// gdcmElValSet.cxx #include #include "gdcmUtil.h" #include "gdcmElValSet.h" #define DEBUG 0 TagElValueHT & gdcmElValSet::GetTagHt(void) { return tagHt; } void gdcmElValSet::Add(gdcmElValue * newElValue) { tagHt [newElValue->GetKey()] = newElValue; NameHt[newElValue->GetName()] = newElValue; } void gdcmElValSet::Print(ostream & os) { for (TagElValueHT::iterator tag = tagHt.begin(); tag != tagHt.end(); ++tag){ os << tag->first << ": "; os << "[" << tag->second->GetValue() << "]"; os << "[" << tag->second->GetName() << "]"; os << "[" << tag->second->GetVR() << "]"; os << " lgr : " << tag->second->GetLength(); os << endl; } } void gdcmElValSet::PrintByName(ostream & os) { for (TagElValueNameHT::iterator tag = NameHt.begin(); tag != NameHt.end(); ++tag){ os << tag->first << ": "; os << "[" << tag->second->GetValue() << "]"; os << "[" << tag->second->GetKey() << "]"; os << "[" << tag->second->GetVR() << "]" << endl; } } gdcmElValue* gdcmElValSet::GetElementByNumber(guint16 group, guint16 element) { TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, element); if ( ! tagHt.count(key)) return (gdcmElValue*)0; return tagHt.find(key)->second; } gdcmElValue* gdcmElValSet::GetElementByName(string TagName) { if ( ! NameHt.count(TagName)) return (gdcmElValue*)0; return NameHt.find(TagName)->second; } string gdcmElValSet::GetElValueByNumber(guint16 group, guint16 element) { TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, element); if ( ! tagHt.count(key)) return "gdcm::Unfound"; return tagHt.find(key)->second->GetValue(); } string gdcmElValSet::GetElValueByName(string TagName) { if ( ! NameHt.count(TagName)) return "gdcm::Unfound"; return NameHt.find(TagName)->second->GetValue(); } int gdcmElValSet::SetElValueByNumber(string content, guint16 group, guint16 element) { TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, element); if ( ! tagHt.count(key)) return 0; tagHt[key]->SetValue(content); tagHt[key]->SetLength(content.length()); return 1; } int gdcmElValSet::SetElValueByName(string content, string TagName) { if ( ! NameHt.count(TagName)) return 0; NameHt[TagName]->SetValue(content); NameHt[TagName]->SetLength(content.length()); return 1; } /** * \ingroup gdcmElValSet * \brief Generate a free TagKey i.e. a TagKey that is not present * in the TagHt dictionary. * @param group The generated tag must belong to this group. * @return The element of tag with given group which is fee. */ guint32 gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup(guint16 group) { for (guint32 elem = 0; elem < UINT32_MAX; elem++) { TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, elem); if (tagHt.count(key) == 0) return elem; } return UINT32_MAX; } int gdcmElValSet::SetElValueLengthByNumber(guint32 length, guint16 group, guint16 element) { TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, element); if ( ! tagHt.count(key)) return 0; tagHt[key]->SetLength(length); return 1 ; } int gdcmElValSet::SetElValueLengthByName(guint32 length, string TagName) { if ( ! NameHt.count(TagName)) return 0; NameHt.find(TagName)->second->SetLength(length); return 1 ; } void gdcmElValSet::UpdateGroupLength(bool SkipSequence) { // TODO : reecrire entierement : une HTable dans la quelle on stocke les groupes, puis leur lgr // Voir juste apres // On parcourt la table pour recalculer la longueur des 'elements 0x0000' // au cas ou un tag ai été ajouté par rapport à ce qui a été lu // dans l'image native // // cf : code IdDcmWriteFile dans libido/src/dcmwrite.c // On fait de l'implicit VR little Endian // (pour moins se fairche sur processeur INTEL) // On force le TRANSFERT SYNTAX UID guint16 gr, el; string vr; guint32 lgrCalcGroupe=0; gdcmElValue *elem, *elemZ, *elemZPrec; guint16 grCourant = 0; TagElValueHT::iterator tag = tagHt.begin(); elem = tag->second; gr = elem->GetGroup(); el = elem->GetElement(); if (el != 0x0000) { if(DEBUG)printf("ajout elem OOOO premiere fois\n"); gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(gr, 0x0000, "UL"); elemZPrec = new gdcmElValue(tagZ); // on le cree elemZPrec->SetLength(4); Add(elemZPrec); // On l'accroche à sa place } else { elemZPrec = elem; if(DEBUG)printf("Pas d'ajout elem OOOO premiere fois\n"); } lgrCalcGroupe = 0; if(DEBUG)printf("init-1 lgr (%d) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, gr); grCourant = gr; for (tag = ++tagHt.begin(); tag != tagHt.end(); ++tag){ elem = tag->second; gr = elem->GetGroup(); el = elem->GetElement(); vr = elem->GetVR(); if (SkipSequence && vr == "SQ") continue; // pas SEQUENCE en ACR-NEMA // WARNING : pb CERTAIN // si on est descendu 'a l'interieur' des SQ if ( (gr != grCourant) /*&& // On arrive sur un nv Groupe (el != 0xfffe) */ ) { if (el != 0x0000) { gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(gr, 0x0000, "UL"); elemZ = new gdcmElValue(tagZ); // on le cree elemZ->SetLength(4); Add(elemZ); // On l'accroche à sa place if(DEBUG)printf("ajout elem OOOO pour gr %04x\n",gr); } else { elemZ=elem; if(DEBUG)printf("maj elemZ\n"); } ostringstream f; f << lgrCalcGroupe; //sprintf(str_lgrCalcGroupe,"%d",lgrCalcGroupe); elemZPrec->SetValue(f.str()); if(DEBUG)printf("ecriture lgr (%d, %s) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, f.str().c_str(), grCourant); if(DEBUG)printf ("%04x %04x [%s]\n",elemZPrec->GetGroup(), elemZPrec->GetElement(), elemZPrec->GetValue().c_str()); if(DEBUG)cout << "Addresse elemZPrec " << elemZPrec<< endl; elemZPrec=elemZ; lgrCalcGroupe = 0; grCourant = gr; // BUG : // calcule lgr erronnée si ExplicitVR et VR =OB, SQ, etc // if(DEBUG)printf("init-2 lgr (%d) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, gr); } else { // On n'EST PAS sur un nv Groupe lgrCalcGroupe += 2 + 2 + 4 + elem->GetLength(); // Gr + Num + Lgr + LgrElem if(DEBUG)printf("increment (%d) el %04x-->lgr (%d) pour gr %04x\n", elem->GetLength(), el, lgrCalcGroupe, gr); } } // BUG : // Ecriture incorrecte si (7FE0 0000) absent et aucun element apres groupe 7FE0 :-( // A JETTER ! // } // // Remplacera UpdateGroupLength // Commite par precaution. // Ne pas utiliser // void gdcmElValSet::UpdateGroupLengthNew(bool SkipSequence, FileType type) { guint16 gr, el; string vr; gdcmElValue *elem; char trash[10]; GroupKey key; GroupHT groupHt; for (TagElValueHT::iterator tag2 = tagHt.begin(); tag2 != tagHt.end(); ++tag2){ elem = tag2->second; gr = elem->GetGroup(); el = elem->GetElement(); vr = elem->GetVR(); sprintf(trash, "%04x", gr); key = trash; if (SkipSequence && vr == "SQ") continue; // pas SEQUENCE en ACR-NEMA // WARNING : pb CERTAIN // si on est descendu 'a l'interieur' des SQ // // --> la descente a l'interieur' des SQ // devra etre faite avec une liste chainee, pas avec une HTable... if ( groupHt.count(key) == 0) { groupHt[key] = 2 + 2 + 4 + 4; // creation automatique, par affectation ??? } else { if (type = ExplicitVR) { if ( (vr == "OB") || (vr == "OW") || (vr == "SQ") ) { groupHt[key] += 4; } } groupHt[key] += 2 + 2 + 4 + elem->GetLength(); } } // Liberer groupHt ! } void gdcmElValSet::WriteElements(FileType type, FILE * _fp) { guint16 gr, el; guint32 lgr; const char * val; string vr; guint32 val_uint32; guint16 val_uint16; vector tokens; void *ptr; // Tout ceci ne marche QUE parce qu'on est sur un proc Little Endian // restent à tester les echecs en écriture (apres chaque fwrite) for (TagElValueHT::iterator tag2=tagHt.begin(); tag2 != tagHt.end(); ++tag2){ gr = tag2->second->GetGroup(); el = tag2->second->GetElement(); lgr = tag2->second->GetLength(); val = tag2->second->GetValue().c_str(); vr = tag2->second->GetVR(); if(DEBUG)printf ("%04x %04x [%s] : [%s]\n",gr, el, vr.c_str(), val); if ( type == ACR ) { if (gr < 0x0008) continue; if (gr %2) continue; if (vr == "SQ" ) continue; } fwrite ( &gr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp); //group fwrite ( &el,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp); //element if ( (type == ExplicitVR) && (gr <= 0x0002) ) { // On est en EXPLICIT VR guint16 z=0, shortLgr; fwrite (vr.c_str(),(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp); if ( (vr == "OB") || (vr == "OW") || (vr == "SQ") ) { fwrite ( &z, (size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp); fwrite ( &lgr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp); } else { shortLgr=lgr; fwrite ( &shortLgr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp); } } else { fwrite ( &lgr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp); } tokens.erase(tokens.begin(),tokens.end()); Tokenize (tag2->second->GetValue(), tokens, "\\"); if (vr == "US" || vr == "SS") { for (unsigned int i=0; i