vv/vvQDicomSeriesSelector.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ======================================================================-====*/
  18 #ifndef VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX
  19 #define VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX
  20 #include <itkGDCMImageIO.h>
  21 #include <itkGDCMSeriesFileNames.h>
  22 #include <gdcmFile.h>
  23 #include <gdcmDocEntry.h>
  24
  25 #include "vvQDicomSeriesSelector.h"
  26 //#include "vvUserConfig.h"
  27
  28 //====================================================================
  29 vvDicomSeriesSelector::vvDicomSeriesSelector(QWidget* parent)
  30   :QDialog(parent)
  31 {
  32   // Set GUI
  33   ui.setupUi(this);
  34   // Correct GUI for splitter ...
  35   //   QSplitter * splitter = new QSplitter(this);
  36   //   splitter->setOrientation(Qt::Horizontal);
  37   //   ui.gridLayout1->addWidget(splitter, 0, 0, 1, 1);
  38   //   ui.mFrameLeft->setParent(splitter);
  39   //   ui.mFrameRight->setParent(splitter);
  40   //  ui.toolBox->setCurrentIndex(0);
  41
  42
  43
  44   ui.mButtonBox->button(QDialogButtonBox::Open)->setEnabled(false);
  45
  46   connect(ui.mBrowseButton, SIGNAL(released()),
  47           this, SLOT(BrowseButtonRelease()));
  48   connect(ui.mSearchButton, SIGNAL(released()),
  49           this, SLOT(SearchButtonRelease()));
  50   connect(ui.mListWidget, SIGNAL(itemSelectionChanged()),
  51           this, SLOT(itemSelectionChanged()));
  52   connect(ui.mDicomDetailsListWidget, SIGNAL(itemSelectionChanged()),
  53           this, SLOT(itemDetailsSelectionChanged()));
  54
  55   // Initialization
  56   /*    if (config::get_current_path() != QString(0))
  57     mFoldername = config::get_current_path();
  58     else*/
  59   mFoldername = QFileInfo("./").absolutePath();
  60
  61   mPreviousPath = mFoldername;
  62   ui.mFolderLineEdit->setText(mFoldername);
  63   //  ui.mTableWidget->setRowCount(0);
  64 }
  65 //====================================================================
  66
  67 //====================================================================
  68 void vvDicomSeriesSelector::show()
  69 {
  70   QDialog::show();
  71   //grabKeyboard();
  72   // ui.mListWidget->grabKeyboard();
  73   //  ui.mDicomDetailsListWidget->grabKeyboard();
  74 }
  75 //====================================================================
  76
  77 //====================================================================
  78 void vvDicomSeriesSelector::close()
  79 {
  80   QDialog::close();
  81   // ui.mListWidget->releaseKeyboard()
  82   //releaseKeyboard();
  83 }
  84 //====================================================================
  85
  86 //====================================================================
  87 void vvDicomSeriesSelector::BrowseButtonRelease()
  88 {
  89   QFileDialog dialog(this);
  90   dialog.setFileMode(QFileDialog::AnyFile);
  91   dialog.setFilter("DICOM files (*.dcm); All files (*)");
  92   mFoldername = dialog.getExistingDirectory(this,
  93                 "Select a folder to find DICOM image",
  94                 mPreviousPath);
  95   ui.mFolderLineEdit->setText(mFoldername);
  96   mPreviousPath = QFileInfo(mFoldername).absolutePath();
  97   //    config::set_current_path(mPreviousPath);
  98 }
  99 //====================================================================
 100
 101 //====================================================================
 102 void vvDicomSeriesSelector::SearchButtonRelease()
 103 {
 104   typedef itk::GDCMSeriesFileNames NamesGeneratorType;
 105   NamesGeneratorType::Pointer nameGenerator = NamesGeneratorType::New();
 106   nameGenerator->SetUseSeriesDetails(true);
 107   //nameGenerator->SetDirectory(mFoldername.toStdString());
 108   nameGenerator->SetRecursive(ui.mIsRecursiveCheckBox->checkState() == Qt::Checked);
 109
 110   //ds gérer recursive moi-meme pour progress ...
