]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmDocument.h
* src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
[gdcm.git] / src / gdcmDocument.h
index a024bdef0f19e4e2c42cb3013eec509d7ec5851f..411d7d31859a98e519ef93d55976b38b035a40b5 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmDocument.h,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2004/10/12 04:35:45 $
-  Version:   $Revision: 1.50 $
+  Date:      $Date: 2004/11/25 13:12:02 $
+  Version:   $Revision: 1.63 $
  
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
@@ -36,9 +36,65 @@ class SeqEntry;
 
 #include <map>
 #include <list>
+#include <fstream>
+
 namespace gdcm 
 {
 
+enum TransferSyntaxType {
+  ImplicitVRLittleEndian = 0,
+  ImplicitVRLittleEndianDLXGE,
+  ExplicitVRLittleEndian,
+  DeflatedExplicitVRLittleEndian,
+  ExplicitVRBigEndian,
+  JPEGBaselineProcess1,
+  JPEGExtendedProcess2_4,
+  JPEGExtendedProcess3_5,
+  JPEGSpectralSelectionProcess6_8,
+  JPEGFullProgressionProcess10_12,
+  JPEGLosslessProcess14,
+  JPEGLosslessProcess14_1,
+  JPEG2000Lossless,
+  JPEG2000,
+  RLELossless,
+  UnknownTS
+};
+
+static const char *TransferSyntaxStrings[] =  {
+  // Implicit VR Little Endian
+  "1.2.840.10008.1.2",
+  // Implicit VR Little Endian DLX G.E?
+  "1.2.840.113619.5.2",
+  // Explicit VR Little Endian
+  "1.2.840.10008.1.2.1",
+  // Deflated Explicit VR Little Endian
+  "1.2.840.10008.1.2.1.99",
+  // Explicit VR Big Endian
+  "1.2.840.10008.1.2.2",
+  // JPEG Baseline (Process 1)
+  "1.2.840.10008.1.2.4.50",
+  // JPEG Extended (Process 2 & 4)
+  "1.2.840.10008.1.2.4.51",
+  // JPEG Extended (Process 3 & 5)
+  "1.2.840.10008.1.2.4.52",
+  // JPEG Spectral Selection, Non-Hierarchical (Process 6 & 8)
+  "1.2.840.10008.1.2.4.53",
+  // JPEG Full Progression, Non-Hierarchical (Process 10 & 12)
+  "1.2.840.10008.1.2.4.55",
+  // JPEG Lossless, Non-Hierarchical (Process 14)
+  "1.2.840.10008.1.2.4.57",
+  // JPEG Lossless, Hierarchical, First-Order Prediction (Process 14, [Selection Value 1])
+  "1.2.840.10008.1.2.4.70",
+  // JPEG 2000 Lossless
+  "1.2.840.10008.1.2.4.90",
+  // JPEG 2000
+  "1.2.840.10008.1.2.4.91",
+  // RLE Lossless
+  "1.2.840.10008.1.2.5",
+  // Unknown
+  "Unknown Transfer Syntax"
+};
+
 //-----------------------------------------------------------------------------
 /**
  * \brief Derived by both Header and DicomDir
@@ -48,11 +104,11 @@ class GDCM_EXPORT Document : public ElementSet
 friend class File;
 private:
    /// Public dictionary used to parse this header
-   Dict *RefPubDict;
+   DictRefPubDict;
    
    /// \brief Optional "shadow dictionary" (private elements) used to parse
    /// this header
-   Dict *RefShaDict;
+   DictRefShaDict;
 
    /// \brief Size threshold above which an element value will NOT be loaded
    /// in memory (to avoid loading the image/volume itself). By default,
@@ -75,7 +131,7 @@ protected:
    int SwapCode;
 
    /// File Pointer, opened during Header parsing.
-   FILE *Fp;
+   std::ifstream* Fp;
 
    /// ACR, ACR_LIBIDO, ExplicitVR, ImplicitVR, Unknown
    FileType Filetype;  
@@ -90,15 +146,15 @@ protected:
    /// \brief Elements whose value is longer than  MAX_SIZE_PRINT_ELEMENT_VALUE
    /// are NOT printed.
    /// \todo Currently not used since collides with #define in
-   ///       \ref DocEntry.cxx. See also
-   ///       \ref Document::SetMaxSizePrintEntry()
+   ///       class DocEntry . See also
+   ///       method ref Document::SetMaxSizePrintEntry()
    static const unsigned int MAX_SIZE_PRINT_ELEMENT_VALUE;
 
    /// Store the RLE frames info obtained during parsing of pixels.
-   RLEFramesInfo RLEInfo;
+   RLEFramesInfo* RLEInfo;
 
    /// Store the JPEG fragments info obtained during parsing of pixels.
-   JPEGFragmentsInfo JPEGInfo;
+   JPEGFragmentsInfo* JPEGInfo;
 
    /// \brief Amount of printed details for each Header Entry (Dicom Element):
    /// 0 : stands for the least detail level.
@@ -110,52 +166,42 @@ public:
    virtual void PrintShaDict (std::ostream &os = std::cout);
 
 // Dictionnaries
-   Dict *GetPubDict();
-   Dict *GetShaDict();
-   bool SetShaDict(Dict *dict);
+   DictGetPubDict();
+   DictGetShaDict();
+   bool SetShaDict(Dictdict);
    bool SetShaDict(DictKey const & dictName);
 
