vv/vvMainWindow.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18
  19 #ifndef VVMAINWINDOW_H
  20 #define VVMAINWINDOW_H
  21
  22 #include <iostream>
  23 #include <vector>
  24 #include "ui_vvMainWindow.h"
  25 #include "vvMainWindowBase.h"
  26 #include "vvToolManager.h"
  27 #include "vvImageReader.h"
  28 #include "vvMesh.h"
  29 #include "clitkMemoryUsage.h"
  30
  31 #include "vtkSmartPointer.h"
  32
  33
  34 class vvSlicerManager;
  35 class vvHelpDialog;
  36 class vvDocumentation;
  37 class vtkRenderWindowInteractor;
  38 class vtkImageData;
  39 class vtkRenderer;
  40 class vtkMatrix4x4;
  41 class vvDicomSeriesSelector;
  42 class vvQPacsConnection;
  43 class vvSlicer;
  44 class QTreeWidget;
  45
  46 //------------------------------------------------------------------------------
  47 class vvMainWindow: public vvMainWindowBase,
  48                     private Ui::vvMainWindow
  49 {
  50   Q_OBJECT
  51
  52   public:
  53   vvMainWindow();
  54   ~vvMainWindow();
  55   void LoadImages(std::vector<std::string> filenames, vvImageReader::LoadedImageType type);
  56   vvSlicerManager * AddImage(vvImage::Pointer image,std::string filename);
  57   void AddField(QString file,int index);
  58   void AddOverlayImage(int index, std::vector<std::string> fileNames, vvImageReader::LoadedImageType type);
  59   void AddFusionImage(int index, std::vector<std::string> fileNames, vvImageReader::LoadedImageType type);
  60   void AddROI(int index, QString filename);
  61
  62   //Process the sequence for fusion:
  63   void AddFusionSequence(int index, std::vector<std::string> fileNames, vvImageReader::LoadedImageType type);
  64
  65   void AddLandmarks(int index, std::vector<std::string>);
  66 ///Adds a mesh to a SlicerManager, with optional warping by vector field
  67   void AddContour(int image_index, vvMesh::Pointer contour, bool propagation);
  68   ///This is used to show an image when opened or computed
  69   void ShowLastImage();
  70   void SaveCurrentStateAs(const std::string& stateFile);
  71   void ReadSavedStateFile(const std::string& stateFile);
  72         void LinkAllImages();
  73   QString Get4x4MatrixDoubleAsString(vtkSmartPointer<vtkMatrix4x4> matrix, const int precision=3);
  74
  75   virtual void UpdateCurrentSlicer();
  76   virtual QTabWidget * GetTab();
  77   QTreeWidget* GetTree() { return DataTree; }
  78   //vvMainWindowToolInfo * GetInfoForTool();
  79 //   void AddRunningTool(vvToolCreatorBase * tool);
  80
  81 public slots:
  82   ///Allows the user to open and select various surfaces contained in a dicom-struct file
  83   void AddDCStructContour(int index, QString file);
  84   void OpenDCStructContour();
  85   ///Computes the midposition image of a 4D sequence with a VF and displays it
  86   void ComputeMidPosition();
  87   void OpenImages();
  88   ///Slot triggered by the dynamically-generated recent file menu actions
  89   void OpenRecentImage();
  90   void OpenImageWithTime();
  91   void MergeImages();
  92   void SliceImages();
  93   void MergeImagesWithTime();
  94   void OpenDicom();
  95   void ConnectPacs();
  96   ///Open a vtkPolyData surface mesh and display it over the current image
  97   void OpenVTKContour();
  98   void SaveAs();
  99   void SaveCurrentState();
 100   void ReadSavedState();
 101   void CurrentImageChanged(std::string id);
 102   void CurrentPickedImageChanged(std::string id);
 103   void ImageInfoChanged();
 104   void ShowHelpDialog();
 105   void ShowDocumentation();
 106   void PopupRegisterForm(bool checkCanPush=false);
 107   void ComputeDeformableRegistration();
 108   void WarpImage();
 109   void ChangeViewMode();
 110   void DisplayChanged(QTreeWidgetItem *item, int column);
 111   void CloseImage(QTreeWidgetItem* item, int column);
 112   void ReloadImage(QTreeWidgetItem* item, int column);
 113   void MousePositionChanged(int visibility, double x, double y, double z, double X, double Y, double Z , double value);
 114   void VectorChanged(int visibility, double x, double y, double z, double value);
 115   void OverlayChanged(int visibility, double valueOver, double valueRef);
 116   void FusionChanged(int visibility, double value);
 117   //void FusionSequenceChanged(int visibility, double value);
 118   void SegmentationOnCurrentImage();
 119   void SurfaceViewerLaunch();
 120
 121   void WindowLevelChanged();
 122   void UpdateSlice(int slicer, int slice);
 123   void UpdateTSlice(int slicer, int slice, int code=-1);
 124   void UpdateSliceRange(int slicer, int min, int max, int tmin, int tmax);
 125   void WindowLevelEdited();
 126   void SetWindowLevel(double w, double l);
