]> Creatis software - clitk.git/blobdiff - tools/clitkSetOriginGenericFilter.txx
Moved from repository clitk to clitk.private/deprecated
[clitk.git] / tools / clitkSetOriginGenericFilter.txx
diff --git a/tools/clitkSetOriginGenericFilter.txx b/tools/clitkSetOriginGenericFilter.txx
deleted file mode 100644 (file)
index 86617bf..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,136 +0,0 @@
-/*=========================================================================
-  Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
-
-  Authors belong to: 
-  - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
-  - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
-  - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
-
-  This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
-  the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
-  PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
-
-  It is distributed under dual licence
-
-  - BSD        See included LICENSE.txt file
-  - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
-===========================================================================**/
-#ifndef clitkSetOriginGenericFilter_txx
-#define clitkSetOriginGenericFilter_txx
-
-/* =================================================
- * @file   clitkSetOriginGenericFilter.txx
- * @author 
- * @date   
- * 
- * @brief 
- * 
- ===================================================*/
-
-
-namespace clitk
-{
-
-  //-------------------------------------------------------------------
-  // Update with the number of dimensions
-  //-------------------------------------------------------------------
-  template<unsigned int Dimension>
-  void 
-  SetOriginGenericFilter::UpdateWithDim(std::string PixelType, int Components)
-  {
-    if (m_Verbose) std::cout << "Image was detected to be "<<Dimension<<"D and "<<Components<<" component(s) of "<<  PixelType<<"..."<<std::endl;
-
-    if (Components==1)
-      {
-       if(PixelType == "short"){  
-         if (m_Verbose) std::cout << "Launching filter in "<< Dimension <<"D and signed short..." << std::endl;
-         UpdateWithDimAndPixelType<Dimension, signed short>(); 
-       }
-       //    else if(PixelType == "unsigned_short"){  
-       //       if (m_Verbose) std::cout  << "Launching filter in "<< Dimension <<"D and unsigned_short..." << std::endl;
-       //       UpdateWithDimAndPixelType<Dimension, unsigned short>(); 
-       //     }
-       
-       else if (PixelType == "unsigned_char"){ 
-         if (m_Verbose) std::cout  << "Launching filter in "<< Dimension <<"D and unsigned_char..." << std::endl;
-         UpdateWithDimAndPixelType<Dimension, unsigned char>();
-       }
-       
-       //     else if (PixelType == "char"){ 
-       //       if (m_Verbose) std::cout  << "Launching filter in "<< Dimension <<"D and signed_char..." << std::endl;
-       //       UpdateWithDimAndPixelType<Dimension, signed char>();
-       //     }
-       else {
-         if (m_Verbose) std::cout  << "Launching filter in "<< Dimension <<"D and float..." << std::endl;
-         UpdateWithDimAndPixelType<Dimension, float>();
-       }
-      }
-
-    else if (Components==3)
-      {
-       if (m_Verbose) std::cout  << "Launching transform in "<< Dimension <<"D and 3D float (DVF)" << std::endl;
-       UpdateWithDimAndPixelType<Dimension, itk::Vector<float, 3> >();
-      }
-
-    else std::cerr<<"Number of components is "<<Components<<", not supported!"<<std::endl;
-
-  }
-
-
-  //-------------------------------------------------------------------
-  // Update with the number of dimensions and the pixeltype
-  //-------------------------------------------------------------------
-  template <unsigned int Dimension, class  PixelType> 
-  void 
-  SetOriginGenericFilter::UpdateWithDimAndPixelType()
-  {
-
-    // ImageTypes
-    typedef itk::Image<PixelType, Dimension> InputImageType;
-    typedef itk::Image<PixelType, Dimension> OutputImageType;
-    
-    // Read the input
-    typedef itk::ImageFileReader<InputImageType> InputReaderType;
-    typename InputReaderType::Pointer reader = InputReaderType::New();
-    reader->SetFileName( m_InputFileName);
-    reader->Update();
-    typename InputImageType::Pointer input= reader->GetOutput();
-
-    // Origin
-    typename InputImageType::PointType origin;
-    origin.Fill(0.0);
-
-    // Like?
-    if (m_ArgsInfo.like_given)
-      {
-       typedef itk::ImageFileReader<InputImageType> InputReaderType;
-       typename InputReaderType::Pointer likeReader = InputReaderType::New();
-       likeReader->SetFileName( m_ArgsInfo.like_arg);
-       likeReader->Update();
-       typename InputImageType::Pointer like= likeReader->GetOutput();
-       origin=like->GetOrigin();
-      }
-    else
-      {
-       if (m_ArgsInfo.origin_given==Dimension)
-         for(unsigned int i=0; i<Dimension;i++)
-           origin[i]=m_ArgsInfo.origin_arg[i];
-       else
-         for(unsigned int i=0; i<Dimension;i++)
-           origin[i]=m_ArgsInfo.origin_arg[0];
-      }
-    input->SetOrigin(origin);
-    // Output
-    typedef itk::ImageFileWriter<OutputImageType> WriterType;
-    typename WriterType::Pointer writer = WriterType::New();
-    writer->SetFileName(m_ArgsInfo.output_arg);
-    writer->SetInput(input);
-    writer->Update();
-
-  }
-
-
-}//end clitk
-#endif //#define clitkSetOriginGenericFilter_txx