]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmDicomDir.cxx
ENH: Since HandleOutOfGroup0002 need access to the transfer syntax move the method...
[gdcm.git] / src / gdcmDicomDir.cxx
index cfeec8cca45090a3863413ae768a9d8cd81a0fda..1ef0feab48d1fa64c560a61a5194a753e16a280b 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmDicomDir.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2005/01/07 16:26:12 $
-  Version:   $Revision: 1.93 $
+  Date:      $Date: 2005/01/08 15:03:59 $
+  Version:   $Revision: 1.97 $
   
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
 #include <sys/types.h>
 
 #ifdef _MSC_VER
-#define getcwd _getcwd
+#   define getcwd _getcwd
 #endif
 
-#if defined( _MSC_VER) || defined(__BORLANDC__)
-   #include <direct.h>
+#if defined(_MSC_VER) || defined(__BORLANDC__)
+#   include <direct.h>
 #else
-   #include <unistd.h>
+#   include <unistd.h>
 #endif
 
 namespace gdcm 
@@ -90,9 +90,9 @@ DicomDir::DicomDir(std::string const &fileName, bool parseDir ):
    // if user passed a root directory, sure we didn't get anything
    if ( TagHT.begin() == TagHT.end() ) // when user passed a Directory to parse
    {
-      Debug::Verbose(0, "DicomDir::DicomDir : entry HT empty");
+      gdcmVerboseMacro( "Entry HT empty");
 
-      if ( fileName.size() == 1 && fileName[0] == '.' )
+      if ( fileName == "." )
       {
          // user passed '.' as Name
          // we get current directory name
@@ -105,8 +105,7 @@ DicomDir::DicomDir(std::string const &fileName, bool parseDir ):
       {
          MetaElems = NewMeta();
 
-         Debug::Verbose(0, "DicomDir::DicomDir : Parse directory"
-                        " and create the DicomDir");
+         gdcmVerboseMacro( "Parse directory and create the DicomDir");
          ParseDirectory();
       }
       else
@@ -119,11 +118,10 @@ DicomDir::DicomDir(std::string const &fileName, bool parseDir ):
    else // Only if user passed a DICOMDIR
    {
       // Directory record sequence
-      DocEntry *e = GetDocEntryByNumber(0x0004, 0x1220);
+      DocEntry *e = GetDocEntry(0x0004, 0x1220);
       if ( !e )
       {
-         Debug::Verbose(0, "DicomDir::DicomDir : NO Directory record"
-                        " sequence (0x0004,0x1220)");
+         gdcmVerboseMacro( "NO Directory record sequence (0x0004,0x1220)");
          /// \todo FIXME : what do we do when the parsed file IS NOT a
          ///       DICOMDIR file ?         
       }
@@ -358,7 +356,7 @@ bool DicomDir::WriteDicomDir(std::string const &fileName)
                                          std::ios::out | std::ios::binary);
    if( !fp ) 
    {
-      Debug::Verbose(2, "Failed to open(write) File: ", fileName.c_str());
+      gdcmVerboseMacro("Failed to open(write) File: " << fileName.c_str());
       return false;
    }
 
@@ -425,10 +423,7 @@ void DicomDir::CreateDicomDirChainedList(std::string const & path)
       header = new Header( it->c_str() );
       if( !header )
       {
-         Debug::Verbose( 1,
-                      "DicomDir::CreateDicomDirChainedList: "
-                      "failure in new Header ",
-                      it->c_str() );
+         gdcmVerboseMacro( "Failure in new Header " << it->c_str() );
          continue;
       }
       
@@ -436,9 +431,7 @@ void DicomDir::CreateDicomDirChainedList(std::string const & path)
       {
          // Add the file header to the chained list:
          list.push_back(header);
-         Debug::Verbose( 1,
-                      "DicomDir::CreateDicomDirChainedList: readable ",
-                      it->c_str() );
+         gdcmVerboseMacro( "Readable " << it->c_str() );
        }
        else
        {
@@ -513,7 +506,7 @@ DicomDirPatient *DicomDir::NewPatient()
    {
       tmpGr     = it->Group;
       tmpEl     = it->Elem;
-      dictEntry = GetPubDict()->GetDictEntryByNumber(tmpGr, tmpEl);
+      dictEntry = GetPubDict()->GetDictEntry(tmpGr, tmpEl);
       entry     = new ValEntry( dictEntry );
       entry->SetOffset(0); // just to avoid further missprinting
       entry->SetValue( it->Value );
@@ -552,8 +545,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
          si = new DicomDirImage();
          if( !AddDicomDirImageToEnd(static_cast<DicomDirImage *>(si)) )
          {
-            Debug::Verbose(0,"DicomDir::SetElement:",
-                        "Add DicomDirImageToEnd failed");
+            gdcmVerboseMacro( "Add DicomDirImageToEnd failed");
          }
          break;
       case GDCM_DICOMDIR_SERIE:
@@ -561,8 +553,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
          si = new DicomDirSerie();
          if( !AddDicomDirSerieToEnd(static_cast<DicomDirSerie *>(si)) )
          {
-            Debug::Verbose(0,"DicomDir::SetElement:",
-                        "Add DicomDirSerieToEnd failed");
+            gdcmVerboseMacro( "Add DicomDirSerieToEnd failed");
          }
          break;
       case GDCM_DICOMDIR_STUDY:
@@ -570,8 +561,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
          si = new DicomDirStudy();
          if( !AddDicomDirStudyToEnd(static_cast<DicomDirStudy *>(si)) )
          {
-            Debug::Verbose(0,"DicomDir::SetElement:",
-                        "Add DicomDirStudyToEnd failed");
+            gdcmVerboseMacro( "Add DicomDirStudyToEnd failed");
          }
          break;
       case GDCM_DICOMDIR_PATIENT:
@@ -579,8 +569,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
          si = new DicomDirPatient();
          if( !AddDicomDirPatientToEnd(static_cast<DicomDirPatient *>(si)) )
          {
-            Debug::Verbose(0,"DicomDir::SetElement:",
-                        "Add DicomDirPatientToEnd failed");
+            gdcmVerboseMacro( "Add DicomDirPatientToEnd failed");
          }
          break;
       case GDCM_DICOMDIR_META:
@@ -588,8 +577,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
          si = new DicomDirMeta();
          if( MetaElems )
          {
-            Debug::Verbose(0,"DicomDir::SetElement:",
-                        "MetaElements already exist, they will be destroyed");
+            gdcmVerboseMacro( "MetaElements already exist, they will be destroyed");
             delete MetaElems;
          }
          MetaElems = static_cast<DicomDirMeta *>(si);
@@ -611,7 +599,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
    {
       tmpGr     = it->Group;
       tmpEl     = it->Elem;
-      dictEntry = GetPubDict()->GetDictEntryByNumber(tmpGr, tmpEl);
+      dictEntry = GetPubDict()->GetDictEntry(tmpGr, tmpEl);
 
