]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmDicomDir.cxx
To please M$VC6 :
[gdcm.git] / src / gdcmDicomDir.cxx
index 22670611d27a12c6d00d84631c9269cab1cb7a6e..f52529f5ec55046447fa78204dee1c14566a8ba2 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmDicomDir.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2005/11/29 17:21:34 $
-  Version:   $Revision: 1.177 $
+  Date:      $Date: 2006/01/18 10:17:40 $
+  Version:   $Revision: 1.184 $
   
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
@@ -353,7 +353,7 @@ bool DicomDir::Write(std::string const &fileName)
 {  
    int i;
    uint16_t sq[6] = { 0x0004, 0x1220, 0x5153, 0x0000, 0xffff, 0xffff };
-   uint16_t sqt[4]= { 0xfffe, 0xe0dd, 0xffff, 0xffff };
+   uint16_t sqt[4]= { 0xfffe, 0xe0dd, 0x0000, 0x0000 };
 
    std::ofstream *fp = new std::ofstream(fileName.c_str(),  
                                          std::ios::out | std::ios::binary);
@@ -387,7 +387,7 @@ bool DicomDir::Write(std::string const &fileName)
    // force writing Sequence Delimitation Item
    for(i=0;i<4;++i)
    {
-      binary_write(*fp, sqt[i]);  // fffe e0dd ffff ffff 
+      binary_write(*fp, sqt[i]);  // fffe e0dd 0000 0000 
    }
 
    fp->close();
@@ -438,7 +438,7 @@ bool DicomDir::Anonymize()
 /**
  * \brief Copies all the attributes from an other DocEntrySet 
  * @param set entry to copy from
- * @remarks The contained DocEntries a not copied, only referenced
+ * @remarks The contained DocEntries are not copied, only referenced
  */
 void DicomDir::Copy(DocEntrySet *set)
 {
@@ -477,12 +477,12 @@ void DicomDir::CreateDicomDirChainedList(std::string const &path)
    File *f;
 
    DirListType fileList = dirList.GetFilenames();
-
+   unsigned int nbFile = fileList.size();
    for( DirListType::iterator it  = fileList.begin();
                               it != fileList.end();
                               ++it )
    {
-      Progress = (float)(count+1)/(float)fileList.size();
+      Progress = (float)(count+1)/(float)nbFile;
       CallProgressMethod();
       if ( Abort )
       {
@@ -588,7 +588,7 @@ void DicomDir::CreateDicomDir()
 
       // A decent DICOMDIR has much more images than series,
       // more series than studies, and so on.
-      // This is the right order to preform the tests
+      // This is the right order to perform the tests
 
       if ( v == "IMAGE " ) 
       {
@@ -927,51 +927,70 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
          if ( tmpGr == 0x0004 ) // never present in File !     
          {
             switch (tmpEl)
-           {
-           case 0x1130: // File-set ID
-              // force to the *end* File Name
-              val = Util::GetName( path );
-              break;
+            {
+            case 0x1130: // File-set ID
+               // force to the *end* File Name
+               val = Util::GetName( path );
+               break;
       
-           case 0x1500: // Only used for image    
+            case 0x1500: // Only used for image    
                if ( header->GetFileName().substr(0, path.length()) != path )
-               {
-                  gdcmWarningMacro( "The base path of file name is incorrect");
-                  val = header->GetFileName();
+               { 
+                 gdcmWarningMacro( "The base path of file name is incorrect");
+                 val = header->GetFileName();
                }
                else
-               {
-                  val = &(header->GetFileName().c_str()[path.length()+1]);
+               { 
+                 // avoid the first '/' in File name !
+                 if ( header->GetFileName().c_str()[path.length()] 
+                                                      == GDCM_FILESEPARATOR )
+                    val = &(header->GetFileName().c_str()[path.length()+1]);
+                 else  
+                    val = &(header->GetFileName().c_str()[path.length()]);   
                }
-       break;
+               break;
     
-       case 0x1510:  // Referenced SOP Class UID in File
-          referencedVal = header->GetEntryString(0x0008, 0x0016);
-          // FIXME : probabely something to check
-          val = referencedVal;
-          break;
+             case 0x1510:  // Referenced SOP Class UID in File
+               referencedVal = header->GetEntryString(0x0008, 0x0016);
+               // FIXME : probabely something to check
+               val = referencedVal;
+               break;
        
-       case 0x1511: // Referenced SOP Instance UID in File
-          referencedVal = header->GetEntryString(0x0008, 0x0018);
-          // FIXME : probabely something to check
-          val = referencedVal;
-          break;
+             case 0x1511: // Referenced SOP Instance UID in File
+               referencedVal = header->GetEntryString(0x0008, 0x0018);
+               // FIXME : probabely something to check
+               val = referencedVal;
+               break;
     
-       case 0x1512: // Referenced Transfer Syntax UID in File
-          referencedVal = header->GetEntryString(0x0002, 0x0010);
-          // FIXME : probabely something to check
-          val = referencedVal;
-          break;
+            case 0x1512: // Referenced Transfer Syntax UID in File
+               referencedVal = header->GetEntryString(0x0002, 0x0010);
+               // FIXME : probabely something to check
+               val = referencedVal;
+               break;
     
-       default :
-         val = it->Value;   
-    } 
+            default :
+               val = it->Value;   
+            
          }
+         else
+         {
+            // If the entry is not found in the Header, don't write its 'value' in the DICOMDIR !
+            entry->Delete();
+            continue;
+          }
       }
       else
       {
          if ( header->GetEntryLength(tmpGr,tmpEl) == 0 )
+         {
             val = it->Value;
+            // Don't polute the DICOMDIR with empty fields
+            if (val == "")
+            {
+               entry->Delete();
+               continue;
+            }  
+         }    
       }
 
 /* FIX later the pb of creating the 'Implementation Version Name'!
@@ -986,12 +1005,14 @@ void DicomDir::SetElement(std::string const &path, DicomDirType type,
          val += Util::GetVersion();
       }
 */ 
+
       entry->SetString( val ); // troubles expected when vr=SQ ...
 
       if ( type == GDCM_DICOMDIR_META ) // fusible : should never print !
       {
          gdcmDebugMacro("GDCM_DICOMDIR_META ?!? should never print that");
       }
+      
       si->AddEntry(entry);
       entry->Delete();
    }