]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmElValSet.cxx
* distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
[gdcm.git] / src / gdcmElValSet.cxx
index 70f21fc15ffc47f8ae25538ca06f97651e3aee99..d716e6af4afa7782926199f484256a50146216dd 100644 (file)
@@ -8,7 +8,7 @@ TagElValueHT & ElValSet::GetTagHt(void) {
 }
 
 void ElValSet::Add(ElValue * newElValue) {
-       tagHt[newElValue->GetKey()]   = newElValue;
+       tagHt [newElValue->GetKey()]  = newElValue;
        NameHt[newElValue->GetName()] = newElValue;
 }
 
@@ -21,46 +21,15 @@ void ElValSet::Print(ostream & os) {
                os << "[" << tag->second->GetName()  << "]";
                os << "[" << tag->second->GetVR()    << "]" << endl;
        }
-}
-
-
-int ElValSet::Write(FILE * _fp) {
+} 
 
-       guint16 gr, el;
-       guint32 lgr;
-       const char * val;
-       // restent à tester les echecs en écriture
-       for (TagElValueHT::iterator tag = tagHt.begin();
-                 tag != tagHt.end();
-                 ++tag){
-
-               // Question :
-               // peut-on se passer des affectations?
-               // - passer l'adresse du resultat d'une fonction (???)
-               // - acceder au champ sans passer par un accesseur ?
-               gr = tag->second->GetGroup();
-               el = tag->second->GetElement();
-               lgr = tag->second->GetLength();
-               val = tag->second->GetValue().c_str();
-               
-               fwrite ( &gr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp);        //group
-               fwrite ( &el,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp);        //element
-               //fwrite ( tag->second->GetVR(),(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp);     //VR
-               
-               // voir pb lgr  + VR
-               fwrite ( &lgr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp);                       //lgr 
-               // voir pb des int16 et int32 : les identifier, les convertir, modifier la longueur
-               fwrite ( val,(size_t)lgr ,(size_t)1 ,_fp); //valeur Elem
-       }
-       return(1);
-}
 void ElValSet::PrintByName(ostream & os) {
        for (TagElValueNameHT::iterator tag = NameHt.begin();
                  tag != NameHt.end();
                  ++tag){
                os << tag->first << ": ";
                os << "[" << tag->second->GetValue() << "]";
-               os << "[" << tag->second->GetKey()  << "]";
+               os << "[" << tag->second->GetKey()   << "]";
                os << "[" << tag->second->GetVR()    << "]" << endl;
        }
 }
@@ -94,6 +63,15 @@ string ElValSet::GetElValueByNumber(guint32 group, guint32 element) {
        return tagHt.find(key)->second->GetValue();
 }
 
+string ElValSet::GetElValueByName(string TagName) {
+       if ( ! NameHt.count(TagName))
+               return "gdcm::Unfound";
+       if (NameHt.count(TagName) > 1)
+               dbg.Verbose(0, "ElValSet::GetElValue",
+                           "multipe entries for this key (FIXME) !");
+       return NameHt.find(TagName)->second->GetValue();
+}
+
 int ElValSet::SetElValueByNumber(string content, guint32 group, guint32 element) {
        TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, element);
        if ( ! tagHt.count(key))
@@ -102,30 +80,189 @@ int ElValSet::SetElValueByNumber(string content, guint32 group, guint32 element)
                dbg.Verbose(0, "ElValSet::SetElValueByNumber",
                            "multiple entries for this key (FIXME) !");
                return (0); 
-       }
-                                      
+       }                                      
        tagHt[key]->SetValue(content);
+
+       // Question : m à j LgrElem ?
+       tagHt[key]->SetLength(strlen(content.c_str()));  
+
+       // FIXME should we really update the element length ?
+       tagHt[key]->SetLength(content.length());         
+
        return(1);              
 }
 
-string ElValSet::GetElValueByName(string TagName) {
+int ElValSet::SetElValueByName(string content, string TagName) {
        if ( ! NameHt.count(TagName))
-               return "gdcm::Unfound";
-       if (NameHt.count(TagName) > 1)
-               dbg.Verbose(0, "ElValSet::GetElValue",
+               return 0;
+       if (NameHt.count(TagName) > 1) {
+               dbg.Verbose(0, "ElValSet::SetElValueByName",
                            "multipe entries for this key (FIXME) !");
-       return NameHt.find(TagName)->second->GetValue();
+               return 0;
+       }
+       NameHt.find(TagName)->second->SetValue(content);
+       NameHt.find(TagName)->second->SetLength(strlen(content.c_str()));        
+       return(1);              
 }
 
-int ElValSet::SetElValueByName(string content, string TagName) {
+
+int ElValSet::SetElValueLengthByNumber(guint32 l, guint32 group, guint32 element) {
+       TagKey key = gdcmDictEntry::TranslateToKey(group, element);
+       if ( ! tagHt.count(key))
+               return 0;
+       if (tagHt.count(key) > 1) {
+               dbg.Verbose(0, "ElValSet::SetElValueLengthByNumber",
+                           "multiple entries for this key (FIXME) !");
+               return (0); 
+       }                                      
+       // m à j LgrElem 
+       tagHt[key]->SetLength(l);        
+       return(1);              
+}
+
+
+int ElValSet::SetElValueLengthByName(guint32 l, string TagName) {
        if ( ! NameHt.count(TagName))
                return 0;
        if (NameHt.count(TagName) > 1) {
-               dbg.Verbose(0, "ElValSet::SetElValue",
+               dbg.Verbose(0, "ElValSet::SetElValueByName",
                            "multipe entries for this key (FIXME) !");
                return 0;
        }
-       NameHt.find(TagName)->second->SetValue(content);
+       NameHt.find(TagName)->second->SetLength(l);      
+       return(1);              
 }
 
