vv/vvQDicomSeriesSelector.cxx

   1 #ifndef VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX
   2 #define VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX
   3 #include <itkGDCMImageIO.h>
   4 #include <itkGDCMSeriesFileNames.h>
   5 #include <gdcmFile.h>
   6 #include <gdcmDocEntry.h>
   7
   8 #include "vvQDicomSeriesSelector.h"
   9 //#include "vvUserConfig.h"
  10
  11 //====================================================================
  12 vvDicomSeriesSelector::vvDicomSeriesSelector(QWidget* parent)
  13         :QDialog(parent) {
  14     // Set GUI
  15     ui.setupUi(this);
  16     // Correct GUI for splitter ...
  17     //   QSplitter * splitter = new QSplitter(this);
  18     //   splitter->setOrientation(Qt::Horizontal);
  19     //   ui.gridLayout1->addWidget(splitter, 0, 0, 1, 1);
  20     //   ui.mFrameLeft->setParent(splitter);
  21     //   ui.mFrameRight->setParent(splitter);
  22     //  ui.toolBox->setCurrentIndex(0);
  23
  24
  25
  26     ui.mButtonBox->button(QDialogButtonBox::Open)->setEnabled(false);
  27
  28     connect(ui.mBrowseButton, SIGNAL(released()),
  29             this, SLOT(BrowseButtonRelease()));
  30     connect(ui.mSearchButton, SIGNAL(released()),
  31             this, SLOT(SearchButtonRelease()));
  32     connect(ui.mListWidget, SIGNAL(itemSelectionChanged()),
  33             this, SLOT(itemSelectionChanged()));
  34     connect(ui.mDicomDetailsListWidget, SIGNAL(itemSelectionChanged()),
  35             this, SLOT(itemDetailsSelectionChanged()));
  36
  37     // Initialization
  38     /*  if (config::get_current_path() != QString(0))
  39       mFoldername = config::get_current_path();
  40       else*/
  41     mFoldername = QFileInfo("./").absolutePath();
  42
  43     mPreviousPath = mFoldername;
  44     ui.mFolderLineEdit->setText(mFoldername);
  45     //  ui.mTableWidget->setRowCount(0);
  46 }
  47 //====================================================================
  48
  49 //====================================================================
  50 void vvDicomSeriesSelector::show() {
  51     QDialog::show();
  52     //grabKeyboard();
  53     // ui.mListWidget->grabKeyboard();
  54     //  ui.mDicomDetailsListWidget->grabKeyboard();
  55 }
  56 //====================================================================
  57
  58 //====================================================================
  59 void vvDicomSeriesSelector::close() {
  60     QDialog::close();
  61     // ui.mListWidget->releaseKeyboard()
  62     //releaseKeyboard();
  63 }
  64 //====================================================================
  65
  66 //====================================================================
  67 void vvDicomSeriesSelector::BrowseButtonRelease() {
  68     QFileDialog dialog(this);
  69     dialog.setFileMode(QFileDialog::AnyFile);
  70     dialog.setFilter("DICOM files (*.dcm); All files (*)");
  71     mFoldername = dialog.getExistingDirectory(this,
  72                   "Select a folder to find DICOM image",
  73                   mPreviousPath);
  74     ui.mFolderLineEdit->setText(mFoldername);
  75     mPreviousPath = QFileInfo(mFoldername).absolutePath();
  76     //  config::set_current_path(mPreviousPath);
  77 }
  78 //====================================================================
  79
  80 //====================================================================
  81 void vvDicomSeriesSelector::SearchButtonRelease() {
  82     typedef itk::GDCMSeriesFileNames NamesGeneratorType;
  83     NamesGeneratorType::Pointer nameGenerator = NamesGeneratorType::New();
  84     nameGenerator->SetUseSeriesDetails(true);
  85     //nameGenerator->SetDirectory(mFoldername.toStdString());
  86     nameGenerator->SetRecursive(ui.mIsRecursiveCheckBox->checkState() == Qt::Checked);
  87
  88     //ds gérer recursive moi-meme pour progress ...
  89     nameGenerator->SetInputDirectory(mFoldername.toStdString());
  90
  91     // insert in table
  92     typedef std::vector<std::string> SeriesIdContainer;
  93     const SeriesIdContainer & seriesUID = nameGenerator->GetSeriesUIDs();
  94
  95     for (unsigned int i=0; i<seriesUID.size(); i++) {
  96         // std::cout << seriesUID[i] << std::endl; //ds verif existe pas déja
  97
  98         if (mListOfSeriesFilenames[seriesUID[i]]) {
  99             std::cout << seriesUID[i] << " exist" << std::endl;
 100         }
 101         else {
 102             // store filenames
 103             std::vector<std::string> * filenames = new std::vector<std::string>;
 104             const std::vector<std::string> & temp = nameGenerator->GetFileNames(seriesUID[i]);
 105             for (unsigned int j=0; j<temp.size(); j++) {
 106                 filenames->push_back(temp[j]);
 107             }
 108             mListOfSeriesFilenames[seriesUID[i]] = filenames;
 109
 110             // store first header
 111             gdcm::File *header = new gdcm::File();
 112             header->SetFileName((*filenames)[0]);
 113             header->SetMaxSizeLoadEntry(16384);
 114             header->SetLoadMode(gdcm::LD_NOSHADOW);// don't load shadow tags (in order to save memory)
 115             header->Load();
 116
 117
 118             //
 119             DD(header->GetEntryValue(0x0028,0x0030).c_str());
 120
 121             //DS TEST DAVID
 122             DD(header->GetXSize());
 123             DD(header->GetYSize());
 124             DD(header->GetZSize());
 125             DD(header->GetXSpacing());
 126             DD(header->GetYSpacing());
 127             DD(header->GetZSpacing());
 128             DD(header->GetXOrigin());
 129             DD(header->GetYOrigin());
 130             DD(header->GetZOrigin());
 131             DD("\n");
 132             /*
 133               QString size = QString("%1x%2x%3")
 134               .arg(header->GetXSize())
 135               .arg(header->GetYSize())
 136               .arg(header->GetZSize());
 137               QString spacing = QString("%1x%2x%3")
 138               .arg(header->GetXSpacing())
 139               .arg(header->GetYSpacing())
 140               .arg(header->GetZSpacing());
 141               QString origin = QString("%1x%2x%3")
 142               .arg(header->GetXOrigin())
 143               .arg(header->GetYOrigin())
 144               .arg(header->GetZOrigin());
 145             */
 146
 147
 148             mDicomHeader[seriesUID[i]] = header;
 149
 150             // new item
 151             QListWidgetItem *newItem = new QListWidgetItem;
 152             newItem->setText(seriesUID[i].c_str());
 153             ui.mListWidget->insertItem(i, newItem);
 154
 155             //AddSerieToTheTable(i, *filenames);
 156         }
 157     }
 158 }
 159 //====================================================================
 160
 161 //====================================================================
 162 void vvDicomSeriesSelector::itemSelectionChanged() {
 163     //  mLabelSelected.setText(
 164     mCurrentSerie = ui.mListWidget->selectedItems()[0]->text().toStdString();
 165     mFilenames = mListOfSeriesFilenames[mCurrentSerie];
 166     ui.mButtonBox->button(QDialogButtonBox::Open)->setEnabled(true);
 167
 168     if (mDicomInfo[mCurrentSerie] == "") {
 169         //      QString m;
 170         //      m = QString("Patient : <font color=\"blue\">%1</font><br>").arg(mDicomHeader[s]->GetEntryValue(0x0010,0x0010).c_str()); // Patient's name
 171         mDicomInfo[mCurrentSerie] = MakeDicomInfo(mCurrentSerie, mDicomHeader[mCurrentSerie]);
 172     }
 173     ui.mDicomInfoPanel->setText(mDicomInfo[mCurrentSerie]);
 174
 175     // Detail tab
 176     ui.mDicomDetailsListWidget->clear();
 177     for (unsigned int i=0; i<mFilenames->size(); i++) {
 178         QListWidgetItem * newItem = new QListWidgetItem;
 179         newItem->setText(QFileInfo((*mFilenames)[i].c_str()).fileName());
 180         ui.mDicomDetailsListWidget->insertItem(i, newItem);
 181     }
 182
 183 }
 184 //====================================================================
 185
 186 //====================================================================
 187 void vvDicomSeriesSelector::itemDetailsSelectionChanged() {
 188     unsigned int i = ui.mDicomDetailsListWidget->currentRow();
 189     if (i<mFilenames->size()) {
 190         if (mDicomDetails[(*mFilenames)[i]] == "") {
 191             std::ostringstream s;
 192             mDicomHeader[mCurrentSerie]->Print(s);
 193
 194             QString l;
 195             gdcm::File * header = mDicomHeader[mCurrentSerie];
 196             gdcm::DocEntry * e = header->GetFirstEntry();
 197             while (e) {
 198                 if (e->GetName() != "gdcm::Unknown") {
 199                     l += QString("%1 : %2\n")
 200                          .arg(e->GetName().c_str())
 201                          .arg((header->GetEntryValue(e->GetGroup(), e->GetElement())).c_str());
 202                 }
 203                 e = header->GetNextEntry();
 204             }
 205
 206             mDicomDetails[(*mFilenames)[i]] = l.toStdString();
 207         }
 208         ui.mDicomDetailsLabel->setText(mDicomDetails[(*mFilenames)[i]].c_str());
 209     }
 210 }
 211 //====================================================================
 212
 213 //====================================================================
 214 QString vvDicomSeriesSelector::MakeDicomInfo(std::string & s, gdcm::File *header) {
 215     QString n = QString("%1").arg(mListOfSeriesFilenames[s]->size());
 216     QString size = QString("%1x%2x%3")
 217                    .arg(header->GetXSize())
 218                    .arg(header->GetYSize())
 219                    .arg(header->GetZSize());
 220     QString spacing = QString("%1x%2x%3")
 221                       .arg(header->GetXSpacing())
 222                       .arg(header->GetYSpacing())
 223                       .arg(header->GetZSpacing());
 224     QString origin = QString("%1x%2x%3")
 225                      .arg(header->GetXOrigin())
 226                      .arg(header->GetYOrigin())
 227                      .arg(header->GetZOrigin());
 228     QString ss =
 229         //AddInfo(        "Serie ID   : ", s)+
 230         AddInfo(header, "Patient : ", 0x0010,0x0010)+
 231         AddInfo(        "Folder : ", QFileInfo((*mFilenames)[0].c_str()).canonicalPath().toStdString())+
 232         AddInfo(header, "Series Description : ", 0x0008,0x103e)+
 233         AddInfo(header, "Modality : ", 0x0008,0x0060)+
 234         AddInfo(header, "# images : ", 0x0020,0x0013)+
 235         AddInfo(        "# files : ", n.toStdString())+
 236         AddInfo(        "Size : ", size.toStdString())+
 237         AddInfo(        "Spacing : ", spacing.toStdString())+
 238         AddInfo(        "Origin : ", origin.toStdString())+
 239         AddInfo(header, "Pixel size : ", 0x0028,0x0100)+
 240         AddInfo(        "Pixel type : ", header->GetPixelType());
 241     return ss;
 242 }
 243 //====================================================================
 244
 245 //====================================================================
 246 QString vvDicomSeriesSelector::AddInfo(gdcm::File *header, QString n, uint16_t group, uint16_t elem) {
 247     return AddInfo(n.toStdString(), header->GetEntryValue(group, elem));
 248 }
 249 //====================================================================
 250
 251 //====================================================================
 252 QString vvDicomSeriesSelector::AddInfo(std::string n, std::string m) {
 253     QString s = QString("%1 <font color=\"blue\">%2</font><br>").
 254                 arg(n.c_str()).arg(m.c_str());
 255     return s;
 256 }
 257 //====================================================================
 258
 259 //====================================================================
 260 void vvDicomSeriesSelector::AddSerieToTheTable(int i, std::vector<std::string> & filenames) {
 261     gdcm::File *header = new gdcm::File();
 262     header->SetFileName(filenames[0]);
 263     header->SetMaxSizeLoadEntry(16384);
 264     header->SetLoadMode(gdcm::LD_NOSHADOW);// don't load shadow tags (in order to save memory)
 265     header->Load();
 266     //header->Print(cout);
 267     // ->GetValEntry
 268     //  mDicomHeader[] = header;
 269
 270     /*
 271
 272     QTableWidgetItem *newItem = new
 273     QTableWidgetItem(QString("# images = %1").arg(header->GetImageNumber()));
 274     //  newItem->setCheckState(Qt::Checked);
 275     //newItem->setFlags(!Qt::ItemIsEditable);
 276     DD(ui.mTableWidget->rowCount());
 277     ui.mTableWidget->setItem(i, 0, newItem);
 278     */
 279 }
 280 //====================================================================
 281
 282 #endif // VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX