]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmDataEntry.cxx
SerieHelper::CreateUserDefinedFileIdentifier doesn't convert unfound fields
[gdcm.git] / src / gdcmDataEntry.cxx
index 1fdb47e2d7563e75b3e3212f8f3aab257961c262..1d8ade9fe3db1dc53094fa0f921db178f2c3e6fd 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmDataEntry.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2005/11/07 09:46:36 $
-  Version:   $Revision: 1.19 $
+  Date:      $Date: 2006/01/20 09:17:25 $
+  Version:   $Revision: 1.28 $
                                                                                 
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
@@ -75,7 +75,9 @@ DataEntry::~DataEntry ()
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Public
 /**
- * \brief Sets the value (non string) of the current Dicom Header Entry
+ * \brief Sets the value (non string) of the current DataEntry
+ * @param area area
+ * @param self self
  */
 void DataEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self )  
 { 
@@ -87,7 +89,9 @@ void DataEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self )
    State = STATE_LOADED;
 }
 /**
- * \brief Inserts the value (non string) into the current Dicom Header Entry
+ * \brief Inserts the value (non string) into the current DataEntry
+ * @param area area
+ * @param length length 
  */
 void DataEntry::CopyBinArea( uint8_t *area, uint32_t length )
 {
@@ -107,6 +111,11 @@ void DataEntry::CopyBinArea( uint8_t *area, uint32_t length )
    }
 }
 
+/**
+ * \brief Inserts the elementary (non string) value into the current DataEntry
+ * @param id index of the elementary value to be set
+ * @param val value, passed as a double 
+ */
 void DataEntry::SetValue(const uint32_t &id, const double &val)
 {
    if( !BinArea )
@@ -151,9 +160,10 @@ void DataEntry::SetValue(const uint32_t &id, const double &val)
 }
 /**
  * \brief returns, as a double (?!?) one of the values 
- //      (when entry is multivaluated), identified by its index.
- //      Returns 0.0 if index is wrong
- //     FIXME : warn the user there was a problem ! 
+ *      (when entry is multivaluated), identified by its index.
+ *      Returns 0.0 if index is wrong
+ *     FIXME : warn the user there was a problem ! 
+ * @param id id
  */
 double DataEntry::GetValue(const uint32_t &id) const
 {
@@ -234,17 +244,19 @@ double DataEntry::GetValue(const uint32_t &id) const
  */
 bool DataEntry::IsValueCountValid() const
 {
-  bool valid;
   uint32_t vm;
   const std::string &strVM = GetVM();
   uint32_t vc = GetValueCount();
+  bool valid = vc == 0;
+  if( valid )
+    return true;
   
   // FIXME : what shall we do with VM = "2-n", "3-n", etc
   
   if( strVM == "1-n" )
   {
     // make sure there is at least one ??? FIXME
-    valid = vc >= 1 || vc == 0;
+    valid = vc >= 1;
   }
   else
   {
@@ -269,7 +281,7 @@ bool DataEntry::IsValueCountValid() const
     // Problem : entry type may depend on the modality and/or the Sequence
     //           it's embedded in !
     //          (Get the information in the 'Conformance Statements' ...)  
-    valid = vc == vm || vc == 0;
+    valid = vc == vm;
   }
   return valid;
 }
@@ -284,14 +296,15 @@ uint32_t DataEntry::GetValueCount( ) const
       return GetLength()/sizeof(uint16_t);
    else if( vr == "UL" || vr == "SL" )
       return GetLength()/sizeof(uint32_t);
-   else if( vr == "FL" )
-      return GetLength()/sizeof(float);
+   else if( vr == "FL" || vr == "OF" )
+      return GetLength()/4 ; // FL has a *4* length! sizeof(float);
    else if( vr == "FD" )
-      return GetLength()/sizeof(double);
+      return GetLength()/8;  // FD has a *8* length! sizeof(double);
    else if( Global::GetVR()->IsVROfStringRepresentable(vr) )
    {
       // Some element in DICOM are allowed to be empty
-      if( !GetLength() ) return 0;
+      if( !GetLength() ) 
+         return 0;
       // Don't use std::string to accelerate processing
       uint32_t count = 1;
       for(uint32_t i=0;i<GetLength();i++)
@@ -301,11 +314,10 @@ uint32_t DataEntry::GetValueCount( ) const
       }
       return count;
    }
-
    return GetLength();
 }
 /**
- * \brief Sets the 'value' of aEntry, passed as a std::string
+ * \brief Sets the 'value' of a DataEntry, passed as a std::string
  * @param value string representation of the value to be set
  */ 
 void DataEntry::SetString(std::string const &value)
@@ -450,9 +462,11 @@ std::string const &DataEntry::GetString() const
    }
    return StrArea;
 }
+
 /**
- * \brief   Copies all the attributes from an other DocEntry 
+ * \brief Copies all the attributes from an other DocEntry 
  * @param doc entry to copy from
+ * @remarks The content BinArea is copied too
  */
 void DataEntry::Copy(DocEntry *doc)
 {
@@ -466,6 +480,7 @@ void DataEntry::Copy(DocEntry *doc)
       CopyBinArea(entry->BinArea,entry->GetLength());
    }
 }
+
 /**
  * \brief   Writes the 'value' area of a DataEntry
  * @param fp already open ofstream pointer
@@ -480,7 +495,7 @@ void DataEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
       return; //delimitors have NO value
    }
    
-   // --> We only deal with Little Endian writting
+   // --> We only deal with Little Endian writting.
    // --> forget Big Endian Transfer Syntax writting!
    //     Next DICOM version will give it up ...
  
@@ -501,8 +516,8 @@ void DataEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
         
    uint8_t *data = BinArea; //safe notation
    size_t l = GetLength(); 
-   gdcmDebugMacro ("in DataEntry::WriteContent " << GetKey() 
-             << " : " << Global::GetVR()->GetAtomicElementLength(this->GetVR())
+   gdcmDebugMacro("in DataEntry::WriteContent " << GetKey() << " AtomicLength: "
+              << Global::GetVR()->GetAtomicElementLength(this->GetVR() ) // << " BinArea in :" << &BinArea
              );
    if (BinArea) // the binArea was *actually* loaded
    {
@@ -546,13 +561,16 @@ void DataEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
    }
    else
    {
-      // nothing was loaded, but we need to skip space on disc
-      
+      // nothing was loaded, but we need to skip space on disc     
+      if (l != 0)
+      {
       //  --> WARNING : nothing is written; 
       //  --> the initial data (on the the source image) is lost
-      //  --> user is *not* informed !
-      
-      fp->seekp(l, std::ios::cur);
+      //  --> user is *not* informed !      
+         gdcmDebugMacro ("Nothing was loaded, but we need to skip space on disc. "
+                      << "Length =" << l << " for " << GetKey() );   
+         fp->seekp(l, std::ios::cur);
+      }
    }
    // to avoid gdcm to propagate oddities
    // (length was already modified)  
@@ -571,14 +589,15 @@ uint32_t DataEntry::ComputeFullLength()
 
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Protected
-void DataEntry::NewBinArea(void)
+/// \brief Creates a DataEntry owned BinArea (remove previous one if any)
+void DataEntry::NewBinArea( )
 {
    DeleteBinArea();
    if( GetLength() > 0 )
       BinArea = new uint8_t[GetLength()];
    SelfArea = true;
 }
-
+/// \brief Removes the BinArea, if owned by the DataEntry
 void DataEntry::DeleteBinArea(void)
 {
    if (BinArea && SelfArea)