#include "gdcm.h"
+#define DEBUG 1
+
+static void _Swap(void* im, int swap, int lgr, int nb);
+
+/////////////////////////////////////////////////////////////////
+/**
+ * \ingroup gdcmFile
+ * \brief Constructor dedicated to writing a new DICOMV3 part10 compliant
+ * \file (see SetFileName, SetDcmTag and Write)
+ * \Opens (in read only and when possible) an existing file and checks
+ * \for DICOM compliance. Returns NULL on failure.
+ * \Note: the in-memory representation of all available tags found in
+ * \the DICOM header is post-poned to first header information access.
+ * \This avoid a double parsing of public part of the header when
+ * \one sets an a posteriori shadow dictionary (efficiency can be
+ * \seen as a side effect).
+ *
+ * @param
+ *
+ * @return
+ */
+
gdcmFile::gdcmFile(string & filename)
:gdcmHeader(filename.c_str())
{
+ if (DEBUG) printf("On a echappe a gdcmHeader !\n");
+}
+
+
+/////////////////////////////////////////////////////////////////
+/**
+ * \ingroup gdcmFile
+ * \brief Renvoie la longueur A ALLOUER pour recevoir les pixels de l'image
+ * \ ou DES images dans le cas d'un multiframe
+ * \ ATTENTION : il ne s'agit PAS de la longueur du groupe des Pixels
+ * \ (dans le cas d'images compressees, elle n'a pas de sens).
+ *
+ * @param void Rien en entree
+ *
+ * @return longueur a allouer
+ */
+
+size_t gdcmFile::GetImageDataSize(void) {
+ int nbLignes, nbCol, nbFrames, nb;
+ string str_nbFrames, str_nb;
+ // Nombre de Lignes
+ nbLignes=atoi(gdcmHeader::GetPubElValByNumber(0x0028,0x0010).c_str());
+ // Nombre de Colonnes
+ nbCol =atoi(gdcmHeader::GetPubElValByNumber(0x0028,0x0011).c_str());
+
+ // Nombre de Frames
+ str_nbFrames=gdcmHeader::GetPubElValByNumber(0x0028,0x0008);
+
+ if (str_nbFrames == "UNFOUND" ) {
+ nbFrames = 1;
+ } else {
+ nbFrames = atoi(str_nbFrames.c_str() );
+ }
+
+ // Nombre de Bits Alloues pour le stockage d'un Pixel
+ str_nb=gdcmHeader::GetPubElValByNumber(0x0028,0x0100);
+
+ if (str_nb == "UNFOUND" ) {
+ nb = 16;
+ } else {
+ nb = atoi(str_nb.c_str() );
+ }
+
+ size_t lgrTotale = nbFrames*nbLignes*nbCol*(nb/8);
+ return (lgrTotale);
+
+}
+
+/////////////////////////////////////////////////////////////////
+/**
+ * \ingroup gdcmFile
+ * \brief amene en mémoire les Pixels d'une image NON COMPRESSEE
+ * \Aucun test n'est fait pour le moment sur le caractere compresse ou non de l'image
+ *
+ * @param rien
+ *
+ * @return Pointeur sur la zone mémoire contenant les Pixels lus
+ */
+
+void * gdcmFile::GetImageData (void) {
+
+ char* _Pixels;
+ int nbLignes, nbCol;
+
+ int nbFrames, nb, nbu, highBit, signe;
+ string str_nbFrames, str_nb, str_nbu, str_highBit, str_signe;
+
+ unsigned short int mask = 0xffff;
+
+ // Nombre de Lignes
+ nbLignes=atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0010).c_str());
+ // Nombre de Colonnes
+ nbCol =atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0011).c_str());
+
+ // Nombre de Frames
+ str_nbFrames=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0008);
+
+
+ if (str_nbFrames == "UNFOUND" ) {
+ nbFrames = 1;
+ } else {
+ nbFrames = atoi(str_nbFrames.c_str() );
+ }
+
+ // Nombre de Bits Alloues
+ str_nb=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0100);
+
+ if (str_nb == "UNFOUND" ) {
+ nb = 16;
+ } else {
+ nb = atoi(str_nb.c_str() );
+ }
+
+ // Nombre de Bits Utilises
+ str_nbu=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0101);
+
+ if (str_nbu == "UNFOUND" ) {
+ nbu = nb;
+ } else {
+ nbu = atoi(str_nbu.c_str() );
+ }
+
+ // Position du Bit de Poids Fort
+ str_highBit=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0102);
+
+ if (str_highBit == "UNFOUND" ) {
+ highBit = nb - 1;
+ } else {
+ highBit = atoi(str_highBit.c_str() );
+ }
+
+ // Signe des Pixels 0 : Unsigned
+ str_signe=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0103);
+
+ if (str_signe == "UNFOUND" ) {
+ signe = 1;
+ } else {
+ signe = atoi(str_signe.c_str() );
+ }
+
+ // Longueur en Octets des Pixels a lire
+ size_t _lgrTotale = nbFrames*nbLignes*nbCol*(nb/8);
+
+ //Pixels = (char *) g_malloc(_lgrTotale);
+ _Pixels = (char *) malloc(_lgrTotale);
+
+ GetPixels(lgrTotale, _Pixels);
+
+ // On remet les Octets dans le bon ordre si besoin est
+ if (nb != 8) {
+ int _sw = GetSwapCode();
+
+ _Swap (_Pixels, _sw, _lgrTotale, nb);
+ }
+
+ // On remet les Bits des Octets dans le bon ordre si besoin est
+ //
+ // ATTENTION : Jamais confronté a des pixels stockes sur 32 bits
+ // avec moins de 32 bits utilises
+ // et dont le bit de poids fort ne serait pas la ou on l'attend ...
