vv/vvToolStructureSetManager.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17   ===========================================================================**/
  18
  19 // vv
  20 #include "vvToolStructureSetManager.h"
  21 #include "vvImageReader.h"
  22 #include "vvStructureSetActor.h"
  23 #include "vvSlicer.h"
  24 #include "vvROIActor.h"
  25
  26 // Qt
  27 #include <QFileDialog>
  28 #include <QMessageBox>
  29 #include <QColorDialog>
  30 #include <QAbstractEventDispatcher>
  31
  32 // vtk
  33 #include <vtkLookupTable.h>
  34 #include <vtkRenderWindow.h>
  35
  36 //------------------------------------------------------------------------------
  37 // Create the tool and automagically (I like this word) insert it in
  38 // the main window menu.
  39 ADD_TOOL(vvToolStructureSetManager);
  40 //------------------------------------------------------------------------------
  41
  42 int vvToolStructureSetManager::m_NumberOfTool = 0;
  43 std::vector<vvSlicerManager*> vvToolStructureSetManager::mListOfInputs;
  44 std::map<vvSlicerManager*, vvToolStructureSetManager*> vvToolStructureSetManager::mListOfOpenTool;
  45
  46 //------------------------------------------------------------------------------
  47 vvToolStructureSetManager::vvToolStructureSetManager(vvMainWindowBase * parent,
  48                                                      Qt::WindowFlags f,
  49                                                      vvSlicerManager * current):
  50   vvToolWidgetBase(parent, f),
  51   // if Qt::Widget -> No dialog in this case (in tab) ; PB = "invisible widget on menu" !
  52   // if "f" normal widget
  53   vvToolBase<vvToolStructureSetManager>(parent),
  54   Ui::vvToolStructureSetManager()
  55 {
  56   Ui_vvToolStructureSetManager::setupUi(mToolWidget);
  57
  58   //  this->setFixedWidth(120);
  59   m_NumberOfTool++;
  60   mCurrentStructureSetActor = 0;
  61   connect(mCloseButton, SIGNAL(clicked()), this, SLOT(close()));
  62   mCloseButton->setVisible(false);
  63   mTree->clear();
  64   mTree->header()->resizeSection(0, 30);
  65   mMainWindowBase->GetTab()->setTabIcon(mTabNumber, GetToolIcon());
  66   mCurrentStructureSet = NULL;
  67   mCurrentStructureSetIndex = -1;
  68   mGroupBoxROI->setEnabled(false);
  69   mCurrentROIActor = NULL;
  70   mIsAllVisibleEnabled = false;
  71   mNumberOfVisibleROI = 0;
  72   mNumberOfVisibleContourROI = 0;
  73   mDefaultLUTColor = vtkSmartPointer<vtkLookupTable>::New();
  74   for(int i=0; i<mDefaultLUTColor->GetNumberOfTableValues(); i++) {
  75     double r = (rand()/(RAND_MAX+1.0));
  76     double v = (rand()/(RAND_MAX+1.0));
  77     double b = (rand()/(RAND_MAX+1.0));
  78     mDefaultLUTColor->SetTableValue(i, r, v, b);
  79     //    std::cout << "mDefaultLUTColor->SetTableValue(" << i << ", " << r << ", " << v << ", " << b << ");" << std::endl;
  80   }
  81 #include "vvDefaultLut.h"
  82
  83   // Add input selector
  84   if (current == NULL) {
  85     MustOpenDialogWhenCreated = true;
  86     AddInputSelector("Select image");
  87   }
  88   else {
  89     MustOpenDialogWhenCreated = false;
  90     mMainButtonBox->setEnabled(true);
  91     mCurrentSlicerManager = current;
  92     mCurrentImage = mCurrentSlicerManager->GetImage();
  93     mToolWidget->setEnabled(true);
  94     InputIsSelected(mCurrentSlicerManager);
  95   }
  96 }
  97 //------------------------------------------------------------------------------
  98
  99
 100 //------------------------------------------------------------------------------
