vv/vvSlicerManager.h

   1
   2 /*=========================================================================
   3   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   4
   5   Authors belong to:
   6   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   7   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   8   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   9
  10   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  11   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  12   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  13
  14   It is distributed under dual licence
  15
  16   - BSD        See included LICENSE.txt file
  17   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  18   ===========================================================================**/
  19
  20 #ifndef VVSLICERMANAGER_H
  21 #define VVSLICERMANAGER_H
  22
  23 // std
  24 #include <iostream>
  25 #include <vector>
  26 #include <string>
  27
  28 // QT
  29 #include <QObject>
  30
  31 // VTK
  32 #include <vtksys/SystemTools.hxx>
  33 class vtkImageData;
  34 class vtkInteractorStyle;
  35 class vtkRenderWindow;
  36 class vtkPolyData;
  37
  38 // VV
  39 #include "clitkCommon.h"
  40 #include "vvImage.h"
  41 #include "vvMesh.h"
  42 #include "vvImageReader.h"
  43
  44 class vvSlicer;
  45 class vvInteractorStyleNavigator;
  46 class vvImageReader;
  47 class vvImageReader;
  48 class vvLandmarks;
  49
  50 //------------------------------------------------------------------------------
  51 class vvSlicerManager : public QObject {
  52   Q_OBJECT
  53
  54   public:
  55   typedef enum {WORLD_SLICING, VOXELS_SLICING} SlicingPresetType;
  56   vvSlicerManager(int numberOfSlicers);
  57   ~vvSlicerManager();
  58
  59   std::string GetLastError() {
  60     return mLastError;
  61   }
  62
  63   bool SetImage(std::string filename, vvImageReader::LoadedImageType type, int n=0, unsigned int slice=0);
  64   void SetImage(vvImage::Pointer image);
  65   bool SetImages(std::vector<std::string> filenames, vvImageReader::LoadedImageType type, int n=0);
  66
  67   bool SetOverlay(std::vector<std::string> filenames, int dim, std::string component, vvImageReader::LoadedImageType type);
  68   bool SetFusion(std::string filename, int dim, std::string component);
  69   ///Set a VF by loading it from the disk
  70   bool SetVF(std::string filename);
  71   ///Set a VF from memory
  72   bool SetVF(vvImage::Pointer vf,std::string filename);
  73   ///Add a mesh to the slicers, with optional propagation using a vector field
  74   void AddContour(vvMesh::Pointer ,bool propagate=false);
  75   ///Toggle temporal superposition of contours
  76   void ToggleContourSuperposition();
  77
  78   std::string GetFileName()      { return mFileName; }
  79   std::string GetBaseFileName()  { return mBaseFileName; }
  80   int GetBaseFileNameNumber()    { return mBaseFileNameNumber; }
  81   std::string GetVFName()        { return mVFName; }
  82   std::string GetOverlayName()   { return mOverlayName; }
  83   std::string GetFusionName()    { return mFusionName; }
  84   std::string GetListOfAbsoluteFilePathInOneString(const std::string &actorType);
  85
  86   ///Switch between nearest neighbor and linear interpolation
  87   void ToggleInterpolation();
  88   vvSlicer* GetSlicer(int i);
  89   int GetSelectedSlicer() {
  90     return mSelectedSlicer;
  91   }
  92
  93   void UpdateSlicer(int num, bool state);
  94   void SetSlicerWindow(int i, vtkRenderWindow* RW);
  95   void SetInteractorStyleNavigator(int i,vtkInteractorStyle* style);
  96
  97   int GetNumberOfSlicers()        { return mSlicers.size(); }
  98   vvImage::Pointer GetImage()  { return mImage; }
  99   vvImage::Pointer GetVF()     { return mVF; }
 100   int GetType()                { return mType; }
 101   void SetId(std::string id)   { mId = id; }
 102   std::string GetId()  const        { return mId; }
 103   int GetDimension() {
 104     if (mImage) return mImage->GetNumberOfDimensions();
 105     else return -1;
 106   }
 107
 108   void SetFilename(std::string f, int number=0);
 109
 110   void SetSliceOrientation(int slicer, int orientation);
 111   int GetTSlice();
 112   void SetTSlice(int slice);
 113   void SetNextTSlice(int originating_slicer);
 114   void SetPreviousTSlice(int originating_slicer);
 115   void SetTSliceInSlicer(int tslice, int slicer);
 116
 117   void GenerateDefaultLookupTable();
 118   void SetColorWindow(double s);
 119   void SetColorLevel(double s);
 120   void SetOverlayColorWindow(double s);
 121   void SetOverlayColorLevel(double s);
 122   void SetLinkOverlayWindowLevel(bool b);
 123   void SetLocalColorWindowing(const int slicer, const bool bCtrlKey);
 124   void SetOpacity(int i, double factor);
 125   void SetColorMap(int colormap);
 126   void SetPreset(int preset);
 127   void SetOverlayColor(int color) {
 128     mOverlayColor = (color/60)*60; //SR: new vvBlendImageActor needs 0 or 255 per component
 129   }
 130   void SetFusionOpacity(int opacity) {
 131     mFusionOpacity = opacity;
 132   }
 133   void SetFusionThresholdOpacity(int thresOpacity) {
 134     mFusionThresOpacity = thresOpacity;
 135   }
 136   void SetFusionColorMap(int colorMap) {
 137     mFusionColorMap = colorMap;
 138   }
 139   void SetFusionWindow(double window) {
