]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmDicomDir.cxx
ENH: Try to sync gdcm CVS and gdcm 1.2. ~2000 lines of changes, please be gentle...
[gdcm.git] / src / gdcmDicomDir.cxx
index b93876b2f4c27800969e7f388a326836b744dc25..2ca54af0f96aee3e5e6db84d9a11ac7ebf90e6dc 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmDicomDir.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2005/12/13 16:32:20 $
-  Version:   $Revision: 1.181 $
+  Date:      $Date: 2006/02/16 20:06:13 $
+  Version:   $Revision: 1.186 $
   
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
 #else
 #   include <unistd.h>
 #endif
+
+#if defined(__BORLANDC__)
+   #include <mem.h> // for memset
+#endif
+
 // ----------------------------------------------------------------------------
 //         Note for future developpers
 // ----------------------------------------------------------------------------
@@ -124,6 +129,36 @@ DicomDir::DicomDir()
    NewMeta();
 }
 
+#ifndef GDCM_LEGACY_REMOVE
+/**
+ * \brief Constructor Parses recursively the directory and creates the DicomDir
+ *        or uses an already built DICOMDIR, depending on 'parseDir' value.
+ * @param fileName  name 
+ *                      - of the root directory (parseDir = true)
+ *                      - of the DICOMDIR       (parseDir = false)
+ * @param parseDir boolean
+ *                      - true if user passed an entry point 
+ *                        and wants to explore recursively the directories
+ *                      - false if user passed an already built DICOMDIR file
+ *                        and wants to use it 
+ * @deprecated use : new DicomDir() + [ SetLoadMode(lm) + ] SetDirectoryName(name)
+ *              or : new DicomDir() + SetFileName(name)
+ */
+DicomDir::DicomDir(std::string const &fileName, bool parseDir ):
+   Document( )
+{
+   // At this step, Document constructor is already executed,
+   // whatever user passed (either a root directory or a DICOMDIR)
+   // and whatever the value of parseDir was.
+   // (nothing is cheked in Document constructor, to avoid overhead)
+
+   ParseDir = parseDir;
+   SetLoadMode (LD_ALL); // concerns only dicom files
+   SetFileName( fileName );
+   Load( );
+}
+#endif
+
 /**
  * \brief  Canonical destructor 
  */
@@ -154,6 +189,28 @@ bool DicomDir::Load( )
    }
    return DoTheLoadingJob( );   
 }
+#ifndef GDCM_LEGACY_REMOVE
+/**
+ * \brief   Loader. (DEPRECATED : kept not to break the API)
+ * @param   fileName file to be open for parsing
+ * @return false if file cannot be open or no swap info was found,
+ *         or no tag was found.
+ * @deprecated use SetFileName(n) + Load() instead
+ */
+bool DicomDir::Load(std::string const &fileName ) 
+{
+   // We should clean out anything that already exists.
+   Initialize();  // sets all private fields to NULL
+
+   SetFileName( fileName );
+   if (!ParseDir)
+   {
+      if ( ! this->Document::Load( ) )
+         return false;
+   }
+   return DoTheLoadingJob( );
+}
+#endif
 
 /**
  * \brief   Does the Loading Job (internal use only)
@@ -203,11 +260,11 @@ bool DicomDir::DoTheLoadingJob( )
          const char *cwd = getcwd(buf, 2048);
          if( cwd )
          {
-           SetFileName( buf ); // will be converted into a string
+            SetFileName( buf ); // will be converted into a string
          }
          else
          {
-           gdcmErrorMacro( "Path was too long to fit on 2048 bytes" );
+            gdcmErrorMacro( "Path was too long to fit on 2048 bytes" );
          }
       }
       NewMeta();
@@ -588,7 +645,7 @@ void DicomDir::CreateDicomDir()
 
