// which should be around 4500 entries which is the
// average dictionary size (said JPR)
//
- // En fait, je disais que dans LE Directory Dicom (dans son etat 2002)
- // il y a 1600 entrees.
+ // En fait, je disais que dans LE Directory Dicom (dans son etat 2001)
+ // il y a +/- 1600 entrees.
// Une valeur raisonable pour un majorant du nombre d'entrees
// dans une entete DICOM d'une image semble semble etre 300
// Si on 'decortique' les elements SQ (ce qui ne semble pas etre fait pour le moment)
#define GDCM_EXPORT
#endif
-//
-// ---------------------------------------------------- gdcmDictEntry
-//
-// c'est une ligne du Dictionnaire Dicom
-//
-
-
////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
// Tag based hash tables.
// We shall use as keys the strings (as the C++ type) obtained by
// gdcmDictEntry::TranslateToKey for this conversion function.
typedef string TagKey;
+typedef string TagName;
class GDCM_EXPORT gdcmDictEntry {
private:
// DcmDictRangeRestriction elementRestriction;
// };
public:
-
- // fabrique une ligne de Dictionnaire Dicom à partir des parametres en entrée
-
gdcmDictEntry(guint16 group,
- guint16 element,
+ guint16 element,
string vr = "Unknown",
string fourth = "Unknown",
string name = "Unknown");
-
// fabrique une 'clé' par concaténation du numGroupe et du numElement
-
static TagKey TranslateToKey(guint16 group, guint16 element);
guint16 GetGroup(void) { return group; };
guint16 GetElement(void){return element;};
string GetVR(void) {return vr; };
void SetVR(string);
- void SetKey(string k){ key = k; }
+ void SetKey(string k){ key = k; }
bool IsVrUnknown(void);
string GetFourth(void) {return fourth;};
string GetName(void) {return name; };
string GetKey(void) {return key; };
};
-//
-// ---------------------------------------------------- gdcmDict
-//
-// c'est le Dictionnaire Dicom
-//
-
////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
// A single DICOM dictionary i.e. a container for a collection of dictionary
// entries. There should be a single public dictionary (THE dictionary of
// the actual DICOM v3) but as many shadow dictionaries as imagers
// combined with all software versions...
-typedef map<TagKey, gdcmDictEntry*> TagHT;
- // Table de Hachage : (group,Elem) --> pointeur vers une ligne du Dictionnaire Dicom
+typedef map<TagKey, gdcmDictEntry*> TagKeyHT;
+typedef map<TagName, gdcmDictEntry*> TagNameHT;
class GDCM_EXPORT gdcmDict {
string name;
string filename;
- TagHT entries;
+ TagKeyHT KeyHt; // Both accesses with a TagKey or with a
+ TagNameHT NameHt; // TagName are required.
public:
- // rempli le Dictionnaire Dicom à partir d'un fichier texte
- gdcmDict(const char* FileName); // Read Dict from disk
-
+ gdcmDict(const char* FileName); // Reads Dict from ascii file
int AddNewEntry (gdcmDictEntry* NewEntry);
int ReplaceEntry(gdcmDictEntry* NewEntry);
- int RemoveEntry (TagKey k);
+ int RemoveEntry (TagKey key);
int RemoveEntry (guint16 group, guint16 element);
-
-
- // renvoie une ligne de Dictionnaire Dicom à partir de (numGroup, numElement)
- gdcmDictEntry * GetTag(guint32 group, guint32 element);
+ gdcmDictEntry * GetTagByKey(guint16 group, guint16 element);
+ gdcmDictEntry * GetTagByName(TagName name);
void Print(ostream&);
- TagHT & GetEntries(void) { return entries; }
+ void PrintByKey(ostream&);
+ void PrintByName(ostream&);
+ TagKeyHT & GetEntries(void) { return KeyHt; }
};
-//
-// ---------------------------------------------------- gdcmDictSet
-//
-// Ensemble de Dictionnaires Dicom (le public + 'des' privés)
-// Au cas ou l'on traiterait un jour les 'dictionnaires privés'
-// - pratiquement un par constructeur, par machine, et par version du logiciel -
-//
-//
-
////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
// Container for managing a set of loaded dictionaries. Sharing dictionaries
// should avoid :
gdcmDict* GetDefaultPublicDict(void);
};
-
-//
-// ---------------------------------------------------- ElValue
-//
-// C'est un Element Dicom
-// (ce qu'on a trouve dans l'entete de l'image
-// + ce qu'on est allé chercher dans le Dictionnaire Dicom)
-//
-
-// QUESTION:
-//
-// Ne faudrait-il pas trouver un autre nom, qui preterait moins à confusion?
