]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmDataEntry.cxx
add
[gdcm.git] / src / gdcmDataEntry.cxx
index 9e35cc59477afef874e9f71c6d5b90cb2cb9c061..fc36ec5666dcf64eeb30580d350c382d17e81519 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmDataEntry.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2007/08/27 16:14:47 $
-  Version:   $Revision: 1.46 $
+  Date:      $Date: 2009/02/05 09:50:09 $
+  Version:   $Revision: 1.55 $
                                                                                 
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  #include <stdlib.h> // for atof
  #include <ctype.h>  // for isdigit
 #endif
+#include <string.h> // memcpy
+#include <stdlib.h> // atof
+
+// Could be defined like MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE
+#define GDCM_MAX_LENGTH_TO_CONVERT_TO_HEXA 8
 
 namespace GDCM_NAME_SPACE 
 {
@@ -52,9 +57,10 @@ DataEntry::DataEntry(uint16_t group,uint16_t elem,
    State = STATE_LOADED;
    Flag = FLAG_NONE;
 
-   StrArea = 0;
-   BinArea = 0;
-   SelfArea = true;
+   StrArea     = 0;
+   StrHexaArea = 0;   
+   BinArea     = 0;
+   SelfArea    = true;
 }
 
 /**
@@ -82,9 +88,6 @@ DataEntry::~DataEntry ()
    
 }
 
-//-----------------------------------------------------------------------------
-// Print
-
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Public
 /**
@@ -127,6 +130,99 @@ void DataEntry::CopyBinArea( uint8_t *area, uint32_t length )
    }
 }
 
+/**
+ * \brief Checks wether the current DataEntry contains number(s)
+ */
+
+bool DataEntry::IsNumerical()
+{
+   const VRKey &vr = GetVR();
+   
+   return 
+          vr == "DS" ||
+          vr == "FL" ||
+          vr == "FD" ||
+          vr == "IS" || 
+          vr == "SH" ||
+          vr == "SL" ||
+          vr == "SS" ||
+          vr == "UI" ||
+          vr == "UL" ||
+          vr == "US" ;      
+}
+
+/**
+ * \brief Gets a std::vector of 'double' holding the value(s) of any 'numerical' DataEntry
+ * @param valueVector std::vector double of value(s)
+ * \return false if VR not "a 'numerical" one
+ */
+ bool DataEntry::GetNumerical(std::vector <double> &valueVector)
+ {
+    valueVector.clear();
+    
+    if (!IsNumerical()) // never trust a user !
+       return false;    
+
+    const VRKey &vr = GetVR();
+    int loop;
+    if (vr == "IS" || vr == "DS")
+    {
+       /// \todo rewrite the whole method, in order *not to use* std::string !
+       std::vector<std::string> tokens;
+           
+       Util::Tokenize ( GetString().c_str(), tokens, "\\" );
+        
+       int nbValues= tokens.size();
+       if (nbValues == 0)
+          return false;
+
+       if (vr == "DS")        
+          for (loop=0; loop<nbValues; loop++) 
+             valueVector.push_back(atof(tokens[loop].c_str()));
+       else
+          for (loop=0; loop<nbValues; loop++) 
+             valueVector.push_back(atoi(tokens[loop].c_str()));
+               
+       return true;     
+    }    
+    
+    uint32_t nbValues = GetValueCount();
+    if (nbValues == 0)
+       return false;
+       
+    if( vr == "US") {
+       for (loop=0; loop<nbValues; loop++)
+             valueVector.push_back(((uint16_t *)BinArea)[loop]);  
+       return true;
+    }
+    if( vr == "SS" ) {
+       for (loop=0; loop<nbValues; loop++)
+             valueVector.push_back(((int16_t *)BinArea)[loop]);  
+       return true;
+    }
+    if( vr == "UL") {
+       for (loop=0; loop<nbValues; loop++) 
+             valueVector.push_back(((uint32_t *)BinArea)[loop]);      
+       return true;
+    }
+    if(vr == "SL" ) {
+       for (loop=0; loop<nbValues; loop++) 
+             valueVector.push_back(((int32_t *)BinArea)[loop]);      
+       return true;
+    }       
+    if( vr == "FL" ) {
+       for (loop=0; loop<nbValues; loop++) 
+             valueVector.push_back(((float *)BinArea)[loop]);     
+       return true;
+    }
+    if( vr == "FD" ) {
+       for (loop=0; loop<nbValues; loop++) 
+             valueVector.push_back(((double *)BinArea)[loop]);
+       return true;
+    }     
+    return false;   // ?!? 
+ }
+
 /**
  * \brief Inserts the elementary (non string) value into the current DataEntry
  * @param id index of the elementary value to be set
@@ -426,10 +522,12 @@ void DataEntry::SetString(std::string const &value)
       NewBinArea();
       memcpy(BinArea, value.c_str(), l);
       if (l%2) // padded with blank except for UI
-         if ( vr == "UI" ) 
-            BinArea[l] = '\0';
-         else
-            BinArea[l] = ' ';                
+        {
+        if ( vr == "UI" )
+          BinArea[l] = '\0';
+        else
+          BinArea[l] = ' ';
+        }
    }
    State = STATE_LOADED;
 }
@@ -449,7 +547,7 @@ std::string const &DataEntry::GetString() const
 
