vv/vvToolMedianFilter.cxx

   1     /*=========================================================================
   2
   3       Program:   vv
   4       Module:    $RCSfile: vvToolMedianFilter.cxx,v $
   5       Language:  C++
   6       Date:      $Date: 2010/04/26 18:21:55 $
   7       Version:   $Revision: 1.2 $
   8       Author :   Bharath Navalpakkam (Bharath.Navalpakkam@creatis.insa-lyon.fr)
   9
  10       Copyright (C) 2010
  11       Léon Bérard cancer center http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
  12       CREATIS                   http://www.creatis.insa-lyon.fr
  13
  14       This program is free software: you can redistribute it and/or modify
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  17
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  19       but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20       MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
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  22
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  24       along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  25
  26       =========================================================================*/
  27
  28     #include "vvToolMedianFilter.h"
  29     #include "vvSlicerManager.h"
  30     #include "vvSlicer.h"
  31     #include "vvToolInputSelectorWidget.h"
  32     #include <clitkMedianImageGenericFilter.h>
  33
  34
  35     //------------------------------------------------------------------------------
  36     // Create the tool and automagically
  37     ADD_TOOL(vvToolMedianFilter);
  38     //------------------------------------------------------------------------------
  39
  40     //------------------------------------------------------------------------------
  41     vvToolMedianFilter::vvToolMedianFilter(vvMainWindowBase * parent, Qt::WindowFlags f)
  42       :vvToolWidgetBase(parent,f),
  43       vvToolBase<vvToolMedianFilter>(parent),
  44       Ui::vvToolMedianFilter()
  45       {
  46
  47       // Setup the UI
  48
  49     Ui_vvToolMedianFilter::setupUi(mToolWidget);
  50
  51     mFilter = new clitk::MedianImageGenericFilter<args_info_clitkMedianImageFilter>;
  52
  53
  54
  55       // Main filter
  56
  57       // Set how many inputs are needed for this tool
  58   AddInputSelector("Select one image", mFilter);
  59     }
  60
  61     //------------------------------------------------------------------------------
  62     vvToolMedianFilter::~vvToolMedianFilter() {
  63     }
  64     //------------------------------------------------------------------------------
  65     void vvToolMedianFilter::Initialize() {
  66       SetToolName("MedianFilter");
  67       SetToolMenuName("MedianFilter");
  68       SetToolIconFilename(":common/icons/ducky.png");
  69       SetToolTip("Make 'MedianFilter' on an image.");
  70     }
  71     //------------------------------------------------------------------------------
  72
  73   void vvToolMedianFilter::apply() {
  74
  75      GetArgsInfoFromGUI();
  76     if (!mCurrentSlicerManager) close();
  77   QApplication::setOverrideCursor(QCursor(Qt::WaitCursor));
  78   // Main filter
  79   clitk::MedianImageGenericFilter<args_info_clitkMedianImageFilter>::Pointer filter =
  80      clitk::MedianImageGenericFilter<args_info_clitkMedianImageFilter>::New();
  81    filter->SetInputVVImage(mCurrentImage);
  82    filter->SetArgsInfo(mArgsInfo);
  83    filter->EnableReadOnDisk(false);
  84    filter->Update();
  85   // Output
  86   vvImage::Pointer output = filter->GetOutputVVImage();
  87   std::ostringstream osstream;
  88   osstream << "MedianFiltered_" << mCurrentSlicerManager->GetSlicer(0)->GetFileName() << ".mhd";
  89   AddImage(output,osstream.str());
  90   QApplication::restoreOverrideCursor();
  91   close();
  92   }
  93     //------------------------------------------------------------------------------
  94   void vvToolMedianFilter::GetArgsInfoFromGUI() {
  95     /* //KEEP THIS FOR READING GGO FROM FILE
  96       int argc=1;
  97       std::string a = "toto";
  98       char * const* argv = new char*;
  99       //a.c_str();
 100       struct cmdline_parser_params p;
 101       p.check_required = 0;
 102       int good = cmdline_parser_ext(argc, argv, &args_info, &p);
 103     DD(good);
 104     */
 105     mArgsInfo.radius_given=0;
 106     mArgsInfo.verbose_flag = false;
 107    // mArgsInfo.radius_arg = new int[3];
 108   // Required (even if not used)
 109     mArgsInfo.input_given = 0;
 110     mArgsInfo.output_given = 0;
 111     mArgsInfo.input_arg=new char;
 112     mArgsInfo.output_arg = new char;
 113     mArgsInfo.config_given=0;
 114     mArgsInfo.verbose_given=0;
 115   }
 116   //------------------------------------------------------------------------------
 117 void vvToolMedianFilter::InputIsSelected(vvSlicerManager *m){
 118   mCurrentSlicerManager =m;
 119   // Specific for this gui
 120     mArgsInfo.radius_arg = new int[3];
 121   int checkdimensions=mCurrentSlicerManager->GetDimension();
 122   if(checkdimensions<3)
 123   {
 124    horizontalSlider_3->hide();
 125    spinBox_3->hide();
 126    mArgsInfo.radius_arg[2]=0;
 127    connect(horizontalSlider, SIGNAL(valueChanged(int)), this, SLOT(UpdateH1slider()));
 128    connect(horizontalSlider_2, SIGNAL(valueChanged(int)), this, SLOT(UpdateH2slider()));
 129   }
 130   else
 131   {
 132   horizontalSlider->show();
 133   horizontalSlider_2->show();
 134   horizontalSlider_3->show();
 135   connect(horizontalSlider, SIGNAL(valueChanged(int)), this, SLOT(UpdateH1slider()));
 136   connect(horizontalSlider_2, SIGNAL(valueChanged(int)), this, SLOT(UpdateH2slider()));
 137   connect(horizontalSlider_3, SIGNAL(valueChanged(int)), this, SLOT(UpdateH3slider()));
 138   }
 139 }
 140
 141 //-----------------------------------------------------------------------------
 142
 143 void vvToolMedianFilter::UpdateH1slider()
 144 {
 145
 146   mArgsInfo.radius_arg[0]=horizontalSlider->value();
 147   spinBox->setValue(mArgsInfo.radius_arg[0]);
 148 }
 149 void vvToolMedianFilter::UpdateH2slider()
 150 {
 151   mArgsInfo.radius_arg[1]=horizontalSlider_2->value();
 152   spinBox_2->setValue(mArgsInfo.radius_arg[1]);
 153 }
 154 void vvToolMedianFilter::UpdateH3slider()
 155 {
 156   mArgsInfo.radius_arg[2]=horizontalSlider_3->value();
 157   spinBox_3->setValue(mArgsInfo.radius_arg[2]);
 158 }