]> Creatis software - clitk.git/blobdiff - tools/clitkAffineTransform.ggo
just build vv with travis
[clitk.git] / tools / clitkAffineTransform.ggo
index ac8c2d0f2088f09fbd5fbe25ef152269cbdf5a08..bb74448cead8ee4624a9087bd5958ecdaa3e29d5 100644 (file)
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 #File clitkAffineTransform.ggo
 #File clitkAffineTransform.ggo
-Package "clitkAffineTransform"
+package "clitkAffineTransform"
 version "1.0"
 purpose "Resample with or without affine transform of 2D, 3D, 4D images or vector fields"
 
 version "1.0"
 purpose "Resample with or without affine transform of 2D, 3D, 4D images or vector fields"
 
-option "config"                -       "Config file"                     string        no
-option "verbose"       v       "Verbose"                         flag          off
+option "config"                - "Config file"                   string        no
+option "verbose"       v "Verbose"                       flag          off
 
 section "I/O"
 
 section "I/O"
-option "input"         i       "Input image filename"            string        yes
-option "output"        o       "Output image filename"           string        yes
-option "like"          l       "Resample output this image (size, spacing,origin)"     string  no
+option "input"         i "Input image filename"                                          string yes
+option "output"        o "Output image filename"                                         string yes
+option "like"          l "Resample output this image (size, spacing, origin, direction)" string no
+option "transform_grid" - "Apply affine transform to input grid for output's"             flag   off
 
 section "Options"
 
 section "Options"
-option "size"          -       "New output size if different from input"       int     no      multiple
-option "spacing"       -       "New output spacing if different from input"    double  no      multiple
-option "origin"                -       "New output origin if different from input"     double  no      multiple
-option "matrix"                m       "Affine matrix (homogene) filename"             string  no
-option "pad"           -       "Edge padding value"                            double  no      default="0.0"
+option "size"          - "New output size if different from input"     int     no      multiple
+option "spacing"       - "New output spacing if different from input"  double  no      multiple
+option "spacinglike"   - "New output spacing like this image"          string  no
+option "origin"                - "New output origin if different from input"   double  no      multiple
+option "matrix"                m "Affine matrix (homogene) filename"           string  no
+option "elastix"       e "Read EulerTransform from elastix output file (combine if multiple)"  string  no
+option "rotate"                r "Rotation to apply (radians)"                 double  no      multiple
+option "translate"     t "Translation to apply (mm)"                   double  no      multiple
+option "pad"           - "Edge padding value"                          double  no      default="0.0"
 
 section "Interpolation"
 
 section "Interpolation"
-option "interp"                -       "Interpolation: 0=NN, 1=Linear, 2=BSpline, 3=BLUT"      int     no  default="1"
-option "interpOrder"   -       "Order if BLUT or BSpline (0-5)"                        int     no  default="3"
-option "interpSF"      -       "Sampling factor if BLUT"                               int     no  default="20"
-option "interpVF"      -       "Interpolation: 0=NN, 1=Linear, 2=BSpline, 3=BLUT"      int     no  default="1"
-option "interpVFOrder" -       "Order if BLUT or BSpline (0-5)"                        int     no  default="3"
-option "interpVFSF"    -       "Sampling factor if BLUT"                               int     no  default="20"
+option "interp"                - "Interpolation: 0=NN, 1=Linear, 2=BSpline, 3=BLUT"    int     no  default="1"
+option "interpOrder"   - "Order if BLUT or BSpline (0-5)"                      int     no  default="3"
+option "interpSF"      - "Sampling factor if BLUT"                             int     no  default="20"
+option "interpVF"      - "Interpolation: 0=NN, 1=Linear, 2=BSpline, 3=BLUT"    int     no  default="1"
+option "interpVFOrder" - "Order if BLUT or BSpline (0-5)"                      int     no  default="3"
+option "interpVFSF"    - "Sampling factor if BLUT"                             int     no  default="20"