]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmPixelReadConvert.cxx
Coding Style + Doxygenation
[gdcm.git] / src / gdcmPixelReadConvert.cxx
index c51dc4fd89813471bd4c1257ff68ee474ba0eeb9..07c2fd94c5e158a7869e73e544be8286484348c8 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmPixelReadConvert.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2004/12/13 14:58:41 $
-  Version:   $Revision: 1.9 $
+  Date:      $Date: 2005/01/06 20:03:28 $
+  Version:   $Revision: 1.14 $
                                                                                 
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
@@ -41,21 +41,21 @@ bool gdcm_read_JPEG2000_file (std::ifstream* fp, void* image_buffer);
 
 #define JOCTET uint8_t
 // For JPEG 8 Bits, body in file gdcmJpeg8.cxx
-bool gdcm_read_JPEG_file8 (std::ifstream* fp, void* image_buffer);
-bool gdcm_read_JPEG_memory8    (const JOCTETbuffer, const size_t buflen, 
-                                voidimage_buffer,
+bool gdcm_read_JPEG_file8 (std::ifstream *fp, void *image_buffer);
+bool gdcm_read_JPEG_memory8    (const JOCTET *buffer, const size_t buflen, 
+                                void *image_buffer,
                                 size_t *howManyRead, size_t *howManyWritten);
 //
 // For JPEG 12 Bits, body in file gdcmJpeg12.cxx
-bool gdcm_read_JPEG_file12 (std::ifstream* fp, void* image_buffer);
+bool gdcm_read_JPEG_file12 (std::ifstream *fp, void *image_buffer);
 bool gdcm_read_JPEG_memory12   (const JOCTET *buffer, const size_t buflen, 
-                                voidimage_buffer,
+                                void *image_buffer,
                                 size_t *howManyRead, size_t *howManyWritten);
 
 // For JPEG 16 Bits, body in file gdcmJpeg16.cxx
 // Beware this is misleading there is no 16bits DCT algorithm, only
 // jpeg lossless compression exist in 16bits.
-bool gdcm_read_JPEG_file16 (std::ifstream* fp, void* image_buffer);
+bool gdcm_read_JPEG_file16 (std::ifstream *fp, void *image_buffer);
 bool gdcm_read_JPEG_memory16   (const JOCTET *buffer, const size_t buflen, 
                                 void* image_buffer,
                                 size_t *howManyRead, size_t *howManyWritten);
@@ -121,7 +121,7 @@ void PixelReadConvert::AllocateRaw()
  * \brief Read from file a 12 bits per pixel image and decompress it
  *        into a 16 bits per pixel image.
  */
-void PixelReadConvert::ReadAndDecompress12BitsTo16Bits( std::ifstreamfp )
+void PixelReadConvert::ReadAndDecompress12BitsTo16Bits( std::ifstream *fp )
                throw ( FormatError )
 {
    int nbPixels = XSize * YSize;
@@ -175,24 +175,24 @@ void PixelReadConvert::ReadAndDecompress12BitsTo16Bits( std::ifstream* fp )
  */
 bool PixelReadConvert::DecompressRLE16BitsFromRLE8Bits( int NumberOfFrames )
 {
-   size_t PixelNumber = XSize * YSize;
-   size_t RawSize = XSize * YSize * NumberOfFrames;
+   size_t pixelNumber = XSize * YSize;
+   size_t rawSize = XSize * YSize * NumberOfFrames;
 
    // We assumed Raw contains the decoded RLE pixels but as
    // 8 bits per pixel. In order to convert those pixels to 16 bits
    // per pixel we cannot work in place within Raw and hence
    // we copy it in a safe place, say copyRaw.
 
-   uint8_t* copyRaw = new uint8_t[ RawSize * 2 ];
-   memmove( copyRaw, Raw, RawSize * 2 );
+   uint8_t* copyRaw = new uint8_t[ rawSize * 2 ];
+   memmove( copyRaw, Raw, rawSize * 2 );
 
    uint8_t* x = Raw;
    uint8_t* a = copyRaw;
-   uint8_t* b = a + PixelNumber;
+   uint8_t* b = a + pixelNumber;
 
    for ( int i = 0; i < NumberOfFrames; i++ )
    {
-      for ( unsigned int j = 0; j < PixelNumber; j++ )
+      for ( unsigned int j = 0; j < pixelNumber; j++ )
       {
          *(x++) = *(b++);
          *(x++) = *(a++);
@@ -216,10 +216,10 @@ bool PixelReadConvert::DecompressRLE16BitsFromRLE8Bits( int NumberOfFrames )
  * @param fp File Pointer: on entry the position should be the one of
  *        the fragment to be decoded.
  */
-bool PixelReadConvert::ReadAndDecompressRLEFragment( uint8_tsubRaw,
+bool PixelReadConvert::ReadAndDecompressRLEFragment( uint8_t *subRaw,
                                                  long fragmentSize,
                                                  long RawSegmentSize,
-                                                 std::ifstreamfp )
+                                                 std::ifstream *fp )
 {
    int8_t count;
    long numberOfOutputBytes = 0;
@@ -274,9 +274,9 @@ bool PixelReadConvert::ReadAndDecompressRLEFragment( uint8_t* subRaw,
  *            at which the pixel data should be copied
  * @return    Boolean
  */
-bool PixelReadConvert::ReadAndDecompressRLEFile( std::ifstreamfp )
+bool PixelReadConvert::ReadAndDecompressRLEFile( std::ifstream *fp )
 {
-   uint8_tsubRaw = Raw;
+   uint8_t *subRaw = Raw;
    long RawSegmentSize = XSize * YSize;
 
