vv/vvMainWindow.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18
  19 #ifndef VVMAINWINDOW_H
  20 #define VVMAINWINDOW_H
  21
  22 #include <iostream>
  23 #include <vector>
  24 #include "ui_vvMainWindow.h"
  25 #include "vvMainWindowBase.h"
  26 #include "vvToolManager.h"
  27 #include "vvImageReader.h"
  28 #include "vvMesh.h"
  29 #include "clitkMemoryUsage.h"
  30
  31 #include "vtkSmartPointer.h"
  32
  33
  34 class vvSlicerManager;
  35 class vvHelpDialog;
  36 class vvDocumentation;
  37 class vtkRenderWindowInteractor;
  38 class vtkImageData;
  39 class vtkRenderer;
  40 class vtkMatrix4x4;
  41 class vvDicomSeriesSelector;
  42 class vvSlicer;
  43 class QTreeWidget;
  44
  45 //------------------------------------------------------------------------------
  46 class vvMainWindow: public vvMainWindowBase,
  47                     private Ui::vvMainWindow
  48 {
  49   Q_OBJECT
  50
  51   public:
  52   vvMainWindow();
  53   ~vvMainWindow();
  54   void LoadImages(std::vector<std::string> filenames, vvImageReader::LoadedImageType type);
  55   vvSlicerManager * AddImage(vvImage::Pointer image,std::string filename);
  56   void AddField(QString file,int index);
  57   void AddOverlayImage(int index, std::vector<std::string> fileNames, vvImageReader::LoadedImageType type);
  58   void AddFusionImage(int index, QString filename);
  59   void AddROI(int index, QString filename);
  60   //Process the sequence for fusion:
  61   void AddFusionSequence(int index, std::vector<std::string> fileNames, vvImageReader::LoadedImageType type);
  62
  63   ///Adds a mesh to a SlicerManager, with optional warping by vector field
  64   void AddContour(int image_index, vvMesh::Pointer contour, bool propagation);
  65   ///This is used to show an image when opened or computed
  66   void ShowLastImage();
  67   void SaveCurrentStateAs(const std::string& stateFile);
  68   void ReadSavedStateFile(const std::string& stateFile);
  69         void LinkAllImages();
  70   QString Get4x4MatrixDoubleAsString(vtkSmartPointer<vtkMatrix4x4> matrix, const int precision=3);
  71
  72   virtual void UpdateCurrentSlicer();
  73   virtual QTabWidget * GetTab();
  74   QTreeWidget* GetTree() { return DataTree; }
  75   //vvMainWindowToolInfo * GetInfoForTool();
  76 //   void AddRunningTool(vvToolCreatorBase * tool);
  77
  78 public slots:
  79   ///Allows the user to open and select various surfaces contained in a dicom-struct file
  80   void AddDCStructContour(int index, QString file);
  81   void OpenDCStructContour();
  82   ///Computes the midposition image of a 4D sequence with a VF and displays it
  83   void ComputeMidPosition();
  84   void OpenImages();
  85   ///Slot triggered by the dynamically-generated recent file menu actions
  86   void OpenRecentImage();
  87   void OpenImageWithTime();
  88   void MergeImages();
  89   void SliceImages();
  90   void MergeImagesWithTime();
  91   void OpenDicom();
  92   ///Open a vtkPolyData surface mesh and display it over the current image
  93   void OpenVTKContour();
  94   void SaveAs();
  95   void SaveCurrentState();
  96   void ReadSavedState();
  97   void CurrentImageChanged(std::string id);
  98   void CurrentPickedImageChanged(std::string id);
  99   void ImageInfoChanged();
 100   void ShowHelpDialog();
 101   void ShowDocumentation();
 102   void PopupRegisterForm(bool checkCanPush=false);
 103   void ComputeDeformableRegistration();
 104   void WarpImage();
 105   void ChangeViewMode();
 106   void DisplayChanged(QTreeWidgetItem *item, int column);
 107   void CloseImage(QTreeWidgetItem* item, int column);
 108   void ReloadImage(QTreeWidgetItem* item, int column);
 109   void MousePositionChanged(int visibility, double x, double y, double z, double X, double Y, double Z , double value);
 110   void VectorChanged(int visibility, double x, double y, double z, double value);
 111   void OverlayChanged(int visibility, double valueOver, double valueRef);
 112   void FusionChanged(int visibility, double value);
 113   //void FusionSequenceChanged(int visibility, double value);
 114   void SegmentationOnCurrentImage();
 115   void SurfaceViewerLaunch();
 116
 117   void WindowLevelChanged();
 118   void UpdateSlice(int slicer, int slice);
 119   void UpdateTSlice(int slicer, int slice, int code=-1);
 120   void UpdateSliceRange(int slicer, int min, int max, int tmin, int tmax);
 121   void WindowLevelEdited();
 122   void SetWindowLevel(double w, double l);
 123   void UpdateColorMap();
 124   void UpdateWindowLevel();
