]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmDocEntrySet.cxx
* Fix bug... sorry, too quick commit when correcting memory leaks
[gdcm.git] / src / gdcmDocEntrySet.cxx
index 9b7286f06a28e627fcf8d8d3e7b7879a7e7a2d42..b3cfe401bd19af2ab6a7e46bc9f8a6e73a96e90f 100644 (file)
-// gdcmDocEntrySet.cxx
-//-----------------------------------------------------------------------------
-//
-#include <errno.h>
+/*=========================================================================
+                                                                                
+  Program:   gdcm
+  Module:    $RCSfile: gdcmDocEntrySet.cxx,v $
+  Language:  C++
+  Date:      $Date: 2005/10/21 10:48:16 $
+  Version:   $Revision: 1.64 $
+                                                                                
+  Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
+  l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
+  http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
+                                                                                
+     This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
+     the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
+     PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
+                                                                                
+=========================================================================*/
+#include "gdcmDocEntrySet.h"
+
 #include "gdcmDebug.h"
 #include "gdcmCommon.h"
+#include "gdcmDictSet.h"
 #include "gdcmGlobal.h"
-#include "gdcmDocEntrySet.h"
-#include "gdcmException.h"
 #include "gdcmDocEntry.h"
 #include "gdcmSeqEntry.h"
-#include "gdcmValEntry.h"
-#include "gdcmBinEntry.h"
+#include "gdcmUtil.h"
+#include "gdcmDataEntry.h"
+#include "gdcmVR.h"
 
+namespace gdcm 
+{
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Constructor / Destructor
+DocEntrySet::DocEntrySet() 
+{ 
+   PreviousDocEntry = 0;
+}
+//-----------------------------------------------------------------------------
+// Public
 /**
- * \ingroup gdcmDocEntrySet
- * \brief   Constructor from a given gdcmDocEntrySet
+ * \brief   Get the "std::string representable" value of the Dicom entry
+ * @param   group  Group number of the searched tag.
+ * @param   elem Element number of the searched tag.
+ * @return  Corresponding element value when it exists,
+ *          and the string GDCM_UNFOUND otherwise.
  */
-gdcmDocEntrySet::gdcmDocEntrySet(int depthLevel) {
-   SQDepthLevel = depthLevel + 1;
+std::string DocEntrySet::GetEntryString(uint16_t group, uint16_t elem)
+{
+   DataEntry *entry = dynamic_cast<DataEntry *>(GetDocEntry(group,elem));
+   if ( entry )
+   {
+      if( entry->IsNotLoaded() )
+         return GDCM_NOTLOADED;
+      if( entry->IsUnfound() )
+         return GDCM_UNFOUND;
+      if( entry->IsUnread() )
+         return GDCM_UNREAD;
+      return entry->GetString();
+   }
+   return GDCM_UNFOUND;
 }
+
 /**
- * \brief   Canonical destructor.
+ * \brief   Gets (from Header) a 'non string' element value 
+ * @param group   group number of the Entry 
+ * @param elem  element number of the Entry
+ * @return Pointer to the 'non string' area
  */
-gdcmDocEntrySet::~gdcmDocEntrySet(){
+void *DocEntrySet::GetEntryBinArea(uint16_t group, uint16_t elem) 
+{
+   DataEntry *entry = GetDataEntry(group, elem);
+   if ( entry )
+      return entry->GetBinArea();
+   return 0;
 }
-//-----------------------------------------------------------------------------
-// Print
-/*
- * \ingroup gdcmDocEntrySet
- * \brief   canonical Printer
+
+/**
+ * \brief   Return the value of the DataEntry if it's "std::string representable"
+ * @param   group  Group number of the searched tag.
+ * @param   elem Element number of the searched tag.
+ * @return  Corresponding element value when it's "std::string representable"
+ *          and the string GDCM_NOTASCII otherwise.