 111   nameGenerator->SetInputDirectory(mFoldername.toStdString());
 112
 113   // insert in table
 114   typedef std::vector<std::string> SeriesIdContainer;
 115   const SeriesIdContainer & seriesUID = nameGenerator->GetSeriesUIDs();
 116
 117   for (unsigned int i=0; i<seriesUID.size(); i++) {
 118     // std::cout << seriesUID[i] << std::endl; //ds verif existe pas déja
 119
 120     if (mListOfSeriesFilenames[seriesUID[i]]) {
 121       std::cout << seriesUID[i] << " exist" << std::endl;
 122     } else {
 123       // store filenames
 124       std::vector<std::string> * filenames = new std::vector<std::string>;
 125       const std::vector<std::string> & temp = nameGenerator->GetFileNames(seriesUID[i]);
 126       for (unsigned int j=0; j<temp.size(); j++) {
 127         filenames->push_back(temp[j]);
 128       }
 129       mListOfSeriesFilenames[seriesUID[i]] = filenames;
 130
 131       // store first header
 132       gdcm::File *header = new gdcm::File();
 133       header->SetFileName((*filenames)[0]);
 134       header->SetMaxSizeLoadEntry(16384);
 135       header->SetLoadMode(gdcm::LD_NOSHADOW);// don't load shadow tags (in order to save memory)
 136       header->Load();
 137
 138
 139       //
 140       DD(header->GetEntryValue(0x0028,0x0030).c_str());
 141
 142       //DS TEST DAVID
 143       DD(header->GetXSize());
 144       DD(header->GetYSize());
 145       DD(header->GetZSize());
 146       DD(header->GetXSpacing());
 147       DD(header->GetYSpacing());
 148       DD(header->GetZSpacing());
 149       DD(header->GetXOrigin());
 150       DD(header->GetYOrigin());
 151       DD(header->GetZOrigin());
 152       DD("\n");
 153       /*
 154         QString size = QString("%1x%2x%3")
 155         .arg(header->GetXSize())
 156         .arg(header->GetYSize())
 157         .arg(header->GetZSize());
 158         QString spacing = QString("%1x%2x%3")
 159         .arg(header->GetXSpacing())
 160         .arg(header->GetYSpacing())
 161         .arg(header->GetZSpacing());
 162         QString origin = QString("%1x%2x%3")
 163         .arg(header->GetXOrigin())
 164         .arg(header->GetYOrigin())
 165         .arg(header->GetZOrigin());
 166       */
 167
 168
 169       mDicomHeader[seriesUID[i]] = header;
 170
 171       // new item
 172       QListWidgetItem *newItem = new QListWidgetItem;
 173       newItem->setText(seriesUID[i].c_str());
 174       ui.mListWidget->insertItem(i, newItem);
 175
 176       //AddSerieToTheTable(i, *filenames);
 177     }
 178   }
 179 }
 180 //====================================================================
 181
 182 //====================================================================
 183 void vvDicomSeriesSelector::itemSelectionChanged()
 184 {
 185   //  mLabelSelected.setText(
 186   mCurrentSerie = ui.mListWidget->selectedItems()[0]->text().toStdString();
 187   mFilenames = mListOfSeriesFilenames[mCurrentSerie];
 188   ui.mButtonBox->button(QDialogButtonBox::Open)->setEnabled(true);
 189
 190   if (mDicomInfo[mCurrentSerie] == "") {
 191     //  QString m;
 192     //  m = QString("Patient : <font color=\"blue\">%1</font><br>").arg(mDicomHeader[s]->GetEntryValue(0x0010,0x0010).c_str()); // Patient's name
 193     mDicomInfo[mCurrentSerie] = MakeDicomInfo(mCurrentSerie, mDicomHeader[mCurrentSerie]);
 194   }
 195   ui.mDicomInfoPanel->setText(mDicomInfo[mCurrentSerie]);
 196
 197   // Detail tab
 198   ui.mDicomDetailsListWidget->clear();
 199   for (unsigned int i=0; i<mFilenames->size(); i++) {
 200     QListWidgetItem * newItem = new QListWidgetItem;
 201     newItem->setText(QFileInfo((*mFilenames)[i].c_str()).fileName());
 202     ui.mDicomDetailsListWidget->insertItem(i, newItem);
 203   }
 204
 205 }
 206 //====================================================================
 207
 208 //====================================================================
 209 void vvDicomSeriesSelector::itemDetailsSelectionChanged()
 210 {
 211   unsigned int i = ui.mDicomDetailsListWidget->currentRow();
 212   if (i<mFilenames->size()) {
 213     if (mDicomDetails[(*mFilenames)[i]] == "") {
 214       std::ostringstream s;
 215       mDicomHeader[mCurrentSerie]->Print(s);
