]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmDicomDir.cxx
New method SerieHelper::AddSeriesDetail() to allow user to specifiy
[gdcm.git] / src / gdcmDicomDir.cxx
index 27cbd3ea38ddb25d9b2b016a9fcb3525b6cd61a0..b93876b2f4c27800969e7f388a326836b744dc25 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmDicomDir.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2005/11/21 09:46:25 $
-  Version:   $Revision: 1.173 $
+  Date:      $Date: 2005/12/13 16:32:20 $
+  Version:   $Revision: 1.181 $
   
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
@@ -37,6 +37,7 @@
 #include "gdcmSeqEntry.h"
 #include "gdcmSQItem.h"
 #include "gdcmDataEntry.h"
+#include "gdcmCommandManager.h"
 
 #include <fstream>
 #include <string>
@@ -117,7 +118,6 @@ namespace gdcm
  * \brief   Constructor : creates an empty DicomDir
  */
 DicomDir::DicomDir()
-         :Document( )
 {
    Initialize();  // sets all private fields to NULL
    ParseDir = false;
@@ -129,10 +129,6 @@ DicomDir::DicomDir()
  */
 DicomDir::~DicomDir() 
 {
-   SetStartMethod(NULL,NULL,NULL);
-   SetProgressMethod(NULL,NULL,NULL);
-   SetEndMethod(NULL,NULL,NULL);
-
    ClearPatient();
    if ( MetaElems )
    {
@@ -206,13 +202,13 @@ bool DicomDir::DoTheLoadingJob( )
          char buf[2048];
          const char *cwd = getcwd(buf, 2048);
          if( cwd )
-           {
+         {
            SetFileName( buf ); // will be converted into a string
-           }
+         }
          else
-           {
+         {
            gdcmErrorMacro( "Path was too long to fit on 2048 bytes" );
-           }
+         }
       }
       NewMeta();
       gdcmDebugMacro( "Parse directory and create the DicomDir : " 
@@ -345,117 +341,6 @@ void DicomDir::ParseDirectory()
    CreateDicomDir();
 }
 
-void DicomDir::SetStartMethod( DicomDir::Method *method, void *arg )
-{
-   SetStartMethod(method,arg,NULL);
-}
-
-void DicomDir::SetProgressMethod( DicomDir::Method *method, void *arg )
-{
-   SetProgressMethod(method,arg,NULL);
-}
-
-void DicomDir::SetEndMethod( DicomDir::Method *method, void *arg )
-{
-   SetEndMethod(method,arg,NULL);
-}
-
-/**
- * \brief   Set the start method to call when the parsing of the
- *          directory starts.
- * @param   method Method to call
- * @param   arg    Argument to pass to the method
- * @param   argDelete    Argument 
- * \warning In python : the arg parameter isn't considered
- */
-void DicomDir::SetStartMethod( DicomDir::Method *method, void *arg, 
-                               DicomDir::Method *argDelete )
-{
-   if ( StartArg && StartMethodArgDelete )
-   {
-      StartMethodArgDelete( StartArg );
-   }
-
-   StartMethod          = method;
-   StartArg             = arg;
-   StartMethodArgDelete = argDelete;
-}
-
-
-/**
- * \brief   Set the progress method to call when the parsing of the
- *          directory progress
- * @param   method Method to call
- * @param   arg    Argument to pass to the method
- * @param   argDelete    Argument  
- * \warning In python : the arg parameter isn't considered
- */
-void DicomDir::SetProgressMethod( DicomDir::Method *method, void *arg, 
-                                  DicomDir::Method *argDelete )
-{
-   if ( ProgressArg && ProgressMethodArgDelete )
-   {
-      ProgressMethodArgDelete( ProgressArg );
-   }
-
-   ProgressMethod          = method;
-   ProgressArg             = arg;
-   ProgressMethodArgDelete = argDelete;
-}
-
-/**
- * \brief   Set the end method to call when the parsing of the directory ends
- * @param   method Method to call
- * @param   arg    Argument to pass to the method
- * @param   argDelete    Argument 
- * \warning In python : the arg parameter isn't considered
- */
-void DicomDir::SetEndMethod( DicomDir::Method *method, void *arg, 
-                             DicomDir::Method *argDelete )
-{
-   if ( EndArg && EndMethodArgDelete )
-   {
-      EndMethodArgDelete( EndArg );
-   }
-
-   EndMethod          = method;
-   EndArg             = arg;
-   EndMethodArgDelete = argDelete;
-}
-
-/**
- * \brief   Set the method to delete the argument
- *          The argument is destroyed when the method is changed or when the
- *          class is destroyed
- * @param   method Method to call to delete the argument
- */
-void DicomDir::SetStartMethodArgDelete( DicomDir::Method *method ) 
-{
-   StartMethodArgDelete = method;
-}
-
-/**
- * \brief   Set the method to delete the argument
- *          The argument is destroyed when the method is changed or when the 
- *          class is destroyed          
- * @param   method Method to call to delete the argument
- */
-void DicomDir::SetProgressMethodArgDelete( DicomDir::Method *method )
-{
-   ProgressMethodArgDelete = method;
-}
-
-/**
- * \brief   Set the method to delete the argument
- *          The argument is destroyed when the method is changed or when
- *          the class is destroyed
- * @param   method Method to call to delete the argument
- */
-void DicomDir::SetEndMethodArgDelete( DicomDir::Method *method )
-{
-   EndMethodArgDelete = method;
-}
-
 /**
  * \brief    writes on disc a DICOMDIR
  * \ warning does NOT add the missing elements in the header :
@@ -468,7 +353,7 @@ bool DicomDir::Write(std::string const &fileName)
 {  
    int i;
    uint16_t sq[6] = { 0x0004, 0x1220, 0x5153, 0x0000, 0xffff, 0xffff };
-   uint16_t sqt[4]= { 0xfffe, 0xe0dd, 0xffff, 0xffff };
+   uint16_t sqt[4]= { 0xfffe, 0xe0dd, 0x0000, 0x0000 };
 
