]> Creatis software - gdcm.git/blobdiff - src/gdcmSeqEntry.cxx
Fix mistypings
[gdcm.git] / src / gdcmSeqEntry.cxx
index 78911b138de921deae81b062e55830db0d8a54f0..7b047295c3205a8fdd7190561e10987e32d0ba23 100644 (file)
@@ -3,8 +3,8 @@
   Program:   gdcm
   Module:    $RCSfile: gdcmSeqEntry.cxx,v $
   Language:  C++
-  Date:      $Date: 2005/01/24 16:10:53 $
-  Version:   $Revision: 1.50 $
+  Date:      $Date: 2007/10/08 15:20:17 $
+  Version:   $Revision: 1.72 $
                                                                                 
   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
 #include <iomanip>
 #include <fstream>
 
-namespace gdcm 
+namespace GDCM_NAME_SPACE 
 {
-
 //-----------------------------------------------------------------------------
+// Constructor / Destructor
+
 // Constructor / Destructor
 /**
  * \brief   Constructor from a given SeqEntry
  */
-SeqEntry::SeqEntry( DictEntry *e ) 
-             : DocEntry(e)
+SeqEntry::SeqEntry( uint16_t group,uint16_t elem ) 
+             : DocEntry(group, elem, "SQ")
 {
    Length       = 0;
    ReadLength   = 0xffffffff;
@@ -47,12 +48,13 @@ SeqEntry::SeqEntry( DictEntry *e )
 }
 
 /**
- * \brief   Constructor from a given SeqEntry
+ * \brief   Constructor from a given DocEntry
  * @param   e Pointer to existing Doc entry
  * @param   depth depth level of the current Seq entry
  */
 SeqEntry::SeqEntry( DocEntry *e, int depth )
-             : DocEntry( e->GetDictEntry() )
+             //: DocEntry( e->GetDictEntry() )
+            : DocEntry( e->GetGroup(), e->GetElement(), "SQ" /*e->GetVR()*/ )
 {
    Length       = 0;
    ReadLength   = 0xffffffff;
@@ -68,57 +70,7 @@ SeqEntry::SeqEntry( DocEntry *e, int depth )
  */
 SeqEntry::~SeqEntry()
 {
-   for(ListSQItem::iterator cc = Items.begin(); cc != Items.end(); ++cc)
-   {
-      delete *cc;
-   }
-   if (SeqTerm)
-   {
-      delete SeqTerm;
-   }
-}
-
-//-----------------------------------------------------------------------------
-// Print
-/**
- * \brief   canonical Printer
- */
-void SeqEntry::Print( std::ostream &os, std::string const & )
-{
-   // First, Print the Dicom Element itself.
-   os << "S ";
-   DocEntry::Print(os);
-   os << std::endl;
-
-   if (GetReadLength() == 0)
-      return;
-
-   // Then, Print each SQ Item   
-   for(ListSQItem::iterator cc = Items.begin(); cc != Items.end(); ++cc)
-   {
-      (*cc)->SetPrintLevel(PrintLevel);
-      (*cc)->Print(os);   
-   }
-
-   // at end, print the sequence terminator item, if any
-   if (DelimitorMode)
-   {
-      for ( int i = 0; i < SQDepthLevel; i++ )
-      {
-         os << "   | " ;
-      }
-      if (SeqTerm != NULL)
-      {
-         SeqTerm->SetPrintLevel(PrintLevel);
-         SeqTerm->Print(os);
-         os << std::endl;
-      } 
-      else 
-      {
-         // fuse
-         gdcmVerboseMacro("  -------- should have a sequence terminator item");
-      }
-   }                    
+   ClearSQItem();
 }
 
 //-----------------------------------------------------------------------------
@@ -128,21 +80,23 @@ void SeqEntry::Print( std::ostream &os, std::string const & )
  * @param fp pointer to an already open file
  * @param filetype type of the file (ACR, ImplicitVR, ExplicitVR, ...)
  */
-void SeqEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
+void SeqEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype, bool , bool )
 {
    uint16_t seq_term_gr = 0xfffe;
    uint16_t seq_term_el = 0xe0dd;
-   uint32_t seq_term_lg = 0xffffffff;
-
-   //uint16_t item_term_gr = 0xfffe;
-   //uint16_t item_term_el = 0xe00d;
-   
-   DocEntry::WriteContent(fp, filetype);
+   uint32_t seq_term_lg = 0x00000000;
+   // ignore 'Zero length' Sequences
+   if ( GetReadLength() == 0 )
+      return;
+   // false : we are not in MetaElements
+   // true : we are inside a Sequence
+   DocEntry::WriteContent(fp, filetype, false, true);
    for(ListSQItem::iterator cc  = Items.begin();
                             cc != Items.end();
                           ++cc)
-   {        
-      (*cc)->WriteContent(fp, filetype);
+   {   
+      (*cc)->WriteContent(fp, filetype, false, true);
    }
    
    // we force the writting of a Sequence Delimitation item
@@ -152,6 +106,56 @@ void SeqEntry::WriteContent(std::ofstream *fp, FileType filetype)
    binary_write(*fp, seq_term_lg);
 }
 