  */
+std::string DocEntrySet::GetEntryForcedAsciiValue(uint16_t group, uint16_t elem)
+{
+   DocEntry *d = GetDocEntry(group,elem);
+   if ( !d )
+      return GDCM_UNFOUND;
 
+   DataEntry *de = dynamic_cast<DataEntry *>(d);
+   if ( de )
+   {
+      if( de->IsNotLoaded() )
+         return GDCM_NOTLOADED;
+      if( de->IsUnfound() )
+         return GDCM_UNFOUND;
+      if( de->IsUnread() )
+         return GDCM_UNREAD;
+   }
 
-//-----------------------------------------------------------------------------
-// Public
+   if( Global::GetVR()->IsVROfStringRepresentable( de->GetVR() ) )
+      return de->GetString();
+   else
+   {
+      uint8_t *a = de->GetBinArea();
+      if( Util::IsCleanArea(a, de->GetLength()) )
+         return  Util::CreateCleanString(a, de->GetLength());
+   }
+   return GDCM_NOTASCII;
+}
+
+/**
+ * \brief   Searches within Header Entries (Dicom Elements) parsed with 
+ *          the public and private dictionaries 
+ *          for the value length of a given tag..
+ * @param   group  Group number of the searched tag.
+ * @param   elem Element number of the searched tag.
+ * @return  Corresponding element length; -2 if not found
+ */
+int DocEntrySet::GetEntryLength(uint16_t group, uint16_t elem)
+{
+   DocEntry *entry = GetDocEntry(group, elem);
+   if ( entry )
+      return entry->GetLength();
+   return -1;
+}
+
+/**
+ * \brief  Same as \ref Document::GetDocEntry except it only
+ *         returns a result when the corresponding entry is of type
+ *         DataEntry.
+ * @param   group  Group number of the searched Dicom Element 
+ * @param   elem Element number of the searched Dicom Element  
+ * @return When present, the corresponding DataEntry. 
+ */
+DataEntry *DocEntrySet::GetDataEntry(uint16_t group, uint16_t elem)
+{
+   DocEntry *currentEntry = GetDocEntry(group, elem);
+   if ( !currentEntry )
+      return NULL;
+
+   return dynamic_cast<DataEntry*>(currentEntry);
+}
+
+/**
+ * \brief  Same as \ref Document::GetDocEntry except it only
+ *         returns a result when the corresponding entry is of type
+ *         SeqEntry.
+ * @param   group  Group number of the searched Dicom Element 
+ * @param   elem Element number of the searched Dicom Element  
+ * @return When present, the corresponding SeqEntry. 
+ */
+SeqEntry *DocEntrySet::GetSeqEntry(uint16_t group, uint16_t elem)
+{
+   DocEntry *currentEntry = GetDocEntry(group, elem);
+   if ( !currentEntry )
+   {
+      gdcmWarningMacro( "No corresponding SeqEntry " << std::hex << group <<
+                        "," << elem);
+      return NULL;
+   }
+
+   return dynamic_cast<SeqEntry*>(currentEntry);
+}
+
+/**
+ * \brief   Accesses an existing DocEntry (i.e. a Dicom Element)
+ *          through it's (group, element) and modifies it's content with
+ *          the given value.
+ * @param   content new value (string) to substitute with
+ * @param   group  group number of the Dicom Element to modify
+ * @param   elem element number of the Dicom Element to modify
+ */
+bool DocEntrySet::SetEntryString(std::string const &content, 
+                                 uint16_t group, uint16_t elem) 
+{
+   DataEntry *entry = GetDataEntry(group, elem);
+   if (!entry )
+   {
+      gdcmWarningMacro( "No corresponding DataEntry " << std::hex << group <<
+                         "," << elem << " element (try promotion first).");
+      return false;
+   }
+   return SetEntryString(content,entry);
+}
+
+/**
+ * \brief   Accesses an existing DocEntry (i.e. a Dicom Element)
+ *          through it's (group, element) and modifies it's content with
+ *          the given value.