 // Informations contained in the parser
    virtual bool IsReadable();
-   bool IsGivenTransferSyntax(std::string const & syntaxToCheck);
-   bool IsImplicitVRLittleEndianTransferSyntax();
-   bool IsExplicitVRLittleEndianTransferSyntax();
-   bool IsDeflatedExplicitVRLittleEndianTransferSyntax();
-   bool IsExplicitVRBigEndianTransferSyntax();
-   bool IsRLELossLessTransferSyntax();
-   bool IsJPEGBaseLineProcess1TransferSyntax();
-   bool IsJPEGExtendedProcess2_4TransferSyntax();
-   bool IsJPEGExtendedProcess3_5TransferSyntax();
-   bool IsJPEGSpectralSelectionProcess6_8TransferSyntax();
+   TransferSyntaxType GetTransferSyntax();
    bool IsJPEGLossless();
    bool IsJPEG2000();
-   bool IsJPEGTransferSyntax();
-   bool IsEncapsulateTransferSyntax();
+   bool IsJPEG();
+   bool IsEncapsulate();
    bool IsDicomV3();
 
    FileType GetFileType();
 
-   FILE* OpenFile();
+   std::ifstream * OpenFile();
    bool CloseFile();
 
-   void Write(FILE* fp, FileType type);
+   void Write( std::ofstream* fp, FileType type );
 
    ValEntry* ReplaceOrCreateByNumber(std::string const & value,
-                                         uint16_t group, uint16_t elem,
-                                         std::string const & VR ="unkn");
+                                     uint16_t group, uint16_t elem,
+                                     TagName const & vr = "unkn");
    
    BinEntry* ReplaceOrCreateByNumber(uint8_t* binArea, int lgth,
-                                         uint16_t group, uint16_t elem,
-                                         std::string const & VR="unkn");
+                                     uint16_t group, uint16_t elem,
+                                     TagName const & vr = "unkn");
 
    SeqEntry* ReplaceOrCreateByNumber(uint16_t group, uint16_t elem);
 
    bool ReplaceIfExistByNumber ( std::string const & value,
-                                 uint16_t group,
-                                 uint16_t elem );
+                                 uint16_t group, uint16_t elem );
    
-   virtual void* LoadEntryBinArea(uint16_t group, uint16_t elem);
-   virtual void* LoadEntryBinArea(BinEntry* entry);
+   virtual void LoadEntryBinArea(uint16_t group, uint16_t elem);
+   virtual void LoadEntryBinArea(BinEntry* entry);
       
    // System access (meaning endian related !?)
    uint16_t SwapShort(uint16_t);   // needed by File
@@ -183,8 +229,8 @@ public:
    virtual std::string GetEntryVRByNumber(uint16_t group, uint16_t elem);
    virtual int     GetEntryLengthByNumber(uint16_t group, uint16_t elem);
 //protected:
-   virtual bool SetEntryByName  (std::string const & content, 
-                                 std::string const & tagName);
+   virtual bool SetEntryByName  ( std::string const & content, 
+                                  TagName const & tagName );
    virtual bool SetEntryByNumber(std::string const & content,
                                  uint16_t group, uint16_t element);
    virtual bool SetEntryByNumber(uint8_t* content, int lgth,
@@ -192,7 +238,7 @@ public:
    virtual bool SetEntryLengthByNumber(uint32_t length,
                                        uint16_t group, uint16_t element);
 
-   virtual size_t GetEntryOffsetByNumber (uint16_t group, uint16_t elem);
+   virtual size_t GetEntryOffsetByNumber(uint16_t group, uint16_t elem);
    virtual void* GetEntryBinAreaByNumber(uint16_t group, uint16_t elem);   
    virtual bool  SetEntryBinAreaByNumber(uint8_t* a, uint16_t group,
                                                    uint16_t elem);
@@ -201,10 +247,12 @@ public:
 
    // Header entry
    DocEntry* GetDocEntryByNumber(uint16_t group, uint16_t element); 
-   DocEntry* GetDocEntryByName  (std::string const & tagName);
+   DocEntry* GetDocEntryByName  (TagName const & tagName);
 
    ValEntry* GetValEntryByNumber(uint16_t group, uint16_t element); 
    //BinEntry* GetBinEntryByNumber(uint16_t group, uint16_t element); 
+   RLEFramesInfo* GetRLEInfo() { return RLEInfo; }
+   JPEGFragmentsInfo* GetJPEGInfo() { return JPEGInfo; }
 
    void LoadDocEntrySafe(DocEntry* entry);
    TagDocEntryHT* BuildFlatHashTable();
@@ -249,14 +297,14 @@ private:
    void BuildFlatHashTableRecurse( TagDocEntryHT& builtHT,
                                    DocEntrySet* set );
 
-
+   void HandleBrokenEndian(uint16_t  group, uint16_t  elem);
 public:
 // Accessors:
    /// Accessor to \ref PrintLevel
    void SetPrintLevel(int level) { PrintLevel = level; }
 
    /// Accessor to \ref Filename
-   const std::string &GetFileName() { return Filename; }
+   const std::string &GetFileName() const { return Filename; }
 
    /// Accessor to \ref Filename
    void SetFileName(std::string const & fileName) { Filename = fileName; }
@@ -264,9 +312,6 @@ public:
    /// 'Swap code' accessor (see \ref SwapCode )
    int GetSwapCode() { return SwapCode; }
    
-   /// File pointer
-   FILE * GetFP() { return Fp; }
-
    bool operator<(Document &document);
 
 };