]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmDocEntry.cxx
Normalization
[gdcm.git] / src / gdcmDocEntry.cxx
index 2d7cfa9433a1e388766282828d546d7077082eb4..3e218c41968260f8c01ffb1a2c64f84eea4f7f05 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmDocEntry.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2004/10/10 00:42:54 $
-  Version:   $Revision: 1.26 $
+  Date:      $Date: 2005/02/02 10:02:17 $
+  Version:   $Revision: 1.51 $
                                                                                 
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
 
 #include "gdcmDocEntry.h"
 #include "gdcmTS.h"
+#include "gdcmVR.h"
 #include "gdcmGlobal.h"
 #include "gdcmUtil.h"
+#include "gdcmDebug.h"
 
 #include <iomanip> // for std::ios::left, ...
+#include <fstream>
 
-// CLEAN ME
+namespace gdcm 
+{
+//-----------------------------------------------------------------------------
 #define MAX_SIZE_PRINT_ELEMENT_VALUE 64
 
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Constructor / Destructor
 /**
- * \ingroup gdcmDocEntry
- * \brief   Constructor from a given gdcmDictEntry
+ * \brief   Constructor from a given DictEntry
  * @param   in Pointer to existing dictionary entry
  */
-gdcmDocEntry::gdcmDocEntry(gdcmDictEntry* in)
+DocEntry::DocEntry(DictEntry *in)
 {
    ImplicitVR = false;
-   DictEntry  = in;
+   DicomDict  = in;
    SetKey( in->GetKey( ) );
    Offset     = 0 ; // To avoid further missprinting
-}
-
-//-----------------------------------------------------------------------------
-// Print
-/**
- * \ingroup gdcmDocEntry
- * \brief   Prints the common part of gdcmValEntry, gdcmBinEntry, gdcmSeqEntry
- * @param   os ostream we want to print in
- */
-void gdcmDocEntry::Print(std::ostream& os)
-{
-   PrintLevel = 2; // FIXME
-   
-   size_t o;
-   unsigned short int g, e;
-   std::string st;
-   TSKey v;
-   std::string d2, vr;
-   std::ostringstream s;
-   uint32_t lgth;
-
-   g  = GetGroup();
-   e  = GetElement();
-   o  = GetOffset();
-   vr = GetVR();
-
-   s << gdcmDictEntry::TranslateToKey(GetGroup(),GetElement()); 
-
-   if (PrintLevel >= 2)
-   {
-      s << " lg : ";
-      lgth = GetReadLength(); // ReadLength, as opposed to UsableLength
-      if (lgth == 0xffffffff)
-      {
-         st = gdcmUtil::Format("x(ffff)");  // I said : "x(ffff)" !
-         s.setf(std::ios::left);
-         s << std::setw(10-st.size()) << " ";  
-         s << st << " ";
-         s.setf(std::ios::left);
-         s << std::setw(8) << "-1"; 
-      }
-      else
-      {
-         st = gdcmUtil::Format("x(%x)",lgth);
-         s.setf(std::ios::left);
-         s << std::setw(10-st.size()) << " ";
-         s << st << " ";
-         s.setf(std::ios::left);
-         s << std::setw(8) << lgth; 
-      }
-      s << " Off.: ";
-      st = gdcmUtil::Format("x(%x)",o); 
-      s << std::setw(10-st.size()) << " ";
-      s << st << " ";
-      s << std::setw(8) << o; 
-   }
 
-   s << "[" << vr  << "] ";
-
-   if (PrintLevel >= 1)
-   {
-      s.setf(std::ios::left);
-      s << std::setw(66-GetName().length()) << " ";
-   }
-    
-   s << "[" << GetName()<< "]";
-   os << s.str();      
+   // init some variables
+   ReadLength = 0;
+   Length = 0;
 }
 
