vv/vvQDicomSeriesSelector.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3 Program:   vv
   4 Language:  C++
   5 Author :   Pierre Seroul (pierre.seroul@gmail.com)
   6
   7 Copyright (C) 2008
   8 Léon Bérard cancer center http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   9 CREATIS-LRMN http://www.creatis.insa-lyon.fr
  10
  11 This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  12 it under the terms of the GNU General Public License as published by
  13 the Free Software Foundation, version 3 of the License.
  14
  15 This program is distributed in the hope that it will be useful,
  16 but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  17 MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  18 GNU General Public License for more details.
  19
  20 You should have received a copy of the GNU General Public License
  21 along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  22
  23 =========================================================================*/
  24 #ifndef VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX
  25 #define VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX
  26
  27 // itk include
  28 #include <itkGDCMImageIO.h>
  29 #include <itkGDCMSeriesFileNames.h>
  30 #include <gdcmFile.h>
  31 #include <gdcmDocEntry.h>
  32
  33 #include "vvQDicomSeriesSelector.h"
  34 //#include "vvUserConfig.h"
  35
  36 //====================================================================
  37 vvDicomSeriesSelector::vvDicomSeriesSelector(QWidget* parent)
  38         :QDialog(parent) {
  39     // Set GUI
  40     ui.setupUi(this);
  41     // Correct GUI for splitter ...
  42     //   QSplitter * splitter = new QSplitter(this);
  43     //   splitter->setOrientation(Qt::Horizontal);
  44     //   ui.gridLayout1->addWidget(splitter, 0, 0, 1, 1);
  45     //   ui.mFrameLeft->setParent(splitter);
  46     //   ui.mFrameRight->setParent(splitter);
  47     //  ui.toolBox->setCurrentIndex(0);
  48
  49
  50
  51     ui.mButtonBox->button(QDialogButtonBox::Open)->setEnabled(false);
  52
  53     connect(ui.mBrowseButton, SIGNAL(released()),
  54             this, SLOT(BrowseButtonRelease()));
  55     connect(ui.mSearchButton, SIGNAL(released()),
  56             this, SLOT(SearchButtonRelease()));
  57     connect(ui.mListWidget, SIGNAL(itemSelectionChanged()),
  58             this, SLOT(itemSelectionChanged()));
  59     connect(ui.mDicomDetailsListWidget, SIGNAL(itemSelectionChanged()),
  60             this, SLOT(itemDetailsSelectionChanged()));
  61
  62     // Initialization
  63     /*  if (config::get_current_path() != QString(0))
  64       mFoldername = config::get_current_path();
  65       else*/
  66     mFoldername = QFileInfo("./").absolutePath();
  67
  68     mPreviousPath = mFoldername;
  69     ui.mFolderLineEdit->setText(mFoldername);
  70     //  ui.mTableWidget->setRowCount(0);
  71 }
  72 //====================================================================
  73
  74 //====================================================================
  75 void vvDicomSeriesSelector::show() {
  76     QDialog::show();
  77     //grabKeyboard();
  78     // ui.mListWidget->grabKeyboard();
  79     //  ui.mDicomDetailsListWidget->grabKeyboard();
  80 }
  81 //====================================================================
  82
  83 //====================================================================
  84 void vvDicomSeriesSelector::close() {
  85     QDialog::close();
  86     // ui.mListWidget->releaseKeyboard()
  87     //releaseKeyboard();
  88 }
  89 //====================================================================
  90
  91 //====================================================================
  92 void vvDicomSeriesSelector::BrowseButtonRelease() {
  93     QFileDialog dialog(this);
  94     dialog.setFileMode(QFileDialog::AnyFile);
  95     dialog.setFilter("DICOM files (*.dcm); All files (*)");
  96     mFoldername = dialog.getExistingDirectory(this,
  97                   "Select a folder to find DICOM image",
  98                   mPreviousPath);
  99     ui.mFolderLineEdit->setText(mFoldername);
 100     mPreviousPath = QFileInfo(mFoldername).absolutePath();
 101     //  config::set_current_path(mPreviousPath);
 102 }
 103 //====================================================================
 104
 105 //====================================================================
 106 void vvDicomSeriesSelector::SearchButtonRelease() {
 107     typedef itk::GDCMSeriesFileNames NamesGeneratorType;
 108     NamesGeneratorType::Pointer nameGenerator = NamesGeneratorType::New();
 109     nameGenerator->SetUseSeriesDetails(true);
 110     //nameGenerator->SetDirectory(mFoldername.toStdString());
 111     nameGenerator->SetRecursive(ui.mIsRecursiveCheckBox->checkState() == Qt::Checked);
 112
 113     //ds gérer recursive moi-meme pour progress ...
