vv/vvSlicerManager.h

   1
   2 /*=========================================================================
   3   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   4
   5   Authors belong to:
   6   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   7   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   8   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   9
  10   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  11   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  12   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  13
  14   It is distributed under dual licence
  15
  16   - BSD        See included LICENSE.txt file
  17   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  18   ===========================================================================**/
  19
  20 #ifndef VVSLICERMANAGER_H
  21 #define VVSLICERMANAGER_H
  22
  23 // std
  24 #include <iostream>
  25 #include <vector>
  26 #include <string>
  27
  28 // QT
  29 #include <QObject>
  30
  31 // VTK
  32 #include <vtksys/SystemTools.hxx>
  33 class vtkImageData;
  34 class vtkInteractorStyle;
  35 class vtkRenderWindow;
  36 class vtkPolyData;
  37
  38 // VV
  39 #include "clitkCommon.h"
  40 #include "vvImage.h"
  41 #include "vvMesh.h"
  42 #include "vvImageReader.h"
  43
  44 class vvSlicer;
  45 class vvInteractorStyleNavigator;
  46 class vvImageReader;
  47 class vvImageReader;
  48 class vvLandmarks;
  49
  50 //------------------------------------------------------------------------------
  51 class vvSlicerManager : public QObject {
  52   Q_OBJECT
  53
  54   public:
  55   vvSlicerManager(int numberOfSlicers);
  56   ~vvSlicerManager();
  57
  58   std::string GetLastError() {
  59     return mLastError;
  60   }
  61
  62   bool SetImage(std::string filename, vvImageReader::LoadedImageType type, int n=0, unsigned int slice=0);
  63   void SetImage(vvImage::Pointer image);
  64   bool SetImages(std::vector<std::string> filenames, vvImageReader::LoadedImageType type, int n=0);
  65
  66   bool SetOverlay(std::string filename, int dim, std::string component);
  67   bool SetFusion(std::string filename, int dim, std::string component);
  68   ///Set a VF by loading it from the disk
  69   bool SetVF(std::string filename);
  70   ///Set a VF from memory
  71   bool SetVF(vvImage::Pointer vf,std::string filename);
  72   ///Add a mesh to the slicers, with optional propagation using a vector field
  73   void AddContour(vvMesh::Pointer ,bool propagate=false);
  74   ///Toggle temporal superposition of contours
  75   void ToggleContourSuperposition();
  76
  77   std::string GetFileName()      { return mFileName; }
  78   std::string GetBaseFileName()  { return mBaseFileName; }
  79   int GetBaseFileNameNumber()    { return mBaseFileNameNumber; }
  80   std::string GetVFName()        { return mVFName; }
  81   std::string GetOverlayName()   { return mOverlayName; }
  82   std::string GetFusionName()    { return mFusionName; }
  83   std::string GetListOfAbsoluteFilePathInOneString(const std::string &actorType);
  84
  85   ///Switch between nearest neighbor and linear interpolation
  86   void ToggleInterpolation();
  87   vvSlicer* GetSlicer(int i);
  88   void UpdateSlicer(int num, bool state);
  89   void SetSlicerWindow(int i, vtkRenderWindow* RW);
  90   void SetInteractorStyleNavigator(int i,vtkInteractorStyle* style);
  91
  92   int GetNumberOfSlicers()        { return mSlicers.size(); }
  93   vvImage::Pointer GetImage()  { return mImage; }
  94   vvImage::Pointer GetVF()     { return mVF; }
  95   int GetType()                { return mType; }
  96   void SetId(std::string id)   { mId = id; }
  97   std::string GetId()          { return mId; }
  98   int GetDimension() {
  99     if (mImage) return mImage->GetNumberOfDimensions();
 100     else return -1;
 101   }
 102
 103   void SetFilename(std::string f, int number=0);
 104
 105   void SetSliceOrientation(int slicer, int orientation);
 106   void SetTSlice(int slice);
 107   void SetNextTSlice(int originating_slicer);
 108   void SetPreviousTSlice(int originating_slicer);
 109   void SetTSliceInSlicer(int tslice, int slicer);
 110
 111   void GenerateDefaultLookupTable();
 112   void SetColorWindow(double s);
 113   void SetColorLevel(double s);
 114   void SetOverlayColorWindow(double s);
 115   void SetOverlayColorLevel(double s);
 116   void SetLinkOverlayWindowLevel(bool b);
 117   void SetLocalColorWindowing(const int slicer, const bool bCtrlKey);
 118   void SetOpacity(int i, double factor);
 119   void SetColorMap(int colormap);
 120   void SetPreset(int preset);
 121   void SetOverlayColor(int color) {
 122     mOverlayColor = (color/60)*60; //SR: new vvBlendImageActor needs 0 or 255 per component
 123   }
 124   void SetFusionOpacity(int opacity) {
 125     mFusionOpacity = opacity;
 126   }
 127   void SetFusionThresholdOpacity(int thresOpacity) {
 128     mFusionThresOpacity = thresOpacity;
 129   }
 130   void SetFusionColorMap(int colorMap) {
 131     mFusionColorMap = colorMap;
 132   }
 133   void SetFusionWindow(double window) {
 134     mFusionWindow = window;
 135   }
 136   void SetFusionLevel(double level) {
 137     mFusionLevel = level;
 138   }
 139   void SetFusionShowLegend(int show) {
 140     mFusionShowLegend = show;
 141   }
 142
 143   double GetColorWindow();
 144   double GetColorLevel();
 145   double GetOverlayColorWindow() const;
 146   double GetOverlayColorLevel() const;
 147   bool GetLinkOverlayWindowLevel() const;
 148   int GetColorMap() {
 149     return mColorMap;
 150   }
 151   int GetPreset() {
 152     return mPreset;
 153   }
 154   int GetSlicingPreset() {
 155     return mSlicingPreset;
 156   }
 157   int GetOverlayColor() const {
 158     return mOverlayColor;
 159   }
 160   int GetFusionOpacity() const {
 161     return mFusionOpacity;
 162   }
 163   int GetFusionThresholdOpacity() const {
 164     return mFusionThresOpacity;
 165   }
 166   int GetFusionColorMap() const {
 167     return mFusionColorMap;
 168   }
 169   double GetFusionWindow() const {
 170     return mFusionWindow;
 171   }
 172   double GetFusionLevel() const {
 173     return mFusionLevel;
 174   }
 175
 176   void SetCursorAndCornerAnnotationVisibility(int s);
 177   void UpdateViews(int current, int slicer);
 178   void UpdateLinked(int slicer);
 179   void UpdateLinkedNavigation(vvSlicer *slicer, bool bPropagate=false);
 180   void ResetTransformationToIdentity(const std::string actorType);
 181   void Render();
 182
 183   void AddLink(std::string newId) {
 184     mLinkedId.push_back(newId);
 185   }
 186   void RemoveLink(std::string oldId) {
 187     mLinkedId.remove(oldId);
 188   }
 189
 190   bool IsLinked() {
 191     return mLinkedId.size() > 0;
 192   }
 193
 194   ///Remove the actor defined by its type and index (example: 3rd contour)
 195   void RemoveActor(const std::string& actor_type, int overlay_index);
 196   void RemoveActors();
 197   void Reload();
 198   void ReloadOverlay();
 199   void ReloadFusion();
 200   void ReloadVF();
 201
 202   void Activated();
 203   void Picked();
 204   void UpdateInfoOnCursorPosition(int slicer);
 205   void UpdateWindowLevel();
 206   void UpdateSlice(int slicer);
 207   void UpdateTSlice(int slicer);
 208   void UpdateSliceRange(int slicer);
 209   void SetSlicingPreset(int preset);
 210
 211   vvLandmarks *GetLandmarks();
 212   void AddLandmark(float x,float y,float z,float t);
 213
 214   void NextImage(int slicer);
 215   void PrevImage(int slicer);
 216   void LeftButtonReleaseEvent(int slicer);
 217   void VerticalSliderHasChanged(int slicer, int slice);
 218   double GetScalarComponentAsDouble(vtkImageData *image, double X, double Y, double Z, int component=0);
 219
 220 signals :
 221   void currentImageChanged(std::string id);
 222   void currentPickedImageChanged(std::string id);
 223   void UpdatePosition(int visibility,double x, double y, double z, double X, double Y, double Z, double value);
 224   void UpdateVector(int display, double x, double y, double z, double value);
 225   void UpdateOverlay(int display, double valueOver, double valueRef);
 226   void UpdateFusion(int display, double valueFus);
 227   void UpdateOrientation(int slicer, int orientation);
 228   void UpdateSlice(int slicer, int slice);
 229   void UpdateTSlice(int slicer, int slice);
 230   void UpdateSliceRange(int slice, int min, int max, int tmin, int tmax);
 231   void WindowLevelChanged();
 232   void UpdateLinkManager(std::string, int slicer, double x, double y, double z, int temps);
 233   void UpdateLinkedNavigation(std::string, vvSlicerManager*, vvSlicer*);
 234   void LandmarkAdded();
 235   void ChangeImageWithIndexOffset(vvSlicerManager *sm, int slicer, int offset);
 236   void LeftButtonReleaseSignal(int slicer);
 237   void AVerticalSliderHasChanged(int slicer, int slice);
 238
 239 protected:
 240   std::vector< vtkSmartPointer<vvSlicer> > mSlicers;
 241   vvImageReader::Pointer mReader;
 242   vvImageReader::Pointer mOverlayReader;
 243   vvImageReader::Pointer mFusionReader;
 244   vvImageReader::Pointer mVectorReader;
 245   vvImage::Pointer mImage;
 246   vvImage::Pointer mVF;
 247   int mColorMap;
 248   int mOverlayColor;
 249
 250   int mFusionOpacity;
 251   int mFusionThresOpacity;
 252   int mFusionColorMap;
 253   double mFusionWindow;
 254   double mFusionLevel;
 255   bool mFusionShowLegend;
 256
 257   int mPreset;
 258   int mSlicingPreset;
 259   vvImageReader::LoadedImageType mType;
 260   std::string mVFComponent;
 261   std::string mOverlayComponent;
 262   std::string mFusionComponent;
 263   std::string mFileName;
 264   std::string mBaseFileName;
 265   int mBaseFileNameNumber;
 266   std::string mId;
 267   std::string mVFName;
 268   std::string mOverlayName;
 269   std::string mFusionName;
 270   std::string mVFId;
 271   std::string mLastError;
 272   std::list<std::string> mLinkedId;
 273
 274   vvLandmarks* mLandmarks;
 275
 276   std::vector<int> mPreviousSlice;
 277   std::vector<int> mPreviousTSlice;
 278 };
 279
 280 #endif