+ // --> ne marchera pas dans ce cas
+ if (nbu!=nb){
+ mask = mask >> (nb-nbu);
+ int l=(int)_lgrTotale/(nb/8);
+ unsigned short *deb = (unsigned short *)_Pixels;
+ for(int i=0;i<l;i++) {
+ *deb = (*deb >> (nbu-highBit-1)) & mask;
+ deb ++;
+ }
+ }
+
+ printf ("on est sorti\n");
+
+ // On l'affecte à un champ du dcmFile
+
+ Pixels = _Pixels;
+ lgrTotale = _lgrTotale;
+
+ return (_Pixels);
+}
+
+
+/////////////////////////////////////////////////////////////////
+/**
+ * \ingroup gdcmFile
+ * \brief amene en mémoire dans une zone précisee par l'utilisateur
+ * \les Pixels d'une image NON COMPRESSEE
+ * \Aucun test n'est fait pour le moment sur le caractere compresse ou non de l'image
+ *
+ * @param
+ *
+ * @return
+ */
+
+int gdcmFile::PutImageDataHere (void* destination, size_t MaxSize) {
+
+ void * Pixels = destination; // pour garder le code identique avec GetImageData
+ int nbLignes, nbCol;
+
+ int nbFrames, nb, nbu, highBit, signe;
+ string str_nbFrames, str_nb, str_nbu, str_highBit, str_signe;
+
+ unsigned short int mask = 0xffff;
+
+ // Nombre de Lignes
+ nbLignes=atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0010).c_str());
+ // Nombre de Colonnes
+ nbCol =atoi(GetPubElValByNumber(0x0028,0x0011).c_str());
+
+ // Nombre de Frames
+ str_nbFrames=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0008);
+
+
+ if (str_nbFrames == "UNFOUND" ) {
+ nbFrames = 1;
+ } else {
+ nbFrames = atoi(str_nbFrames.c_str() );
+ }
+
+ // Nombre de Bits Alloues
+ str_nb=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0100);
+
+ if (str_nb == "UNFOUND" ) {
+ nb = 16;
+ } else {
+ nb = atoi(str_nb.c_str() );
+ }
+
+ // Nombre de Bits Utilises
+ str_nbu=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0101);
+
+ if (str_nbu == "UNFOUND" ) {
+ nbu = nb;
+ } else {
+ nbu = atoi(str_nbu.c_str() );
+ }
+
+ // Position du Bit de Poids Fort
+ str_highBit=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0102);
+
+ if (str_highBit == "UNFOUND" ) {
+ highBit = nb - 1;
+ } else {
+ highBit = atoi(str_highBit.c_str() );
+ }
+
+ // Signe des Pixels
+ str_signe=GetPubElValByNumber(0x0028,0x0103);
+
+ if (str_signe == "UNFOUND" ) {
+ signe = 1;
+ } else {
+ signe = atoi(str_signe.c_str() );
+ }
+
+ // Longueur en Octets des Pixels a lire
+ size_t lgrTotale = nbFrames*nbLignes*nbCol*(nb/8);
+
+ // si lgrTotale < MaxSize ==> Gros pb . A VOIR
+
+ lgrTotale = MaxSize; // pour garder le code identique avec GetImageData
+ //Pixels = (char *) malloc(lgrTotale); // pour garder le code identique avec GetImageData
+
+ GetPixels(lgrTotale, Pixels);
+
+ // On remet les Octets dans le bon ordre si besoin est
+ if (nb != 8) {
+ int _sw = GetSwapCode();
+
+ _Swap (Pixels, _sw, lgrTotale, nb);
+ }
+ // On remet les Bits des Octets dans le bon ordre si besoin est
+ //
+ // ATTENTION : Jamais confronté a des pixels stockes sur 32 bits
+ // avec moins de 32 bits utilises
+ // et dont le bit de poids fort ne serait pas la ou on l'attend ...