+ * @param   content new value (void*  -> uint8_t*) to substitute with
+ * @param   lgth new value length
+ * @param   group  group number of the Dicom Element to modify
+ * @param   elem element number of the Dicom Element to modify
+ */
+bool DocEntrySet::SetEntryBinArea(uint8_t *content, int lgth, 
+                                  uint16_t group, uint16_t elem) 
+{
+   DataEntry *entry = GetDataEntry(group, elem);
+   if (!entry )
+   {
+      gdcmWarningMacro( "No corresponding DataEntry " << std::hex << group <<
+                        "," << elem << " element (try promotion first).");
+      return false;
+   }
+
+   return SetEntryBinArea(content,lgth,entry);
+} 
+
+/**
+ * \brief   Accesses an existing DocEntry (i.e. a Dicom Element)
+ *          and modifies it's content with the given value.
+ * @param  content new value (string) to substitute with
+ * @param  entry Entry to be modified
+ */
+bool DocEntrySet::SetEntryString(std::string const &content, DataEntry *entry)
+{
+   if (entry)
+   {
+      entry->SetString(content);
+      return true;
+   }
+   return false;
+}
+
+/**
+ * \brief   Accesses an existing DataEntry (i.e. a Dicom Element)
+ *          and modifies it's content with the given value.
+ * @param   content new value (void*  -> uint8_t*) to substitute with
+ * @param  entry Entry to be modified 
+ * @param  lgth new value length
+ */
+bool DocEntrySet::SetEntryBinArea(uint8_t *content, int lgth, DataEntry *entry)
+{
+   if (entry)
+   {
+      entry->SetLength(lgth);
+      entry->SetBinArea(content);  
+      return true;
+   }
+   return false;
+}
+
+/**
+ * \brief   Modifies the value of a given Doc Entry (Dicom Element)
+ *          when it exists. Create it with the given value when unexistant.
+ * @param   value (string) Value to be set
+ * @param   group   Group number of the Entry 
+ * @param   elem  Element number of the Entry
+ * @param   vr  V(alue) R(epresentation) of the Entry -if private Entry-
+ * \return  pointer to the modified/created Header Entry (NULL when creation
+ *          failed).
+ */ 
+DataEntry *DocEntrySet::InsertEntryString(std::string const &value, 
+                                             uint16_t group, uint16_t elem,
+                                             VRKey const &vr )
+{
+   DataEntry *dataEntry = 0;
+   DocEntry *currentEntry = GetDocEntry( group, elem );
+   
+   if (currentEntry)
+   {
+      dataEntry = dynamic_cast<DataEntry *>(currentEntry);
+
+      // Verify the VR
+      if ( dataEntry )
+         if ( dataEntry->GetVR()!=vr )
+            dataEntry = NULL;
+
+      // if currentEntry doesn't correspond to the requested dataEntry
+      if ( !dataEntry)
+      {
+         if ( !RemoveEntry(currentEntry) )
+         {
+            gdcmWarningMacro( "Removal of previous DocEntry failed.");
+            return NULL;
+         }
+      }
+   }
+
+   // Create a new dataEntry if necessary
+   if ( !dataEntry )
+   {
+      dataEntry = NewDataEntry( group, elem, vr );
+
+      if ( !AddEntry(dataEntry) )
+      {
+         gdcmWarningMacro("AddEntry failed although this is a creation.");
+
+         delete dataEntry;
+         return NULL;
+      }
+   }
+
+   // Set the dataEntry value
+   SetEntryString(value, dataEntry); // The std::string value
+   return dataEntry;
+}
+
+/**
+ * \brief   Modifies the value of a given Header Entry (Dicom Element)
+ *          when it exists. Create it with the given value when unexistant.
+ *          A copy of the binArea is made to be kept in the Document.
+ * @param   binArea (binary) value to be set
+ * @param   lgth length of the Bin Area we want to set
+ * @param   group   Group number of the Entry 
+ * @param   elem  Element number of the Entry
+ * @param   vr  V(alue) R(epresentation) of the Entry -if private Entry-
+ * \return  pointer to the modified/created Header Entry (NULL when creation
+ *          failed).
