]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmDocument.cxx
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[gdcm.git] / src / gdcmDocument.cxx
index e1abb25b65229d0d1663c31cb81e38015fef4d4f..1af57e734cef5178d6c3dcfae17b12e726c81a82 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmDocument.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2005/09/07 08:55:22 $
-  Version:   $Revision: 1.275 $
+  Date:      $Date: 2005/09/22 14:41:24 $
+  Version:   $Revision: 1.284 $
                                                                                 
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
@@ -264,26 +264,37 @@ bool Document::DoTheLoadingDocumentJob(  )
                                it != UserForceLoadList.end();
                              ++it)
    {
+      gdcmWarningMacro( "Force Load " << std::hex 
+                       << (*it).Group << "|" <<(*it).Elem );
+  
       d = GetDocEntry( (*it).Group, (*it).Elem);
-
+  
       if ( d == NULL)
+      {
+         gdcmWarningMacro( "You asked toForce Load "  << std::hex
+                          << (*it).Group <<"|"<< (*it).Elem
+                          << " that doesn't exist" );
          continue;
+      }
 
-      if ( dynamic_cast<BinEntry *>(d) )
+      if ( dynamic_cast<ValEntry *>(d) )
       {
          LoadDocEntry(d, true);
          continue;
       }
 
-      if ( dynamic_cast<BinEntry *>(d) )
+      BinEntry *b = dynamic_cast<BinEntry *>(d);
+      if ( b )
       {
-         LoadEntryBinArea((*it).Group, (*it).Elem);
+         LoadEntryBinArea(b);
+         b->SetValue(GDCM_BINLOADED);
          continue;
       }
  
       if ( dynamic_cast<SeqEntry *>(d) )
       {
-         gdcmWarningMacro( "You cannot 'ForceLoad' a SeqEntry ");
+         gdcmWarningMacro( "You cannot 'ForceLoad' a SeqEntry :" << std::hex
+                           << (*it).Group <<"|"<< (*it).Elem );
          continue;
       }
    }
@@ -637,11 +648,10 @@ bool Document::CloseFile()
 }
 
 /**
- * \brief Writes in a file all the Header Entries (Dicom Elements) 
+ * \brief Writes in a file all the Entries (Dicom Elements) 
  * @param fp file pointer on an already open file (actually: Output File Stream)
  * @param filetype Type of the File to be written 
  *          (ACR-NEMA, ExplicitVR, ImplicitVR)
- * @return Always true.
  */
 void Document::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
 {
@@ -684,12 +694,18 @@ void Document::LoadEntryBinArea(uint16_t group, uint16_t elem)
    // Search the corresponding DocEntry
    DocEntry *docElement = GetDocEntry(group, elem);
    if ( !docElement )
+   {
+      gdcmWarningMacro(std::hex << group << "|" << elem 
+                       <<  "doesn't exist" );
       return;
-
+   }
    BinEntry *binElement = dynamic_cast<BinEntry *>(docElement);
    if ( !binElement )
+   {
+      gdcmWarningMacro(std::hex << group << "|" << elem 
+                       <<  "is NOT a BinEntry");
       return;
-
+   }
    LoadEntryBinArea(binElement);
 }
 
@@ -947,9 +963,10 @@ void Document::ParseDES(DocEntrySet *set, long offset,
    BinEntry *newBinEntry;
    SeqEntry *newSeqEntry;
    VRKey vr;
-   bool used;
+   bool used; // will be set to false when something wrong happens to an Entry.
+              // (Entry will then be deleted)
    bool delim_mode_intern = delim_mode;
-   bool first = true;
+   bool first = true;  
    while (true)
    {
       if ( !delim_mode && ((long)(Fp->tellg())-offset) >= l_max)
@@ -959,6 +976,14 @@ void Document::ParseDES(DocEntrySet *set, long offset,
 
       newDocEntry = ReadNextDocEntry( );
 
+      // FIXME :
+      // Private tag, in IMplicit VR are defaulted as a BinEntry,
+      // Very often they are only composed of Printable characters, 
+      // and could be defaulted as a ValEntry.
+      // It's too late to do the Job
+      // (we should check the value, but we know it after LoadDocEntry ...)
+      // --> in next gdcm major release let's unify ValEntry and BinEntry !
+
       // Uncoment this printf line to be able to 'follow' the DocEntries
       // when something *very* strange happens
 
@@ -971,7 +996,7 @@ void Document::ParseDES(DocEntrySet *set, long offset,
          break;
       }
 
-       // an Item Starter found elsewhere but the first postition
+       // an Item Starter found elsewhere but the first position
        // of a SeqEntry  means previous entry was a Sequence
        // but we didn't get it (private Sequence + Implicit VR)
        // we have to backtrack.
@@ -1084,16 +1109,17 @@ void Document::ParseDES(DocEntrySet *set, long offset,
                      {
                         lgrGroup = atoi(strLgrGroup.c_str());
                         Fp->seekg(lgrGroup, std::ios::cur);
-                        used = false;
-                        RemoveEntry( newDocEntry );
-                        newDocEntry = 0;
+                        //used = false;  // never used
+                        RemoveEntry( newDocEntry );  // Remove and delete
+                        // bcc 5.5 is right "assigned a value that's never used"
+                        // newDocEntry = 0;
                         continue;
                      }
                   }
                }
             }
 
-            bool delimitor=newValEntry->IsItemDelimitor();
+            bool delimitor = newValEntry->IsItemDelimitor();
 
             if ( (delimitor) || 
                 (!delim_mode && ((long)(Fp->tellg())-offset) >= l_max) )
@@ -1130,7 +1156,8 @@ void Document::ParseDES(DocEntrySet *set, long offset,
             if ( newDocEntry->GetGroup()%2 != 0 )
             {
                 Fp->seekg( l, std::ios::cur);
-                used = false;
+                RemoveEntry( newDocEntry );  // Remove and delete
+                //used = false; // never used
                 continue;  
             } 
          } 
@@ -1138,7 +1165,8 @@ void Document::ParseDES(DocEntrySet *set, long offset,
          {
            // User asked to skip *any* SeQuence
             Fp->seekg( l, std::ios::cur);
-            used = false;
+            //used = false; // never used
+            RemoveEntry( newDocEntry );  // Remove and delete
             continue;
          }
          // delay the dynamic cast as late as possible
@@ -1185,7 +1213,7 @@ void Document::ParseDES(DocEntrySet *set, long offset,
             used = false;
          }
  
-        if ( !delim_mode && ((long)(Fp->tellg())-offset) >= l_max)
+         if ( !delim_mode && ((long)(Fp->tellg())-offset) >= l_max)
          {
             if ( !used )
                delete newDocEntry;  
@@ -1316,8 +1344,6 @@ return newEntry;
  * \brief   Loads (or not) the element content depending if its length exceeds
  *          or not the value specified with Document::SetMaxSizeLoadEntry()
  * @param   entry Header Entry (Dicom Element) to be dealt with
- * @param  forceLoad wheter we want to load its content even if its length 
- *         exceeds the value specified with Document::SetMaxSizeLoadEntry()
  */
 void Document::LoadDocEntry(DocEntry *entry, bool forceLoad)
 {
@@ -1674,7 +1700,7 @@ std::string Document::FindDocEntryVR()
  *            and the taken VR. If they are different, the header entry is 
  *            updated with the new VR.
  * @param     vr    Dicom Value Representation
- * @return    false if the VR is incorrect of if the VR isn't referenced
+ * @return    false if the VR is incorrect or if the VR isn't referenced
  *            otherwise, it returns true
 */
 bool Document::CheckDocEntryVR(VRKey vr)
@@ -2160,7 +2186,7 @@ bool Document::CheckSwap()
                Filetype = ACR;
                return true;
             default :
-               gdcmWarningMacro( "ACR/NEMA unfound swap info (Really hopeless !)");
+               gdcmWarningMacro("ACR/NEMA unfound swap info (Really hopeless !)");
                Filetype = Unknown;
                return false;
          }
@@ -2193,7 +2219,7 @@ void Document::SwitchByteSwapCode()
 }
 
 /**
- * \brief  during parsing, Header Elements too long are not loaded in memory 
+ * \brief  during parsing, Header Elements too long are not loaded in memory
  * @param newSize new size
  */
 void Document::SetMaxSizeLoadEntry(long newSize) 
@@ -2227,7 +2253,7 @@ DocEntry *Document::ReadNextDocEntry()
       group = ReadInt16();
       elem  = ReadInt16();
    }
-   catch ( FormatError )
+   catch ( FormatError )
    {
       // We reached the EOF (or an error occured) therefore 
       // header parsing has to be considered as finished.
@@ -2247,7 +2273,15 @@ DocEntry *Document::ReadNextDocEntry()
    if ( vr == GDCM_UNKNOWN )
    {
       if ( elem == 0x0000 ) // Group Length
+      {
          realVR = "UL";     // must be UL
+      }
+      else if (group%2 == 1 &&  (elem >= 0x0010 && elem <=0x00ff ))
+      {  
+      // DICOM PS 3-5 7.8.1 a) states that those 
+      // (gggg-0010->00FF where gggg is odd) attributes have to be LO
+         realVR = "LO";
+      }
       else
       {
          DictEntry *dictEntry = GetDictEntry(group,elem);
@@ -2262,9 +2296,9 @@ DocEntry *Document::ReadNextDocEntry()
    if ( Global::GetVR()->IsVROfSequence(realVR) )
       newEntry = NewSeqEntry(group, elem);
    else if ( Global::GetVR()->IsVROfStringRepresentable(realVR) )
-      newEntry = NewValEntry(group, elem,vr);
+      newEntry = NewValEntry(group, elem, realVR);
    else
-      newEntry = NewBinEntry(group, elem,vr);
+      newEntry = NewBinEntry(group, elem, realVR);
 
    if ( vr == GDCM_UNKNOWN )
    {
@@ -2288,7 +2322,7 @@ DocEntry *Document::ReadNextDocEntry()
    {
       FindDocEntryLength(newEntry);
    }
-   catch ( FormatError )
+   catch ( FormatError )
    {
       // Call it quits
       delete newEntry;