]> Creatis software - clitk.git/blobdiff - vv/vv.cxx
script to compress MHDs
[clitk.git] / vv / vv.cxx
index 2a04dc0d396f3765155fadeb098eac8c29c06360..9c3f666be3904a8de0350748bfd96c363917519b 100644 (file)
--- a/vv/vv.cxx
+++ b/vv/vv.cxx
@@ -3,7 +3,7 @@
 
   Authors belong to:
   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
-  - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
+  - Léon Bérard cancer center       http://www.centreleonberard.fr
   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
 
   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
@@ -14,7 +14,7 @@
 
   - BSD        See included LICENSE.txt file
   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
-======================================================================-====*/
+===========================================================================**/
 #include <utility>
 #include <cassert>
 #include <ctime>
 
 #include "clitkIO.h"
 #include "vvMainWindow.h"
+#include "vvReadState.h"
+#include "vvToolsList.h"
+#include "vvConfiguration.h"
+
 #include <vtkFileOutputWindow.h>
 #include <vtkSmartPointer.h>
+
 #include <itkFileOutputWindow.h>
 #include <itkSmartPointer.h>
 #include <itksys/SystemTools.hxx>
 
 #include <sys/types.h>
 #include <sys/stat.h>
-#include  <errno.h>
+#include <errno.h>
 
 void load_image_first_error()
 {
@@ -61,19 +66,37 @@ std::string create_timed_string()
 }
 
 //------------------------------------------------------------------------------
+#ifdef _WIN32
+int CALLBACK WinMain(HINSTANCE hInstance, HINSTANCE prevInstance, LPSTR lpCmdLine, int nShowCmd)
+{
+  int argc = __argc;
+  char **argv = __argv;
+#else
 int main( int argc, char** argv )
 {
+#endif
+
   CLITK_INIT;
 
   QApplication app( argc, argv );
   Q_INIT_RESOURCE(vvIcons);
-  //QPixmap pixmap(":/splashscreen.PNG");
-  QSplashScreen *splash = new QSplashScreen(QPixmap(QString::fromUtf8(":/new/prefix1/splashscreen.PNG")));
-  /*splash->showMessage("VV 1.0 developped by Léon Bérard c`ancer center http://oncora1.lyon.fnclcc.fr and CREATIS-LRMN http://www.creatis.insa-lyon.fr",(Qt::AlignRight | Qt::AlignBottom));*/
-  //  splash->show();
-  QTimer::singleShot(2000, splash, SLOT(close()));
-  while (!splash->isHidden())
-    app.processEvents();
+  
+  // 
+  // ATTENTION: Rômulo Pinho - 05/08/2011
+  // Forcing the locale of the application is necessary
+  // because QT initialization changes it to the locale
+  // of the language of the system. This can cause 
+  // inconsistencies when, e.g., reading float values
+  // from DICOM fields with gdcm, since the decimal
+  // point may be changed for a comma (as in French).
+  // In practice, functions such as scanf and its
+  // variations are directly affected.
+  // https://bugreports.qt.nokia.com//browse/QTBUG-15247?page=com.atlassian.jira.plugin.system.issuetabpanels%253Achangehistory-tabpanel
+  //
+#ifndef _WIN32
+  std::string old_locale = setlocale(LC_NUMERIC, NULL);
+  setlocale(LC_NUMERIC, "POSIX");
+#endif
 
   vvMainWindow window;
 
@@ -92,6 +115,7 @@ int main( int argc, char** argv )
   int n_image_loaded=0;
   std::string win(""), lev("");
 