    // Loop on the frame[s]
@@ -315,7 +315,7 @@ void PixelReadConvert::ConvertSwapZone()
 
    if( BitsAllocated == 16 )
    {
-      uint16_tim16 = (uint16_t*)Raw;
+      uint16_t *im16 = (uint16_t*)Raw;
       switch( SwapCode )
       {
          case 0:
@@ -421,9 +421,9 @@ void PixelReadConvert::ConvertReorderEndianity()
  * @param     fp File Pointer
  * @return    Boolean
  */
-bool PixelReadConvert::ReadAndDecompressJPEGFramesFromFile( std::ifstreamfp )
+bool PixelReadConvert::ReadAndDecompressJPEGFramesFromFile( std::ifstream *fp )
 {
-   uint8_tlocalRaw = Raw;
+   uint8_t *localRaw = Raw;
    // Loop on the fragment[s]
    for( JPEGFragmentsInfo::JPEGFragmentsList::iterator
         it  = JPEGInfo->Fragments.begin();
@@ -485,7 +485,7 @@ bool PixelReadConvert::ReadAndDecompressJPEGFramesFromFile( std::ifstream* fp )
  * @return    Boolean
  */
 bool PixelReadConvert::
-ReadAndDecompressJPEGSingleFrameFragmentsFromFile( std::ifstreamfp )
+ReadAndDecompressJPEGSingleFrameFragmentsFromFile( std::ifstream *fp )
 {
    // Loop on the fragment[s] to get total length
    size_t totalLength = 0;
@@ -501,7 +501,6 @@ ReadAndDecompressJPEGSingleFrameFragmentsFromFile( std::ifstream* fp )
    JOCTET *buffer = new JOCTET [totalLength];
    JOCTET *p = buffer;
 
-   uint8_t* localRaw = Raw;
    // Loop on the fragment[s]
    for( it  = JPEGInfo->Fragments.begin();
         it != JPEGInfo->Fragments.end();
@@ -515,7 +514,6 @@ ReadAndDecompressJPEGSingleFrameFragmentsFromFile( std::ifstream* fp )
 
    size_t howManyRead = 0;
    size_t howManyWritten = 0;
-   size_t fragmentLength = 0;
    
    if ( BitsStored == 8)
    {
@@ -579,12 +577,12 @@ ReadAndDecompressJPEGSingleFrameFragmentsFromFile( std::ifstream* fp )
  * @return    Boolean
  */
 bool PixelReadConvert::
-ReadAndDecompressJPEGFragmentedFramesFromFile( std::ifstreamfp )
+ReadAndDecompressJPEGFragmentedFramesFromFile( std::ifstream *fp )
 {
    // Loop on the fragment[s] to get total length
    size_t totalLength = 0;
-   for( JPEGFragmentsInfo::JPEGFragmentsList::iterator
-        it  = JPEGInfo->Fragments.begin();
+   JPEGFragmentsInfo::JPEGFragmentsList::iterator it;
+   for( it  = JPEGInfo->Fragments.begin();
         it != JPEGInfo->Fragments.end();
         ++it )
    {
@@ -595,10 +593,8 @@ ReadAndDecompressJPEGFragmentedFramesFromFile( std::ifstream* fp )
    JOCTET *buffer = new JOCTET [totalLength];
    JOCTET *p = buffer;
 
-   uint8_t* localRaw = Raw;
    // Loop on the fragment[s]
-   for( JPEGFragmentsInfo::JPEGFragmentsList::iterator
-        it  = JPEGInfo->Fragments.begin();
+   for( it  = JPEGInfo->Fragments.begin();
         it != JPEGInfo->Fragments.end();
         ++it )
    {
@@ -612,8 +608,7 @@ ReadAndDecompressJPEGFragmentedFramesFromFile( std::ifstream* fp )
    size_t howManyWritten = 0;
    size_t fragmentLength = 0;
    
