]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmFile.cxx
STYLE: remove cout
[gdcm.git] / src / gdcmFile.cxx
index b26c57d831b59495ceb2d1c672dbccbe757b29c4..ef4814503b16b88530e0f8f05b890d40f892a784 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmFile.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2005/10/23 15:26:43 $
-  Version:   $Revision: 1.289 $
+  Date:      $Date: 2005/10/27 09:52:33 $
+  Version:   $Revision: 1.298 $
                                                                                 
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
@@ -233,7 +233,7 @@ bool File::DoTheLoadingJob( )
             DictEntry* newDict = DictEntry::New(GrPixel,NumPixel,
                                                 PixelVR,"1","Pixel Data");
 
-            DataEntry *newEntry = new DataEntry(newDict);
+            DataEntry *newEntry = DataEntry::New(newDict);
             newDict->Delete();
             newEntry->Copy(entry);
             newEntry->SetBinArea(oldEntry->GetBinArea(),oldEntry->IsSelfArea());
@@ -241,6 +241,7 @@ bool File::DoTheLoadingJob( )
 
             RemoveEntry(oldEntry);
             AddEntry(newEntry);
+            newEntry->Delete();
          }
       }
    }
@@ -490,7 +491,7 @@ float File::GetXSpacing()
       nbValue = entry->GetValueCount();
       if( nbValue >= 3 )
          xspacing = (float)entry->GetValue(2);
-      if( nbValue >= 2 )
+      else if( nbValue >= 2 )
          xspacing = (float)entry->GetValue(1);
       else
          xspacing = (float)entry->GetValue(0);
@@ -630,7 +631,10 @@ float File::GetXOrigin()
 
    if( entry->GetValueCount() == 3 )
    {
-      gdcmAssertMacro( entry->IsValueCountValid() );
+      if (!entry->IsValueCountValid() )
+      {
+         gdcmErrorMacro( "Invalid Value Count" );
+      }
       return (float)entry->GetValue(0);
    }
    return 0.0f;
@@ -658,7 +662,10 @@ float File::GetYOrigin()
 
    if( entry->GetValueCount() == 3 )
    {
-      gdcmAssertMacro( entry->IsValueCountValid() );
+      if (!entry->IsValueCountValid() )
+      {
+         gdcmErrorMacro( "Invalid Value Count" );
+      }
       return (float)entry->GetValue(1);
    }
    return 0.0f;
@@ -679,7 +686,10 @@ float File::GetZOrigin()
    {
       if( entry->GetValueCount() == 3 )
       {
-         gdcmAssertMacro( entry->IsValueCountValid() );
+         if (!entry->IsValueCountValid() )
+         {
+            gdcmErrorMacro( "Invalid Value Count" );
+         }
          return (float)entry->GetValue(2);
       }
       gdcmWarningMacro( "Wrong Image Position Patient (0020,0032)");
@@ -691,7 +701,10 @@ float File::GetZOrigin()
    {
       if( entry->GetValueCount() == 3 )
       {
-         gdcmAssertMacro( entry->IsValueCountValid() );
+         if (!entry->IsValueCountValid() )
+         {
+            gdcmErrorMacro( "Invalid Value Count" );
+         }
          return (float)entry->GetValue(2);
       }
       gdcmWarningMacro( "Wrong Image Position (RET) (0020,0030)");
@@ -704,7 +717,10 @@ float File::GetZOrigin()
    {
       if( entry->GetValueCount() == 1 )
       {
-         gdcmAssertMacro( entry->IsValueCountValid() );
+         if (!entry->IsValueCountValid() )
+         {
+            gdcmErrorMacro( "Invalid Value Count" );
+         }
          return (float)entry->GetValue(0); // VM=1 !
       }
       gdcmWarningMacro( "Wrong Slice Location (0020,1041)");
@@ -716,7 +732,10 @@ float File::GetZOrigin()
    {
       if( entry->GetValueCount() == 1 )
       {
-         gdcmAssertMacro( entry->IsValueCountValid() );
+         if (!entry->IsValueCountValid() )
+         {
+            gdcmErrorMacro( "Invalid Value Count" );
+         }
          return (float)entry->GetValue(0);
       }
       gdcmWarningMacro( "Wrong Location (0020,0050)");
@@ -844,7 +863,6 @@ int File::GetPlanarConfiguration()
    DataEntry *entry = GetDataEntry(0x0028,0x0006);
    if( !entry )
    {
-      gdcmWarningMacro( "Not found : Planar Configuration (0028,0006)");
       return 0;
    }
    return (int)entry->GetValue(0);
@@ -1455,10 +1473,10 @@ bool File::Write(std::string fileName, FileType writetype)
 
