-// ATTENTION : fonction non terminée (commitée a titre de precaution)
-
- guint16 gr, el;
- guint32 lgr;
- const char * val;
- string vr;
- guint32 val_uint32;
- gint32 val_int32;
- guint16 val_uint16;
- gint16 val_int16;
-
- vector<string> tokens;
-
- void *ptr;
- char str_lgrCalcGroupe[10];
-
- string implicitVRTransfertSyntax = "1.2.840.10008.1.2";
-
- // Utilisées pour le calcul Group Length
- int deja = 0;
- guint32 lgrCalcGroupe=0;
- ElValue *elem, *elemZ, *elemZPrec;
- guint16 grCourant = 0;
-
- // Question :
- // Comment pourrait-on tester si on est TrueDicom ou non ,
- // (FileType est un champ de gdcmHeader ...)
- //
-
- // On parcourt la table pour recalculer la longueur des 'elements 0x0000'
- // au cas ou un tag ai été ajouté par rapport à ce qui a été lu
- // dans l'image native
- //
- // cf : code IdDcmWriteFile dans libido/src/dcmwrite.c
-
- if (0) // Risque de pb dans le calcul des lgr de chaque groupe. On le saute pour le moment!
-
- for (TagElValueHT::iterator tag = tagHt.begin();
- tag != tagHt.end();
- ++tag){
-
- elem = tag->second;
- printf("gr %04x el %04x lgr %d\n",elem->GetGroup(), elem->GetElement(), elem->GetLength());
-
- if ( (elem->GetGroup() != grCourant) &&
- (elem->GetGroup() != 0xfffe) ) { // On arrive sur un nv Groupe
-
- printf("Nouv Groupegr %04x el %04x \n",elem->GetGroup(), elem->GetElement());
-
- elemZ = elem;
-
- if(elemZ->GetElement() != 0x0000) { // pas d'element 'Lgr groupe'
- // On crée
- gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(grCourant, 0x0000, "UL");
- elemZ = new ElValue(tagZ); // on le cree
- elemZ->SetLength(4);
- Add(elemZ); // On l'accroche à sa place
- }
-
- if (deja) {
- //sprintf(str_lgrCalcGroupe,"%d",lgrCalcGroupe);
- elemZPrec->SetValue(str_lgrCalcGroupe);
- lgrCalcGroupe = 0;
- }
- deja = 1;
-
- lgrCalcGroupe = 12; //2 + 2 + 4 + 4; // Gr + Num + Lgr + LgrGroupe
- printf ("lgrCalcGroupe %d\n",lgrCalcGroupe);
-
- elemZPrec = elemZ;
- grCourant = elem->GetGroup();
-
- } else { // On n'EST PAS sur un nv Groupe
-
- printf ("lgrCalcGroupe avant : %d LgrElem %d\n",lgrCalcGroupe,elem->GetLength());
-
- lgrCalcGroupe += 2 + 2 + 4 + elem->GetLength(); // Gr + Num + Lgr + LgrElem
-
- printf ("lgrCalcGroupe apres %d\n",lgrCalcGroupe);
- }
- }
-
- // Si on fait de l'implicit VR little Endian
- // (pour moins se fairche sur processeur INTEL)
- // penser a forcer le TRANSFERT SYNTAX UID
-
- SetElValueByNumber(implicitVRTransfertSyntax, 0x0002, 0x0010);
- SetElValueLengthByNumber(18, 0x0002, 0x0010); // Le 0 de fin de chaine doit etre stocké, dans ce cas
-
- // restent à tester les echecs en écriture (apres chaque fwrite)
-
- for (TagElValueHT::iterator tag2 = tagHt.begin();
- tag2 != tagHt.end();
- ++tag2){
-
- gr = tag2->second->GetGroup();
- el = tag2->second->GetElement();
- lgr = tag2->second->GetLength();
- val = tag2->second->GetValue().c_str();
- vr = tag2->second->GetVR();
-
- fwrite ( &gr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp); //group
- fwrite ( &el,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp); //element
-
- //fwrite ( vr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp); //VR
-
- // si on n'est pas en IMPLICIT VR voir pb (lgr + VR)
-
- fwrite ( &lgr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp); //lgr
-
- tokens.erase(tokens.begin(),tokens.end());
- Tokenize (tag2->second->GetValue(), tokens, "\\");
-
- //printf ("%04x %04x [%s] : [%s]\n",gr, el, vr.c_str(), val);
- //if (tokens.size() > 1) { printf ("size : %d\n",tokens.size());}
-
-
- if (vr == "US" || vr == "SS") {
- /*
- val_int16 = atoi(val);
- ptr = &val_int16;
- fwrite ( ptr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp);
- continue;
- */
-
- for (unsigned int i=0; i<tokens.size();i++) {
- val_uint16 = atoi(tokens[i].c_str());
- ptr = &val_uint16;
- fwrite ( ptr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp);
- }
- continue;
-
- }
- if (vr == "UL" || vr == "SL") {
- /*
- val_int32 = atoi(val);
- ptr = &val_int32;
- fwrite ( ptr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp);
- continue;
- */
-
-
- for (unsigned int i=0; i<tokens.size();i++) {
- val_uint32 = atoi(tokens[i].c_str());
- ptr = &val_uint32;
- fwrite ( ptr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp);
- }
- continue;
-
- }
-
- // Les pixels ne sont pas chargés dans l'element !
- if ((gr == 0x7fe0) && (el == 0x0010) ) break;
-
- fwrite ( val,(size_t)lgr ,(size_t)1 ,_fp); //valeur Elem
- }
-
- return(1);
+void gdcmElValSet::UpdateGroupLength(bool SkipSequence, FileType type) {
+ guint16 gr, el;
+ string vr;
+
+ gdcmElValue *elem;
+ char trash[10];
+ string str_trash;
+ GroupKey key;
+ GroupHT groupHt;
+ TagKey tk;
+ gdcmElValue *elemZ;
+
+ for (TagElValueHT::iterator tag2 = tagHt.begin();
+ tag2 != tagHt.end();
+ ++tag2){
+
+ elem = tag2->second;
+ gr = elem->GetGroup();
+ el = elem->GetElement();
+ vr = elem->GetVR();
+
+ sprintf(trash, "%04x", gr);
+ key = trash;
+
+ if (SkipSequence && vr == "SQ") continue;
+ // pas SEQUENCE en ACR-NEMA
+ // WARNING : pb CERTAIN
+ // si on est descendu 'a l'interieur' des SQ
+ //
+ // --> la descente a l'interieur' des SQ
+ // devra etre faite avec une liste chainee, pas avec une HTable...
+
+ if ( groupHt.count(key) == 0) {
+ if (el ==0x0000) {
+ groupHt[key] = 0;
+ } else {
+ groupHt[key] =2 + 2 + 4 + elem->GetLength();
+ }
+ } else {
+ if (type = ExplicitVR) {
+ if ( (vr == "OB") || (vr == "OW") || (vr == "SQ") ) {
+ groupHt[key] += 4;
+ }
+ }
+ groupHt[key] += 2 + 2 + 4 + elem->GetLength();
+ }
+ }
+
+ if(0)
+ for (GroupHT::iterator g = groupHt.begin();
+ g != groupHt.end();
+ ++g){
+ printf("groupKey %s : %d\n",g->first.c_str(),g->second);
+ }
+
+
+ unsigned short int gr_bid;
+
+ for (GroupHT::iterator g = groupHt.begin();
+ g != groupHt.end();
+ ++g){
+
+ sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid);
+ tk = g->first + "|0000";
+
+ if ( tagHt.count(tk) == 0) {
+ gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(gr_bid, 0x0000, "UL");
+ elemZ = new gdcmElValue(tagZ);
+ elemZ->SetLength(4);
+ Add(elemZ);
+ } else {
+ elemZ=GetElementByNumber(gr_bid, 0x0000);
+ }
+ sprintf(trash ,"%d",g->second);
+ str_trash=trash;
+ elemZ->SetValue(str_trash);
+ }