+/**
+ * \brief   Compute the full length of the SeqEntry (not only value
+ *          length) depending on the VR.
+ */
+uint32_t SeqEntry::ComputeFullLength()
+{
+   uint32_t l = 12; // Tag (4) + VR (explicit) 4 + 4 (length);   
+   for(ListSQItem::iterator cc  = Items.begin();
+                            cc != Items.end();
+                          ++cc)
+   {        
+      l += (*cc)->ComputeFullLength();
+   }   
+   l += 8; // seq_term Tag (4) +  seq_term_lg (4)
+   return l;
+}
+
+/**
+ * \brief   adds the passed ITEM to the ITEM chained List for this SeQuence.
+ * @param sqItem SQItem to be pushed back in the SeqEntry
+ * @param itemNumber ordinal number of the SQItem
+ *  \note NOT end-user intendend method !
+ */
+void SeqEntry::AddSQItem(SQItem *sqItem, int itemNumber)
+{
+// FIXME : SQItemNumber is supposed to be the ordinal number of the SQItem
+//         within the Sequence.
+//         Either only 'push_back' is allowed, 
+//                and we just have to do something like SeqEntry::lastNb++
+//         Or we can add (or remove) anywhere, and SQItemNumber will be broken
+   sqItem->SetSQItemNumber(itemNumber);
+   Items.push_back(sqItem);
+   sqItem->Register();
+}
+
+/**
+ * \brief Remove all SQItem.
+ */
+void SeqEntry::ClearSQItem()
+{
+   for(ListSQItem::iterator cc = Items.begin(); cc != Items.end(); ++cc)
+   {
+      (*cc)->Unregister();
+   }
+   if (SeqTerm)
+   {
+      SeqTerm->Unregister();
+   }
+}
+
 /**
  * \brief   Get the first entry while visiting the SeqEntry
  * \return  The first SQItem if found, otherwhise NULL
@@ -184,7 +188,7 @@ SQItem *SeqEntry::GetNextSQItem()
 /**
  * \brief return a pointer to the SQItem referenced by its ordinal number.
  *        Returns the first item when argument is negative.
- *        Returns the last item when argument is bigger than the total
+ *        Returns the  last item when argument is bigger than the total
  *        item number.
  */
 SQItem *SeqEntry::GetSQItem(int nb)
@@ -206,26 +210,109 @@ SQItem *SeqEntry::GetSQItem(int nb)
    return *(Items.end());
 }
 
-/// \brief retuens the number of SQItems within the current Sequence
+/**
+ * \brief returns the number of SQItems within the current Sequence
+ */
 unsigned int SeqEntry::GetNumberOfSQItems()
 {
    return Items.size();
 }
 
-/// \brief   adds the passed ITEM to the ITEM chained List for this SeQuence.
-void SeqEntry::AddSQItem(SQItem *sqItem, int itemNumber)
+/**
+ * \brief Sets the Sequence Delimitation Item
+ * \param e Delimitation item
+ */
+void SeqEntry::SetDelimitationItem(DocEntry *e)
 {
-   sqItem->SetSQItemNumber(itemNumber);
-   Items.push_back(sqItem);
+   if( SeqTerm != e )
+   {
+      if( SeqTerm )
+         SeqTerm->Unregister();
+      SeqTerm = e;
+      if( SeqTerm )
+         SeqTerm->Register();
+   }
+}
+
+/**
+ * \brief Copies all the attributes from an other DocEntry 
+ * @param doc entry to copy from
+ * @remarks The contained SQItems a not copied, only referenced
+ */
+void SeqEntry::Copy(DocEntry *doc)
+{
+   // Delete previous SQ items
+   ClearSQItem();
+
+   DocEntry::Copy(doc);
+   SeqEntry *entry = dynamic_cast<SeqEntry *>(doc);
+   if ( entry )
+   {
+      DelimitorMode = entry->DelimitorMode;
+      SQDepthLevel = entry->SQDepthLevel;
+
+      SeqTerm = entry->SeqTerm;
+      if(SeqTerm)
+         SeqTerm->Register();
+      Items = entry->Items;
+      for(ItSQItem = Items.begin();ItSQItem != Items.end(); ++ItSQItem)
+      {
+         (*ItSQItem)->Register();
+      }
+   }
 }
 
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Protected
 
-
 //-----------------------------------------------------------------------------
 // Private
 
 //-----------------------------------------------------------------------------
-} // end namespace gdcm
+// Print
+/**
+ * \brief   canonical Printer
+ */
+void SeqEntry::Print( std::ostream &os, std::string const & )
+{
+   // os << "S ";
+   
+   // First, Print the common part (vr [length offset] name).
+   DocEntry::Print(os);
+   os << std::endl;
+
+   if (GetReadLength() == 0)
+      return;
+
+   // Then, Print each SQ Item   
+   for(ListSQItem::iterator cc = Items.begin(); cc != Items.end(); ++cc)
+   {
+      (*cc)->SetPrintLevel(PrintLevel);
+      (*cc)->Print(os);   
+   }
 
+   // at end, print the sequence terminator item, if any
+   if (DelimitorMode)
+   {
+      int i;
+      for ( i = 0; i < SQDepthLevel; i++ )
+         os << "   | " ;
+      os << " --- "  << std::endl;
+      for ( i = 0; i < SQDepthLevel; i++ )
+         os << "   | " ;
+      if (SeqTerm != NULL)
+      {
+         SeqTerm->SetPrintLevel(PrintLevel);
+         SeqTerm->Print(os);
+         os << std::endl;
+      } 
+      else 
+      {
+         // fuse
+         gdcmWarningMacro("  -------- should have a sequence terminator item");
+      }
+   }
+}
+
+//-----------------------------------------------------------------------------
+} // end namespace gdcm