-// $Header: /cvs/public/gdcm/src/Attic/gdcmElValSet.cxx,v 1.17 2003/03/12 21:33:20 frog Exp $
+// gdcmElValSet.cxx
+#include <sstream>
#include "gdcmUtil.h"
#include "gdcmElValSet.h"
-#include <vector>
-static void Tokenize (const string& str, vector<string>& tokens, const string& delimiters = " ");
-
-
TagElValueHT & gdcmElValSet::GetTagHt(void) {
return tagHt;
}
void gdcmElValSet::Add(gdcmElValue * newElValue) {
+ cout << "#### gdcmElValSet::Add" << newElValue->GetKey() << newElValue->GetName() << endl;
tagHt [newElValue->GetKey()] = newElValue;
NameHt[newElValue->GetName()] = newElValue;
}
+// TODO : faire un gdcmElValSet::ReplaceOrCreate qui remplace si ça existe, qui cree sinon
+
+void gdcmElValSet::ReplaceOrCreate(gdcmElValue * newElValue) {
+
+ TagKey key = newElValue->GetKey();
+
+ if (tagHt.count(key) > 1)
+ dbg.Verbose(0, "gdcmElValSet::GetElValueByNumber",
+ "multiple entries for this key (FIXME) !");
+
+ if (tagHt.count(key)) {
+ tagHt.erase(key);
+ tagHt.erase(newElValue->GetName());
+ }
+
+ tagHt [key] = newElValue;
+ NameHt[newElValue->GetName()] = newElValue;
+}
+
+
void gdcmElValSet::Print(ostream & os) {
for (TagElValueHT::iterator tag = tagHt.begin();
tag != tagHt.end();
os << tag->first << ": ";
os << "[" << tag->second->GetValue() << "]";
os << "[" << tag->second->GetName() << "]";
- os << "[" << tag->second->GetVR() << "]" << endl;
+ os << "[" << tag->second->GetVR() << "]";
+ os << " lgr : " << tag->second->GetLength();
+ os << endl;
}
}
return(1);
}
+/**
+ * \ingroup gdcmElValSet
+ * \brief Generate a free TagKey i.e. a TagKey that is not present
+ * in the TagHt dictionary. One of the potential usage is
+ * to add gdcm generated additional informartion to the ElValSet
+ * (see gdcmHeader::AddAndDefaultElements).
+ * @param group The generated tag must belong to this group.
+ * @return The element of tag with given group which is fee.
+ */
+guint32 gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup(guint32 group) {
+ for (guint32 elem = 0; elem < UINT32_MAX; elem++) {
+ TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, elem);
+ if (tagHt.count(key) == 0)
+ return elem;
+ }
+ return UINT32_MAX;
+}
int gdcmElValSet::SetElValueLengthByNumber(guint32 l,
guint32 group, guint32 element) {
"multiple entries for this key (FIXME) !");
return (0);
}
- // FIXME JPR: comments in English please !
- // m à j LgrElem
tagHt[key]->SetLength(l);
return(1);
}
return(1);
}
+// Sorry for the DEBUG's, but tomorow is gonna be hoter than today
+#define DEBUG 0
int gdcmElValSet::Write(FILE * _fp) {
guint32 val_uint32;
gint32 val_int32;
guint16 val_uint16;
- gint16 val_int16;
+ gint16 val_int16;;
vector<string> tokens;
void *ptr;
char str_lgrCalcGroupe[10];
+
string implicitVRTransfertSyntax = "1.2.840.10008.1.2";
// Utilisées pour le calcul Group Length
- int deja = 0;
+ int deja = 0, prem=0;
guint32 lgrCalcGroupe=0;
gdcmElValue *elem, *elemZ, *elemZPrec;
guint16 grCourant = 0;
//
// cf : code IdDcmWriteFile dans libido/src/dcmwrite.c
- if (0) // Risque de pb dans le calcul des lgr de chaque groupe. On le saute pour le moment!
+if (1) { // Risque de pb dans le calcul des lgr de chaque groupe. On le saute pour le moment!