 114     nameGenerator->SetInputDirectory(mFoldername.toStdString());
 115
 116     // insert in table
 117     typedef std::vector<std::string> SeriesIdContainer;
 118     const SeriesIdContainer & seriesUID = nameGenerator->GetSeriesUIDs();
 119
 120     for (unsigned int i=0; i<seriesUID.size(); i++) {
 121         // std::cout << seriesUID[i] << std::endl; //ds verif existe pas déja
 122
 123         if (mListOfSeriesFilenames[seriesUID[i]]) {
 124             std::cout << seriesUID[i] << " exist" << std::endl;
 125         }
 126         else {
 127             // store filenames
 128             std::vector<std::string> * filenames = new std::vector<std::string>;
 129             const std::vector<std::string> & temp = nameGenerator->GetFileNames(seriesUID[i]);
 130             for (unsigned int j=0; j<temp.size(); j++) {
 131                 filenames->push_back(temp[j]);
 132             }
 133             mListOfSeriesFilenames[seriesUID[i]] = filenames;
 134
 135             // store first header
 136             gdcm::File *header = new gdcm::File();
 137             header->SetFileName((*filenames)[0]);
 138             header->SetMaxSizeLoadEntry(16384);
 139             header->SetLoadMode(gdcm::LD_NOSHADOW);// don't load shadow tags (in order to save memory)
 140             header->Load();
 141
 142
 143             //
 144             DD(header->GetEntryValue(0x0028,0x0030).c_str());
 145
 146             //DS TEST DAVID
 147             DD(header->GetXSize());
 148             DD(header->GetYSize());
 149             DD(header->GetZSize());
 150             DD(header->GetXSpacing());
 151             DD(header->GetYSpacing());
 152             DD(header->GetZSpacing());
 153             DD(header->GetXOrigin());
 154             DD(header->GetYOrigin());
 155             DD(header->GetZOrigin());
 156             DD("\n");
 157             /*
 158               QString size = QString("%1x%2x%3")
 159               .arg(header->GetXSize())
 160               .arg(header->GetYSize())
 161               .arg(header->GetZSize());
 162               QString spacing = QString("%1x%2x%3")
 163               .arg(header->GetXSpacing())
 164               .arg(header->GetYSpacing())
 165               .arg(header->GetZSpacing());
 166               QString origin = QString("%1x%2x%3")
 167               .arg(header->GetXOrigin())
 168               .arg(header->GetYOrigin())
 169               .arg(header->GetZOrigin());
 170             */
 171
 172
 173             mDicomHeader[seriesUID[i]] = header;
 174
 175             // new item
 176             QListWidgetItem *newItem = new QListWidgetItem;
 177             newItem->setText(seriesUID[i].c_str());
 178             ui.mListWidget->insertItem(i, newItem);
 179
 180             //AddSerieToTheTable(i, *filenames);
 181         }
 182     }
 183 }
 184 //====================================================================
 185
 186 //====================================================================
 187 void vvDicomSeriesSelector::itemSelectionChanged() {
 188     //  mLabelSelected.setText(
 189     mCurrentSerie = ui.mListWidget->selectedItems()[0]->text().toStdString();
 190     mFilenames = mListOfSeriesFilenames[mCurrentSerie];
 191     ui.mButtonBox->button(QDialogButtonBox::Open)->setEnabled(true);
 192
 193     if (mDicomInfo[mCurrentSerie] == "") {
 194         //      QString m;
 195         //      m = QString("Patient : <font color=\"blue\">%1</font><br>").arg(mDicomHeader[s]->GetEntryValue(0x0010,0x0010).c_str()); // Patient's name
 196         mDicomInfo[mCurrentSerie] = MakeDicomInfo(mCurrentSerie, mDicomHeader[mCurrentSerie]);
 197     }
 198     ui.mDicomInfoPanel->setText(mDicomInfo[mCurrentSerie]);
 199
 200     // Detail tab
 201     ui.mDicomDetailsListWidget->clear();
 202     for (unsigned int i=0; i<mFilenames->size(); i++) {
 203         QListWidgetItem * newItem = new QListWidgetItem;
 204         newItem->setText(QFileInfo((*mFilenames)[i].c_str()).fileName());
 205         ui.mDicomDetailsListWidget->insertItem(i, newItem);
 206     }
 207
 208 }
 209 //====================================================================
 210
 211 //====================================================================
 212 void vvDicomSeriesSelector::itemDetailsSelectionChanged() {
 213     unsigned int i = ui.mDicomDetailsListWidget->currentRow();
 214     if (i<mFilenames->size()) {
 215         if (mDicomDetails[(*mFilenames)[i]] == "") {