+       bool link_images = false;
   if (argc >1) {
     for (int i = 1; i < argc; i++) {
       std::string current = argv[i];
@@ -101,6 +125,27 @@ int main( int argc, char** argv )
           sequence_filenames.clear();
           parse_mode=P_NORMAL;
         }
+        if ((current=="--help") || (current=="-h")) {
+          std::cout << "vv " << VV_VERSION << ", the 2D, 2D+t, 3D and 3D+t (or 4D) image viewer" << std::endl << std::endl
+                    << "Synopsis: vv file(s) [OPTIONS] file(s)" << std::endl << std::endl
+                    << "Open file(s) for visualization." << std::endl << std::endl
+                    << "OPTIONS may be:" << std::endl
+                    << "--help         \t Print command line help and exit." << std::endl
+                    << "--window number\t Gray scale window width for all images." << std::endl
+                    << "--level number \t Gray scale window level for all images." << std::endl
+                    << "--linkall      \t Link pan, zoom and spatial position of crosshair in images." << std::endl
+                    << "--log          \t Log output messages in vv-log directory." << std::endl
+                    << "--state file   \t Read display parameters from file." << std::endl
+                    << "--sequence file\t Read all file(s) until next option in a single temporal sequence." << std::endl
+                    << std::endl
+                    << "These last options must follow a file name since they overlay something on an image:" << std::endl
+                    << "--vf file      \t Overlay the vector field in file." << std::endl
+                    << "--overlay file \t Overlay the image in file with complementary colors." << std::endl
+                    << "--fusion file  \t Overlay the image in file with alpha blending and colormap." << std::endl
+                    //<< "--roi file     \t Overlay binary mask images. Option may be repeated on a single base image." << std::endl
+                    << "--contour file \t Overlay DICOM RT-STRUCT contours." << std::endl;
+          exit(0);
+        }
         if (current=="--vf") {
           if (!n_image_loaded) load_image_first_error();
           window.AddField(argv[i+1],n_image_loaded-1);
@@ -109,10 +154,14 @@ int main( int argc, char** argv )
           if (!n_image_loaded) load_image_first_error();
           window.AddOverlayImage(n_image_loaded-1,argv[i+1]);
           i++; //skip overlay name
-        } else if (current=="--roi") {
+        } /*else if (current=="--roi") {
           if (!n_image_loaded) load_image_first_error();
           window.AddROI(n_image_loaded-1,argv[i+1]);
           i++; //skip roi name
+        }*/ else if (current=="--contour") {
+          if (!n_image_loaded) load_image_first_error();
+          window.AddDCStructContour(n_image_loaded-1,argv[i+1]);
+          i++; //skip roi name
         } else if (current=="--fusion") {
           if (!n_image_loaded) load_image_first_error();
           window.AddFusionImage(n_image_loaded-1,argv[i+1]);
@@ -124,14 +173,19 @@ int main( int argc, char** argv )
           parse_mode=P_WINDOW;
         } else if (current == "--level") {
           parse_mode=P_LEVEL;
-        } else if (current == "--log") {
+        } else if (current == "--linkall") {
+                                       link_images = true;
+                               }
+                               else if (current == "--log") {
           std::string log_dir = QDir::tempPath().toStdString() + std::string("/vv-log");
 
           if(itksys::SystemTools::FileExists(log_dir.c_str()) &&
               !itksys::SystemTools::FileIsDirectory(log_dir.c_str())) {
-            itkGenericExceptionMacro(<< "Error creating log directory, file exists and is not a directory.");
+            std::cerr << "Error creating log directory, file exists and is not a directory." << std::endl;
+            exit(1);
           } else if(!itksys::SystemTools::MakeDirectory(log_dir.c_str())) {
-            itkGenericExceptionMacro(<< "Error creating log directory.");
+            std::cerr << "Error creating log directory." << std::endl;
+            exit(1);
           }
 
           std::string log_file = log_dir + "/" + create_timed_string() + ".log";
@@ -147,7 +201,14 @@ int main( int argc, char** argv )
           vtk_log->FlushOn();
           vtk_log->AppendOn();
           vtkOutputWindow::SetInstance(vtk_log);
+        } else if (current == "--state") {
+          //window.ReadSavedStateFile(argv[i+1]);
+          vvReadState read_state;
+          read_state.Run(&window, argv[i+1]);
+          n_image_loaded += read_state.GetNumberOfImages();
+          i++;
         }
+        
       } else if (parse_mode == P_SEQUENCE) {
         sequence_filenames.push_back(current);
       } else if (parse_mode == P_WINDOW) {
@@ -171,9 +232,19 @@ int main( int argc, char** argv )
   }
 
   if(win!="" && lev!="") {
-    window.WindowLevelChanged(atof(win.c_str()), atof(lev.c_str()), 6, 0);
+    window.SetWindowLevel(atof(win.c_str()), atof(lev.c_str()));
     window.ApplyWindowLevelToAllImages();
   }
 
-  return app.exec();
+       if (link_images)
+               window.LinkAllImages();
+
+  int ret = app.exec();
+  
+#ifndef _WIN32
+  // restoring the locale, just to be clean...
+  setlocale(LC_NUMERIC, old_locale.c_str());
+#endif
+
+  return ret;
 }