 101 vvToolStructureSetManager::~vvToolStructureSetManager()
 102 {
 103   m_NumberOfTool--;
 104
 105   // clearing the list at this point avoids
 106   // segfaulting due to events being dispatched
 107   // after object destruction
 108   mTreeWidgetList.clear();
 109   mTree->clearSelection();
 110
 111   //std::cout << "vvToolStructureSetManager::~vvToolStructureSetManager()" << std::endl;
 112 }
 113 //------------------------------------------------------------------------------
 114
 115
 116 //------------------------------------------------------------------------------
 117 // STATIC
 118 void vvToolStructureSetManager::Initialize() {
 119   SetToolName("ROIManager");
 120   SetToolMenuName("Display ROI (binary image)");
 121   SetToolIconFilename(":/common/icons/tool-roi.png");
 122   SetToolTip("Display ROI from a binary image.");
 123   SetToolExperimental(false);
 124 }
 125 //------------------------------------------------------------------------------
 126
 127
 128 //------------------------------------------------------------------------------
 129 void vvToolStructureSetManager::InputIsSelected(vvSlicerManager *m)
 130 {
 131   //std::cout << "vvToolStructureSetManager::InputIsSelected()" << std::endl;
 132
 133   //int mTabNumber = parent->GetTab()->addTab(this, "");
 134   //  this->setFixedWidth(120);
 135   //this->setPreferedHeight(441);
 136   // Refuse if 4D
 137   if (mCurrentImage->GetNumberOfDimensions() != 3) {
 138     QMessageBox::information(this,tr("Sorry only 3D yet"), tr("Sorry only 3D yet"));
 139     close();
 140     return;
 141   }
 142   // Hide selector
 143   HideInputSelector(); // splitter
 144   mToolInputSelectionWidget->hide();
 145   mLabelInputInfo->setText(QString("%1").arg(m->GetFileName().c_str()));
 146
 147   // add to instance
 148   // if (!isWindow()) {
 149   mListOfInputs.push_back(mCurrentSlicerManager);
 150   mListOfOpenTool[mCurrentSlicerManager] = this;
 151   // }
 152
 153   // Connect open menus
 154   connect(mOpenBinaryButton, SIGNAL(clicked()), this, SLOT(OpenBinaryImage()));
 155   connect(mTree, SIGNAL(itemSelectionChanged()), this, SLOT(SelectedItemChangedInTree()));
 156   connect(mCheckBoxShow, SIGNAL(toggled(bool)), this, SLOT(VisibleROIToggled(bool)));
 157   connect(mOpacitySlider, SIGNAL(valueChanged(int)), this, SLOT(OpacityChanged(int)));
 158   connect(mChangeColorButton, SIGNAL(clicked()), this, SLOT(ChangeColor()));
 159   connect(mContourCheckBoxShow, SIGNAL(toggled(bool)), this, SLOT(VisibleContourROIToggled(bool)));
 160   connect(mChangeContourColorButton, SIGNAL(clicked()), this, SLOT(ChangeContourColor()));
 161   connect(mContourWidthSpinBox, SIGNAL(valueChanged(int)), this, SLOT(ChangeContourWidth(int)));
 162   connect(mReloadButton, SIGNAL(clicked()), this, SLOT(ReloadCurrentROI()));
 163   connect(mCheckBoxShowAll, SIGNAL(stateChanged(int)), this, SLOT(AllVisibleROIToggled(int)));
 164   connect(mContourCheckBoxShowAll, SIGNAL(toggled(bool)), this, SLOT(AllVisibleContourROIToggled(bool)));
 165
 166   // Browse to load image
 167   if (MustOpenDialogWhenCreated)
 168     OpenBinaryImage();
 169 }
 170 //------------------------------------------------------------------------------
 171
 172
 173 //------------------------------------------------------------------------------
 174 void vvToolStructureSetManager::Open(int type) {
 175   switch (type) {
 176   case 0: OpenBinaryImage(); return; // Open binary image;
 177   case 1: DD("TODO"); return; // Open DICOM RT