+ */
+DataEntry *DocEntrySet::InsertEntryBinArea(uint8_t *binArea, int lgth, 
+                                              uint16_t group, uint16_t elem,
+                                              VRKey const &vr )
+{
+   DataEntry *dataEntry = 0;
+   DocEntry *currentEntry = GetDocEntry( group, elem );
+
+   // Verify the currentEntry
+   if (currentEntry)
+   {
+      dataEntry = dynamic_cast<DataEntry *>(currentEntry);
+
+      // Verify the VR
+      if ( dataEntry )
+         if ( dataEntry->GetVR()!=vr )
+            dataEntry = NULL;
+
+      // if currentEntry doesn't correspond to the requested dataEntry
+      if ( !dataEntry)
+      {
+         if ( !RemoveEntry(currentEntry) )
+         {
+            gdcmWarningMacro( "Removal of previous DocEntry failed.");
+            return NULL;
+         }
+      }
+   }
+
+   // Create a new dataEntry if necessary
+   if ( !dataEntry)
+   {
+      dataEntry = NewDataEntry(group, elem, vr);
+
+      if ( !AddEntry(dataEntry) )
+      {
+         gdcmWarningMacro( "AddEntry failed although this is a creation.");
+
+         delete dataEntry;
+         return NULL;
+      }
+   }
+
+   // Set the dataEntry value
+   uint8_t *tmpArea;
+   if ( lgth>0 && binArea )
+   {
+      tmpArea = new uint8_t[lgth];
+      memcpy(tmpArea,binArea,lgth);
+   }
+   else
+   {
+      tmpArea = 0;
+   }
+   if ( !SetEntryBinArea(tmpArea,lgth,dataEntry) )
+   {
+      if ( tmpArea )
+      {
+         delete[] tmpArea;
+      }
+   }
+
+   return dataEntry;
+}  
+
+/**
+ * \brief   Modifies the value of a given Doc Entry (Dicom Element)
+ *          when it exists. Creates it when unexistant.
+ * @param   group   Group number of the Entry 
+ * @param   elem  Element number of the Entry
+ * \return  pointer to the modified/created SeqEntry (NULL when creation
+ *          failed).
+ */
+SeqEntry *DocEntrySet::InsertSeqEntry(uint16_t group, uint16_t elem)
+{
+   SeqEntry *seqEntry = 0;
+   DocEntry *currentEntry = GetDocEntry( group, elem );
+
+   // Verify the currentEntry
+   if ( currentEntry )
+   {
+      seqEntry = dynamic_cast<SeqEntry *>(currentEntry);
+
+      // Verify the VR
+      if ( seqEntry )
+         seqEntry = NULL;
+
+      // if currentEntry doesn't correspond to the requested seqEntry
+      if ( !seqEntry )
+      {
+         if (!RemoveEntry(currentEntry))
+         {
+            gdcmWarningMacro( "Removal of previous DocEntry failed.");
+
+            return NULL;
+         }
+      }
+   }
+   // Create a new seqEntry if necessary
+   if ( !seqEntry )
+   {
+      seqEntry = NewSeqEntry(group, elem);
+
+      if ( !AddEntry(seqEntry) )
+      {
+         gdcmWarningMacro( "AddEntry failed although this is a creation.");
+
+         delete seqEntry;
+         return NULL;
+      }
+   }
+
+   // TODO : Find a trick to insert a SequenceDelimitationItem 
+   //       in the SeqEntry, at the end.
+   return seqEntry;
+} 
+/**
+ * \brief   Checks if a given Dicom Element exists within the H table
+ * @param   group   Group number of the searched Dicom Element 
+ * @param   elem  Element number of the searched Dicom Element 
+ * @return true is found
+ */
+bool DocEntrySet::CheckIfEntryExist(uint16_t group, uint16_t elem )
+{
+   return GetDocEntry(group,elem)!=NULL;
+}
+
+/**
+ * \brief   Build a new Val Entry from all the low level arguments. 
+ *          Check for existence of dictionary entry, and build
+ *          a default one when absent.
