]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - Example/WriteDicomAsJPEG.cxx
Add undocument option for Jpeg Writting (still bugged)
[gdcm.git] / Example / WriteDicomAsJPEG.cxx
index e848a915ea8d652c044761ae0dcead9db0b830f9..9c6e7fa36879a85fce7f101cc5823c2620c2cb7b 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: WriteDicomAsJPEG.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2005/10/19 22:19:20 $
-  Version:   $Revision: 1.8 $
+  Date:      $Date: 2007/05/23 14:18:04 $
+  Version:   $Revision: 1.14 $
                                                                                 
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
@@ -31,6 +31,10 @@ extern "C" {
 #include "gdcmjpeg/8/jerror.h"
 }
 
+#if defined(__BORLANDC__)
+ #include <mem.h> // for memcpy
+#endif
+
 #include "gdcmJPEGFragment.h"
 #include <setjmp.h>
 #include <fstream>
@@ -46,15 +50,15 @@ void WriteDICOMItems(std::ostream *fp, JpegVector &v)
   // Item tag:
   uint16_t group = 0xfffe;
   uint16_t elem  = 0xe000;
-  gdcm::binary_write(*fp, group);
-  gdcm::binary_write(*fp, elem);
+  GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, group);
+  GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, elem);
   // Item Length
   uint32_t dummy = 0x12345678;
   size_t offset = fp->tellp();
   JpegPair jp;
   jp.first = offset;
   v.push_back(jp);
-  gdcm::binary_write(*fp, dummy);
+  GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, dummy);
 }
 
 // PS 3.5, page 66
@@ -65,11 +69,11 @@ void EncodeWithoutBasicOffsetTable(std::ostream *fp, int numFrag)// JpegVector&
   // Item tag:
   uint16_t group = 0xfffe;
   uint16_t elem  = 0xe000;
-  gdcm::binary_write(*fp, group);
-  gdcm::binary_write(*fp, elem);
+  GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, group);
+  GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, elem);
   // Item Length
   uint32_t item_length = 0x0000;
-  gdcm::binary_write(*fp, item_length);
+  GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, item_length);
 
 }
 
@@ -79,18 +83,18 @@ void EncodeWithBasicOffsetTable(std::ostream *fp, int numFrag, size_t &start)
   // Item tag:
   uint16_t group = 0xfffe;
   uint16_t elem  = 0xe000;
-  gdcm::binary_write(*fp, group);
-  gdcm::binary_write(*fp, elem);
+  GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, group);
+  GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, elem);
   // Item Length
   uint32_t item_length = numFrag*4; // sizeof(uint32_t)
-  gdcm::binary_write(*fp, item_length);
+  GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, item_length);
 
   // Just prepare the space
   start = fp->tellp(); //to be able to rewind
   for(int i=0; i<numFrag;++i)
     {
     uint32_t dummy = 0x0000;
-    gdcm::binary_write(*fp, dummy);
+    GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, dummy);
     }
 }
 
@@ -103,8 +107,9 @@ void UpdateBasicOffsetTable(std::ostream *fp, JpegVector const &v, size_t pos)
     {
     const JpegPair &jp = *i;
     if(i == v.begin() ){ assert( jp.first - first.first == 0); }
-    gdcm::binary_write(*fp, jp.first - first.first);
-    std::cerr << "Updating Table:" << jp.first - first.first << std::endl;
+    uint32_t offset = jp.first - first.first;
+    GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, offset);
+    //std::cerr << "Updating Table:" << jp.first - first.first << std::endl;
     }
 }
 
@@ -115,8 +120,9 @@ void UpdateJpegFragmentSize(std::ostream *fp, JpegVector const &v)
     {
     const JpegPair &jp = *i;
     fp->seekp( jp.first );
-    gdcm::binary_write(*fp, jp.second );
-    std::cerr << "Updating:" << jp.first << "," << jp.second << std::endl;
+    uint32_t length = jp.second;
+    GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, length );
+    //std::cerr << "Updating:" << jp.first << "," << jp.second << std::endl;
     }
 }
 
@@ -125,11 +131,11 @@ void CloseJpeg(std::ostream *fp, JpegVector &v)
   // sequence terminator
   uint16_t group = 0xfffe;
   uint16_t elem  = 0xe000;
-  gdcm::binary_write(*fp, group);
-  gdcm::binary_write(*fp, elem);
+  GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, group);
+  GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, elem);
 
   uint32_t length = 0x0;
-  gdcm::binary_write(*fp, length);
+  GDCM_NAME_SPACE::binary_write(*fp, length);
 
