vv/vvToolSegmentation.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ===========================================================================**/
  18 #ifndef VVTOOLSEGMENTATION_H
  19 #define VVTOOLSEGMENTATION_H
  20
  21 #include <QtGlobal>
  22 #if QT_VERSION < 0x050000
  23 #include <QtDesigner/QDesignerExportWidget>
  24 #else
  25 #include <QtUiPlugin/QDesignerExportWidget>
  26 #endif
  27
  28 #include "vvToolBase.h"
  29 #include "vvToolWidgetBase.h"
  30 #include "vvROIActor.h"
  31 #include "ui_vvToolSegmentation.h"
  32
  33 #include "vtkLookupTable.h"
  34
  35 //------------------------------------------------------------------------------
  36 class vvToolSegmentation:
  37   public vvToolWidgetBase,
  38   public vvToolBase<vvToolSegmentation>,
  39   private Ui::vvToolSegmentation
  40 {
  41   Q_OBJECT
  42     public:
  43   vvToolSegmentation(vvMainWindowBase * parent=0, Qt::WindowFlags f=0);
  44   ~vvToolSegmentation();
  45
  46   //-----------------------------------------------------
  47   static void Initialize();
  48   virtual void InputIsSelected(vvSlicerManager * m);
  49   void OpenBinaryImage();
  50   void RegionGrowing();
  51   void Erode();
  52   void Dilate();
  53   void Labelize();
  54   void Merge();
  55   void RemoveLabel();
  56   void UpdateAndRenderNewMask();
  57
  58   //-----------------------------------------------------
  59   public slots:
  60   virtual void apply();
  61   void KeyPressed(std::string KeyPress);
  62   virtual bool close();
  63   virtual void MousePositionChanged(int slicer);
  64
  65  protected:
  66   Ui::vvToolSegmentation ui;
  67   QSharedPointer<vvROIActor> mRefMaskActor;
  68   QSharedPointer<vvROIActor> mCurrentMaskActor;
  69   std::vector<QSharedPointer<vvROIActor> > mCurrentCCLActors;
  70   vvImage::Pointer mRefMaskImage;
  71   vvImage::Pointer mCurrentMaskImage;
  72   vvImage::Pointer mCurrentCCLImage;
  73   int mKernelValue;
  74   vtkSmartPointer<vtkLookupTable> mDefaultLUTColor;
  75   enum { State_Default, State_CCL};
  76   int mCurrentState;
  77
  78   QSharedPointer<vvROIActor> CreateMaskActor(vvImage::Pointer image, int i, int colorID, bool BGMode=false);
  79
  80   double mCurrentLabelUnderMousePointer;
  81   std::vector<double> mCurrentMousePositionInMM;
  82   //std::vector<double> mCurrentMousePositionInPixel;
  83   double GetBackgroundValue() { return 0; }
  84   double GetForegroundValue() { return 1; }
  85   long ComputeNumberOfPixels(vvImage::Pointer image, double value);
  86
  87   // Compute and store sizes of mask Foreground
  88   void   UpdateMaskSize(vvImage::Pointer image, long & pix, double & cc);
  89   void   UpdateMaskSizeLabels();
  90   long   mRefMaskSizeInPixels;
  91   double mRefMaskSizeInCC;
  92   long   mCurrentMaskSizeInPixels;
  93   double mCurrentMaskSizeInCC;
  94
  95 }; // end class vvToolSegmentation
  96 //------------------------------------------------------------------------------
  97
  98 #endif