-// ElValue n'EST PAS la 'valeur d'un Element', mais la reunion d'infos
-// trouvees dans l'Entete du fichier ET dans le Dictionnaire DICOM
-//
-
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
// The dicom header of a Dicom file contains a set of such ELement VALUES
// (when successfuly parsed against a given Dicom dictionary)
-
class GDCM_EXPORT ElValue {
private:
gdcmDictEntry *entry;
// elements happen to be implicit. Flag them here
// since we can't use the entry->vr without breaking
// the underlying dictionary.
- // Might prove of some interest (see _ID_DCM_ELEM)
- // int Swap;
public:
- string value; // used to be char * valeurElem
+ string value;
size_t Offset; // Offset from the begining of file for direct user access
ElValue(gdcmDictEntry*);
bool IsVrUnknown(void) { return entry->IsVrUnknown(); };
void SetImplicitVr(void) { ImplicitVr = true; };
bool IsImplicitVr(void) { return ImplicitVr; };
-
- guint16 GetGroup(void) { return entry->GetGroup(); };
- guint16 GetElement(void) { return entry->GetElement(); };
- string GetKey(void) { return entry->GetKey(); };
- string GetName(void) { return entry->GetName(); };
-
- string GetVR(void) { return entry->GetVR(); };
-
- void SetVR(string v) { entry->SetVR(v); };
-
- // Question :
- // Un champ privé, accessible en consultation et en modif (sans restriction)
- // interet par rapport à un champ public ?
- // --> pouvoir en changer la définition sans toucher à l'API
- void SetLength(guint32 l){ LgrElem = l; };
- guint32 GetLength(void) { return LgrElem; };
-
- void SetValue(string val){ value = val; };
- string GetValue(void) { return value; };
-
- void SetOffset(size_t of){ Offset = of; };
- size_t GetOffset(void) { return Offset; };
-
+ guint16 GetGroup(void) { return entry->GetGroup(); };
+ guint16 GetElement(void) { return entry->GetElement();};
+ string GetKey(void) { return entry->GetKey(); };
+ string GetName(void) { return entry->GetName(); };
+ string GetVR(void) { return entry->GetVR(); };
+ void SetVR(string v) { entry->SetVR(v); };
+ void SetLength(guint32 l){ LgrElem = l; };
+ guint32 GetLength(void) { return LgrElem; };
+
+ // Question : SetLength est public
+ // (sinon, on ne pourrait pas l'appeler dans ElValSet)
+ // alors que *personne* ne devrait s'en servir !
+ // c'est *forcément* la lgr de la string 'value', non?
+
+ void SetValue(string val){ value = val; };
+ string GetValue(void) { return value;};
+
+ void SetOffset(size_t of){ Offset = of; };
+ size_t GetOffset(void) { return Offset;};
+ // Question : SetOffset est public ...
+ // Quel utilisateur serait ammené à modifier l'Offset ?
};
-//
-// ---------------------------------------------------- ElValSet
-//
-// ... un ensemble d'Elements Dicom
-// ... le résultat de l'analyse d'une entete d'image, par exemple
-
////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
// Container for a set of successfully parsed ElValues.
typedef map<TagKey, ElValue*> TagElValueHT;
typedef map<string, ElValue*> TagElValueNameHT;
class GDCM_EXPORT ElValSet {
- // We need both accesses with a TagKey and the Dictentry.Name
-
- TagElValueHT tagHt;
- TagElValueNameHT NameHt;
+ TagElValueHT tagHt; // Both accesses with a TagKey or with a
+ TagElValueNameHT NameHt; // the DictEntry.Name are required.
public:
void Add(ElValue*);
void Print(ostream &);
TagElValueHT & GetTagHt(void);
int SetElValueByNumber(string content, guint32 group, guint32 element);
- int SetElValueByName(string content, string TagName);
-};
-
+ int SetElValueByName (string content, string TagName);
+
+ int SetElValueLengthByNumber(guint32 l, guint32 group, guint32 element);
+ int SetElValueLengthByName (guint32 l, string TagName);
-//
-// ---------------------------------------------------- gdcmHeader
-//
-// C'est le Dicom Header d'une image donnée
-// (tous les elements Dicom qui la composent
-// + des info 'de service')
-//
+};
////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+// The purpous of an instance of gdcmHeader is to act as a container of
+// all the elements and their corresponding values (and additionaly the
+// corresponding DICOM dictionary entry) of the header of a DICOM file.
+//
// The typical usage of instances of class gdcmHeader is to classify a set of
// dicom files according to header information e.g. to create a file hierarchy
// reflecting the Patient/Study/Serie informations, or extracting a given
// be managed within a dictionary which is shared by all gdcmHeader instances
// * the gdcmHeader::Set*Tag* family members cannot be defined as protected
// (Swig limitations for as Has_a dependency between gdcmFile and gdcmHeader)
-
typedef string VRKey;
typedef string VRAtr;
typedef map<VRKey, VRAtr> VRHT; // Value Representation Hash Table
-
class GDCM_EXPORT gdcmHeader {
void SkipBytes(guint32);
private:
ElValSet ShaElVals; // parsed with Shadow Dictionary
string filename; // refering underlying file
FILE * fp;
- // The tag Image Location (0028,0200) - containing the address of
- // the pixels - is not allways present. Then we store this information
-
- // FIXME
-
- // Question :
- // Qu'y a-t-il a corriger ?
- //
- // outside of the elements:
-
guint16 grPixel;
guint16 numPixel;
// Ne faudrait-il pas une indication sur la presence ou non
guint32 ReadInt32(void);
guint16 SwapShort(guint16);
guint32 SwapLong(guint32);
+ guint32 FindLengthOB(void);
void Initialise(void);
void CheckSwap(void);
+ void InitVRDict(void);
+ void SwitchSwapToBigEndian(void);
+ void AddAndDefaultElements(void);
+ void SetMaxSizeLoadElementValue(long);
+
+ gdcmDictEntry * GetDictEntryByKey(guint16, guint16);
+ gdcmDictEntry * GetDictEntryByName(string name);
+
+ // ElValue related utilities
+ ElValue * ReadNextElement(void);
+ ElValue * NewElValueByKey(guint16 group, guint16 element);
+ ElValue * NewElValueByName(string name);
void FindLength(ElValue *);
- guint32 FindLengthOB(void);
void FindVR(ElValue *);
void LoadElementValue(ElValue *);
void LoadElementValueSafe(ElValue *);
void SkipElementValue(ElValue *);
- void InitVRDict(void);
- void SwitchSwapToBigEndian(void);
void FixFoundLength(ElValue*, guint32);
bool IsAnInteger(ElValue *);
bool IsJPEGExtendedProcess2_4TransferSyntax(void);
bool IsJPEGExtendedProcess3_5TransferSyntax(void);
bool IsJPEGSpectralSelectionProcess6_8TransferSyntax(void);
-//
-// Euhhhhhhh
-// Il y en a encore DIX-SEPT, comme ça.
-// Il faudrait trouver qq chose + rusé ...
-//
- void SetMaxSizeLoadElementValue(long);
- ElValue * ReadNextElement(void);
- gdcmDictEntry * IsInDicts(guint32, guint32);
protected:
enum FileType {
Unknown = 0,
// Copies (at most MaxSize bytes) of data to caller's memory space.
// Returns an error code on failure (if MaxSize is not big enough)
- int PutImageDataHere(void* destination, size_t MaxSize );
+ int GetImageDataIntoVector(void* destination, size_t MaxSize );
// Question :
//
- // GetImageData et PutImageDataHere
+ // GetImageData et GetImageDataIntoVector
// Get et Put pour 2 fonctions qui font presque la meme chose :-(
//
// Ca sera à l'utilisateur d'appeler son Reader correctement
int WriteRawData (string nomFichier);
- int WriteDcm (string nomFichier);
+ int WriteDcm (string nomFichier);
};
//
git://git.creatis.insa-lyon.fr / gdcm.git / blobdiff