    // Derma?.dcm does not have it...let's remove it  FIXME FIXME
    if( writetype != JPEG )
-     {
+   {
      int i_lgPix = GetEntryLength(GrPixel, NumPixel);
      if (i_lgPix != -2)
-       {
+     {
        // no (GrPixel, NumPixel) element
        std::string s_lgPix = Util::Format("%d", i_lgPix+12);
        s_lgPix = Util::DicomString( s_lgPix.c_str() );
@@ -1658,7 +1676,7 @@ void File::ComputeJPEGFragmentInfo()
 
 /**
  * \brief   Assuming the internal file pointer \ref Document::Fp 
- *          is placed at the beginning of a tag check whether this
+ *          is placed at the beginning of a tag, check whether this
  *          tag is (TestGroup, TestElem).
  * \warning On success the internal file pointer \ref Document::Fp
  *          is modified to point after the tag.
@@ -1693,15 +1711,17 @@ bool File::ReadTag(uint16_t testGroup, uint16_t testElem)
       return false;
    }
    if ( itemTagGroup != testGroup || itemTagElem != testElem )
-   {
-      gdcmErrorMacro( "Wrong Item Tag found:"
-       << "   We should have found tag ("
-       << DictEntry::TranslateToKey(testGroup,testElem) << ")" << std::endl
-       << "   but instead we encountered tag ("
-       << DictEntry::TranslateToKey(itemTagGroup,itemTagElem) << ")"
-       << "  at address: " << "  0x(" << std::hex 
-       << (unsigned int)currentPosition  << std::dec << ")" 
-       ) ;
+   { 
+       // in order not to pollute output we don't warn on 'delimitors'
+      if (itemTagGroup != 0xfffe ||  testGroup != 0xfffe )
+         gdcmErrorMacro( "Wrong Item Tag found:"
+          << "   We should have found tag ("
+          << DictEntry::TranslateToKey(testGroup,testElem) << ")" << std::endl
+          << "   but instead we encountered tag ("
+          << DictEntry::TranslateToKey(itemTagGroup,itemTagElem) << ")"
+          << "  at address: " << "  0x(" << std::hex 
+          << (unsigned int)currentPosition  << std::dec << ")" 
+          ) ;
       Fp->seekg(positionOnEntry, std::ios::beg);
 
       return false;
@@ -1728,7 +1748,9 @@ uint32_t File::ReadTagLength(uint16_t testGroup, uint16_t testElem)
 
    if ( !ReadTag(testGroup, testElem) )
    {
-      gdcmErrorMacro( "ReadTag did not succeed for ("
+      // Avoid polutting output
+      if ( testGroup != 0xfffe ) 
+         gdcmErrorMacro( "ReadTag did not succeed for ("
                     << DictEntry::TranslateToKey(testGroup,testElem) 
                     << ")..." );
       return 0;
@@ -1785,21 +1807,6 @@ void File::ReadEncapsulatedBasicOffsetTable()
 // These are the deprecated method that one day should be removed (after the next release)
 
 #ifndef GDCM_LEGACY_REMOVE
-/*
- *  brief  Constructor (DEPRECATED : temporaryly kept not to break the API)
- *  param  filename name of the file whose header we want to analyze
- *  deprecated do not use any longer
- */
-File::File( std::string const &filename )
-     :Document( )
-{    
-   RLEInfo  = new RLEFramesInfo;
-   JPEGInfo = new JPEGFragmentsInfo;
-
-   SetFileName( filename );
-   Load( ); // gdcm::Document is first Loaded, then the 'File part'
-}
-
 /*
  * \ brief   Loader. (DEPRECATED :  temporaryly kept not to break the API)
  * @ param   fileName file to be open for parsing