 
+int ElValSet::Write(FILE * _fp) {
+
+// ATTENTION : fonction non terminée (commitée a titre de precaution)
+
+       guint16 gr, el;
+       guint32 lgr;
+       const char * val;
+       string vr;
+       guint32 val_int32;
+       guint16 val_int16;
+       void *ptr;
+       char str_lgrCalcGroupe[10];
+       
+       string implicitVRTransfertSyntax = "1.2.840.10008.1.2";
+       
+       // Utilisées pour le calcul Group Length
+       int deja = 0;
+       guint32 lgrCalcGroupe=0;
+       ElValue *elem, *elemZ, *elemZPrec;
+       guint16 grCourant = 0;
+       
+       // Question :
+       // Comment pourrait-on tester si on est TrueDicom ou non ,
+       // (FileType est un champ de gdcmHeader ...)
+       //
+
+       // On parcourt la table pour recalculer la longueur des 'elements 0x0000'
+       // au cas ou un tag ai été ajouté par rapport à ce qui a été lu
+       // dans l'image native
+       //
+       // cf : code IdDcmWriteFile dans libido/src/dcmwrite.c
+               
+       for (TagElValueHT::iterator tag = tagHt.begin();
+                 tag != tagHt.end();
+                 ++tag){
+
+               elem = tag->second;
+               printf("gr %04x el %04x lgr %d\n",elem->GetGroup(), elem->GetElement(), elem->GetLength());
+       
+               if ( (elem->GetGroup() != grCourant) &&   
+                        (elem->GetGroup() != 0xfffe)   ) {     // On arrive sur un nv Groupe
+                        
+               printf("Nouv Groupegr %04x el %04x \n",elem->GetGroup(), elem->GetElement());
+
+                       elemZ = elem; 
+                        
+                       if(elemZ->GetElement() != 0x0000) {     // pas d'element 'Lgr groupe'
+                               // On crée
+                               gdcmDictEntry * tagZ = new gdcmDictEntry(grCourant, 0x0000, "UL");
+                               elemZ = new ElValue(tagZ); // on le cree
+                               elemZ->SetLength(4);
+                               Add(elemZ);                                      // On l'accroche à sa place    
+                       }       
+                       
+                       if (deja) {
+                               sprintf(str_lgrCalcGroupe,"%d",lgrCalcGroupe);
+                               elemZPrec->SetValue(str_lgrCalcGroupe);
+                               lgrCalcGroupe = 0;
+                       }
+                       deja = 1;
+                       
+                       lgrCalcGroupe =  12; //2 + 2 + 4 + 4; // Gr + Num + Lgr + LgrGroupe
+                       printf ("lgrCalcGroupe %d\n",lgrCalcGroupe);
+                       
+                       elemZPrec = elemZ;
+                       grCourant = elem->GetGroup();
+                                                       
+               } else {                // On n'EST PAS sur un nv Groupe
+               
+                       printf ("lgrCalcGroupe avant : %d LgrElem %d\n",lgrCalcGroupe,elem->GetLength());
+
+                       lgrCalcGroupe += 2 + 2 + 4 + elem->GetLength();  // Gr + Num + Lgr + LgrElem 
+                       
+                       printf ("lgrCalcGroupe apres %d\n",lgrCalcGroupe);
+
+               }               
+       }
+       
+       // Si on fait de l'implicit VR little Endian 
+       // (pour moins se fairche sur processeur INTEL)
+       // penser a forcer le TRANSFERT SYNTAX UID
+                               
+       SetElValueByNumber(implicitVRTransfertSyntax, 0x0002, 0x0010);  
+       SetElValueLengthByNumber(18, 0x0002, 0x0010);  // Le 0 de fin de chaine doit etre stocké, dans ce cas   
+               
+       // restent à tester les echecs en écriture (apres chaque fwrite)
+       
+       for (TagElValueHT::iterator tag2 = tagHt.begin();
+                 tag2 != tagHt.end();
+                 ++tag2){
+
+               // Question :
+               // peut-on se passer des affectations?
+               // - passer l'adresse du resultat d'une fonction (???)
+               // - acceder au champ sans passer par un accesseur ?
+               
+               gr =  tag2->second->GetGroup();
+               el =  tag2->second->GetElement();
+               lgr = tag2->second->GetLength();
+               val = tag2->second->GetValue().c_str();
+               vr =  tag2->second->GetVR();
+                       
+               fwrite ( &gr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp);        //group
+               fwrite ( &el,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp);        //element
+               
+               //fwrite ( vr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp);       //VR
+               
+               // si on n'est pas en IMPLICIT VR voir pb (lgr  + VR)
+               
+               fwrite ( &lgr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp);                       //lgr
+               
+               if (vr == "US" || vr == "SS") {
+                       val_int16 = atoi(val);
+                       ptr = &val_int16;
+                       fwrite ( ptr,(size_t)2 ,(size_t)1 ,_fp);        
+                       continue;
+               }
+               if (vr == "UL" || vr == "SL") {
+                       val_int32 = atoi(val);
+                       ptr = &val_int32;
+                       fwrite ( ptr,(size_t)4 ,(size_t)1 ,_fp);        
+                       continue;
+               }       
+               
+               // Les pixels ne sont pas chargés dans l'element !
+               if ((gr == 0x7fe0) && (el == 0x0010) ) break;
+
+               fwrite ( val,(size_t)lgr ,(size_t)1 ,_fp); //valeur Elem
+       }
+               
+       return(1);
+}