+
+ // On fait de l'implicit VR little Endian
+ // (pour moins se fairche sur processeur INTEL)
+ // On force le TRANSFERT SYNTAX UID
+
+ SetElValueByNumber(implicitVRTransfertSyntax, 0x0002, 0x0010);
+ SetElValueLengthByNumber(18, 0x0002, 0x0010); // Le 0 de fin de chaine doit etre stocké, dans ce cas
+
+ TagElValueHT::iterator tag = tagHt.begin();
- for (TagElValueHT::iterator tag = tagHt.begin();
+ elem = tag->second;
+ gr = elem->GetGroup();
+ el = elem->GetElement();
+
+ if (el != 0x0000) {
+ if(DEBUG)printf("ajout elem OOOO premiere fois\n");
+ gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(gr, 0x0000, "UL");
+ elemZPrec = new gdcmElValue(tagZ); // on le cree
+ elemZPrec->SetLength(4);
+ Add(elemZPrec); // On l'accroche à sa place
+ } else {
+ elemZPrec = elem;
+ if(DEBUG)printf("Pas d'ajout elem OOOO premiere fois\n");
+ }
+ lgrCalcGroupe = 0;
+ if(DEBUG)printf("init-1 lgr (%d) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, gr);
+ grCourant = gr;
+
+ for (tag = ++tagHt.begin();
tag != tagHt.end();
++tag){
-
+
elem = tag->second;
- printf("gr %04x el %04x lgr %d\n",elem->GetGroup(), elem->GetElement(), elem->GetLength());
-
- if ( (elem->GetGroup() != grCourant) &&
- (elem->GetGroup() != 0xfffe) ) { // On arrive sur un nv Groupe
-
- printf("Nouv Groupegr %04x el %04x \n",elem->GetGroup(), elem->GetElement());
-
- elemZ = elem;
-
- if(elemZ->GetElement() != 0x0000) { // pas d'element 'Lgr groupe'
- // On crée
- gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(grCourant, 0x0000, "UL");
+ gr = elem->GetGroup();
+ el = elem->GetElement();
+
+ if ( (gr != grCourant) /*&& // On arrive sur un nv Groupe
+ (el != 0xfffe) */ ) {
+
+ if (el != 0x0000) {
+ gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(gr, 0x0000, "UL");
elemZ = new gdcmElValue(tagZ); // on le cree
elemZ->SetLength(4);
- Add(elemZ); // On l'accroche à sa place
- }
-
- if (deja) {
- //sprintf(str_lgrCalcGroupe,"%d",lgrCalcGroupe);
- elemZPrec->SetValue(str_lgrCalcGroupe);
- lgrCalcGroupe = 0;
+ Add(elemZ); // On l'accroche à sa place
+ if(DEBUG)printf("ajout elem OOOO pour gr %04x\n",gr);
+ } else {
+ elemZ=elem;
+ if(DEBUG)printf("maj elmeZ\n");
}
- deja = 1;
-
- lgrCalcGroupe = 12; //2 + 2 + 4 + 4; // Gr + Num + Lgr + LgrGroupe
- printf ("lgrCalcGroupe %d\n",lgrCalcGroupe);
- elemZPrec = elemZ;
- grCourant = elem->GetGroup();
-
- } else { // On n'EST PAS sur un nv Groupe
-
- printf ("lgrCalcGroupe avant : %d LgrElem %d\n",lgrCalcGroupe,elem->GetLength());
-
- lgrCalcGroupe += 2 + 2 + 4 + elem->GetLength(); // Gr + Num + Lgr + LgrElem
-
- printf ("lgrCalcGroupe apres %d\n",lgrCalcGroupe);
+ ostringstream fock;
+ fock << lgrCalcGroupe;
+ //sprintf(str_lgrCalcGroupe,"%d",lgrCalcGroupe);
+ elemZPrec->SetValue(fock.str());
+ if(DEBUG)printf("ecriture lgr (%d, %s) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, fock.str().c_str(), grCourant);
