#include "gdcm.h"
+#define DEBUG 1
+
static void _Swap(void* im, int swap, int lgr, int nb);
/////////////////////////////////////////////////////////////////
*
* @return
*/
-
-/////////////////////////////////////////////////////////////////
-/**
- * \ingroup gdcmFile
- * \brief constructeur
- *
- * @param
- *
- * @return
- */
-
gdcmFile::gdcmFile(string & filename)
:gdcmHeader(filename.c_str())
{
+ if (DEBUG) printf("On a echappe a gdcmHeader !\n");
}
* \ingroup gdcmFile
* \brief Renvoie la longueur A ALLOUER pour recevoir les pixels de l'image
* \ ou DES images dans le cas d'un multiframe
- * \ ATTENTION : il ne s'agit PAS de la lgr du groupe des Pixels
+ * \ ATTENTION : il ne s'agit PAS de la longueur du groupe des Pixels
* \ (dans le cas d'images compressees, elle n'a pas de sens).
*
* @param void Rien en entree
void * gdcmFile::GetImageData (void) {
- char* Pixels;
+ char* _Pixels;
+ int nbLignes, nbCol;
+
+ int nbFrames, nb, nbu, highBit, signe;
+ string str_nbFrames, str_nb, str_nbu, str_highBit, str_signe;
+
+ unsigned short int mask = 0xffff;
+
+ // Nombre de Lignes
+ nbLignes=atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0010).c_str());
+ // Nombre de Colonnes
+ nbCol =atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0011).c_str());
+
+ // Nombre de Frames
+ str_nbFrames=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0008);
+
+
+ if (str_nbFrames == "UNFOUND" ) {
+ nbFrames = 1;
+ } else {
+ nbFrames = atoi(str_nbFrames.c_str() );
+ }
+
+ // Nombre de Bits Alloues
+ str_nb=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0100);
+
+ if (str_nb == "UNFOUND" ) {
+ nb = 16;
+ } else {
+ nb = atoi(str_nb.c_str() );
+ }
+
+ // Nombre de Bits Utilises
+ str_nbu=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0101);
+
+ if (str_nbu == "UNFOUND" ) {
+ nbu = nb;
+ } else {
+ nbu = atoi(str_nbu.c_str() );
+ }
+
+ // Position du Bit de Poids Fort
+ str_highBit=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0102);
+
+ if (str_highBit == "UNFOUND" ) {
+ highBit = nb - 1;
+ } else {
+ highBit = atoi(str_highBit.c_str() );
+ }
+
+ // Signe des Pixels 0 : Unsigned
+ str_signe=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0103);
+
+ if (str_signe == "UNFOUND" ) {
+ signe = 1;
+ } else {
+ signe = atoi(str_signe.c_str() );
+ }
+
+ // Longueur en Octets des Pixels a lire
+ size_t _lgrTotale = nbFrames*nbLignes*nbCol*(nb/8);
+
+ //Pixels = (char *) g_malloc(_lgrTotale);
+ _Pixels = (char *) malloc(_lgrTotale);
+
+ GetPixels(lgrTotale, _Pixels);
+
+ // On remet les Octets dans le bon ordre si besoin est
+ if (nb != 8) {
+ int _sw = GetSwapCode();
+
+ _Swap (_Pixels, _sw, _lgrTotale, nb);
+ }
+
+ // On remet les Bits des Octets dans le bon ordre si besoin est
+ //
+ // ATTENTION : Jamais confronté a des pixels stockes sur 32 bits
+ // avec moins de 32 bits utilises
+ // et dont le bit de poids fort ne serait pas la ou on l'attend ...
+ // --> ne marchera pas dans ce cas
+ if (nbu!=nb){
+ mask = mask >> (nb-nbu);
+ int l=(int)_lgrTotale/(nb/8);
+ unsigned short *deb = (unsigned short *)_Pixels;
+ for(int i=0;i<l;i++) {
+ *deb = (*deb >> (nbu-highBit-1)) & mask;
+ deb ++;
+ }
+ }
+
+ printf ("on est sorti\n");
+
+ // On l'affecte à un champ du dcmFile
+
+ Pixels = _Pixels;
+ lgrTotale = _lgrTotale;
+
+ return (_Pixels);
+}
+
+
+/////////////////////////////////////////////////////////////////
+/**
+ * \ingroup gdcmFile
+ * \brief amene en mémoire dans une zone précisee par l'utilisateur
+ * \les Pixels d'une image NON COMPRESSEE
+ * \Aucun test n'est fait pour le moment sur le caractere compresse ou non de l'image
+ *
+ * @param
+ *
+ * @return
+ */
+
+int gdcmFile::PutImageDataHere (void* destination, size_t MaxSize) {
+
+ void * Pixels = destination; // pour garder le code identique avec GetImageData
int nbLignes, nbCol;
int nbFrames, nb, nbu, highBit, signe;
// Longueur en Octets des Pixels a lire
size_t lgrTotale = nbFrames*nbLignes*nbCol*(nb/8);
- //Pixels = (char *) g_malloc(lgrTotale);
- Pixels = (char *) malloc(lgrTotale);
+ // si lgrTotale < MaxSize ==> Gros pb . A VOIR
+
+ lgrTotale = MaxSize; // pour garder le code identique avec GetImageData
+ //Pixels = (char *) malloc(lgrTotale); // pour garder le code identique avec GetImageData
GetPixels(lgrTotale, Pixels);
// On remet les Octets dans le bon ordre si besoin est
if (nb != 8) {
- //int sw = GetSwapCode();
+ int _sw = GetSwapCode();
- // _Swap (Pixels, sw, lgrTotale, nb); // A REMETTRE
+ _Swap (Pixels, _sw, lgrTotale, nb);
}
// On remet les Bits des Octets dans le bon ordre si besoin est
// VOIR s'il ne faudrait pas l'affecter à un champ du dcmHeader
- return (Pixels);
+ //return (Pixels); // pour garder le code identique avec GetImageData
+ return 1;
}
-
//
// Je laisse le code integral, au cas ça puisse etre reutilise ailleurs
//
+
+/////////////////////////////////////////////////////////////////
+/**
+ * \ingroup gdcmFile
+ * \brief Ecrit sur disque les pixels d'UNE image
+ * \Aucun test n'est fait sur l'"Endiannerie" du processeur.
+ * \ C'est à l'utilisateur d'appeler son Reader correctement
+ * \(Equivalent a IdImaWriteRawFile)
+ *
+ * @param
+ *
+ * @return
+ */
+
+int gdcmFile::WriteRawData (string nomFichier) {
+
+ FILE * fp1;
+ fp1 = fopen(nomFichier.c_str(),"wb");
+ if (fp1 == NULL) {
+ printf("Echec ouverture (ecriture) Fichier [%s] \n",nomFichier.c_str());
+ return (0);
+ }
+
+ fwrite (Pixels,lgrTotale, 1, fp1);
+ fclose (fp1);
+}
+
+
git://git.creatis.insa-lyon.fr / gdcm.git / blobdiff