vv/vvSlicerManager.h

   1
   2 /*=========================================================================
   3   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   4
   5   Authors belong to:
   6   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   7   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   8   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   9
  10   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  11   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  12   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  13
  14   It is distributed under dual licence
  15
  16   - BSD        See included LICENSE.txt file
  17   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  18   ======================================================================-====*/
  19
  20 #ifndef VVSLICERMANAGER_H
  21 #define VVSLICERMANAGER_H
  22
  23 // std
  24 #include <iostream>
  25 #include <vector>
  26 #include <string>
  27
  28 // QT
  29 #include <QObject>
  30
  31 // VTK
  32 #include <vtksys/SystemTools.hxx>
  33 class vtkImageData;
  34 class vtkInteractorStyle;
  35 class vtkRenderWindow;
  36 class vtkPolyData;
  37
  38 // VV
  39 #include "clitkCommon.h"
  40 #include "vvImage.h"
  41 #include "vvMesh.h"
  42 #include "vvImageReader.h"
  43
  44 class vvSlicer;
  45 class vvInteractorStyleNavigator;
  46 class vvImageReader;
  47 class vvImageReader;
  48 class vvLandmarks;
  49
  50 //------------------------------------------------------------------------------
  51 class vvSlicerManager : public QObject {
  52   Q_OBJECT
  53
  54   public:
  55   vvSlicerManager(int numberOfSlicers);
  56   ~vvSlicerManager();
  57
  58   std::string GetLastError() {
  59     return mLastError;
  60   }
  61
  62   bool SetImage(std::string filename, vvImageReader::LoadedImageType type, int n=0, unsigned int slice=0);
  63   void SetImage(vvImage::Pointer image);
  64   bool SetImages(std::vector<std::string> filenames, vvImageReader::LoadedImageType type, int n=0);
  65
  66   bool SetOverlay(std::string filename, int dim, std::string component);
  67   bool SetFusion(std::string filename, int dim, std::string component);
  68   ///Set a VF by loading it from the disk
  69   bool SetVF(std::string filename);
  70   ///Set a VF from memory
  71   bool SetVF(vvImage::Pointer vf,std::string filename);
  72   ///Add a mesh to the slicers, with optional propagation using a vector field
  73   void AddContour(vvMesh::Pointer ,bool propagate=false);
  74   ///Toggle temporal superposition of contours
  75   void ToggleContourSuperposition();
  76
  77   std::string GetFileName()      { return mFileName; }
  78   std::string GetBaseFileName()  { return mBaseFileName; }
  79   int GetBaseFileNameNumber()    { return mBaseFileNameNumber; }
  80   std::string GetVFName()        { return mVFName; }
  81   std::string GetOverlayName()   { return mOverlayName; }
  82   std::string GetFusionName()    { return mFusionName; }
  83
  84   ///Switch between nearest neighbor and linear interpolation
  85   void ToggleInterpolation();
  86   vvSlicer* GetSlicer(int i);
  87   void UpdateSlicer(int num, bool state);
  88   void SetSlicerWindow(int i, vtkRenderWindow* RW);
  89   void SetInteractorStyleNavigator(int i,vtkInteractorStyle* style);
  90
  91   int GetNumberOfSlicers()        { return mSlicers.size(); }
  92   vvImage::Pointer GetImage()  { return mImage; }
  93   vvImage::Pointer GetVF()     { return mVF; }
  94   int GetType()                { return mType; }
  95   void SetId(std::string id)   { mId = id; }
  96   std::string GetId()          { return mId; }
  97   int GetDimension() {
  98     if (mImage) return mImage->GetNumberOfDimensions();
  99     else return -1;
 100   }
 101
 102   void SetFilename(std::string f, int number=0);
 103
 104   void SetTSlice(int slice);
 105   void SetNextTSlice(int originating_slicer);
 106   void SetPreviousTSlice(int originating_slicer);
 107   void SetTSliceInSlicer(int tslice, int slicer);
 108
 109   void GenerateDefaultLookupTable();
 110   void SetColorWindow(double s);
 111   void SetColorLevel(double s);
 112   void SetLocalColorWindowing(const int slicer);
 113   void SetOpacity(int i, double factor);
 114   void SetColorMap();
 115   void SetColorMap(int colormap);
 116   void SetPreset(int preset);
 117   void SetOverlayColor(int color) {
 118     mOverlayColor = (color/60)*60; //SR: new vvBlendImageActor needs 0 or 255 per component
 119   }
 120   void SetFusionOpacity(int opacity) {
 121     mFusionOpacity = opacity;
 122   }
 123   void SetFusionColorMap(int colorMap) {
 124     mFusionColorMap = colorMap;
 125   }
 126   void SetFusionWindow(double window) {
 127     mFusionWindow = window;
 128   }
 129   void SetFusionLevel(double level) {
 130     mFusionLevel = level;
 131   }
 132
 133   double GetColorWindow();
 134   double GetColorLevel();
 135   int GetColorMap() {
 136     return mColorMap;
 137   }
 138   int GetPreset() {
 139     return mPreset;
 140   }
 141   int GetOverlayColor() {
 142     return mOverlayColor;
 143   }
 144
 145   int GetFusionOpacity() {
 146     return mFusionOpacity;
 147   }
 148   int GetFusionColorMap() {
 149     return mFusionColorMap;
 150   }
 151   double GetFusionWindow() {
 152     return mFusionWindow;
 153   }
 154   double GetFusionLevel() {
 155     return mFusionLevel;
 156   }
 157
 158   void SetCursorAndCornerAnnotationVisibility(int s);
 159   void UpdateViews(int current, int slicer);
 160   void UpdateLinked(int slicer);
 161   void UpdateLinkedNavigation(vvSlicer *slicer, bool bPropagate=false);
 162   void Render();
 163
 164   void AddLink(std::string newId) {
 165     mLinkedId.push_back(newId);
 166   }
 167   void RemoveLink(std::string oldId) {
 168     mLinkedId.remove(oldId);
 169   }
 170
 171   bool IsLinked() {
 172     return mLinkedId.size() > 0;
 173   }
 174
 175   ///Remove the actor defined by its type and index (example: 3rd contour)
 176   void RemoveActor(const std::string& actor_type, int overlay_index);
 177   void RemoveActors();
 178   void Reload();
 179   void ReloadOverlay();
 180   void ReloadFusion();
 181   void ReloadVF();
 182
 183   void Activated();
 184   void Picked();
 185   void UpdateInfoOnCursorPosition(int slicer);
 186   void UpdateWindowLevel();
 187   void UpdateSlice(int slicer);
 188   void UpdateTSlice(int slicer);
 189   void UpdateSliceRange(int slicer);
 190
 191   vvLandmarks *GetLandmarks();
 192   void AddLandmark(float x,float y,float z,float t);
 193
 194   void NextImage(int slicer);
 195   void PrevImage(int slicer);
 196   void LeftButtonReleaseEvent(int slicer);
 197   void VerticalSliderHasChanged(int slicer, int slice);
 198   double GetScalarComponentAsDouble(vtkImageData *image, double X, double Y, double Z, int component=0);
 199
 200 signals :
 201   void currentImageChanged(std::string id);
 202   void currentPickedImageChanged(std::string id);
 203   void UpdatePosition(int visibility,double x, double y, double z, double X, double Y, double Z, double value);
 204   void UpdateVector(int display, double x, double y, double z, double value);
 205   void UpdateOverlay(int display, double valueOver, double valueRef);
 206   void UpdateFusion(int display, double valueFus);
 207   void UpdateWindows(int slicer, int view, int slice);
 208   void UpdateSlice(int slicer, int slice);
 209   void UpdateTSlice(int slicer, int slice);
 210   void UpdateSliceRange(int slice, int min, int max, int tmin, int tmax);
 211   void WindowLevelChanged(double window, double level, int preset, int colormap);
 212   void UpdateLinkManager(std::string, int slicer, double x, double y, double z, int temps);
 213   void UpdateLinkedNavigation(std::string, vvSlicerManager*, vvSlicer*);
 214   void LandmarkAdded();
 215   void ChangeImageWithIndexOffset(vvSlicerManager *sm, int slicer, int offset);
 216   void LeftButtonReleaseSignal(int slicer);
 217   void AVerticalSliderHasChanged(int slicer, int slice);
 218
 219 protected:
 220   std::vector< vtkSmartPointer<vvSlicer> > mSlicers;
 221   vvImageReader::Pointer mReader;
 222   vvImageReader::Pointer mOverlayReader;
 223   vvImageReader::Pointer mFusionReader;
 224   vvImageReader::Pointer mVectorReader;
 225   vvImage::Pointer mImage;
 226   vvImage::Pointer mVF;
 227   int mColorMap;
 228   int mOverlayColor;
 229
 230   int mFusionOpacity;
 231   int mFusionColorMap;
 232   double mFusionWindow;
 233   double mFusionLevel;
 234
 235   int mPreset;
 236   vvImageReader::LoadedImageType mType;
 237   std::string mVFComponent;
 238   std::string mOverlayComponent;
 239   std::string mFusionComponent;
 240   std::string mFileName;
 241   std::string mBaseFileName;
 242   int mBaseFileNameNumber;
 243   std::string mId;
 244   std::string mVFName;
 245   std::string mOverlayName;
 246   std::string mFusionName;
 247   std::string mVFId;
 248   std::string mLastError;
 249   std::list<std::string> mLinkedId;
 250
 251   vvLandmarks* mLandmarks;
 252
 253   std::vector<int> mPreviousSlice;
 254   std::vector<int> mPreviousTSlice;
 255 };
 256
 257 #endif