 140     mFusionWindow = window;
 141   }
 142   void SetFusionLevel(double level) {
 143     mFusionLevel = level;
 144   }
 145   void SetFusionShowLegend(int show) {
 146     mFusionShowLegend = show;
 147   }
 148
 149   double GetColorWindow() const;
 150   double GetColorLevel() const;
 151   double GetOverlayColorWindow() const;
 152   double GetOverlayColorLevel() const;
 153   bool GetLinkOverlayWindowLevel() const;
 154   int GetColorMap() {
 155     return mColorMap;
 156   }
 157   int GetPreset() const {
 158     return mPreset;
 159   }
 160   SlicingPresetType GetSlicingPreset() {
 161     return mSlicingPreset;
 162   }
 163   int GetOverlayColor() const {
 164     return mOverlayColor;
 165   }
 166   int GetFusionOpacity() const {
 167     return mFusionOpacity;
 168   }
 169   int GetFusionThresholdOpacity() const {
 170     return mFusionThresOpacity;
 171   }
 172   int GetFusionColorMap() const {
 173     return mFusionColorMap;
 174   }
 175   double GetFusionWindow() const {
 176     return mFusionWindow;
 177   }
 178   double GetFusionLevel() const {
 179     return mFusionLevel;
 180   }
 181
 182   void SetCursorAndCornerAnnotationVisibility(int s);
 183   void UpdateViews(int current, int slicer);
 184   void UpdateLinked(int slicer);
 185   void UpdateLinkedNavigation(vvSlicer *slicer, bool bPropagate=false);
 186   void ResetTransformationToIdentity(const std::string actorType);
 187   void Render();
 188
 189   void AddLink(std::string newId) {
 190     mLinkedId.push_back(newId);
 191   }
 192   void RemoveLink(std::string oldId) {
 193     mLinkedId.remove(oldId);
 194   }
 195
 196   std::list<std::string> GetLinks() const {
 197     return mLinkedId;
 198   }
 199
 200   bool IsLinked() {
 201     return mLinkedId.size() > 0;
 202   }
 203
 204   ///Remove the actor defined by its type and index (example: 3rd contour)
 205   void RemoveActor(const std::string& actor_type, int overlay_index);
 206   void RemoveActors();
 207   void Reload();
 208   void ReloadOverlay();
 209   void ReloadFusion();
 210   void ReloadVF();
 211
 212   void Activated();
 213   void Picked();
 214   void UpdateInfoOnCursorPosition(int slicer);
 215   void EmitMousePositionUpdated(int slicer);
 216   void EmitKeyPressed(std::string keyPress);
 217   void UpdateWindowLevel();
 218   void UpdateSlice(int slicer);
 219   void UpdateTSlice(int slicer);
 220   void UpdateSliceRange(int slicer);
 221   void SetSlicingPreset(SlicingPresetType preset);
 222
 223   vvLandmarks *GetLandmarks();
 224   void AddLandmark(float x,float y,float z,float t);
 225
 226   void NextImage(int slicer);
 227   void PrevImage(int slicer);
 228   void LeftButtonReleaseEvent(int slicer);
 229   void VerticalSliderHasChanged(int slicer, int slice);
 230   double GetScalarComponentAsDouble(vtkImageData *image, double X, double Y, double Z, int component=0);
 231
 232 signals :
 233   void currentImageChanged(std::string id);
 234   void currentPickedImageChanged(std::string id);
 235   void UpdatePosition(int visibility,double x, double y, double z, double X, double Y, double Z, double value);
 236   void UpdateVector(int display, double x, double y, double z, double value);
 237   void UpdateOverlay(int display, double valueOver, double valueRef);
 238   void UpdateFusion(int display, double valueFus);
 239   void MousePositionUpdatedSignal(int slicer);
 240   void KeyPressedSignal(std::string KeyPressed);
 241   void UpdateOrientation(int slicer, int orientation);
 242   void UpdateSlice(int slicer, int slice);
 243   void UpdateTSlice(int slicer, int slice);
 244   void UpdateSliceRange(int slice, int min, int max, int tmin, int tmax);
 245   void WindowLevelChanged();
 246   void UpdateLinkManager(std::string, int slicer, double x, double y, double z, int temps);
 247   void UpdateLinkedNavigation(std::string, vvSlicerManager*, vvSlicer*);
 248   void LandmarkAdded();
 249   void ChangeImageWithIndexOffset(vvSlicerManager *sm, int slicer, int offset);
 250   void LeftButtonReleaseSignal(int slicer);
 251   void AVerticalSliderHasChanged(int slicer, int slice);
 252
 253 protected:
 254   std::vector< vtkSmartPointer<vvSlicer> > mSlicers;
 255   int mSelectedSlicer;
 256   vvImageReader::Pointer mReader;
 257   vvImageReader::Pointer mOverlayReader;
 258   vvImageReader::Pointer mFusionReader;
 259   vvImageReader::Pointer mVectorReader;
 260   vvImage::Pointer mImage;
 261   vvImage::Pointer mVF;
 262   int mColorMap;
 263   int mOverlayColor;
 264
 265   int mFusionOpacity;
 266   int mFusionThresOpacity;
 267   int mFusionColorMap;
 268   double mFusionWindow;
 269   double mFusionLevel;
 270   bool mFusionShowLegend;
 271
 272   int mPreset;
 273   SlicingPresetType mSlicingPreset;
 274   vvImageReader::LoadedImageType mType;
 275   std::string mVFComponent;
 276   std::string mOverlayComponent;
 277   std::string mFusionComponent;
 278   std::string mFileName;
 279   std::string mBaseFileName;
 280   int mBaseFileNameNumber;
 281   std::string mId;
 282   std::string mVFName;
 283   std::string mOverlayName;
 284   std::string mFusionName;
 285   std::string mVFId;
 286   std::string mLastError;
 287   std::list<std::string> mLinkedId;
 288
 289   vvLandmarks* mLandmarks;
 290
 291   std::vector<int> mPreviousSlice;
 292   std::vector<int> mPreviousTSlice;
 293 };
 294
 295 #endif