+ if(DEBUG)printf ("%04x %04x [%s]\n",elemZPrec->GetGroup(), elemZPrec->GetElement(),elemZPrec->GetValue().c_str());
+ if(DEBUG)cout << "Addresse elemZPrec " << elemZPrec<< endl;
+ elemZPrec=elemZ;
+ lgrCalcGroupe = 0;
+ grCourant = gr;
+ if(DEBUG)printf("init-2 lgr (%d) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, gr);
+ } else { // On n'EST PAS sur un nv Groupe
+ lgrCalcGroupe += 2 + 2 + 4 + elem->GetLength(); // Gr + Num + Lgr + LgrElem
+ if(DEBUG)printf("increment (%d) el %04x-->lgr (%d) pour gr %04x\n",elem->GetLength(), el, lgrCalcGroupe, gr);
}
}
- // Si on fait de l'implicit VR little Endian
- // (pour moins se fairche sur processeur INTEL)
- // penser a forcer le TRANSFERT SYNTAX UID
-
- SetElValueByNumber(implicitVRTransfertSyntax, 0x0002, 0x0010);
- SetElValueLengthByNumber(18, 0x0002, 0x0010); // Le 0 de fin de chaine doit etre stocké, dans ce cas
-
+} // fin if (1)
+
+
// restent à tester les echecs en écriture (apres chaque fwrite)
for (TagElValueHT::iterator tag2 = tagHt.begin();
lgr = tag2->second->GetLength();
val = tag2->second->GetValue().c_str();
vr = tag2->second->GetVR();
+ if(DEBUG)printf ("%04x %04x [%s] : [%s]\n",gr, el, vr.c_str(), val);
fwrite ( &gr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp); //group
fwrite ( &el,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp); //element
// si on n'est pas en IMPLICIT VR voir pb (lgr + VR)
- fwrite ( &lgr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp); //lgr
+ fwrite ( &lgr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp); //lgr
tokens.erase(tokens.begin(),tokens.end());
Tokenize (tag2->second->GetValue(), tokens, "\\");
- //printf ("%04x %04x [%s] : [%s]\n",gr, el, vr.c_str(), val);
//if (tokens.size() > 1) { printf ("size : %d\n",tokens.size());}
-
if (vr == "US" || vr == "SS") {
- /*
- val_int16 = atoi(val);
- ptr = &val_int16;
- fwrite ( ptr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp);
- continue;
- */
-
for (unsigned int i=0; i<tokens.size();i++) {
val_uint16 = atoi(tokens[i].c_str());
ptr = &val_uint16;
fwrite ( ptr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp);
}
- continue;
-
+ continue;
}
- if (vr == "UL" || vr == "SL") {
- /*
- val_int32 = atoi(val);
- ptr = &val_int32;
- fwrite ( ptr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp);
- continue;
- */
-
-
+ if (vr == "UL" || vr == "SL") {
for (unsigned int i=0; i<tokens.size();i++) {
val_uint32 = atoi(tokens[i].c_str());
ptr = &val_uint32;
fwrite ( ptr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp);
}
- continue;
-
+ continue;
}
// Les pixels ne sont pas chargés dans l'element !
//
// cf : code IdDcmWriteFile dans libido/src/dcmwrite.c
- if (1) // Risque de pb dans le calcul des lgr de chaque groupe. On le saute pour le moment!