+ // --> ne marchera pas dans ce cas
+ if (nbu!=nb){
+ mask = mask >> (nb-nbu);
+ int l=(int)lgrTotale/(nb/8);
+ unsigned short *deb = (unsigned short *)Pixels;
+ for(int i=0;i<l;i++) {
+ *deb = (*deb >> (nbu-highBit-1)) & mask;
+ deb ++;
+ }
+ }
+
+ printf ("on est sorti\n");
+
+ // VOIR s'il ne faudrait pas l'affecter à un champ du dcmHeader
+
+ //return (Pixels); // pour garder le code identique avec GetImageData
+ return 1;
+}
+
+//
+// Je laisse le code integral, au cas ça puisse etre reutilise ailleurs
+//
+
+static void _Swap(void* im, int swap, int lgr, int nb) {
+guint32 s32;
+guint16 fort,faible;
+int i;
+
+if(nb == 16)
+
+ switch(swap) {
+ case 0:
+ case 12:
+ case 1234:
+ break;
+
+ case 21:
+ case 3412:
+ case 2143:
+ case 4321:
+
+ for(i=0;i<lgr;i++)
+ ((unsigned short int*)im)[i]= ((((unsigned short int*)im)[i])>>8)
+ | ((((unsigned short int*)im)[i])<<8);
+ break;
+
+ default:
+ printf("valeur de SWAP (16 bits) non autorisee : %d\n", swap);
+ }
+
+if( nb == 32 )
+
+ switch (swap) {
+ case 0:
+ case 1234:
+ break;
+
+ case 4321:
+ for(i=0;i<lgr;i++) {
+ faible= ((unsigned long int*)im)[i]&0x0000ffff; /* 4321 */
+ fort =((unsigned long int*)im)[i]>>16;
+ fort= (fort>>8) | (fort<<8);
+ faible=(faible>>8) | (faible<<8);
+ s32=faible;
+ ((unsigned long int*)im)[i]=(s32<<16)|fort;
+ }
+ break;
+
+ case 2143:
+ for(i=0;i<lgr;i++) {
+ faible= ((unsigned long int*)im)[i]&0x0000ffff; /* 2143 */
+ fort=((unsigned long int*)im)[i]>>16;
+ fort= (fort>>8) | (fort<<8);
+ faible=(faible>>8) | (faible<<8);
+ s32=fort;
+ ((unsigned long int*)im)[i]=(s32<<16)|faible;
+ }
+ break;
+
+ case 3412:
+ for(i=0;i<lgr;i++) {
+ faible= ((unsigned long int*)im)[i]&0x0000ffff; /* 3412 */
+ fort=((unsigned long int*)im)[i]>>16;
+ s32=faible;
+ ((unsigned long int*)im)[i]=(s32<<16)|fort;
+ }
+ break;
+
+ default:
+ printf("valeur de SWAP (32 bits) non autorisee : %d\n", swap);
+ }
+return;
}
+
+
+
+
+/////////////////////////////////////////////////////////////////
+/**
+ * \ingroup gdcmFile
+ * \brief Ecrit sur disque les pixels d'UNE image
+ * \Aucun test n'est fait sur l'"Endiannerie" du processeur.
+ * \ C'est à l'utilisateur d'appeler son Reader correctement
+ * \(Equivalent a IdImaWriteRawFile)
+ *
+ * @param
+ *
+ * @return
+ */
+
+int gdcmFile::WriteRawData (string nomFichier) {
+
+ FILE * fp1;
+ fp1 = fopen(nomFichier.c_str(),"wb");
+ if (fp1 == NULL) {
+ printf("Echec ouverture (ecriture) Fichier [%s] \n",nomFichier.c_str());
+ return (0);
+ }
+
+ fwrite (Pixels,lgrTotale, 1, fp1);
+ fclose (fp1);
+}
+
+
git://git.creatis.insa-lyon.fr / gdcm.git / blobdiff