+//-----------------------------------------------------------------------------
+// Public
 /**
- * \ingroup gdcmDocEntry
- * \brief   Writes the common part of any gdcmValEntry, gdcmBinEntry, gdcmSeqEntry
- * @param fp already open file pointer
- * @param filetype type of the file to be written
+ * \brief   Writes the common part of any ValEntry, BinEntry, SeqEntry
+ * @param fp already open ofstream pointer
+ * @param filetype type of the file (ACR, ImplicitVR, ExplicitVR, ...)
  */
-void gdcmDocEntry::Write(FILE* fp, FileType filetype)
+void DocEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
 {
    uint32_t ffff  = 0xffffffff;
    uint16_t group = GetGroup();
-   gdcmVRKey vr   = GetVR();
+   VRKey vr       = GetVR();
    uint16_t el    = GetElement();
-   uint32_t lgr   = GetReadLength();
+   uint32_t lgr   = GetLength();
 
    if ( group == 0xfffe && el == 0x0000 )
    {
@@ -129,14 +71,13 @@ void gdcmDocEntry::Write(FILE* fp, FileType filetype)
      // we just *always* ignore spurious fffe|0000 tag !   
       return;
    }
-
    //
    // ----------- Writes the common part
    //
-   fwrite ( &group,(size_t)2 ,(size_t)1 ,fp);  //group
-   fwrite ( &el,   (size_t)2 ,(size_t)1 ,fp);  //element
-      
-   if ( filetype == gdcmExplicitVR )
+   binary_write( *fp, group); //group number
+   binary_write( *fp, el);    //element number
+
+   if ( filetype == ExplicitVR )
    {
       // Special case of delimiters:
       if (group == 0xfffe)
@@ -145,49 +86,47 @@ void gdcmDocEntry::Write(FILE* fp, FileType filetype)
          // Hence we skip writing the VR.
          // In order to avoid further troubles, we choose to write them
          // as 'no-length' Item Delimitors (we pad by writing 0xffffffff)
-         // The end of a given Item will be found when  :
-         //  - a new Item Delimitor Item is encountered (the Seq goes on)
-         //  - a Sequence Delimitor Item is encountered (the Seq just ended)
-
-         // TODO : verify if the Sequence Delimitor Item was forced during Parsing 
+         // We shall force the end of a given Item by writting 
+         //  a Item Delimitation Item (fffe, e00d)
 
-         int ff = 0xffffffff;
-         fwrite (&ff,(size_t)4 ,(size_t)1 ,fp);
+         uint32_t ff = 0xffffffff;
+         binary_write(*fp, ff);
          return;
       }
 
       uint16_t z = 0;
       uint16_t shortLgr = lgr;
 
-      if (vr == "unkn")
+      if (vr == GDCM_UNKNOWN)
       {
          // Unknown was 'written'
          // deal with Little Endian            
-         fwrite ( &shortLgr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,fp);
-         fwrite ( &z,       (size_t)2 ,(size_t)1 ,fp);
+         binary_write(*fp, shortLgr);
+         binary_write(*fp, z);
       }
       else
       {
-         fwrite (vr.c_str(),(size_t)2 ,(size_t)1 ,fp); 
+         binary_write(*fp, vr);
+         gdcmAssertMacro( vr.size() == 2 );
                   
          if ( (vr == "OB") || (vr == "OW") || (vr == "SQ") || (vr == "UN") )
          {
-            fwrite ( &z,  (size_t)2 ,(size_t)1 ,fp);
+            binary_write(*fp, z);
             if (vr == "SQ")
             {
                // we set SQ length to ffffffff
                // and  we shall write a Sequence Delimitor Item 
                // at the end of the Sequence! 
-               fwrite ( &ffff,(size_t)4 ,(size_t)1 ,fp);
+               binary_write(*fp, ffff);
             }
             else
             {
-               fwrite ( &lgr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,fp);
+               binary_write(*fp, lgr);
             }
          }
          else
          {
-            fwrite ( &shortLgr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,fp);
+            binary_write(*fp, shortLgr);
          }
       }
    } 
@@ -195,24 +134,20 @@ void gdcmDocEntry::Write(FILE* fp, FileType filetype)
    { 
       if (vr == "SQ")
       {
-         fwrite ( &ffff,(size_t)4 ,(size_t)1 ,fp);
+         binary_write(*fp, ffff);
       }
       else
       {
-         fwrite ( &lgr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,fp);
+         binary_write(*fp, lgr);
       }
    }
 }
 