-   for( JPEGFragmentsInfo::JPEGFragmentsList::iterator
-        it  = JPEGInfo->Fragments.begin() ;
+   for( it  = JPEGInfo->Fragments.begin() ;
         (it != JPEGInfo->Fragments.end()) && (howManyRead < totalLength);
         ++it )
    {
@@ -681,7 +676,7 @@ ReadAndDecompressJPEGFragmentedFramesFromFile( std::ifstream* fp )
  * @param     fp File Pointer
  * @return    Boolean
  */
-bool PixelReadConvert::ReadAndDecompressJPEGFile( std::ifstreamfp )
+bool PixelReadConvert::ReadAndDecompressJPEGFile( std::ifstream *fp )
 {
    if ( IsJPEG2000 )
    {
@@ -697,7 +692,7 @@ bool PixelReadConvert::ReadAndDecompressJPEGFile( std::ifstream* fp )
       // read from it
       return ReadAndDecompressJPEGSingleFrameFragmentsFromFile( fp );
    }
-   else if (JPEGInfo->Fragments.size() == ZSize)
+   else if (JPEGInfo->Fragments.size() == (size_t)ZSize)
    {
       // suppose each fragment is a frame
       return ReadAndDecompressJPEGFramesFromFile( fp );
@@ -757,8 +752,8 @@ bool PixelReadConvert::ConvertReArrangeBits() throw ( FormatError )
  */
 void PixelReadConvert::ConvertYcBcRPlanesToRGBPixels()
 {
-   uint8_tlocalRaw = Raw;
-   uint8_tcopyRaw = new uint8_t[ RawSize ];
+   uint8_t *localRaw = Raw;
+   uint8_t *copyRaw = new uint8_t[ RawSize ];
    memmove( copyRaw, localRaw, RawSize );
 
    // to see the tricks about YBR_FULL, YBR_FULL_422,
@@ -769,9 +764,9 @@ void PixelReadConvert::ConvertYcBcRPlanesToRGBPixels()
    int l        = XSize * YSize;
    int nbFrames = ZSize;
 
-   uint8_ta = copyRaw;
-   uint8_tb = copyRaw + l;
-   uint8_tc = copyRaw + l + l;
+   uint8_t *a = copyRaw;
+   uint8_t *b = copyRaw + l;
+   uint8_t *c = copyRaw + l + l;
    double R, G, B;
 
    /// \todo : Replace by the 'well known' integer computation
@@ -811,8 +806,8 @@ void PixelReadConvert::ConvertYcBcRPlanesToRGBPixels()
  */
 void PixelReadConvert::ConvertRGBPlanesToRGBPixels()
 {
-   uint8_tlocalRaw = Raw;
-   uint8_tcopyRaw = new uint8_t[ RawSize ];
+   uint8_t *localRaw = Raw;
+   uint8_t *copyRaw = new uint8_t[ RawSize ];
    memmove( copyRaw, localRaw, RawSize );
 
    int l = XSize * YSize * ZSize;
@@ -830,7 +825,7 @@ void PixelReadConvert::ConvertRGBPlanesToRGBPixels()
    delete[] copyRaw;
 }
 
-bool PixelReadConvert::ReadAndDecompressPixelData( std::ifstreamfp )
+bool PixelReadConvert::ReadAndDecompressPixelData( std::ifstream *fp )
 {
    // ComputeRawAndRGBSizes is already made by 
    // ::GrabInformationsFromHeader. So, the structure sizes are
@@ -1027,7 +1022,7 @@ void PixelReadConvert::ComputeRawAndRGBSizes()
    }
 }
 
-void PixelReadConvert::GrabInformationsFromHeader( Headerheader )
+void PixelReadConvert::GrabInformationsFromHeader( Header *header )
 {
    // Number of Bits Allocated for storing a Pixel is defaulted to 16
    // when absent from the header.
@@ -1086,7 +1081,6 @@ void PixelReadConvert::GrabInformationsFromHeader( Header* header )
    if ( HasLUT )
    {
       // Just in case some access to a Header element requires disk access.
-      // Note: gdcmDocument::Fp is leaved open after OpenFile.
       LutRedDescriptor   = header->GetEntryByNumber( 0x0028, 0x1101 );
       LutGreenDescriptor = header->GetEntryByNumber( 0x0028, 0x1102 );
       LutBlueDescriptor  = header->GetEntryByNumber( 0x0028, 0x1103 );
@@ -1308,6 +1302,15 @@ bool PixelReadConvert::BuildRGBImage()
    return true;
 }
 
+/**
+ * \brief        Print self.
+ * @param os     Stream to print to.
+ */
+void PixelReadConvert::Print( std::ostream &os )
+{
+   Print("",os);
+}
+
 /**
  * \brief        Print self.
  * @param indent Indentation string to be prepended during printing.
@@ -1320,10 +1323,10 @@ void PixelReadConvert::Print( std::string indent, std::ostream &os )
       << std::endl;
    os << indent
       << "Pixel Data: offset " << PixelOffset
-      << " x" << std::hex << PixelOffset << std::dec
-      << "   length " << PixelDataLength
-      << " x" << std::hex << PixelDataLength << std::dec
-      << std::endl;
+      << " x(" << std::hex << PixelOffset << std::dec
+      << ")   length " << PixelDataLength
+      << " x(" << std::hex << PixelDataLength << std::dec
+      << ")" << std::endl;
 
    if ( IsRLELossless )
    {