]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmFile.cxx
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[gdcm.git] / src / gdcmFile.cxx
index a48f1a5423fed18a7a8192376a369a9fbec45d57..176b2c8c1b66abcc018d415854cc048593b3b88a 100644 (file)
@@ -14,14 +14,12 @@ typedef std::pair<TagHeaderEntryHT::iterator,TagHeaderEntryHT::iterator> IterHT;
  *        file (see SetFileName, SetDcmTag and Write)
  *        Opens (in read only and when possible) an existing file and checks
  *        for DICOM compliance. Returns NULL on failure.
- * \Note  the in-memory representation of all available tags found in
+ * \note  the in-memory representation of all available tags found in
  *        the DICOM header is post-poned to first header information access.
  *        This avoid a double parsing of public part of the header when
  *        one sets an a posteriori shadow dictionary (efficiency can be
  *        seen as a side effect).   
- *
  * @param header file to be opened for reading datas
- *
  * @return     
  */
  
@@ -40,13 +38,12 @@ gdcmFile::gdcmFile(gdcmHeader *header) {
  *        file (see SetFileName, SetDcmTag and Write)
  *        Opens (in read only and when possible) an existing file and checks
  *        for DICOM compliance. Returns NULL on failure.
- * \Note  the in-memory representation of all available tags found in
+ * \note  the in-memory representation of all available tags found in
  *        the DICOM header is post-poned to first header information access.
  *        This avoid a double parsing of public part of the header when
  *        one sets an a posteriori shadow dictionary (efficiency can be
  *        seen as a side effect).   
  * @param filename file to be opened for parsing
- * @return     
  */
 gdcmFile::gdcmFile(std::string & filename) {
    Header=new gdcmHeader(filename.c_str());
@@ -57,7 +54,20 @@ gdcmFile::gdcmFile(std::string & filename) {
       SetPixelDataSizeFromHeader();
 }
 
-gdcmFile::gdcmFile(const char * filename) {
+/**
+ * \ingroup   gdcmFile
+ * \brief Constructor dedicated to writing a new DICOMV3 part10 compliant
+ *        file (see SetFileName, SetDcmTag and Write)
+ *        Opens (in read only and when possible) an existing file and checks
+ *        for DICOM compliance. Returns NULL on failure.
+ * \note  the in-memory representation of all available tags found in
+ *        the DICOM header is post-poned to first header information access.
+ *        This avoid a double parsing of public part of the header when
+ *        one sets an a posteriori shadow dictionary (efficiency can be
+ *        seen as a side effect).   
+ * @param filename file to be opened for parsing
+ */
+ gdcmFile::gdcmFile(const char * filename) {
    Header=new gdcmHeader(filename);
    SelfHeader=true;
    PixelRead=-1; // no ImageData read yet.
@@ -85,7 +95,7 @@ gdcmFile::~gdcmFile(void) {
 // Public
 /**
  * \ingroup   gdcmFile
- * \brief     
+ * \brief returns the gdcmHeader *Header   
  * @return     
  */
 gdcmHeader *gdcmFile::GetHeader(void) {
@@ -162,9 +172,9 @@ size_t gdcmFile::GetImageDataSize(void) {
 /**
  * \ingroup   gdcmFile
  * \brief     Returns the size (in bytes) of required memory to hold
- * \          the pixel data represented in this file, when user DOESN'T want 
- * \          to get RGB pixels image when it's stored as a PALETTE COLOR image
- * \          - the (vtk) user is supposed to know how deal with LUTs 
+ *            the pixel data represented in this file, when user DOESN'T want 
+ *            to get RGB pixels image when it's stored as a PALETTE COLOR image
+ *            -the (vtk) user is supposed to know how deal with LUTs
  * \warning   to be used with GetImagePixelsRaw()
  * @return    The size of pixel data in bytes.
  */
@@ -180,7 +190,7 @@ size_t gdcmFile::GetImageDataSizeRaw(void) {
  *          Transforms 3 planes R, G, B into a single RGB Plane
  *          Transforms single Grey plane + 3 Palettes into a RGB Plane
  * @return  Pointer to newly allocated pixel data.
- * \        NULL if alloc fails 
+ *          NULL if alloc fails 
  */
 void * gdcmFile::GetImageData (void) {
    PixelData = (void *) malloc(lgrTotale);
@@ -393,7 +403,7 @@ size_t gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw (void* destination, size_t MaxSize) {
          return (size_t)0; 
       }
    } 
-// DO NOT remove this code commented out.
+// DO NOT remove this commented out code .
 // Nobody knows what's expecting you ...
 // Just to 'see' what was actually read on disk :-(
 
@@ -531,12 +541,13 @@ size_t gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw (void* destination, size_t MaxSize) {
 