   // Jpeg is done, now update the frag length
   UpdateJpegFragmentSize(fp, v);
@@ -232,6 +238,7 @@ bool InitializeJpeg(std::ostream *fp, int fragment_size, int image_width, int im
    */
   if (sample_pixel == 3)
     {
+    assert( sample_pixel == 1 );
     row_stride = image_width * 3;/* JSAMPLEs per row in image_buffer */
     }
   else
@@ -322,7 +329,15 @@ bool CreateOneFrame (std::ostream *fp, void *input_buffer, int fragment_size,
     static int i = 0;
     JpegPair &jp = v[i];
     jp.second = end-beg;
-    std::cerr << "DIFF: " << i <<" -> " << end-beg << std::endl;
+    
+    if( ((end-beg) % 2) )
+    {
+       fp->put( '\0' );
+       jp.second += 1;
+    }
+    assert( !(jp.second % 2) );
+    std::cerr << "DIFF: " << i <<" -> " << jp.second << std::endl;    
+       
     ++i;
 
   //JpegPair &jp = v[0];
@@ -354,12 +369,12 @@ int main(int argc, char *argv[])
    std::cerr << "Using quality: " << quality << std::endl;
 
 // Step 1 : Create the header of the image
-   gdcm::File *f = new gdcm::File();
-   f->SetLoadMode ( gdcm::LD_ALL ); // Load everything
+   GDCM_NAME_SPACE::File *f = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
+   f->SetLoadMode ( GDCM_NAME_SPACE::LD_ALL ); // Load everything
    f->SetFileName( filename );
    f->Load();
 
-   gdcm::FileHelper *tested = new gdcm::FileHelper( f );
+   GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *tested = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New( f );
    std::string PixelType = tested->GetFile()->GetPixelType();
    int xsize = f->GetXSize();
    int ysize = f->GetYSize();
@@ -390,6 +405,7 @@ int main(int argc, char *argv[])
      WriteDICOMItems(of, JpegFragmentSize);
      CreateOneFrame(of, pImageData, fragment_size, xsize, ysize, zsize, 
        samplesPerPixel, quality, JpegFragmentSize);
+     assert( !(fragment_size % 2) );  
      pImageData += fragment_size;
      }
    CloseJpeg(of, JpegFragmentSize);
@@ -423,46 +439,46 @@ int main(int argc, char *argv[])
 
 // Step 1 : Create the header of the image
 
-   gdcm::File *fileToBuild = new gdcm::File();
+   GDCM_NAME_SPACE::File *fileToBuild = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
    std::ostringstream str;
 
    // Set the image size
    str.str("");
    str << xsize;
-   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0011); // Columns
+   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0011,"US"); // Columns
    str.str("");
    str << ysize;
-   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0010); // Rows
+   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0010,"US"); // Rows
 
    if(zsize>1)
    {
       str.str("");
       str << zsize;
-      fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0008); // Number of Frames
+      fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0008,"IS"); // Number of Frames
    }
 
    // Set the pixel type
    str.str("");
    str << 8; //img.componentSize;
-   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0100); // Bits Allocated
+   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0100,"US"); // Bits Allocated
 
    str.str("");
    str << 8; //img.componentUse;
-   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0101); // Bits Stored
+   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0101,"US"); // Bits Stored
 
    str.str("");
    str << 7; //( img.componentSize - 1 );
-   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0102); // High Bit
+   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0102,"US"); // High Bit
 
    // Set the pixel representation
    str.str("");
    str << 0; //img.sign;
-   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0103); // Pixel Representation
+   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0103,"US"); // Pixel Representation
 
    // Set the samples per pixel
    str.str("");
    str << samplesPerPixel; //img.components;
-   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0002); // Samples per Pixel
+   fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0002,"US"); // Samples per Pixel
 
 // Step 2 : Create the output image
 //   std::cout << "2...";
@@ -474,7 +490,7 @@ int main(int argc, char *argv[])
                * samplesPerPixel /* * img.componentSize / 8*/;
 
    uint8_t *imageData = new uint8_t[size];
-   gdcm::FileHelper *fileH = new gdcm::FileHelper(fileToBuild);
+   GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *fileH = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New(fileToBuild);
    //fileH->SetImageData(imageData,size);
    assert( size == testedDataSize );
    size = of->str().size();
@@ -502,10 +518,10 @@ int main(int argc, char *argv[])
    out.close();
 
    delete of;
-   delete f;
-   delete tested;
-   delete fileToBuild;
-   delete fileH;
+   f->Delete();
+   tested->Delete();
+   fileToBuild->Delete();
+   fileH->Delete();
 
    return 0;
 }