 125   void UpdateSlicingPreset();
 126   void SwitchWindowLevel();
 127   void ApplyWindowLevelToAllImages();
 128   void ApplyWindowToSetOfImages(double window, unsigned int indexMin, unsigned int indexMax);
 129   void ApplyLevelToSetOfImages(double level, unsigned int indexMin, unsigned int indexMax);
 130   void UpdateLinkManager(std::string id, int slicer, double x, double y, double z, int temps);
 131   void UpdateLinkedNavigation(std::string id, vvSlicerManager *sm, vvSlicer* refSlicer);
 132   void AddLink(QString image1,QString image2,bool fromPanel = true);
 133   void RemoveLink(QString image1,QString image2);
 134   void ChangeImageWithIndexOffset(vvSlicerManager *sm, int slicer, int offset);
 135
 136   ///Generic method called when any one of the horizontal sliders is moved
 137   void HorizontalSliderMoved(int value,int column, int slicer_index);
 138   void NOHorizontalSliderMoved();
 139   void NEHorizontalSliderMoved();
 140   void SOHorizontalSliderMoved();
 141   void SEHorizontalSliderMoved();
 142
 143   void NOVerticalSliderChanged();
 144   void NEVerticalSliderChanged();
 145   void SOVerticalSliderChanged();
 146   void SEVerticalSliderChanged();
 147
 148   void SaveNEScreenshot();
 149   void SaveNOScreenshot();
 150   void SaveSEScreenshot();
 151   void SaveSOScreenshot();
 152   void SaveScreenshotAllSlices();
 153
 154   void ShowContextMenu(QPoint point);
 155   void CloseImage();
 156   void ReloadImage();
 157   void OpenField();
 158   void SelectOverlayImage();
 159   void SelectFusionImage();
 160   //select the file(s) from the disk containing the image sequence to fuse
 161   void SelectFusionSequence();
 162   void SelectFusionSequenceTemporalSignal();
 163
 164   void ResetTransformationToIdentity();
 165
 166   void SetVFProperty(int subsampling,int scale,int lut, int width, double r, double g, double b);
 167   void SetOverlayProperty(int color, int linked, double window, double level);
 168   void SetFusionProperty(int opacity, int tresOpacity, int colormap,double window,double level, bool showLegend);
 169   void SetFusionSequenceProperty(int fusionSequenceFrameIndex, bool spatialSyncFlag, unsigned int fusionSequenceNbFrames, bool temporalSyncFlag);
 170
 171   void GoToCursor();
 172   void PlayPause();
 173   void PlayNext();
 174   void ChangeFrameRate(int rate) {
 175     mFrameRate = rate;
 176   }
 177   void UpdateRenderWindows();
 178   void UpdateMemoryUsage();
 179   void show();
 180
 181 protected:
 182
 183   void createRecentlyOpenedFilesMenu();
 184   void updateRecentlyOpenedFilesMenu(const std::list<std::string> &files);
 185
 186 private:
 187
 188   //variables
 189   // std::vector<vvSlicerManager*> mSlicerManagers;
 190   vvHelpDialog *help_dialog;
 191   vvDocumentation *documentation;
 192   vvDicomSeriesSelector *dicomSeriesSelector;
 193
 194   bool viewMode;
 195   bool playMode;
 196
 197   //functions
 198   void UpdateTree();
 199   ///Adds a vector field to slicer manager index
 200   void WarpImage(vvSlicerManager* selected_slicer,int reference_phase);
 201   void AddFieldEntry(QString filename,int index,bool from_disk);
 202   void AddField(vvImage::Pointer vf,QString file,int index);
 203   void InitDisplay();
 204   ///Sets the render window and LUT for the last SlicerManager
 205   void InitSlicers();
 206   void DisplaySliders(int slicer, int window);
 207   QString GetSizeInBytes(unsigned long size);
 208   QString GetVectorDoubleAsString(std::vector<double> vectorDouble);
 209   QString GetVectorIntAsString(std::vector<int> vectorInt);
 210   int GetSlicerIndexFromItem(QTreeWidgetItem* item); //this actually returns the SlicerManager index TODO: rename it to GetSlicerManagerIndexFromItem
 211   QTreeWidgetItem* GetItemFromSlicerManager(vvSlicerManager* sm);
 212   void SaveScreenshot(QVTKWidget *widget);
 213   int GetImageDuplicateFilenameNumber(std::string filename);
 214
 215   QMenu contextMenu;
 216   QMenu* recentlyOpenedFilesMenu;
 217   //QMenu *AddSubImageMenu;
 218   std::vector<QAction*> contextActions;
 219   std::vector<QSlider*> horizontalSliders;
 220   std::vector<QSlider*> verticalSliders;
 221   int mFrameRate;
 222
 223   std::string mCurrentSelectedImageId;
 224   std::string mCurrentPickedImageId;
 225   unsigned int mCurrentPickedImageIndex;
 226
 227   // vvMainWindowToolInfo * mCurrentToolInfo;
 228   // std::vector<vvToolCreatorBase*> mListOfRunningTool;
 229
 230   static vvMainWindow * mSingleton;
 231
 232   int mCurrentTime;
 233
 234 };
 235
 236 #endif