 216             std::ostringstream s;
 217             mDicomHeader[mCurrentSerie]->Print(s);
 218
 219             QString l;
 220             gdcm::File * header = mDicomHeader[mCurrentSerie];
 221             gdcm::DocEntry * e = header->GetFirstEntry();
 222             while (e) {
 223                 if (e->GetName() != "gdcm::Unknown") {
 224                     l += QString("%1 : %2\n")
 225                          .arg(e->GetName().c_str())
 226                          .arg((header->GetEntryValue(e->GetGroup(), e->GetElement())).c_str());
 227                 }
 228                 e = header->GetNextEntry();
 229             }
 230
 231             mDicomDetails[(*mFilenames)[i]] = l.toStdString();
 232         }
 233         ui.mDicomDetailsLabel->setText(mDicomDetails[(*mFilenames)[i]].c_str());
 234     }
 235 }
 236 //====================================================================
 237
 238 //====================================================================
 239 QString vvDicomSeriesSelector::MakeDicomInfo(std::string & s, gdcm::File *header) {
 240     QString n = QString("%1").arg(mListOfSeriesFilenames[s]->size());
 241     QString size = QString("%1x%2x%3")
 242                    .arg(header->GetXSize())
 243                    .arg(header->GetYSize())
 244                    .arg(header->GetZSize());
 245     QString spacing = QString("%1x%2x%3")
 246                       .arg(header->GetXSpacing())
 247                       .arg(header->GetYSpacing())
 248                       .arg(header->GetZSpacing());
 249     QString origin = QString("%1x%2x%3")
 250                      .arg(header->GetXOrigin())
 251                      .arg(header->GetYOrigin())
 252                      .arg(header->GetZOrigin());
 253     QString ss =
 254         //AddInfo(        "Serie ID   : ", s)+
 255         AddInfo(header, "Patient : ", 0x0010,0x0010)+
 256         AddInfo(        "Folder : ", QFileInfo((*mFilenames)[0].c_str()).canonicalPath().toStdString())+
 257         AddInfo(header, "Series Description : ", 0x0008,0x103e)+
 258         AddInfo(header, "Modality : ", 0x0008,0x0060)+
 259         AddInfo(header, "# images : ", 0x0020,0x0013)+
 260         AddInfo(        "# files : ", n.toStdString())+
 261         AddInfo(        "Size : ", size.toStdString())+
 262         AddInfo(        "Spacing : ", spacing.toStdString())+
 263         AddInfo(        "Origin : ", origin.toStdString())+
 264         AddInfo(header, "Pixel size : ", 0x0028,0x0100)+
 265         AddInfo(        "Pixel type : ", header->GetPixelType());
 266     return ss;
 267 }
 268 //====================================================================
 269
 270 //====================================================================
 271 QString vvDicomSeriesSelector::AddInfo(gdcm::File *header, QString n, uint16_t group, uint16_t elem) {
 272     return AddInfo(n.toStdString(), header->GetEntryValue(group, elem));
 273 }
 274 //====================================================================
 275
 276 //====================================================================
 277 QString vvDicomSeriesSelector::AddInfo(std::string n, std::string m) {
 278     QString s = QString("%1 <font color=\"blue\">%2</font><br>").
 279                 arg(n.c_str()).arg(m.c_str());
 280     return s;
 281 }
 282 //====================================================================
 283
 284 //====================================================================
 285 void vvDicomSeriesSelector::AddSerieToTheTable(int i, std::vector<std::string> & filenames) {
 286     gdcm::File *header = new gdcm::File();
 287     header->SetFileName(filenames[0]);
 288     header->SetMaxSizeLoadEntry(16384);
 289     header->SetLoadMode(gdcm::LD_NOSHADOW);// don't load shadow tags (in order to save memory)
 290     header->Load();
 291     //header->Print(cout);
 292     // ->GetValEntry
 293     //  mDicomHeader[] = header;
 294
 295     /*
 296
 297     QTableWidgetItem *newItem = new
 298     QTableWidgetItem(QString("# images = %1").arg(header->GetImageNumber()));
 299     //  newItem->setCheckState(Qt::Checked);
 300     //newItem->setFlags(!Qt::ItemIsEditable);
 301     DD(ui.mTableWidget->rowCount());
 302     ui.mTableWidget->setItem(i, 0, newItem);
 303     */
 304 }
 305 //====================================================================
 306
 307 #endif // VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX