]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - ChangeLog
ENH: update dvpt version
[gdcm.git] / ChangeLog
index 52fde1bb7562945cd26d6cb9790b9d11165b499d..9735dfad936452c296100b98f4dfa9b54a157890 100644 (file)
--- a/ChangeLog
+++ b/ChangeLog
@@ -1,4 +1,237 @@
+2004-09-23 Jean-Pierre Roux
+  * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
+    the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
+        we can now delete[] it safely  
+  * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
+    and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
+  * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
+
+2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+  * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
+    clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
+    up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
+    pointed content.
+
+2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+  * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
+  * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
+
+2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+  * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
+    holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
+    of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
+    an example of usage.
+    - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
+      BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
+    - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
+      gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
+    - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
+    - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
+    - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
+
+2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+  * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
+    moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
+    acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
+    in class 
+    - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
+      and associated accessors. Doxygenation of the class.
+    - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
+      accessors added.
+    - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
+      Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
+    - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
+    - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
+
+2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+  * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
+    - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
+      of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
+           gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
+           Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
+           A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
+           embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
+           the same group and element all share the same (group, element)
+           "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
+           identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
+           In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
+           consider the following definition of a TagKey:
+           - let Group, Element be the string representation of the
+             group and element dicom tag members,
+           - let ItemNumber be the string representation of the integer
+             index of the considered item number of a sequence,
+           Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
+           the form:
+              /ItemNumber#Group|Element
+           where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
+           Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
+              Group|Element<SeqTag>
+           where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
+           Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
+           string e.g.
+               0028|1201
+           but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
+           a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
+           string e.g.
+               0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
+    - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
+      order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
+      GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
+    - src/gdcmDocEntry.cxx:
+      -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
+         Key member.
+      -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
+    - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
+    - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
+      -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
+      -- now has a new BaseTagKey member.
+      -- STYLE.
+  * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
+    previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
+    truly belongs.
+    This poses the problem with the semantics of the following lines
+       LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
+       LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
+       LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
+    in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
+    to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
+    order to get things working the dicom dictionary was altered !
+    Please fix things urgently...
+  * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
+    information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
+    the following entries previously correctly set as US are now inproperly
+    set to OW:
+      0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
+      0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
+      0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
+  * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
+    of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
+  * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
+
+2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+  * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
+
+2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+  * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
+    to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
+  * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
+  * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
+
+2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+  * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
+    to avoid inclusion recursion until STL is reached.
+  * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
+    mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
+  * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
+    (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
+  * TODO updated
+  * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
+    gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
+  * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
+  * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
+    exception_on_error parameter.
+    - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
+    - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
+    - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
+
+2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+  * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
+  * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
+    enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
+  * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
+  * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
+  * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
+    skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
+  * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
+
+2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+  * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
+    in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
+
+2004-07-21 Jean-Pierre Roux
+  * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
+       ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
+                
+2004-07-20 Jean-Pierre Roux
+  * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
+        for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
+
+2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
+   * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
+   * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
+     variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
+     is now in static in the gdcmDebug class
+   * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
+   * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
+
+2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+   * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
+     check out gdcmData properly for things to run smoothly...
+   * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
+     (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
+     we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
+     that displays position and size).
+   * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
+     This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
+     be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
+     modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
+     without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
+     I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
+     reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
+        Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
+     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
+     commiting changes).
+   * Test/CMakeLists.txt:
+      - now uses TestAllEntryVerify.cxx
+      - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
+        to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
+        gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
+   * TODO updated.
+
+2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+   * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
+     - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
+     - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
+     - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
+     - removal of typedef duplication.
+     - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
+     - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
+   * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
+      - printf polluting ctest removed.
+      - TAB removal for comminting
+   * Test:
+     - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
+       images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
+       gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
+       this test creates them.
+       Note: we need to validate each reference image, but before that
+             I'd like to rename them with a more explicit name...
+     - CMakeLists.txt: changed accordingly.
+   * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
+     including each header needed).
+
+2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+   * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
+     test suite to the Example directory. Are concerned:
+     - PrintHeader.cxx
+     - TestDcm2Acr.cxx
+     - TestFindTags.cxx
+     - TestWrite.cxx was
+     - TestWriteSimple.cxx
+   * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
+     image gdcmData/oldACR00001.ima
+
 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
+   * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
+     with removal from gdcmData):
+      - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
+      - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
+      - US.3405.1.dcm
+     Added the following because after last cvs update, they cause
+       ctest -R TestReadWriteReadCompare 
+     to segfault:
+      - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
+      - oldACR00001.ima
    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
@@ -405,7 +638,7 @@ WARNING : save your own sources *before* cvs up !
     * .... alas, the python testSuite is still broken.
 
 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
-    * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal 
+    * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
       gdcmGlob
     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
     * src/gdcmUtil.h : export methods