 178   case 2: DD("TODO"); return; // Open mesh
 179   default: std::cerr << "Error ????" << std::endl; exit(0);
 180   }
 181 }
 182 //------------------------------------------------------------------------------
 183
 184
 185 //------------------------------------------------------------------------------
 186 void vvToolStructureSetManager::AddRoiInTreeWidget(clitk::DicomRT_ROI * roi, QTreeWidget * ww) {
 187   mTreeWidgetList.push_back(QSharedPointer<QTreeWidgetItem>(new QTreeWidgetItem(ww)));
 188   QTreeWidgetItem * w = mTreeWidgetList.back().data();
 189   w->setText(0, QString("%1").arg(roi->GetROINumber()));
 190   w->setText(1, QString("%1").arg(roi->GetName().c_str()));
 191   QBrush brush(QColor(roi->GetDisplayColor()[0]*255, roi->GetDisplayColor()[1]*255, roi->GetDisplayColor()[2]*255));
 192   brush.setStyle(Qt::SolidPattern);
 193   w->setBackground(2, brush);
 194   mMapROIToTreeWidget[roi] = w;
 195   mMapTreeWidgetToROI[w] = roi;
 196   mTree->resizeColumnToContents(0);
 197   mTree->resizeColumnToContents(1);
 198 }
 199 //------------------------------------------------------------------------------
 200
 201
 202 //------------------------------------------------------------------------------
 203 void vvToolStructureSetManager::UpdateStructureSetInTreeWidget(int index, clitk::DicomRT_StructureSet * s) {
 204   // Insert ROI
 205   /*
 206   const std::vector<clitk::DicomRT_ROI::Pointer> & rois = s->GetListOfROI();
 207   for(unsigned int i=0; i<rois.size(); i++) {
 208     if (mMapROIToTreeWidget.find(rois[i]) == mMapROIToTreeWidget.end())
 209       AddRoiInTreeWidget(rois[i], mTree); // replace mTree with ss if several SS
 210   }
 211   */
 212   clitk::DicomRT_StructureSet::ROIConstIteratorType iter;
 213   for(iter = s->GetROIs().begin(); iter != s->GetROIs().end(); iter++) {
 214     clitk::DicomRT_ROI::Pointer roi = iter->second;
 215     if (mMapROIToTreeWidget.find(roi) == mMapROIToTreeWidget.end())
 216       AddRoiInTreeWidget(roi, mTree); // replace mTree with ss if several SS
 217   }
 218 }
 219 //------------------------------------------------------------------------------
 220
 221
 222 //------------------------------------------------------------------------------
 223 int vvToolStructureSetManager::AddStructureSet(clitk::DicomRT_StructureSet * mStructureSet) {
 224   // Create actor for this SS
 225
 226   QSharedPointer<vvStructureSetActor> mStructureSetActor(new vvStructureSetActor);
 227
 228   mStructureSetActor->SetStructureSet(mStructureSet);
 229   mStructureSetActor->SetSlicerManager(mCurrentSlicerManager);
 230   // Insert in lists and get index
 231   mStructureSetsList.push_back(mStructureSet);
 232   mStructureSetActorsList.push_back(mStructureSetActor);
 233   int index = mStructureSetsList.size()-1;
 234   // Return index
 235   return index;
 236 }
 237 //------------------------------------------------------------------------------
 238
 239
 240 //------------------------------------------------------------------------------
 241 void vvToolStructureSetManager::OpenBinaryImage()
 242 {
 243   int index;
 244   if (mCurrentStructureSet == NULL) {
 245     if (mStructureSetsList.size() == 0) { // Create a default SS
 246       clitk::DicomRT_StructureSet::Pointer mStructureSet = clitk::DicomRT_StructureSet::New();
 247       index = AddStructureSet(mStructureSet);
 248     }
 249     else { // Get first SS
 250       index = 0;
 251     }
 252   } else {
 253     index = mCurrentStructureSetIndex;
 254   }