       // A decent DICOMDIR has much more images than series,
       // more series than studies, and so on.
-      // This is the right order to preform the tests
+      // This is the right order to perform the tests
 
       if ( v == "IMAGE " ) 
       {
@@ -888,9 +945,9 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
       default:
          return;
    }
-   
+
    // FIXME : troubles found when it's a SeqEntry
-      
+
    // removed all the seems-to-be-useless stuff about Referenced Image Sequence
    // to avoid further troubles
    // imageElem 0008 1140 "" // Referenced Image Sequence
@@ -914,8 +971,7 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
       {
          // NULL when we Build Up (ex nihilo) a DICOMDIR
          //   or when we add the META elems
-            val = header->GetEntryString(tmpGr, tmpEl); 
+         val = header->GetEntryString(tmpGr, tmpEl); 
       }
       else
       {
@@ -923,56 +979,74 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
       }
 
       if ( val == GDCM_UNFOUND) 
-      {       
+      {
          if ( tmpGr == 0x0004 ) // never present in File !     
          {
             switch (tmpEl)
-           {
-           case 0x1130: // File-set ID
-              // force to the *end* File Name
-              val = Util::GetName( path );
-              break;
+            {
+            case 0x1130: // File-set ID
+               // force to the *end* File Name
+               val = Util::GetName( path );
+               break;
       
-           case 0x1500: // Only used for image    
+            case 0x1500: // Only used for image    
                if ( header->GetFileName().substr(0, path.length()) != path )
-               {
-                  gdcmWarningMacro( "The base path of file name is incorrect");
-                  val = header->GetFileName();
+               { 
+                 gdcmWarningMacro( "The base path of file name is incorrect");
+                 val = header->GetFileName();
                }
                else
-               {
-                  //val = &(header->GetFileName().c_str()[path.length()+1]);
-                  val = &(header->GetFileName().c_str()[path.length()]);
+               { 
+                 // avoid the first '/' in File name !
+                 if ( header->GetFileName().c_str()[path.length()] 
+                                                      == GDCM_FILESEPARATOR )
+                    val = &(header->GetFileName().c_str()[path.length()+1]);
+                 else  
+                    val = &(header->GetFileName().c_str()[path.length()]);   
                }
-       break;
+               break;
     
-       case 0x1510:  // Referenced SOP Class UID in File
-          referencedVal = header->GetEntryString(0x0008, 0x0016);
-          // FIXME : probabely something to check
-          val = referencedVal;
-          break;
+             case 0x1510:  // Referenced SOP Class UID in File
+               referencedVal = header->GetEntryString(0x0008, 0x0016);
+               // FIXME : probabely something to check
+               val = referencedVal;
+               break;
        
-       case 0x1511: // Referenced SOP Instance UID in File
-          referencedVal = header->GetEntryString(0x0008, 0x0018);
-          // FIXME : probabely something to check
-          val = referencedVal;
-          break;
+             case 0x1511: // Referenced SOP Instance UID in File
+               referencedVal = header->GetEntryString(0x0008, 0x0018);
+               // FIXME : probabely something to check
+               val = referencedVal;
+               break;
     
-       case 0x1512: // Referenced Transfer Syntax UID in File
-          referencedVal = header->GetEntryString(0x0002, 0x0010);
-          // FIXME : probabely something to check
-          val = referencedVal;
-          break;
+            case 0x1512: // Referenced Transfer Syntax UID in File
+               referencedVal = header->GetEntryString(0x0002, 0x0010);
+               // FIXME : probabely something to check
+               val = referencedVal;
+               break;
     
-       default :
-         val = it->Value;   
-    } 
+            default :
+               val = it->Value;   
+            
          }
+         else
+         {
+            // If the entry is not found in the Header, don't write its 'value' in the DICOMDIR !
+            entry->Delete();
+            continue;
+          }
       }
       else
       {
          if ( header->GetEntryLength(tmpGr,tmpEl) == 0 )
+         {
             val = it->Value;
+            // Don't polute the DICOMDIR with empty fields
+            if (val == "")
+            {
+               entry->Delete();
+               continue;
+            }  
+         }    
       }
 
 /* FIX later the pb of creating the 'Implementation Version Name'!
@@ -987,12 +1061,14 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
          val += Util::GetVersion();
       }
 */ 
+
       entry->SetString( val ); // troubles expected when vr=SQ ...
 
       if ( type == GDCM_DICOMDIR_META ) // fusible : should never print !
       {
          gdcmDebugMacro("GDCM_DICOMDIR_META ?!? should never print that");
       }
+      
       si->AddEntry(entry);
       entry->Delete();
    }