    std::ofstream *fp = new std::ofstream(fileName.c_str(),  
                                          std::ios::out | std::ios::binary);
@@ -502,7 +387,7 @@ bool DicomDir::Write(std::string const &fileName)
    // force writing Sequence Delimitation Item
    for(i=0;i<4;++i)
    {
-      binary_write(*fp, sqt[i]);  // fffe e0dd ffff ffff 
+      binary_write(*fp, sqt[i]);  // fffe e0dd 0000 0000 
    }
 
    fp->close();
@@ -550,6 +435,33 @@ bool DicomDir::Anonymize()
    return true;
 }
 
+/**
+ * \brief Copies all the attributes from an other DocEntrySet 
+ * @param set entry to copy from
+ * @remarks The contained DocEntries are not copied, only referenced
+ */
+void DicomDir::Copy(DocEntrySet *set)
+{
+   // Remove all previous childs
+   ClearPatient();
+
+   Document::Copy(set);
+
+   DicomDir *dd = dynamic_cast<DicomDir *>(set);
+   if( dd )
+   {
+      if(MetaElems)
+         MetaElems->Unregister();
+      MetaElems = dd->MetaElems;
+      if(MetaElems)
+         MetaElems->Register();
+
+      Patients = dd->Patients;
+      for(ItPatient = Patients.begin();ItPatient != Patients.end();++ItPatient)
+         (*ItPatient)->Register();
+   }
+}
+
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Protected
 /**
@@ -565,12 +477,12 @@ void DicomDir::CreateDicomDirChainedList(std::string const &path)
    File *f;
 
    DirListType fileList = dirList.GetFilenames();
-
+   unsigned int nbFile = fileList.size();
    for( DirListType::iterator it  = fileList.begin();
                               it != fileList.end();
                               ++it )
    {
-      Progress = (float)(count+1)/(float)fileList.size();
+      Progress = (float)(count+1)/(float)nbFile;
       CallProgressMethod();
       if ( Abort )
       {
@@ -611,41 +523,6 @@ void DicomDir::CreateDicomDirChainedList(std::string const &path)
    }
 }
 
-/**
- * \brief   CallStartMethod
- */
-void DicomDir::CallStartMethod()
-{
-   Progress = 0.0f;
-   Abort    = false;
-   if ( StartMethod )
-   {
-      StartMethod( StartArg );
-   }
-}
-
-/**
- * \brief   CallProgressMethod
- */
-void DicomDir::CallProgressMethod()
-{
-   if ( ProgressMethod )
-   {
-      ProgressMethod( ProgressArg );
-   }
-}
-
-/**
- * \brief   CallEndMethod
- */
-void DicomDir::CallEndMethod()
-{
-   Progress = 1.0f;
-   if ( EndMethod )
-   {
-      EndMethod( EndArg );
-   }
-}
 
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Private
@@ -654,16 +531,6 @@ void DicomDir::CallEndMethod()
  */
 void DicomDir::Initialize()
 {
-   StartMethod             = NULL;
-   ProgressMethod          = NULL;
-   EndMethod               = NULL;
-   StartMethodArgDelete    = NULL;
-   ProgressMethodArgDelete = NULL;
-   EndMethodArgDelete      = NULL;
-   StartArg                = NULL;
-   ProgressArg             = NULL;
-   EndArg                  = NULL;
-
    Progress = 0.0;
    Abort = false;
 
@@ -786,7 +653,7 @@ void DicomDir::CreateDicomDir()
         continue;
       }
       if ( si )
-         si->MoveObject(tmpSI);  // New code : Copies the List
+         si->Copy(tmpSI);
 
       tmpSI=s->GetNextSQItem();
    }
@@ -1074,7 +941,8 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
                }
                else
                {
-                  val = &(header->GetFileName().c_str()[path.length()+1]);
+                  //val = &(header->GetFileName().c_str()[path.length()+1]);
+                  val = &(header->GetFileName().c_str()[path.length()]);
                }
        break;
     
@@ -1136,15 +1004,16 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
  * @param dst destination SQItem
  * @param src source SQItem
  */
-void DicomDir::MoveSQItem(DocEntrySet *dst,DocEntrySet *src)
+void DicomDir::MoveSQItem(DocEntrySet *dst, DocEntrySet *src)
 { 
    DocEntry *entry;
-
+// todo : rewrite the whole stuff, without using RemoveEntry an AddEntry,
+//        to save time
    entry = src->GetFirstEntry();
    while(entry)
    {
+      dst->AddEntry(entry);  // use it, *before* removing it!
       src->RemoveEntry(entry);
-      dst->AddEntry(entry);
       // we destroyed -> the current iterator is not longer valid
       entry = src->GetFirstEntry();
    }