 255   mCurrentStructureSet = mStructureSetsList[index];
 256   mCurrentStructureSetActor = mStructureSetActorsList[index].data();
 257   mCurrentStructureSetIndex = index;
 258   // Open images
 259   QString Extensions = "Images files ( *.mha *.mhd *.hdr *.his)";
 260   Extensions += ";;All Files (*)";
 261   QStringList filename =
 262     QFileDialog::getOpenFileNames(this,tr("Open binary image"),
 263                                   mMainWindowBase->GetInputPathName(),Extensions);
 264   if (filename.size() == 0) return;
 265   mLoadedROIIndex.clear();
 266   for(int i=0; i<filename.size(); i++) {
 267     // Open Image
 268     QApplication::setOverrideCursor(QCursor(Qt::WaitCursor));
 269     vvImageReader::Pointer reader = vvImageReader::New();
 270     std::vector<std::string> filenames;
 271     filenames.push_back(filename[i].toStdString());
 272     reader->SetInputFilenames(filenames);
 273     reader->Update(vvImageReader::IMAGE);
 274     QApplication::restoreOverrideCursor();
 275
 276     if (reader->GetLastError().size() != 0) {
 277       std::cerr << "Error while reading " << filename[i].toStdString() << std::endl;
 278       QString error = "Cannot open file \n";
 279       error += reader->GetLastError().c_str();
 280       QMessageBox::information(this,tr("Reading problem"),error);
 281       return;
 282     }
 283     vvImage::Pointer binaryImage = reader->GetOutput();
 284     AddImage(binaryImage, filename[i].toStdString(), mBackgroundValueSpinBox->value());
 285     mOpenedBinaryImage.push_back(binaryImage);
 286   }
 287
 288   UpdateImage();
 289 }
 290 //------------------------------------------------------------------------------
 291
 292
 293 //------------------------------------------------------------------------------
 294 void vvToolStructureSetManager::UpdateImage()
 295 {
 296   // Update the TreeWidget
 297   UpdateStructureSetInTreeWidget(mCurrentStructureSetIndex, mCurrentStructureSet);
 298   // Render loaded ROIs (the first is sufficient)
 299   for(unsigned int i=0; i<mLoadedROIIndex.size(); i++) {
 300     mCurrentStructureSetActor->GetROIActor(mLoadedROIIndex[i])->Update();
 301   }
 302   for(int i=0; i<mCurrentSlicerManager->GetNumberOfSlicers(); i++) {
 303     mCurrentSlicerManager->GetSlicer(i)->Render();
 304   }
 305 }
 306 //------------------------------------------------------------------------------
 307
 308
 309 //------------------------------------------------------------------------------
 310 void vvToolStructureSetManager::AddImage(vvImage * binaryImage, std::string filename,
 311                                          double BG, bool m_modeBG)
 312 {
 313   // Check current structure set
 314   int index;
 315   if (mCurrentStructureSet == NULL) {
 316     if (mStructureSetsList.size() == 0) { // Create a default SS
 317       clitk::DicomRT_StructureSet::Pointer mStructureSet = clitk::DicomRT_StructureSet::New();
 318       index = AddStructureSet(mStructureSet);
 319     }
 320     else { // Get first SS
 321       index = 0;
 322     }
 323   } else {
 324     index = mCurrentStructureSetIndex;
 325   }
 326   mCurrentStructureSet = mStructureSetsList[index];
 327   mCurrentStructureSetActor = mStructureSetActorsList[index].data();
 328   mCurrentStructureSetIndex = index;
 329
 330   // Check Dimension
 331   int dim = mCurrentImage->GetNumberOfDimensions();
 332   int bin_dim = binaryImage->GetNumberOfDimensions();
 333   if (dim < bin_dim) {  ////////// TO CHANGE FOR 3D/4D
 334     std::ostringstream os;
 335     os << "Error. Loaded binary image is " << bin_dim
 336        << "D while selected image is " << dim << "D" << std::endl;
 337     QMessageBox::information(this,tr("Reading problem"),os.str().c_str());
 338     return;
 339   }
 340
 341   // Add a new roi to the structure
 342   int n = mCurrentStructureSet->AddBinaryImageAsNewROI(binaryImage, filename);
 343   mLoadedROIIndex.push_back(n);
 344   if (m_modeBG)
 345     mCurrentStructureSet->GetROIFromROINumber(n)->SetBackgroundValueLabelImage(BG);
 346   else
 347     mCurrentStructureSet->GetROIFromROINumber(n)->SetForegroundValueLabelImage(BG);
 348
 349   // Change color
 350   if (n<mDefaultLUTColor->GetNumberOfTableValues ()) {
 351     double * color = mDefaultLUTColor->GetTableValue(n % mDefaultLUTColor->GetNumberOfTableValues ());
 352     mCurrentStructureSet->GetROIFromROINumber(n)->SetDisplayColor(color[0], color[1], color[2]);
 353   }
 354
 355   // Add a new roi actor
 356   mCurrentStructureSetActor->CreateNewROIActor(n, m_modeBG);
 357
 358   // CheckBox for "All"
 359   if (mCurrentStructureSetActor->GetROIActor(n)->IsVisible())
 360     mNumberOfVisibleROI++;
 361   if (mCurrentStructureSetActor->GetROIActor(n)->IsContourVisible())
 362     mNumberOfVisibleContourROI++;
 363   UpdateAllROIStatus();
 364 }
 365 //------------------------------------------------------------------------------
 366
 367
 368 //------------------------------------------------------------------------------
 369 void vvToolStructureSetManager::apply()
 370 {
 371   close();
 372 }
 373 //------------------------------------------------------------------------------
 374
 375
 376 //------------------------------------------------------------------------------
 377 bool vvToolStructureSetManager::close()
 378 {
 379   //std::cout << "vvToolStructureSetManager::close()" << std::endl;
 380
 381   return vvToolWidgetBase::close();
 382 }
 383 //------------------------------------------------------------------------------
 384
 385
 386 //------------------------------------------------------------------------------
 387 void vvToolStructureSetManager::closeEvent(QCloseEvent *event)
 388 {
 389   //std::cout << "vvToolStructureSetManager::closeEvent()" << std::endl;
 390
 391   std::vector<vvSlicerManager*>::iterator iter = std::find(mListOfInputs.begin(), mListOfInputs.end(), mCurrentSlicerManager);
 392   if (iter != mListOfInputs.end()) mListOfInputs.erase(iter);
 393
 394   //  DD("how delete mListOfOpenTool ???");
 395   mListOfOpenTool.erase(mCurrentSlicerManager);
 396
 397   mCheckBoxShowAll->setCheckState(Qt::Unchecked);
 398   mContourCheckBoxShowAll->setCheckState(Qt::Unchecked);
 399   if (mCurrentSlicerManager != 0)
 400     mCurrentSlicerManager->Render();
 401
 402   if (!isWindow()) {
 403     if (m_NumberOfTool == 1) {
 404       mMainWindow->GetTab()->removeTab(mTabNumber);
 405     }
 406   }
 407
 408   event->accept();
 409 }
 410 //------------------------------------------------------------------------------
 411
 412
 413 //------------------------------------------------------------------------------
 414 // CURRENT ROI INTERACTION
 415 //------------------------------------------------------------------------------
 416
 417
 418 //------------------------------------------------------------------------------
 419 void vvToolStructureSetManager::SelectedItemChangedInTree() {
 420
 421   // Search which roi is selected
 422   QList<QTreeWidgetItem *> l = mTree->selectedItems();
 423   if (l.size() == 0) {
 424     mCurrentROIActor = NULL;