 216
 217       QString l;
 218       gdcm::File * header = mDicomHeader[mCurrentSerie];
 219       gdcm::DocEntry * e = header->GetFirstEntry();
 220       while (e) {
 221         if (e->GetName() != "gdcm::Unknown") {
 222           l += QString("%1 : %2\n")
 223                .arg(e->GetName().c_str())
 224                .arg((header->GetEntryValue(e->GetGroup(), e->GetElement())).c_str());
 225         }
 226         e = header->GetNextEntry();
 227       }
 228
 229       mDicomDetails[(*mFilenames)[i]] = l.toStdString();
 230     }
 231     ui.mDicomDetailsLabel->setText(mDicomDetails[(*mFilenames)[i]].c_str());
 232   }
 233 }
 234 //====================================================================
 235
 236 //====================================================================
 237 QString vvDicomSeriesSelector::MakeDicomInfo(std::string & s, gdcm::File *header)
 238 {
 239   QString n = QString("%1").arg(mListOfSeriesFilenames[s]->size());
 240   QString size = QString("%1x%2x%3")
 241                  .arg(header->GetXSize())
 242                  .arg(header->GetYSize())
 243                  .arg(header->GetZSize());
 244   QString spacing = QString("%1x%2x%3")
 245                     .arg(header->GetXSpacing())
 246                     .arg(header->GetYSpacing())
 247                     .arg(header->GetZSpacing());
 248   QString origin = QString("%1x%2x%3")
 249                    .arg(header->GetXOrigin())
 250                    .arg(header->GetYOrigin())
 251                    .arg(header->GetZOrigin());
 252   QString ss =
 253     //AddInfo(        "Serie ID   : ", s)+
 254     AddInfo(header, "Patient : ", 0x0010,0x0010)+
 255     AddInfo(        "Folder : ", QFileInfo((*mFilenames)[0].c_str()).canonicalPath().toStdString())+
 256     AddInfo(header, "Series Description : ", 0x0008,0x103e)+
 257     AddInfo(header, "Modality : ", 0x0008,0x0060)+
 258     AddInfo(header, "# images : ", 0x0020,0x0013)+
 259     AddInfo(        "# files : ", n.toStdString())+
 260     AddInfo(        "Size : ", size.toStdString())+
 261     AddInfo(        "Spacing : ", spacing.toStdString())+
 262     AddInfo(        "Origin : ", origin.toStdString())+
 263     AddInfo(header, "Pixel size : ", 0x0028,0x0100)+
 264     AddInfo(        "Pixel type : ", header->GetPixelType());
 265   return ss;
 266 }
 267 //====================================================================
 268
 269 //====================================================================
 270 QString vvDicomSeriesSelector::AddInfo(gdcm::File *header, QString n, uint16_t group, uint16_t elem)
 271 {
 272   return AddInfo(n.toStdString(), header->GetEntryValue(group, elem));
 273 }
 274 //====================================================================
 275
 276 //====================================================================
 277 QString vvDicomSeriesSelector::AddInfo(std::string n, std::string m)
 278 {
 279   QString s = QString("%1 <font color=\"blue\">%2</font><br>").
 280               arg(n.c_str()).arg(m.c_str());
 281   return s;
 282 }
 283 //====================================================================
 284
 285 //====================================================================
 286 void vvDicomSeriesSelector::AddSerieToTheTable(int i, std::vector<std::string> & filenames)
 287 {
 288   gdcm::File *header = new gdcm::File();
 289   header->SetFileName(filenames[0]);
 290   header->SetMaxSizeLoadEntry(16384);
 291   header->SetLoadMode(gdcm::LD_NOSHADOW);// don't load shadow tags (in order to save memory)
 292   header->Load();
 293   //header->Print(cout);
 294   // ->GetValEntry
 295   //  mDicomHeader[] = header;
 296
 297   /*
 298
 299   QTableWidgetItem *newItem = new
 300   QTableWidgetItem(QString("# images = %1").arg(header->GetImageNumber()));
 301   //  newItem->setCheckState(Qt::Checked);
 302   //newItem->setFlags(!Qt::ItemIsEditable);
 303   DD(ui.mTableWidget->rowCount());
 304   ui.mTableWidget->setItem(i, 0, newItem);
 305   */
 306 }
 307 //====================================================================
 308
 309 #endif // VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX