]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmDocument.h
ENH : now parsing creates a Vitual DictEntry for Pixels Element,
[gdcm.git] / src / gdcmDocument.h
index 657fe8c250d662aa1fe653f769d058912a3231a3..ad5d48b1094b8005a2609ccf171c062e2baeefce 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmDocument.h,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2004/10/13 14:15:29 $
-  Version:   $Revision: 1.51 $
+  Date:      $Date: 2005/01/05 16:53:23 $
+  Version:   $Revision: 1.71 $
  
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
 #ifndef GDCMDOCUMENT_H
 #define GDCMDOCUMENT_H
 
-#include "gdcmCommon.h"
 #include "gdcmVR.h"
-#include "gdcmTS.h"
-#include "gdcmException.h"
-#include "gdcmDictSet.h"
-#include "gdcmDocEntry.h"
-#include "gdcmRLEFramesInfo.h"
-#include "gdcmJPEGFragmentsInfo.h"
-#include "gdcmDocEntrySet.h"
+#include "gdcmDict.h"
 #include "gdcmElementSet.h"
 
-class ValEntry;
-class BinEntry;
-class SeqEntry;
-
 #include <map>
 #include <list>
+#include <fstream>
+
 namespace gdcm 
 {
+class ValEntry;
+class BinEntry;
+class SeqEntry;
+class Dict;
+class RLEFramesInfo;
+class JPEGFragmentsInfo;
+
+enum TransferSyntaxType {
+  ImplicitVRLittleEndian = 0,
+  ImplicitVRLittleEndianDLXGE,
+  ExplicitVRLittleEndian,
+  DeflatedExplicitVRLittleEndian,
+  ExplicitVRBigEndian,
+  JPEGBaselineProcess1,
+  JPEGExtendedProcess2_4,
+  JPEGExtendedProcess3_5,
+  JPEGSpectralSelectionProcess6_8,
+  JPEGFullProgressionProcess10_12,
+  JPEGLosslessProcess14,
+  JPEGLosslessProcess14_1,
+  JPEG2000Lossless,
+  JPEG2000,
+  RLELossless,
+  UnknownTS
+};
 
 //-----------------------------------------------------------------------------
 /**
@@ -48,11 +64,11 @@ class GDCM_EXPORT Document : public ElementSet
 friend class File;
 private:
    /// Public dictionary used to parse this header
-   Dict *RefPubDict;
+   DictRefPubDict;
    
    /// \brief Optional "shadow dictionary" (private elements) used to parse
    /// this header
-   Dict *RefShaDict;
+   DictRefShaDict;
 
    /// \brief Size threshold above which an element value will NOT be loaded
    /// in memory (to avoid loading the image/volume itself). By default,
@@ -75,7 +91,7 @@ protected:
    int SwapCode;
 
    /// File Pointer, opened during Header parsing.
-   FILE *Fp;
+   std::ifstream* Fp;
 
    /// ACR, ACR_LIBIDO, ExplicitVR, ImplicitVR, Unknown
    FileType Filetype;  
@@ -95,67 +111,53 @@ protected:
    static const unsigned int MAX_SIZE_PRINT_ELEMENT_VALUE;
 
    /// Store the RLE frames info obtained during parsing of pixels.
-   RLEFramesInfo RLEInfo;
+   RLEFramesInfo* RLEInfo;
 
    /// Store the JPEG fragments info obtained during parsing of pixels.
-   JPEGFragmentsInfo JPEGInfo;
+   JPEGFragmentsInfo* JPEGInfo;
 
-   /// \brief Amount of printed details for each Header Entry (Dicom Element):
-   /// 0 : stands for the least detail level.
-   int PrintLevel;
-   
 public:
 // the 2 following will be merged
    virtual void PrintPubDict (std::ostream &os = std::cout);
    virtual void PrintShaDict (std::ostream &os = std::cout);
 
 // Dictionnaries
-   Dict *GetPubDict();
-   Dict *GetShaDict();
-   bool SetShaDict(Dict *dict);
+   DictGetPubDict();
+   DictGetShaDict();
+   bool SetShaDict(Dictdict);
    bool SetShaDict(DictKey const & dictName);
 
 // Informations contained in the parser
    virtual bool IsReadable();
-   bool IsGivenTransferSyntax(std::string const & syntaxToCheck);
-   bool IsImplicitVRLittleEndianTransferSyntax();
-   bool IsExplicitVRLittleEndianTransferSyntax();
-   bool IsDeflatedExplicitVRLittleEndianTransferSyntax();
-   bool IsExplicitVRBigEndianTransferSyntax();
-   bool IsRLELossLessTransferSyntax();
-   bool IsJPEGBaseLineProcess1TransferSyntax();
-   bool IsJPEGExtendedProcess2_4TransferSyntax();
-   bool IsJPEGExtendedProcess3_5TransferSyntax();
-   bool IsJPEGSpectralSelectionProcess6_8TransferSyntax();
+   TransferSyntaxType GetTransferSyntax();
    bool IsJPEGLossless();
    bool IsJPEG2000();
-   bool IsJPEGTransferSyntax();
-   bool IsEncapsulateTransferSyntax();
+   bool IsJPEG();
+   bool IsEncapsulate();
    bool IsDicomV3();
 
    FileType GetFileType();
 
-   FILE* OpenFile();
+   std::ifstream * OpenFile();
    bool CloseFile();
 
-   void Write(FILE* fp, FileType type);
+   void WriteContent( std::ofstream* fp, FileType type );
 
    ValEntry* ReplaceOrCreateByNumber(std::string const & value,
-                                         uint16_t group, uint16_t elem,
-                                         std::string const & VR ="unkn");
+                                     uint16_t group, uint16_t elem,
+                                     TagName const & vr = GDCM_UNKNOWN);
    
    BinEntry* ReplaceOrCreateByNumber(uint8_t* binArea, int lgth,
-                                         uint16_t group, uint16_t elem,
-                                         std::string const & VR="unkn");
+                                     uint16_t group, uint16_t elem,
+                                     TagName const & vr = GDCM_UNKNOWN);
 
    SeqEntry* ReplaceOrCreateByNumber(uint16_t group, uint16_t elem);
 
    bool ReplaceIfExistByNumber ( std::string const & value,
-                                 uint16_t group,
-                                 uint16_t elem );
+                                 uint16_t group, uint16_t elem );
    
-   virtual void* LoadEntryBinArea(uint16_t group, uint16_t elem);
-   virtual void* LoadEntryBinArea(BinEntry* entry);
+   virtual void LoadEntryBinArea(uint16_t group, uint16_t elem);
+   virtual void LoadEntryBinArea(BinEntry* entry);
       
    // System access (meaning endian related !?)
    uint16_t SwapShort(uint16_t);   // needed by File
@@ -163,6 +165,8 @@ public:
    uint16_t UnswapShort(uint16_t); // needed by File
    uint32_t UnswapLong(uint32_t);  // needed by File
 
+   static std::string GetTransferSyntaxValue(TransferSyntaxType type);
+
 protected:
    // Constructor and destructor are protected to forbid end user 
    // to instanciate from this class Document (only Header and
@@ -184,27 +188,28 @@ public:
    virtual int     GetEntryLengthByNumber(uint16_t group, uint16_t elem);
 //protected:
    virtual bool SetEntryByName  (std::string const & content, 
-                                 std::string const & tagName);
+                                 TagName const & tagName );
    virtual bool SetEntryByNumber(std::string const & content,
                                  uint16_t group, uint16_t element);
    virtual bool SetEntryByNumber(uint8_t* content, int lgth,
                                  uint16_t group, uint16_t element);
-   virtual bool SetEntryLengthByNumber(uint32_t length,
-                                       uint16_t group, uint16_t element);
-
-   virtual size_t GetEntryOffsetByNumber (uint16_t group, uint16_t elem);
    virtual void* GetEntryBinAreaByNumber(uint16_t group, uint16_t elem);   
-   virtual bool  SetEntryBinAreaByNumber(uint8_t* a, uint16_t group,
-                                                   uint16_t elem);
+   // FIXME
+   // Verify the usefull of this method... otherwise remove it
+   // It's body is commented in the .xx
+   //virtual bool  SetEntryBinAreaByNumber(uint8_t* a, uint16_t group,
+   //                                                uint16_t elem);
 
    virtual void UpdateShaEntries();
 
    // Header entry
    DocEntry* GetDocEntryByNumber(uint16_t group, uint16_t element); 
-   DocEntry* GetDocEntryByName  (std::string const & tagName);
+   DocEntry* GetDocEntryByName  (TagName const & tagName);
 
    ValEntry* GetValEntryByNumber(uint16_t group, uint16_t element); 
    //BinEntry* GetBinEntryByNumber(uint16_t group, uint16_t element); 
+   RLEFramesInfo* GetRLEInfo() { return RLEInfo; }
+   JPEGFragmentsInfo* GetJPEGInfo() { return JPEGInfo; }
 
    void LoadDocEntrySafe(DocEntry* entry);
    TagDocEntryHT* BuildFlatHashTable();
@@ -249,14 +254,11 @@ private:
    void BuildFlatHashTableRecurse( TagDocEntryHT& builtHT,
                                    DocEntrySet* set );
 
-
+   void HandleBrokenEndian(uint16_t  group, uint16_t  elem);
 public:
 // Accessors:
-   /// Accessor to \ref PrintLevel
-   void SetPrintLevel(int level) { PrintLevel = level; }
-
    /// Accessor to \ref Filename
-   const std::string &GetFileName() { return Filename; }
+   const std::string &GetFileName() const { return Filename; }
 
    /// Accessor to \ref Filename
    void SetFileName(std::string const & fileName) { Filename = fileName; }
@@ -264,11 +266,10 @@ public:
    /// 'Swap code' accessor (see \ref SwapCode )
    int GetSwapCode() { return SwapCode; }
    
-   /// File pointer
-   FILE * GetFP() { return Fp; }
-
    bool operator<(Document &document);
 
+   int ComputeGroup0002Length( FileType filetype );
+
 };
 } // end namespace gdcm