+
+
+ TagElValueHT::iterator tag = tagHt.begin();
- for (TagElValueHT::iterator tag = tagHt.begin();
+ elem = tag->second;
+ gr = elem->GetGroup();
+ el = elem->GetElement();
+
+ if (el != 0x0000) {
+ if(DEBUG)printf("ajout elem OOOO premiere fois\n");
+ gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(gr, 0x0000, "UL");
+ elemZPrec = new gdcmElValue(tagZ); // on le cree
+ elemZPrec->SetLength(4);
+ Add(elemZPrec); // On l'accroche à sa place
+ } else {
+ elemZPrec = elem;
+ if(DEBUG)printf("Pas d'ajout elem OOOO premiere fois\n");
+ }
+ lgrCalcGroupe = 0;
+ if(DEBUG)printf("init-1 lgr (%d) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, gr);
+ grCourant = gr;
+
+ for (tag = ++tagHt.begin();
tag != tagHt.end();
++tag){
-
+
elem = tag->second;
- //printf("gr %04x el %04x lgr %d\n",elem->GetGroup(), elem->GetElement(), elem->GetLength());
-
- if ( (elem->GetGroup() != grCourant) &&
- (elem->GetGroup() != 0xfffe) ) { // On arrive sur un nv Groupe
-
- //printf("Nouv Groupegr %04x el %04x \n",elem->GetGroup(), elem->GetElement());
-
- elemZ = elem;
-
- if(elemZ->GetElement() != 0x0000) { // pas d'element 'Lgr groupe'
- // On crée
- gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(grCourant, 0x0000, "UL");
+ gr = elem->GetGroup();
+ el = elem->GetElement();
+
+ if ( (gr != grCourant) /*&& // On arrive sur un nv Groupe
+ (el != 0xfffe) */ ) {
+
+ if (el != 0x0000) {
+ gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(gr, 0x0000, "UL");
elemZ = new gdcmElValue(tagZ); // on le cree
elemZ->SetLength(4);
- Add(elemZ); // On l'accroche à sa place
- }
-
- if (deja) {
- //sprintf(str_lgrCalcGroupe,"%d",lgrCalcGroupe);
- elemZPrec->SetValue(str_lgrCalcGroupe);
- lgrCalcGroupe = 0;
+ Add(elemZ); // On l'accroche à sa place
+ if(DEBUG)printf("ajout elem OOOO pour gr %04x\n",gr);
+ } else {
+ elemZ=elem;
+ if(DEBUG)printf("maj elmeZ\n");
}
- deja = 1;
- lgrCalcGroupe = 12; //2 + 2 + 4 + 4; // Gr + Num + Lgr + LgrGroupe
- //printf ("lgrCalcGroupe %d\n",lgrCalcGroupe);
-
- elemZPrec = elemZ;
- grCourant = elem->GetGroup();
-
- } else { // On n'EST PAS sur un nv Groupe
-
- //printf ("lgrCalcGroupe avant : %d LgrElem %d\n",lgrCalcGroupe,elem->GetLength());
-
- lgrCalcGroupe += 2 + 2 + 4 + elem->GetLength(); // Gr + Num + Lgr + LgrElem
-
- //printf ("lgrCalcGroupe apres %d\n",lgrCalcGroupe);
+ ostringstream fock;
+ fock << lgrCalcGroupe;
+ //sprintf(str_lgrCalcGroupe,"%d",lgrCalcGroupe);
+ elemZPrec->SetValue(fock.str());
+ if(DEBUG)printf("ecriture lgr (%d, %s) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, fock.str().c_str(), grCourant);
+ if(DEBUG)printf ("%04x %04x [%s]\n",elemZPrec->GetGroup(), elemZPrec->GetElement(),elemZPrec->GetValue().c_str());
+ if(DEBUG)cout << "Addresse elemZPrec " << elemZPrec<< endl;
+ elemZPrec=elemZ;
+ lgrCalcGroupe = 0;
+ grCourant = gr;
+ if(DEBUG)printf("init-2 lgr (%d) pour gr %04x\n",lgrCalcGroupe, gr);
+ } else { // On n'EST PAS sur un nv Groupe
+ lgrCalcGroupe += 2 + 2 + 4 + elem->GetLength(); // Gr + Num + Lgr + LgrElem
+ if(DEBUG)printf("increment (%d) el %04x-->lgr (%d) pour gr %04x\n",elem->GetLength(), el, lgrCalcGroupe, gr);
}
}
return(1);
}
-
-
-
-
-// mettre ça dans une bibliothèque d'utilitaires ?
-// ca peut servir
-
-static void Tokenize (const string& str, vector<string>& tokens, const string& delimiters = " ") {
- string::size_type lastPos = str.find_first_not_of(delimiters,0);
- string::size_type pos = str.find_first_of(delimiters,lastPos);
- while (string::npos != pos || string::npos != lastPos) {
- tokens.push_back(str.substr(lastPos, pos - lastPos));
- lastPos = str.find_first_not_of(delimiters, pos);
- pos = str.find_first_of(delimiters, lastPos);
- }
-}
git://git.creatis.insa-lyon.fr / gdcm.git / blobdiff