+ * @param   group Group number   of the new Entry
+ * @param   elem  Element number of the new Entry
+ * @param   vr    V(alue) R(epresentation) of the new Entry 
+ */
+DataEntry *DocEntrySet::NewDataEntry(uint16_t group,uint16_t elem,
+                                     VRKey const &vr) 
+{
+   DictEntry *dictEntry = GetDictEntry(group, elem, vr);
+
+   DataEntry *newEntry = new DataEntry(dictEntry);
+   dictEntry->Unregister(); // GetDictEntry register it
+   if (!newEntry) 
+   {
+      gdcmWarningMacro( "Failed to allocate DataEntry");
+      return 0;
+   }
+   return newEntry;
+}
+
+/**
+ * \brief   Build a new Seq Entry from all the low level arguments. 
+ *          Check for existence of dictionary entry, and build
+ *          a default one when absent.
+ * @param   group Group   number of the new Entry
+ * @param   elem  Element number of the new Entry
+ */
+SeqEntry* DocEntrySet::NewSeqEntry(uint16_t group, uint16_t elem) 
+{
+   DictEntry *dictEntry = GetDictEntry(group, elem, "SQ");
+
+   SeqEntry *newEntry = new SeqEntry( dictEntry );
+   dictEntry->Unregister(); // GetDictEntry register it
+   if (!newEntry)
+   {
+      gdcmWarningMacro( "Failed to allocate SeqEntry");
+      return 0;
+   }
+   return newEntry;
+}
 
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Protected
+/**
+ * \brief   Searches [both] the public [and the shadow dictionary (when they
+ *          exist)] for the presence of the DictEntry with given
+ *          group and element. The public dictionary has precedence on the
+ *          shadow one(s), if any.
+ * @param   group  Group number of the searched DictEntry
+ * @param   elem Element number of the searched DictEntry
+ * @return  Corresponding DictEntry when it exists, NULL otherwise.
+ * \remarks The returned DictEntry is registered when existing
+ */
+DictEntry *DocEntrySet::GetDictEntry(uint16_t group,uint16_t elem) 
+{
+   DictEntry *found = 0;
+   Dict *pubDict = Global::GetDicts()->GetDefaultPubDict();
+   if (!pubDict) 
+   {
+      gdcmWarningMacro( "We SHOULD have a default dictionary");
+   }
+   else
+   {
+      found = pubDict->GetEntry(group, elem);
+      if( found )
+         found->Register();
+   }
+   return found;
+}
+
+/**
+ * \brief   Searches [both] the public [and the shadow dictionary (when they
+ *          exist)] for the presence of the DictEntry with given
+ *          group and element, and create a new virtual DictEntry if necessary
+ * @param   group  group number of the searched DictEntry
+ * @param   elem element number of the searched DictEntry
+ * @param   vr V(alue) R(epresentation) to use, if necessary 
+ * @return  Corresponding DictEntry when it exists, NULL otherwise.
+ * \remarks The returned DictEntry is registered
+ */
+DictEntry *DocEntrySet::GetDictEntry(uint16_t group, uint16_t elem,
+                                     VRKey const &vr)
+{
+   DictEntry *dictEntry = GetDictEntry(group,elem);
+   DictEntry *goodEntry = dictEntry;
+   VRKey goodVR = vr;
+
+   if (elem == 0x0000) 
+      goodVR="UL";
+
+   if ( goodEntry )
+   {
+      if ( goodVR != goodEntry->GetVR()
+        && goodVR != GDCM_VRUNKNOWN )
+      {
+         goodEntry = NULL;
+      }
+      dictEntry->Unregister();
+   }
 
+   // Create a new virtual DictEntry if necessary
+   if (!goodEntry)
+   {
+      if (dictEntry)
+      {
+         goodEntry = DictEntry::New(group, elem, goodVR, "FIXME", 
+                                    dictEntry->GetName() );
+      }
+      else
+      {
+         goodEntry = DictEntry::New(group, elem, goodVR);
+      }
+   }
+   else
+   {
+      goodEntry->Register();
+   }
+   return goodEntry;
+}
 
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Private
 
+//-----------------------------------------------------------------------------
+// Print
 
 //-----------------------------------------------------------------------------
+} // end namespace gdcm