vv/vvMaximumIntensityProjection.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
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   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
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  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ======================================================================-====*/
  18 #include <itkImage.h>
  19 #include <itkMaximumProjectionImageFilter.h>
  20
  21 #include "clitkCommon.h"
  22 #include "vvSlicerManager.h"
  23 #include "vvSlicer.h"
  24 #include "vvToITK.h"
  25 #include "vvFromITK.h"
  26 #include "vvMaximumIntensityProjection.h"
  27 #include <QMessageBox>
  28 #include <QInputDialog>
  29
  30 void vvMaximumIntensityProjection::Compute(vvSlicerManager * slicer_manager)
  31 {
  32   mCurrentSlicerManager = slicer_manager;
  33   mDimension = QInputDialog::getInteger(0, "MIP Axis","Choose the axis along which to perform the MIP",0,0,\
  34                                      slicer_manager->GetImage()->GetNumberOfDimensions()-1,1);
  35 #define TRY_TYPE(TYPE)                                                  \
  36   if (clitk::IsSameType<TYPE>(image->GetScalarTypeAsITKString())) { this->Update_WithPixelType<TYPE>(image); return; }
  37   std::string list = clitk::CreateListOfTypes<short>();
  38   vvImage::Pointer image=slicer_manager->GetSlicer(0)->GetImage();
  39   TRY_TYPE(float);
  40   TRY_TYPE(double);
  41   TRY_TYPE(int);
  42   TRY_TYPE(unsigned int);
  43   TRY_TYPE(short);
  44   TRY_TYPE(unsigned short);
  45   TRY_TYPE(char);
  46   TRY_TYPE(unsigned char);
  47   QMessageBox::warning(0,"Unsupported image type",
  48                        QString("Error, I don't know the type")+QString(image->GetScalarTypeAsITKString().c_str()) +QString("' for the input image.\nKnown types are ") + QString(list.c_str()));
  49   error=true;
  50 #undef TRY_TYPE
  51 }
  52
  53 template <class PixelType>
  54 void vvMaximumIntensityProjection::Update_WithPixelType(vvImage::Pointer image)
  55 {
  56   switch(image->GetNumberOfDimensions()) {
  57   case 3:
  58     Update_WithDimAndPixelType<PixelType,3>(image);
  59     break;;
  60   case 4:
  61     Update_WithDimAndPixelType<PixelType,4>(image);
  62     break;;
  63   default:
  64     QMessageBox::warning(0,"Unsupported image dimension",QString("Unsupported image dimension. Supported dimensions are 3 and 4"));
  65     error=true;
  66   }
  67 }
  68
  69 template <class PixelType,int Dim>
  70 void vvMaximumIntensityProjection::Update_WithDimAndPixelType(vvImage::Pointer image)
  71 {
  72   typedef itk::Image<PixelType,Dim> ImageType;
  73   typedef itk::Image<PixelType,Dim-1> OutputImageType;
  74   typedef itk::MaximumProjectionImageFilter<ImageType,OutputImageType> FilterType;
  75   typename FilterType::Pointer filter = FilterType::New();
  76   filter->SetProjectionDimension(mDimension);
  77   typename ImageType::ConstPointer input = vvImageToITK<ImageType>(image);
  78   filter->SetInput(input);
  79   filter->Update();
  80   mOutputImage=vvImageFromITK<Dim-1,PixelType>(filter->GetOutput());
  81   // std::ostringstream osstream;
  82   // osstream << "MIP_" << mCurrentSlicerManager->GetSlicer(0)->GetFileName() << ".mhd";
  83   // AddImage(mOutputImage,osstream.str());
  84 }