 /**
  * \ingroup   gdcmFile
- * \brief TODO JPR
- * \warning doit-etre etre publique ?  
- * TODO : y a-t-il un inconvenient à fusioner ces 2 fonctions
- *
- * @param inData 
- * @param ExpectedSize 
+ * \brief performs a shadow copy (not a deep copy) of the user given
+ *        pixel area.
+ *        'image' Pixels are presented as C-like 2D arrays : line per line.
+ *        'volume'Pixels are presented as C-like 3D arrays : lane per plane 
+ * \warning user is kindly requested NOT TO 'free' the Pixel area
+ * @param inData user supplied pixel area
+ * @param ExpectedSize total image size, in Bytes
  *
  * @return boolean     
  */
@@ -551,9 +562,7 @@ bool gdcmFile::SetImageData(void * inData, size_t ExpectedSize) {
  * \ingroup   gdcmFile
  * \brief Writes on disk A SINGLE Dicom file
  *        NO test is performed on  processor "Endiannity".
- *        Ca sera à l'utilisateur d'appeler son Reader correctement
- *        (Equivalent a IdImaWriteRawFile) 
- *
+ *        It's up to the user to call his Reader properly
  * @param fileName name of the file to be created
  *                 (any already existing file is over written)
  * @return false if write fails        
@@ -573,9 +582,9 @@ bool gdcmFile::WriteRawData (std::string fileName) {
 
 /**
  * \ingroup   gdcmFile
- * \brief Writes on disk A SINGLE Dicom file
+ * \brief Writes on disk A SINGLE Dicom file, 
+ *        using the Implicit Value Representation convention
  *        NO test is performed on  processor "Endiannity".
- *
  * @param fileName name of the file to be created
  *                 (any already existing file is overwritten)
  * @return false if write fails        
@@ -587,8 +596,9 @@ bool gdcmFile::WriteDcmImplVR (std::string fileName) {
 
 /**
  * \ingroup   gdcmFile
- * \brief  
- * @param fileName name of the file to be created
+ * \brief Writes on disk A SINGLE Dicom file, 
+ *        using the Implicit Value Representation convention
+ *        NO test is performed on  processor "Endiannity". * @param fileName name of the file to be created
  *                 (any already existing file is overwritten)
  * @return false if write fails        
  */
@@ -599,8 +609,9 @@ bool gdcmFile::WriteDcmImplVR (const char* fileName) {
        
 /**
  * \ingroup   gdcmFile
- * \brief  
- * @param fileName name of the file to be created
+* \brief Writes on disk A SINGLE Dicom file, 
+ *        using the Explicit Value Representation convention
+ *        NO test is performed on  processor "Endiannity". * @param fileName name of the file to be created
  *                 (any already existing file is overwritten)
  * @return false if write fails        
  */
@@ -611,15 +622,14 @@ bool gdcmFile::WriteDcmExplVR (std::string fileName) {
        
 /**
  * \ingroup   gdcmFile
- * \brief  Ecrit au format ACR-NEMA sur disque l'entete et les pixels
+ * \brief Writes on disk A SINGLE Dicom file, 
+ *        using the ACR-NEMA convention
+ *        NO test is performed on  processor "Endiannity".
  *        (a l'attention des logiciels cliniques 
  *        qui ne prennent en entrée QUE des images ACR ...
  * \warning if a DICOM_V3 header is supplied,
  *         groups < 0x0008 and shadow groups are ignored)
  * \warning NO TEST is performed on processor "Endiannity".
- *        Ca fonctionnera correctement (?) sur processeur Intel
- *        (Equivalent a IdDcmWrite) 
- *
  * @param fileName name of the file to be created
  *                 (any already existing file is overwritten)
  * @return false if write fails                
@@ -633,10 +643,11 @@ bool gdcmFile::WriteAcr (std::string fileName) {
 // Protected
 /**
  * \ingroup   gdcmFile
- *
-* @param fileName name of the file to be created
+ * \brief NOT a end user inteded function
+ *        (used by WriteDcmExplVR, WriteDcmImplVR, WriteAcr, etc)
+ * @param fileName name of the file to be created
  *                 (any already existing file is overwritten)
- * @param  type file type (ExplicitVR, ImplicitVR, ...)
+ * @param  type file type (ExplicitVR, ImplicitVR, DICOMDIR, ...)
  * @return false if write fails                
  */
 bool gdcmFile::WriteBase (std::string fileName, FileType type) {
@@ -644,8 +655,8 @@ bool gdcmFile::WriteBase (std::string fileName, FileType type) {
    FILE * fp1;
    
    if (PixelRead==-1 && type != DICOMDIR) {
-      std::cout << "U never Read the pixels; U cannot write the file" 
-                << std::endl;
+/*      std::cout << "U never Read the pixels; U cannot write the file" 
+                << std::endl;*/
       return false;               
    }