       entry     = new ValEntry( dictEntry ); // Be sure it's never a BinEntry !
 
@@ -621,7 +609,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
       {
          // NULL when we Build Up (ex nihilo) a DICOMDIR
          //   or when we add the META elems
-         val = header->GetEntryByNumber(tmpGr, tmpEl);
+         val = header->GetEntry(tmpGr, tmpEl);
       }
       else
       {
@@ -639,8 +627,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
          {
             if( header->GetFileName().substr(0, path.length()) != path )
             {
-               Debug::Verbose(0, "DicomDir::SetElement : the base path"
-                              " of file name is incorrect");
+               gdcmVerboseMacro( "The base path of file name is incorrect");
                val = header->GetFileName();
             }
             else
@@ -655,7 +642,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
       }
       else
       {
-         if ( header->GetEntryLengthByNumber(tmpGr,tmpEl) == 0 )
+         if ( header->GetEntryLength(tmpGr,tmpEl) == 0 )
             val = it->Value;
       }
 
@@ -728,11 +715,10 @@ void DicomDir::CreateDicomDir()
    //       + loop to 1 -
 
    // Directory record sequence
-   DocEntry *e = GetDocEntryByNumber(0x0004, 0x1220);
+   DocEntry *e = GetDocEntry(0x0004, 0x1220);
    if ( !e )
    {
-      Debug::Verbose(0, "DicomDir::DicomDir : NO Directory record"
-                     " sequence (0x0004,0x1220)");
+      gdcmVerboseMacro( "NO Directory record sequence (0x0004,0x1220)");
       /// \todo FIXME: what to do when the parsed file IS NOT a DICOMDIR file ? 
       return;         
    }
@@ -740,7 +726,7 @@ void DicomDir::CreateDicomDir()
    SeqEntry *s = dynamic_cast<SeqEntry *>(e);
    if ( !s )
    {
-      Debug::Verbose(0, "DicomDir::CreateDicomDir: no SeqEntry present");
+      gdcmVerboseMacro( "No SeqEntry present");
       // useless : (0x0004,0x1220) IS a Sequence !
       return;
    }
@@ -756,14 +742,14 @@ void DicomDir::CreateDicomDir()
    for( ListSQItem::iterator i = listItems.begin(); 
                              i !=listItems.end(); ++i ) 
    {
-      d = (*i)->GetDocEntryByNumber(0x0004, 0x1430); // Directory Record Type
+      d = (*i)->GetDocEntry(0x0004, 0x1430); // Directory Record Type
       if ( ValEntry* valEntry = dynamic_cast<ValEntry *>(d) )
       {
          v = valEntry->GetValue();
       }
       else
       {
-         Debug::Verbose(0, "DicomDir::CreateDicomDir: not a ValEntry.");
+         gdcmVerboseMacro( "Not a ValEntry.");
          continue;
       }
 
@@ -922,12 +908,12 @@ void DicomDir::SetElements(std::string const & path, VectDocument const &list)
                                      it != list.end(); ++it )
    {
       // get the current file characteristics
-      patCurName         = (*it)->GetEntryByNumber(0x0010,0x0010);
-      patCurID           = (*it)->GetEntryByNumber(0x0010,0x0011);
-      studCurInstanceUID = (*it)->GetEntryByNumber(0x0020,0x000d);
-      studCurID          = (*it)->GetEntryByNumber(0x0020,0x0010);
-      serCurInstanceUID  = (*it)->GetEntryByNumber(0x0020,0x000e);
-      serCurID           = (*it)->GetEntryByNumber(0x0020,0x0011);
+      patCurName         = (*it)->GetEntry(0x0010,0x0010);
+      patCurID           = (*it)->GetEntry(0x0010,0x0011);
+      studCurInstanceUID = (*it)->GetEntry(0x0020,0x000d);
+      studCurID          = (*it)->GetEntry(0x0020,0x0010);
+      serCurInstanceUID  = (*it)->GetEntry(0x0020,0x000e);
+      serCurID           = (*it)->GetEntry(0x0020,0x0011);
 
       if( patCurName != patPrevName || patCurID != patPrevID || first )
       {