 425     mCurrentROI = NULL;
 426     mGroupBoxROI->setEnabled(false);
 427     return;
 428   }
 429   QTreeWidgetItem * w = l[0];
 430   //std::cout << "selected item -> " << w->text(1).toStdString() << std::endl;
 431   //std::cout << "m_NumberOfTool -> " << m_NumberOfTool << std::endl;
 432   if (mMapTreeWidgetToROI.find(w) == mMapTreeWidgetToROI.end()) {
 433     mCurrentROIActor = NULL;
 434     mCurrentROI = NULL;
 435     mGroupBoxROI->setEnabled(false);
 436     return;
 437   }
 438   clitk::DicomRT_ROI * roi = mMapTreeWidgetToROI[w];
 439   // Get selected roi actor
 440   vvROIActor * actor = mStructureSetActorsList[mCurrentStructureSetIndex]->GetROIActor(roi->GetROINumber());
 441   mCurrentROI = roi;
 442   mCurrentROIActor = actor;
 443
 444   // Update GUI
 445   mGroupBoxROI->setEnabled(true);
 446   mROInameLabel->setText(roi->GetName().c_str());
 447   mCheckBoxShow->setChecked(actor->IsVisible());
 448   mContourCheckBoxShow->setChecked(actor->IsContourVisible());
 449   mContourWidthSpinBox->setValue(actor->GetContourWidth());
 450
 451   // Warning -> avoir unuseful Render here by disconnect slider
 452   disconnect(mOpacitySlider, SIGNAL(valueChanged(int)),
 453              this, SLOT(OpacityChanged(int)));
 454   mOpacitySlider->setValue((int)lrint(actor->GetOpacity()*100));
 455   mOpacitySpinBox->setValue((int)lrint(actor->GetOpacity()*100));
 456   connect(mOpacitySlider, SIGNAL(valueChanged(int)),
 457           this, SLOT(OpacityChanged(int)));
 458   actor->Update();
 459
 460   // Final rendering
 461   mCurrentSlicerManager->Render();
 462 }
 463 //------------------------------------------------------------------------------
 464
 465
 466 //------------------------------------------------------------------------------
 467 void vvToolStructureSetManager::UpdateAllROIStatus() {
 468   int nbVisible = 0;
 469   int nb = mCurrentStructureSetActor->GetROIList().size();
 470   for(int i=0; i<nb; i++) {
 471     if (mCurrentStructureSetActor->GetROIList()[i]->IsVisible()) {
 472       nbVisible++;
 473     }
 474   }
 475
 476   disconnect(mCheckBoxShowAll, SIGNAL(stateChanged(int)), this, SLOT(AllVisibleROIToggled(int)));
 477   disconnect(mContourCheckBoxShowAll, SIGNAL(toggled(bool)), this, SLOT(AllVisibleContourROIToggled(bool)));
 478   if (nbVisible == nb) mCheckBoxShowAll->setCheckState(Qt::Checked);
 479   else {
 480     if (nbVisible == 0) mCheckBoxShowAll->setCheckState(Qt::Unchecked);
 481     else mCheckBoxShowAll->setCheckState(Qt::PartiallyChecked);
 482   }
 483   connect(mContourCheckBoxShowAll, SIGNAL(toggled(bool)), this, SLOT(AllVisibleContourROIToggled(bool)));
 484   connect(mCheckBoxShowAll, SIGNAL(stateChanged(int)), this, SLOT(AllVisibleROIToggled(int)));
 485 }
 486 //------------------------------------------------------------------------------
 487
 488 //------------------------------------------------------------------------------
 489 void vvToolStructureSetManager::VisibleROIToggled(bool b) {
 490   if (mCurrentROIActor == NULL) return;
 491   if (b == mCurrentROIActor->IsVisible()) return; // nothing to do
 492   mCurrentROIActor->SetVisible(b);
 493   UpdateAllROIStatus();
 494   mCurrentSlicerManager->Render();
 495 }
 496 //------------------------------------------------------------------------------
 497
 498
 499 //------------------------------------------------------------------------------
 500 void vvToolStructureSetManager::VisibleContourROIToggled(bool b) {
 501   if (mCurrentROIActor == NULL) return;
