]> Creatis software - clitk.git/blobdiff - segmentation/clitkExtractLung.ggo
add memory usage info in panel (need libstatgrab)
[clitk.git] / segmentation / clitkExtractLung.ggo
index 186508602e980191bb4b9db2e59578f06e7e5ae6..a5cf62a745e5e9069a5895db6d955dd2c14f7105 100644 (file)
@@ -5,6 +5,7 @@ purpose "Segment lungs in CT image. Need 'patient' mask."
 
 option "config"                -  "Config file"                  string        no
 option "imagetypes"     -  "Display allowed image types"  flag          off
+
 option "verbose"        v  "Verbose"                     flag          off
 option "verboseStep"    -  "Verbose each step"           flag          off
 option "writeStep"      w  "Write image at each step"    flag          off
@@ -34,7 +35,7 @@ option "skipslices"                  -  "Number of slices to skip before searchi
 option "upperThresholdForTrachea"    - "Initial upper threshold for trachea"  double   no  default="-900"
 option "multiplierForTrachea"       -  "Multiplier for the region growing"    double   no  default="5"
 option "thresholdStepSizeForTrachea" - "Threshold step size"                  int      no  default="64"
-option "seed"                        - "Index of the trachea seed point"      int      no  multiple
+option "seed"                        - "Index of the trachea seed point (in pixel, not in mm)"      int        no  multiple
 option "doNotCheckTracheaVolume"     -  "If set, do not check the trachea volume" flag off
 option "verboseRG"                   -  "Verbose RegionGrowing"   flag off