-//-----------------------------------------------------------------------------
-// Public
-
 /**
- * \ingroup gdcmDocEntry
  * \brief   Gets the full length of the elementary DocEntry (not only value
  *          length) depending on the VR.
  */
-uint32_t gdcmDocEntry::GetFullLength()
+uint32_t DocEntry::GetFullLength()
 {
    uint32_t l = GetReadLength();
    if ( IsImplicitVR() )
@@ -234,35 +169,31 @@ uint32_t gdcmDocEntry::GetFullLength()
 }
 
 /**
- * \ingroup gdcmDocEntry
  * \brief   Copies all the attributes from an other DocEntry 
+ * @param doc entry to copy from
  */
-void gdcmDocEntry::Copy (gdcmDocEntry* e)
+void DocEntry::Copy(DocEntry *doc)
 {
-   DictEntry    = e->DictEntry;
-   UsableLength = e->UsableLength;
-   ReadLength   = e->ReadLength;
-   ImplicitVR   = e->ImplicitVR;
-   Offset       = e->Offset;
-   PrintLevel   = e->PrintLevel;
-   // TODO : remove gdcmDocEntry SQDepth
+   Length     = doc->Length;
+   ReadLength = doc->ReadLength;
+   ImplicitVR = doc->ImplicitVR;
+   Offset     = doc->Offset;
 }
 
 /**
- * \ingroup gdcmDocEntry
  * \brief   tells us if entry is the last one of a 'no length' SequenceItem 
  *          (fffe,e00d) 
  */
-bool gdcmDocEntry::IsItemDelimitor()
+bool DocEntry::IsItemDelimitor()
 {
    return (GetGroup() == 0xfffe && GetElement() == 0xe00d);
 }
+
 /**
- * \ingroup gdcmDocEntry
  * \brief   tells us if entry is the last one of a 'no length' Sequence 
  *          (fffe,e0dd) 
  */
-bool gdcmDocEntry::IsSequenceDelimitor()
+bool DocEntry::IsSequenceDelimitor()
 {
    return (GetGroup() == 0xfffe && GetElement() == 0xe0dd);
 }
@@ -270,8 +201,72 @@ bool gdcmDocEntry::IsSequenceDelimitor()
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Protected
 
-
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Private
 
 //-----------------------------------------------------------------------------
+// Print
+/**
+ * \brief   Prints the common part of ValEntry, BinEntry, SeqEntry
+ * @param   os ostream we want to print in
+ * @param indent Indentation string to be prepended during printing
+ */
+void DocEntry::Print(std::ostream &os, std::string const & )
+{
+   size_t o;
+   std::string st;
+   TSKey v;
+   std::string d2, vr;
+   std::ostringstream s;
+   uint32_t lgth;
+
+   o  = GetOffset();
+   vr = GetVR();
+   if(vr==GDCM_UNKNOWN)
+      vr="  ";
+
+   s << DictEntry::TranslateToKey(GetGroup(),GetElement()); 
+
+   if (PrintLevel >= 2)
+   {
+      s << " lg : ";
+      lgth = GetReadLength(); // ReadLength, as opposed to Length
+      if (lgth == 0xffffffff)
+      {
+         st = Util::Format("x(ffff)");  // I said : "x(ffff)" !
+         s.setf(std::ios::left);
+         s << std::setw(10-st.size()) << " ";  
+         s << st << " ";
+         s.setf(std::ios::left);
+         s << std::setw(8) << "-1"; 
+      }
+      else
+      {
+         st = Util::Format("x(%x)",lgth);
+         s.setf(std::ios::left);
+         s << std::setw(10-st.size()) << " ";
+         s << st << " ";
+         s.setf(std::ios::left);
+         s << std::setw(8) << lgth; 
+      }
+      s << " Off.: ";
+      st = Util::Format("x(%x)",o); 
+      s << std::setw(10-st.size()) << " ";
+      s << st << " ";
+      s << std::setw(8) << o; 
+   }
+
+   s << "[" << vr  << "] ";
+
+   if (PrintLevel >= 1)
+   {
+      s.setf(std::ios::left);
+      s << std::setw(66-GetName().length()) << " ";
+   }
+    
+   s << "[" << GetName()<< "]";
+   os << s.str();      
+}
+
+//-----------------------------------------------------------------------------
+} // end namespace gdcm