55   void run();
  56   //====================================================================
  57   std::vector<std::string> mInputFilenames;
  58   ///Method used to load the image, see vvConstants.h for definition
  59   LoadedImageType mType;
  60   unsigned int mSlice;
  61   itk::Command::Pointer mObserver;
  62
  63   std::string mLastError;
  64
  65   //====================================================================
  66   template<unsigned int VImageDimension>
  67   void UpdateWithDim(std::string inputPixelType);
  68
  69   //====================================================================
  70   /*template<unsigned int VImageDimension>
  71   void ExtractWithDim(std::string inputPixelType, int slice);*/
  72
  73   //====================================================================
  74   template<class InputPixelType, unsigned int VImageDimension>
  75   void UpdateWithDimAndInputPixelType();
  76   ///Input dimension and pixel type
  77   int mDim;
  78   std::string mInputPixelType;
  79
  80   //====================================================================
  81   void ReadNkiImageTransform();
  82   void ReadMatImageTransform();
  83 private:
  84   vvImageReader();
  85   ~vvImageReader();
  86
  87   vvImage::Pointer mImage;
  88 }; // end class vvImageReader
  89
  90 #endif /* end #define CLITKvvImageReader_H */
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