]> Creatis software - clitk.git/blobdiff - segmentation/clitkExtractLungGenericFilter.txx
compatibility with itk3.2 debug
[clitk.git] / segmentation / clitkExtractLungGenericFilter.txx
index 9aa03434184c7beb355385bd8fbfe92ba6a22e14..b40dc28fc49de81bd0a4784fba74158b7dd333f6 100644 (file)
@@ -3,7 +3,7 @@
 
   Authors belong to: 
   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
-  - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
+  - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
 
   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
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   - BSD        See included LICENSE.txt file
   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
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+  ===========================================================================**/
 
 #ifndef CLITKEXTRACTLUNGSGENERICFILTER_TXX
 #define CLITKEXTRACTLUNGSGENERICFILTER_TXX
@@ -102,11 +102,17 @@ SetOptionsFromArgsInfoToFilter(FilterType * f)
   
   f->SetOpenCloseFlag(mArgsInfo.openclose_flag);
   f->SetOpenCloseRadius(mArgsInfo.opencloseRadius_arg);
+  f->SetAutoCrop(!mArgsInfo.noAutoCrop_flag);
   
   if (mArgsInfo.doNotFillHoles_given)
     f->SetFillHolesFlag(false);
   else
     f->SetFillHolesFlag(true);
+
+  if (mArgsInfo.doNotSeparateLungs_given)
+    f->SetSeparateLungsFlag(false);
+  else
+    f->SetSeparateLungsFlag(true);
 }
 //--------------------------------------------------------------------