 127   void UpdateColorMap();
 128   void UpdateWindowLevel();
 129   void UpdateSlicingPreset();
 130   void SwitchWindowLevel();
 131   void ApplyWindowLevelToAllImages();
 132   void ApplyWindowToSetOfImages(double window, unsigned int indexMin, unsigned int indexMax);
 133   void ApplyLevelToSetOfImages(double level, unsigned int indexMin, unsigned int indexMax);
 134   void UpdateLinkManager(std::string id, int slicer, double x, double y, double z, int temps);
 135   void UpdateLinkedNavigation(std::string id, vvSlicerManager *sm, vvSlicer* refSlicer);
 136   void AddLink(QString image1,QString image2,bool fromPanel = true);
 137   void RemoveLink(QString image1,QString image2);
 138   void ChangeImageWithIndexOffset(vvSlicerManager *sm, int slicer, int offset);
 139
 140   ///Generic method called when any one of the horizontal sliders is moved
 141   void HorizontalSliderMoved(int value,int column, int slicer_index);
 142   void NOHorizontalSliderMoved();
 143   void NEHorizontalSliderMoved();
 144   void SOHorizontalSliderMoved();
 145   void SEHorizontalSliderMoved();
 146
 147   void NOVerticalSliderChanged();
 148   void NEVerticalSliderChanged();
 149   void SOVerticalSliderChanged();
 150   void SEVerticalSliderChanged();
 151
 152   void SaveNEScreenshot();
 153   void SaveNOScreenshot();
 154   void SaveSEScreenshot();
 155   void SaveSOScreenshot();
 156   void SaveScreenshotAllSlices();
 157
 158   void ShowContextMenu(QPoint point);
 159   void CloseImage();
 160   void ReloadImage();
 161   void OpenField();
 162   void SelectOverlayImage();
 163   void SelectFusionImage();
 164   //select the file(s) from the disk containing the image sequence to fuse
 165   void SelectFusionSequence();
 166   void SelectFusionSequenceCorrespondances();
 167
 168   void ResetTransformationToIdentity();
 169
 170   void SetVFProperty(int subsampling,int scale,int lut, int width, double r, double g, double b);
 171   void SetOverlayProperty(int color, int linked, double window, double level);
 172   void SetFusionProperty(int opacity, int tresOpacity, int colormap,double window,double level, bool showLegend);
 173   void SetFusionSequenceProperty(int fusionSequenceFrameIndex, bool spatialSyncFlag, unsigned int fusionSequenceNbFrames, bool temporalSyncFlag);
 174
 175   void GoToCursor();
 176   void GoToLandmark();
 177   void PlayPause();
 178   void PlayNext();
 179   void ChangeFrameRate(int rate) {
 180     mFrameRate = rate;
 181   }
 182   void UpdateRenderWindows();
 183   void UpdateMemoryUsage();
 184   void show();
 185
 186 protected:
 187
 188   void createRecentlyOpenedFilesMenu();
 189   void updateRecentlyOpenedFilesMenu(const std::list<std::string> &files);
 190
 191 private:
 192
 193   //variables
 194   // std::vector<vvSlicerManager*> mSlicerManagers;
 195   vvHelpDialog *help_dialog;
 196   vvDocumentation *documentation;
 197   vvDicomSeriesSelector *dicomSeriesSelector;
 198   vvQPacsConnection *pacsconnect;
 199
 200   bool viewMode;
 201   bool playMode;
 202
 203   //functions
 204   void UpdateTree();
 205   ///Adds a vector field to slicer manager index
 206   void WarpImage(vvSlicerManager* selected_slicer,int reference_phase);
 207   void AddFieldEntry(QString filename,int index,bool from_disk);
 208   void AddField(vvImage::Pointer vf,QString file,int index);
 209   void InitDisplay();
 210   ///Sets the render window and LUT for the last SlicerManager
 211   void InitSlicers();
 212   void DisplaySliders(int slicer, int window);
 213   QString GetSizeInBytes(unsigned long size);
 214   QString GetVectorDoubleAsString(std::vector<double> vectorDouble);
 215   QString GetVectorIntAsString(std::vector<int> vectorInt);
 216   int GetSlicerIndexFromItem(QTreeWidgetItem* item); //this actually returns the SlicerManager index TODO: rename it to GetSlicerManagerIndexFromItem
 217   QTreeWidgetItem* GetItemFromSlicerManager(vvSlicerManager* sm);
 218   void SaveScreenshot(QVTKWidget *widget);
 219   int GetImageDuplicateFilenameNumber(std::string filename);
 220
 221   QMenu contextMenu;
 222   QMenu* recentlyOpenedFilesMenu;
 223   //QMenu *AddSubImageMenu;
 224   std::vector<QAction*> contextActions;
 225   std::vector<QSlider*> horizontalSliders;
 226   std::vector<QSlider*> verticalSliders;
 227   int mFrameRate;
 228
 229   std::string mCurrentSelectedImageId;
 230   std::string mCurrentPickedImageId;
 231   unsigned int mCurrentPickedImageIndex;
 232
 233   // vvMainWindowToolInfo * mCurrentToolInfo;
 234   // std::vector<vvToolCreatorBase*> mListOfRunningTool;
 235
 236   static vvMainWindow * mSingleton;
 237
 238   int mCurrentTime;
 239
 240 };
 241
 242 #endif