   if( !BinArea )
      return *StrArea;
-      // When short integer(s) are stored, convert the following (n * 2) characters
+  // When short integer(s) are stored, convert the following (n * 2) characters
   // as a displayable string, the values being separated by a back-slash
   if( vr == "US" )
   {
@@ -494,7 +592,8 @@ std::string const &DataEntry::GetString() const
         s << data[i];
      }
      *StrArea=s.str();
-  }    else if( vr == "FL" )
+  }     // See above comment on multiple short integers (mutatis mutandis).
+  else if( vr == "FL" )
   {
      float *data=(float *)BinArea;
      for (unsigned int i=0; i < GetValueCount(); i++)
@@ -504,7 +603,7 @@ std::string const &DataEntry::GetString() const
         s << data[i];
      }
      *StrArea=s.str();
-  }
+  }     // See above comment on multiple short integers (mutatis mutandis).
   else if( vr == "FD" )
   {
      double *data=(double *)BinArea;
@@ -521,10 +620,133 @@ std::string const &DataEntry::GetString() const
      StrArea->append((const char *)BinArea,GetLength());
      // to avoid gdcm to propagate oddities in lengthes
      if ( GetLength()%2)
-        StrArea->append(" ",1);   }
+        StrArea->append(" ",1);
+   }
   return *StrArea;
 }
 
+/**
+ * \brief   returns an hexadecimal representation of the DataEntry value
+ */
+std::string const &DataEntry::GetHexaRepresentation() const
+{ 
+  static std::ostringstream s2;
+  const VRKey &vr = GetVR();
+   
+  s2.str("");
+  if (!StrHexaArea)
+     StrHexaArea = new std::string();
+  else 
+     *StrHexaArea="";
+  if( !BinArea )
+     return *StrHexaArea;
+  // When short integer(s) are stored, convert the following (n * 2) characters
+  // as a displayable string, the values being separated by a back-slash
+  
+  s2 << std::hex;
+  
+  if( vr == "US" )
+  {
+     uint16_t *data=(uint16_t *)BinArea;
+     for (unsigned int i=0; i < GetValueCount(); i++)
+     {
+        s2  << std::setw( 2 ) << std::setfill( '0' );     
+        if( i!=0 )
+           s2 << '\\';
+        s2 << data[i];
+     }
+     *StrHexaArea=s2.str();
+  }
+  else if (vr == "SS" )
+  {
+     int16_t *data=(int16_t *)BinArea;
+     for (unsigned int i=0; i < GetValueCount(); i++)
+     {
+        s2  << std::setw( 4 ) << std::setfill( '0' );
+        if( i!=0 )
+           s2 << '\\';
+        s2  << data[i];
+     }
+     *StrHexaArea=s2.str();
+  }      // See above comment on multiple short integers (mutatis mutandis).
+  else if( vr == "UL" )
+  {
+     uint32_t *data=(uint32_t *)BinArea;
+     for (unsigned int i=0; i < GetValueCount(); i++)
+     {
+        s2  << std::setw( 4 ) << std::setfill( '0' );
+        if( i!=0 ) 
+           s2  << '\\';
+        s2 << data[i];
+     }
+     *StrHexaArea=s2.str();
+  }
+  else if( vr == "SL" )
+  {
+     int32_t *data=(int32_t *)BinArea;
+     for (unsigned int i=0; i < GetValueCount(); i++)
+     {
+        s2  << std::setw( 4 ) << std::setfill( '0' );
+         if( i!=0 )
+           s2  << '\\';
+        s2 << data[i];
+     }
+     *StrHexaArea=s2.str();
+  }
+  else if( vr == "FL" )
+  {
+     unsigned char *toto=(unsigned char *)BinArea;
+     for (unsigned int i=0; i < GetValueCount(); i++)
+     {
+         s2.str("");
+         if( i!=0 )
+           s2 << '\\';
+         unsigned int a4;
+         for(int iif=0; iif<4; iif++)
+         {
+            a4=toto[iif];
+            s2 << a4; 
+         }
+     }
+     *StrHexaArea=s2.str();
+  }
+  else if( vr == "FD" )
+  {
+     //double *data=(double *)BinArea;
+     unsigned char *toto=(unsigned char *)BinArea;
+     for (unsigned int i=0; i < GetValueCount(); i++)
+     {
+        s2.str("");
+        if( i!=0 )
+           s2 << '\\';
+        //s2 << data[i];
+
+         unsigned int a4;
+         for(int iid=0; iid<8; iid++)
+         {
+            a4=toto[iid];
+            s2 << a4; 
+         }
+
+     }
+     *StrHexaArea=s2.str();
+  }
+  else
+  {
+     unsigned int l = (Length > GDCM_MAX_LENGTH_TO_CONVERT_TO_HEXA) ? GDCM_MAX_LENGTH_TO_CONVERT_TO_HEXA : Length;
+     uint8_t *data=(uint8_t *)BinArea;
+     for (unsigned int i=0; i < l; i++)
+     {
+        if( i!=0 )
+           s2 << '\\';
+        s2 << std::setw( 2 ) << (int)(data[i]);
+     }
+     if (Length > 16)
+        s2 << "\\...";
+     *StrHexaArea=s2.str();
+   }
+  return *StrHexaArea;
+}
 
 /**
  * \brief Copies all the attributes from an other DocEntry 
@@ -550,10 +772,10 @@ void DataEntry::Copy(DocEntry *doc)
  * @param filetype type of the file (ACR, ImplicitVR, ExplicitVR, ...)
  */
 void DataEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype, 
-                                                      bool insideMetaElements)
+                                                      bool insideMetaElements, bool insideSequence)
 { 
    // writes the 'common part'
-   DocEntry::WriteContent(fp, filetype, insideMetaElements);
+   DocEntry::WriteContent(fp, filetype, insideMetaElements, insideSequence);
 
    if ( GetGroup() == 0xfffe )
    {
@@ -654,6 +876,7 @@ uint32_t DataEntry::ComputeFullLength()
 
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Protected
+
 /// \brief Creates a DataEntry owned BinArea 
 ///       (remove previous one if any and relevant StrArea if any)
 void DataEntry::NewBinArea( )
@@ -677,6 +900,11 @@ void DataEntry::DeleteBinArea(void)
       delete StrArea;
       StrArea = 0;
    }
+   if (StrHexaArea)
+   {
+      delete StrHexaArea;
+      StrHexaArea = 0;
+   }   
 }
 
 //-----------------------------------------------------------------------------
@@ -691,7 +919,9 @@ void DataEntry::DeleteBinArea(void)
  */
 void DataEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
 {
-   os << "D ";
+   //os << "D ";
+   
+   // First, Print the common part (vr [length offset] name).
    DocEntry::Print(os);
 
    uint16_t g = GetGroup();
@@ -710,7 +940,7 @@ void DataEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
 
       if( vr == "US" || vr == "SS" || vr == "UL" || vr == "SL" 
        || vr == "FL" || vr == "FD")
-         s << " [" << GetString() << "]";
+         s << " [" << GetString() << "] =0x(" << GetHexaRepresentation() << ")";
       else
       { 
          if(Global::GetVR()->IsVROfStringRepresentable(vr))
@@ -749,7 +979,7 @@ void DataEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
             else
             {
                s << " [" << GDCM_BINLOADED << ";"
-               << "length = " << GetLength() << "]";
+               << "length = " << GetLength() << "] =0x(" << GetHexaRepresentation() << ")";      
             }
          }
       }