]> Creatis software - clitk.git/blobdiff - tools/clitkDicom2Image.ggo
Add reverse flag in clitkDicom2Image
[clitk.git] / tools / clitkDicom2Image.ggo
index daf0a5bb2e0353fcbe4fa4a9b1184f62b5ffb5c3..8563d469641c517ced46ed01dc58cb6b0ff35c93 100644 (file)
@@ -1,11 +1,13 @@
 # file clitkDicom2Image.ggo
 package "clitk"
-version "Try to convert a DICOM into an image (.hdr, .vox...)"
+version "Try to convert a DICOM into an image (.hdr, .vox...) identifying all available series"
 
-option "config"                 -      "Config file"            string         no
-option "verbose"        v "Verbose"                     flag off
-option "tolerance"      t "Tolerance for slice position"        double default="0" no
-option "output"      o "Output image filename"         string  yes
-option "std_input"   - "Take the like of input file from stdin, to support huge lists of filenames" flag off
-option "focal_origin" - "Output files with FOCAL-like origin, instead of the origin present in the dicom files" flag off
-option "extract_series" s "Identify different series in the file list and create the MHDs accordinly" flag off
+option "config"                    -   "Config file"            string         no
+option "verbose"             v "Verbose"                        flag off
+option "tolerance"         t "Tolerance for slice position"     double default="0" no
+option "output"         o "Output image filename"              string  yes
+option "std_input"      - "Take the like of input file from stdin, to support huge lists of filenames" flag off
+option "focal_origin"   - "Output files with FOCAL-like origin, instead of the origin present in the dicom files" flag off
+option "patientSystem"  p "Open the image with patient coordinate system" flag off
+option "instanceNumber" n "Sort the images regarding instance number in dicom tag" flag off
+option "reverse"        r "Reverse the slice order" flag off