 502   if (mCurrentROIActor->IsContourVisible() == b) return; // nothing to do
 503   mCurrentROIActor->SetContourVisible(b);
 504   mCurrentROIActor->UpdateColor();
 505   mCurrentSlicerManager->Render();
 506 }
 507 //------------------------------------------------------------------------------
 508
 509
 510 //------------------------------------------------------------------------------
 511 void vvToolStructureSetManager::OpacityChanged(int v) {
 512   if (mCurrentROIActor == NULL) return;
 513   mCurrentROIActor->SetOpacity((double)v/100.0);
 514   mCurrentROIActor->UpdateColor();
 515   mCurrentSlicerManager->Render();
 516 }
 517 //------------------------------------------------------------------------------
 518
 519
 520 //------------------------------------------------------------------------------
 521 void vvToolStructureSetManager::AllVisibleROIToggled(int b) {
 522   bool status = false;
 523   if ((mCheckBoxShowAll->checkState() == Qt::Checked) ||
 524       (mCheckBoxShowAll->checkState() == Qt::PartiallyChecked))  status = true;
 525
 526   for(int i=0; i<mCurrentStructureSetActor->GetNumberOfROIs(); i++) {
 527     mCurrentStructureSetActor->GetROIList()[i]->SetVisible(status);
 528   }
 529   if (status) mCheckBoxShowAll->setCheckState(Qt::Checked);
 530   else  mCheckBoxShowAll->setCheckState(Qt::Unchecked);
 531   mCheckBoxShow->setChecked(status);
 532   mCurrentSlicerManager->Render();
 533 }
 534 //------------------------------------------------------------------------------
 535
 536
 537 //------------------------------------------------------------------------------
 538 void vvToolStructureSetManager::AllVisibleContourROIToggled(bool b) {
 539   bool status = false;
 540   if ((mContourCheckBoxShowAll->checkState() == Qt::Checked) ||
 541       (mContourCheckBoxShowAll->checkState() == Qt::PartiallyChecked))  status = true;
 542   // Update current
 543   for(int i=0; i<mCurrentStructureSetActor->GetNumberOfROIs(); i++) {
 544     mCurrentStructureSetActor->GetROIList()[i]->SetContourVisible(status);
 545   }
 546   // Update current selection
 547   if (status) mContourCheckBoxShowAll->setCheckState(Qt::Checked);
 548   else  mContourCheckBoxShowAll->setCheckState(Qt::Unchecked);
 549   mContourCheckBoxShow->setChecked(status);
 550   mCurrentSlicerManager->Render();
 551 }
 552 //------------------------------------------------------------------------------
 553
 554
 555 //------------------------------------------------------------------------------
 556 void vvToolStructureSetManager::ChangeColor() {
 557   QColor color;
 558   color.setRgbF(mCurrentROIActor->GetROI()->GetDisplayColor()[0],
 559                 mCurrentROIActor->GetROI()->GetDisplayColor()[1],
 560                 mCurrentROIActor->GetROI()->GetDisplayColor()[2]);
 561   QColor c = QColorDialog::getColor(color, this, "Choose the ROI color");
 562   mCurrentROIActor->GetROI()->SetDisplayColor(c.redF(), c.greenF(), c.blueF());
 563   mCurrentROIActor->UpdateColor();
 564
 565   QTreeWidgetItem * w = mMapROIToTreeWidget[mCurrentROI];
 566   QBrush brush(QColor(mCurrentROI->GetDisplayColor()[0]*255,
 567                       mCurrentROI->GetDisplayColor()[1]*255,
 568                       mCurrentROI->GetDisplayColor()[2]*255));
 569   brush.setStyle(Qt::SolidPattern);
 570   w->setBackground(2, brush);
 571   // Render
 572   mCurrentSlicerManager->Render();
 573 }
 574 //------------------------------------------------------------------------------
 575
 576
 577 //------------------------------------------------------------------------------
 578 void vvToolStructureSetManager::ChangeContourColor() {
 579   QColor color;
 580   color.setRgbF(mCurrentROIActor->GetContourColor()[0],
 581                 mCurrentROIActor->GetContourColor()[1],
 582                 mCurrentROIActor->GetContourColor()[2]);
 583   QColor c = QColorDialog::getColor(color, this, "Choose the contour color");
 584   mCurrentROIActor->SetContourColor(c.redF(), c.greenF(), c.blueF());
 585   mCurrentROIActor->UpdateColor();
 586   mCurrentSlicerManager->Render();
 587 }
 588 //------------------------------------------------------------------------------
 589
 590
 591 //------------------------------------------------------------------------------
 592 void vvToolStructureSetManager::ChangeContourWidth(int n) {
 593   mCurrentROIActor->SetContourWidth(n);
 594   mCurrentROIActor->UpdateColor();
 595   mCurrentSlicerManager->Render();
 596 }
 597 //------------------------------------------------------------------------------
 598
 599
 600 //------------------------------------------------------------------------------
 601 void vvToolStructureSetManager::ReloadCurrentROI() {
 602   // Reload image
 603   vvImageReader::Pointer reader = vvImageReader::New();
 604   reader->SetInputFilename(mCurrentROI->GetFilename());
 605   reader->Update(vvImageReader::IMAGE);
 606   if (reader->GetLastError() != "") {
 607     QMessageBox::information(mMainWindowBase, tr("Sorry, error. Could not reload"), reader->GetLastError().c_str());
 608     return;
 609   }
 610   mCurrentROI->GetImage()->GetFirstVTKImageData()->ReleaseData();
 611   mCurrentROI->SetImage(reader->GetOutput());
 612
 613   // Update visu"
 614   mCurrentROIActor->UpdateImage();
 615   mCurrentSlicerManager->Render();
 616 }
 617 //------------------------------------------------------------------------------
 618
 619
 620 //------------------------------------------------------------------------------
 621 void vvToolStructureSetManager::CheckInputList(std::vector<vvSlicerManager*> & l, int & index)
 622 {
 623   for(unsigned int i=0; i<l.size(); i++) {
 624     std::vector<vvSlicerManager*>::iterator iter = std::find(mListOfInputs.begin(), mListOfInputs.end(), l[i]);
 625     if (iter != mListOfInputs.end()) {
 626       for(unsigned int j=i;j<l.size(); j++) l[j] = l[j+1];
 627       l.pop_back();
 628       if (index == (int)i) index = 0;
 629       i--;
 630     }
 631   }
 632 }
 633 //------------------------------------------------------------------------------
 634
 635
 636 //------------------------------------------------------------------------------
 637 // STATIC
 638 vvToolStructureSetManager * vvToolStructureSetManager::AddImage(vvSlicerManager * m, std::string name, vvImage::Pointer image, double BG, bool m_modeBG)
 639 {
 640   // If the tool is open for this vvSlicerManager, use it and return
 641   if (mListOfOpenTool[m]) {
 642     vvToolStructureSetManager * tool = mListOfOpenTool[m];
 643     tool->AddImage(image, name, BG, m_modeBG);
 644     tool->UpdateImage();
 645     return tool;
 646   }
 647
 648   // If the tool is not open, create it
 649   vvToolStructureSetManager * tool = new vvToolStructureSetManager
 650     (CREATOR(vvToolStructureSetManager)->GetMainWindow(), Qt::Dialog, m);
 651   tool->AddImage(image, name, BG, m_modeBG);
 652   tool->UpdateImage();
 653   tool->show();
 654   return tool;
 655 }
 656 //------------------------------------------------------------------------------